ggKbase home page

SCGC_AAA011_L22_17_8

Organism: DUSEL4_archaeon_sp_SCGC_AAA011_L22

partial RP 32 / 55 MC: 2 BSCG 15 / 51 MC: 1 ASCG 0 / 38
Location: comp(7390..9963)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 61.1
  • Coverage: 854.0
  • Bit_score: 1111
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Methanothermus fervidus (strain ATCC 43054 / DSM 2088 / JCM 10308 / V24 S) RepID=E3GYR8_METFV Tax=AR20 UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 61.1
  • Coverage: 854.0
  • Bit_score: 1111
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase, subunit A' (EC 2.7.7.6) similarity jgi
DB: jgi
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 0
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Sequences

DNA sequence
Length: 2574
ATGCAGCAATTAGATTATATATACAAAAAGGTAGGAAGTATTGTTTTCGGAATTCTATCTCCATTGATGATTAAAAAAATGGCTGCTATTAAGATTGTTACTCCTGAGCTTTATGATAAAGAGGGTTATCCTGTTGATGGGGGATTAATGGACATTAGAATGGGTGTTATTGATCCTGGGCTGAGATGTAAAACCTGCGGCCAGAAATTGAAGGAATGCCCTGGACATTTTGGTTTTATTGAGTTAGCCAGACCAGTAGTTCATGTTAATCATGTCAAACCTATTTTGGATTTCTTAAGAGTTACATGCAAAGACTGCGGAAAGGCATTGGTATTAGATGCTGATAAGGAAAAATGGACTGCTAAGTTAAACAGGATAGAAAGAGAAAAGGGATTAGAGCAAAAGAGAAAAGCAATTAATGAATTAATAAATCATTTCAAGATTGTTAAAAAATGCCCACACTGTGAGGCAAAACAGTTTAACGTTAGTGTTGAAAAACCAACTACCTTTATGGAGAATGATATAAGATTAAGCCCAATTGAGGTGAGAGCAAGACTGGAAAAAATAAGCGATGATGATGTTAAATTCTTTGGAGTAAATCCTGATTTTGCAAGACCAGAATGGATGATTTTAACATTAATGCCTATACCTCCTGTAACAATAAGACCAAGCATTACTCTTGAATCAGGAGAAAGGAGTGAGGATGATTTAACACACAAATTAAGCGATGTAATAAGAATAAACCAGAGATTATTTGAAAATATCAATGCTGGTGCTCCTGAGGTTATAATTGAGGATTTATGGGATTTATTACAATATCATGTTACAACCTTTTTCAATAATGACCTGGCTTCTGTTCCTCCTGCAAGACACAGAGGGGGAGACCCATTAAAGACATTGGCTGAGAGAATTAAGAGCAAAGAAGGAAGATTCAGGCACAACTTGGCTGGAAAGAGAGTAAACTTTTCTGCAAGAAGTGTTATCAGCCCTGATCCACAAATTAAATTTGATGAGGTTGGTGTTCCATTATATGTTGCATTAGAATTAACTGTTCCTGAAAGGGTTAATGTGTGGAATATTGACAGATTAAAAGAGTTCATTAAACAAGGACCTACTAATTATCCGGGTGCTAATTATGTTATAAGGCTTGATGGAAAGAAAAAGAAAATAACTGATGAGACAAAAGAGCAGTTAGTTGAGGAATTACAAGAGGGTTATATTGTTGAAAGGCATTTGATGGAAGGAGATACTGTTATATTCAACAGACAGCCAAGCCTGCACAGAATGAGTATAATGTGCCACAAGGTCAGGATATTTGACGGCAAGAGCTTTAGAATAAATCCAAGTGTCTGCAAGCCATATAATGCTGATTTTGACGGGGATGAGATGAATTTGCATGTTCCTCAGACAGAAGAGGCTATTGCTGAAGCAGATATTTTAATGGAAGTCAGAACACAGATTATCAGCCCTAAGAATGGTGTTAATATTATTACTTCTATTCAGGATTCTATAACTGGGAATTATCTTCTTACAAAATTAATGAATATGAAAAGAGAAAAGGCGATTGAGTTATTATCCAGTGTCGGCTGCGATGACTTTAAAAAATTAAAAGGAAAAAATGTTGACGGCAAGCAGATATTCAGCTGTTTGCTGCCAGATGACTTTGATTTCATTGGCCAGTCAAAAAATGATGGGGAAGAAGTTTCGATTGAAAATGGAAATTTAGTTTCTGGAGTTATAGATCATACTATGATTGGAGATGGTGGCGGAGCAGTTATAAGAAGCTTATATGCAAAATATGGCGCTGAACAAACATTAGAAATAATGTGGAAGATATCCCAGTTAGGAATAAAGATTATGTTGAGTAATGGTTTTACAACCGGCATCTCTGATACTGATTTAAGTGATGGTATCAAAAAAGAAATTAATGTTTTAATTGAAGAGGGAATAGTTAAAATTGATGAATTAATTACCCAATATAGGGAAGGAAAATTAGATGCTTTCCCAGGAAAAACAATTAATGAAACACTTGAGTTAAAAATTATAGAACTATTAAGCAAGGTAAGAAATAAAATCGGTAAATTAGTTACTGATAACAGCAATCCTGAGAATCCTTCAATTATTATGGCAGTTTCTGGTGCAAGAGGAAGTTCTCTGAATTTAACACAGAATGCTGCTATGGTAGGACAACAGTCCTTAGTTGGTCAGAGGATAAACAGGGGATTTTATGGAAGAACATTACCATATTTCAAAAAAGGAGATTTGGGTGCAAATGCCCACGGCTTTATCAGGAATAGTTATAAGTCAGGGTTGAATCCATTTGAATTTTTCTTCCATGCAATGACTGGTAGAGACAGCTTAATGGACACTGCATTAAGGACCCCTAAATCCGGTTATTTATACAGAAGATTAAGCAGCGCTTTACAGGATTTAAAGATTGAATATGACGGAACTGTAAGGGGAGCTGATAATTCAATTATCCAGTTTGCTTACGGCGGAGATAATATTGATGTTTCAAAGAGTGAGGGTGGAACTATAAATGTCAAAAAAATTATCAGGGAGATTTTAAAATGA
PROTEIN sequence
Length: 858
MQQLDYIYKKVGSIVFGILSPLMIKKMAAIKIVTPELYDKEGYPVDGGLMDIRMGVIDPGLRCKTCGQKLKECPGHFGFIELARPVVHVNHVKPILDFLRVTCKDCGKALVLDADKEKWTAKLNRIEREKGLEQKRKAINELINHFKIVKKCPHCEAKQFNVSVEKPTTFMENDIRLSPIEVRARLEKISDDDVKFFGVNPDFARPEWMILTLMPIPPVTIRPSITLESGERSEDDLTHKLSDVIRINQRLFENINAGAPEVIIEDLWDLLQYHVTTFFNNDLASVPPARHRGGDPLKTLAERIKSKEGRFRHNLAGKRVNFSARSVISPDPQIKFDEVGVPLYVALELTVPERVNVWNIDRLKEFIKQGPTNYPGANYVIRLDGKKKKITDETKEQLVEELQEGYIVERHLMEGDTVIFNRQPSLHRMSIMCHKVRIFDGKSFRINPSVCKPYNADFDGDEMNLHVPQTEEAIAEADILMEVRTQIISPKNGVNIITSIQDSITGNYLLTKLMNMKREKAIELLSSVGCDDFKKLKGKNVDGKQIFSCLLPDDFDFIGQSKNDGEEVSIENGNLVSGVIDHTMIGDGGGAVIRSLYAKYGAEQTLEIMWKISQLGIKIMLSNGFTTGISDTDLSDGIKKEINVLIEEGIVKIDELITQYREGKLDAFPGKTINETLELKIIELLSKVRNKIGKLVTDNSNPENPSIIMAVSGARGSSLNLTQNAAMVGQQSLVGQRINRGFYGRTLPYFKKGDLGANAHGFIRNSYKSGLNPFEFFFHAMTGRDSLMDTALRTPKSGYLYRRLSSALQDLKIEYDGTVRGADNSIIQFAYGGDNIDVSKSEGGTINVKKIIREILK*