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SCNpilot_expt_500_p_scaffold_51_curated_11

Organism: scnpilot_dereplicated_Chlamydia_1

near complete RP 50 / 55 BSCG 47 / 51 MC: 1 ASCG 12 / 38 MC: 2
Location: 13494..18374

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Value Algorithm Source
Putative rhs family protein n=1 Tax=Waddlia chondrophila (strain ATCC VR-1470 / WSU 86-1044) RepID=D6YT00_WADCW similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 31.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 764
  • Evalue 3.10e-217
Cell wall-associated polypeptide CWBP200 {ECO:0000313|EMBL:CDZ79942.1}; TaxID=1444712 species="Bacteria; Chlamydiae; Chlamydiales; Chlamydiaceae; Chlamydia/Chlamydophila group; Chlamydia.;" source="Chlamydia sp. 'Rubis'.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3301
  • Evalue 0.0
rhs37; rhs family protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 764
  • Evalue 9.70e-218

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Chlamydia sp. 'Rubis' → Chlamydia → Chlamydiales → Chlamydiia → Chlamydiae → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4881
ATGGTTATTAATATCACAAATATTAAATTTATATTTTCAAAATATTACTTTAGTTTCACTTACCTTTTACTACTTTTTAGTCTTTGGTATTCTCCCTTAAAAGCCGCTAATGAAAACCTTGAACTACCTATAGTTTGCCATTCTGTTAATATTATTACTGGAGATTACATCGAAACACAAACAGATAATTTTTTTTTTCATAAAGATATAAAAATTAGAAGAGCTTATTCGAGCAAAGATTGTGCATGGGAATTTAATATTCCTTTTTTTCAAAAAGATTCTTATGAGAATCAAATTCAATCCTTAACTTTCAAATATGATAATCATTTATTGAAAGAAATAAATTGGTGCAATTATGCCGGACAGAAAAAAATACTGCATACATCCGTTGATACTAAAGACGAAATCCATTTTTTCTTGAATAATGATCATGGTCAAGACCTTAGCTATTCGTTTTCGAAAGAGGATACATCTTTATTAAACAAAGTAAGCATAAATCAATTTTTTATTGCCTACACTTATGAAGTTCATCCTCAGTTACAAAAAAAACAATTAGTGAAAAGAGAGTTACCTGAAGGTCGTTATCTGATTAATGAATACTATAAACTCGGATCTAATCAAGTAGGTGATCAAGAAGTCATTATAGAAAATAGGAATGACTTTAGAATAGGCAGGGTAATGCTTCAAAAAGAGCCTTTATCCTATAATCTCGAACCTATTATTTCTCATCGTTTTTTTTATCATGAAAATTATACAGAAGTGCTTGATGCTAATAATAATAAAATCGTTTACCACTATTCCCCCAAACTATTTCTAACTGCCATTGAATATTTTATCGATCACAAACTTTATAAATCAGAAAGCTATTATTGGGAAGATAGTGAACATATTGATTTACCAAAATTAATTGGAAAAGGGATTGCTGACCATCAAGGCAATATTTTTTCTTATAAAAAATATGCTTATAATAAATGGGGTTTGATTGCCCTAGAAAGTATATTTGGAAACTTTTCCGGTCAAGTGACTGAACAAATTATTCTCAATGATAAAGCTCAACCTATAACAAATGTTGAAGCAATCCATAAAATCTACACTTATAGTGATGAACCTGAACATAACCTTATTGCAGTAGACGACTCTAATGGTAATAAAACCATATTTCGATATGATCCTAAATTAAAAAGAAAAGTAGCACAATTTCATTACTATAATGAAATTTGTAAAGAAAGAGAATTCTACTTCTATAATTCTTTTAGTCAAATTGAGAAAATTATTAAAGATGATGGCATAAGTGAGGATTATACCAATTTAGAAAATGTTTATCATAGGCAAATTACTAGCTTAAAACAGGTTAATGAAAATGAATCTGCTCAAGAAATTGAACATTATAACTATGACGATCAATTGCAAATGCTATCATTGGCTTATAAAGAAATTGCTTATTATAATGAACAAGGATACCTGCAAAGAAAAACACTTTTAGATTCAAACTTAAATATTTTTGAATTAAACGTTTATAACTATGACCCCATGGGAAATATTGTTTATGAGAAAAATTTAAAAGGTGAAGAAATTGATTATACTTACGACTCTATGGGGAATTTGTTAAAAAAGGCTTCAAGAAATGAAGTTGTTAGTTATCAATATAGCCCAGCTAATCGACTAATTGTAGTAAAGACAAACGATCAAATCATACAATATAAATATGATTATAATGGTAATTGTATTTCAGAAATAGATAACGATGGAAATGAAACATTTCATACTTATGACAATTTAAATCGTAAAATCGGTATTACTTACCCAAAAATTAAGACTATGGATGGGTGGCTTCATCCTCAAGAACAATATATCTATAATATACTCGACCAAGTTATTGAAATAATAGATCCCAAAGGATATAGCACAAAAAATCAATATAATAGCTTTGGAAAAATCCTTAAAACTATTTACCCCGATAGCACTGAAGAACAATATTGCTACTTCTTAGACGGTCAATTGCAAGGTTTTCGCTCAAAAATTGGCCTAGTAACTAACCATACTAAAGATTCCAGGGGTCAAATCTCTCAAACTTCTACTTTTTCTAAAGAATCAACCCCAAAAAACACTGATTTAACCTATAGAAATAACGATCTCATCAAAGTAAGTAGACAAAATGAAGAAATATCTTTTACTTACAATAAATTTGGTAAAATTGCTTCTCAAAAAATAATCGCAGATGACACGGTTATAAAACGAAATTTTTTTTATGATGAGAAAGGAAAACTAATTTCTGATGATAATGCACAAAATTCCTCTCAGGACTTAATGGCAAACGGGTGTAAAGAAAGCTATTTTGATAATGAGGTGGATCTATTCTTCAAAAAGGACGTTTACACTTATCCCAATGGATTGCAAATCACCTTTTTTTCCGATTCGAATAATCGCATTATAAAAACAAAAAAAACGAATTTCTGTAACCAAGTCATCGAAGAAGTAGAATTCTTCTATGATCTCAATGGCAATAAAACTAAAACGATTGTTATAACTCCTTCAGATATTTATACCTTAATTAGAATTTATGGACCCTGTAATCGTTTAGAAAATCAAACAGAAATCTTTTCTAATCAAATCCCTCGCAAACTTTTTTATAATTACAATAATTTTGGACTTTTAGAAACTTTTACAAAAGCAGATGGGATTCAGATTTTTTACACGTATGATACTTGGGGTAGGTTGCATACAATAACTTCTTCGGATCAATCTATTGCCTATATTCTCTCTTATAATCATGCCGATCAAATTATACAAATCGAGGATGCTGTTCAAAAAAAAACGAGTAGAAGAGATTATAAAGGAAAAAATCTTGTTTATGAATTATTAGCTAATGGCTATTCCATAACAAACTTTTATAACGACGCCAATCAAAAAGCTAAACAACAATTATGGGACGGCACAGAGATAGATTATCTTTATAAAAATGAAAATATCATCTCTATAAGAAGGACTAATAAATTACAGTCTTACGACATTAATTTTGAATATTTTGAAAACCAAATAACTTCTATTCAGTACCCTTTTAATCATTCTGTAACCTTTGAATACAAAGATACTTTGCTAAAAAAAATTACTAGCCCTTTCTATAAACAAGAAATTTTTAGAGACGAGAAACAATTAATAAATAGAATCACAACGAAAACTCTTTCAAATCAGGAAAAAACAACTTTCGAATATGATGATTTATGTCGTATTTCAAAGGAGACTAGTAGTAGTAGTGAATGGCAATATAGATATGATGATTTTCAAAATTTATACTTATCTAATGAGACTGTCTATAAAAATTGTTATGAAATATCTCAAAGCAATAATTGGCTATACTCTCATGATATTAATGGTAATTTGATTTCAAAAAAAAATTGTAGTGAAGAATTTACTTACTTTTATGACGCCCTCAATCGTTTAACCAAAATAGTGAATCATAATAAATGGAAAATTGAATTTATTTATGATTACTTTAATAGGTGTTTAAGAAAAATTAAGTGGATCTATGATACTGATCGTGGCGATTGGGGTGATAAAGAAGAAACCGATTTTGTATACGACATTGACAACGAAATAGCACAGATAGTTAATGACGTGGTAAATCTTAGAATTTTAGCCGTTTCTAGAATTGGGGCTGAAATTGGAAACAGCATTGTCTTTGAAAAAAATGACAGGCTCTATTTTCCAATCTATGATTTCAGAGGCAATGTAACCTTTATCGTTGATCCTCTAACTAATAATCACCAACAATTAAATTACAGTTCTTTTGGAAATTTTACTATCGAGAATACTCAATCTAATTCTAATTCCAAACTTTTATTTAATTGGACATTTTTTAGTAAAAGATATGATGAAGATTTACACTATGTTTTTTTTGGTAGAAGATTTTACGACATGGAAATTGGGCGTTGGATTAATTTAGATCCCATGGGACAAATTGATGGGTTTAATAGATATCTTTTTATCAAAAATGATCCCATCAATAATTTTGATTTATATGGACATTTTTCCATCCCTTCTTTTCTTACCGATTTAAAAACTAAATTCACTGAATGGAAAGATCAATTTTTTTCCTTTTATCAACCAGTTGACGAACTGTTAAACAGACATCTAGCTGTAGATCAATTCCTTCAAAATAATGTCGATAAGCTCGGAGAAGAGTTATTTGGAAAAACGTTTTTGATTATGTTGGGACTTCGGATCGATCCTTTAGAAAAAGGGATATATGGTAAAGGGGAAATCGATGATAAAATCCGGATAACCTTAATAAATGGTATTTTAAATGTAAGAAATGACTGTGAATATATGGCAAGCCTTGTATCCCAATCTCATGGCAATGCTAATGTGCATTACATCTTTCATCCGACCCAAGGATGGGGCGCTGACATGGTTTTAGCCTTTAGGGTGAAACTTGGGCATATATCTCCTCAAGCAGCTCTTTTAGCAAGGACTTGGAAAAGCTTAATTCGTGAAATGGGAGGGATCGAAGGGAATGGAACTATTTATCATTACGCGCATAGTATGGGAGGAAGCGATACAGCTGCTGCACAATCTTTATTAACCGAAGAAGAAAAGCAAATGATAAAAGTTATTTCTTTTGGATCAGCTACCTTGATTCAAAAGGATGGTTTTCAATCTGTAACAAATTACGTCAGCAAACATGACGCCGTACCATTAAGCGATCCTATTGGCTTTATAAAAGCTATGCTTGATAGAAATACCAATGTTATTTTTATCGGTCAGTATCTTGGTCTTCCCTTTATAGATCATCCCTTTAATGCGGAAACTTATCAATTAATTGTGCAAGCTTTAGGTGAAGCTTTTGTTAATGAATATGGCTGTGTAAACGAAAATAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1627
MVINITNIKFIFSKYYFSFTYLLLLFSLWYSPLKAANENLELPIVCHSVNIITGDYIETQTDNFFFHKDIKIRRAYSSKDCAWEFNIPFFQKDSYENQIQSLTFKYDNHLLKEINWCNYAGQKKILHTSVDTKDEIHFFLNNDHGQDLSYSFSKEDTSLLNKVSINQFFIAYTYEVHPQLQKKQLVKRELPEGRYLINEYYKLGSNQVGDQEVIIENRNDFRIGRVMLQKEPLSYNLEPIISHRFFYHENYTEVLDANNNKIVYHYSPKLFLTAIEYFIDHKLYKSESYYWEDSEHIDLPKLIGKGIADHQGNIFSYKKYAYNKWGLIALESIFGNFSGQVTEQIILNDKAQPITNVEAIHKIYTYSDEPEHNLIAVDDSNGNKTIFRYDPKLKRKVAQFHYYNEICKEREFYFYNSFSQIEKIIKDDGISEDYTNLENVYHRQITSLKQVNENESAQEIEHYNYDDQLQMLSLAYKEIAYYNEQGYLQRKTLLDSNLNIFELNVYNYDPMGNIVYEKNLKGEEIDYTYDSMGNLLKKASRNEVVSYQYSPANRLIVVKTNDQIIQYKYDYNGNCISEIDNDGNETFHTYDNLNRKIGITYPKIKTMDGWLHPQEQYIYNILDQVIEIIDPKGYSTKNQYNSFGKILKTIYPDSTEEQYCYFLDGQLQGFRSKIGLVTNHTKDSRGQISQTSTFSKESTPKNTDLTYRNNDLIKVSRQNEEISFTYNKFGKIASQKIIADDTVIKRNFFYDEKGKLISDDNAQNSSQDLMANGCKESYFDNEVDLFFKKDVYTYPNGLQITFFSDSNNRIIKTKKTNFCNQVIEEVEFFYDLNGNKTKTIVITPSDIYTLIRIYGPCNRLENQTEIFSNQIPRKLFYNYNNFGLLETFTKADGIQIFYTYDTWGRLHTITSSDQSIAYILSYNHADQIIQIEDAVQKKTSRRDYKGKNLVYELLANGYSITNFYNDANQKAKQQLWDGTEIDYLYKNENIISIRRTNKLQSYDINFEYFENQITSIQYPFNHSVTFEYKDTLLKKITSPFYKQEIFRDEKQLINRITTKTLSNQEKTTFEYDDLCRISKETSSSSEWQYRYDDFQNLYLSNETVYKNCYEISQSNNWLYSHDINGNLISKKNCSEEFTYFYDALNRLTKIVNHNKWKIEFIYDYFNRCLRKIKWIYDTDRGDWGDKEETDFVYDIDNEIAQIVNDVVNLRILAVSRIGAEIGNSIVFEKNDRLYFPIYDFRGNVTFIVDPLTNNHQQLNYSSFGNFTIENTQSNSNSKLLFNWTFFSKRYDEDLHYVFFGRRFYDMEIGRWINLDPMGQIDGFNRYLFIKNDPINNFDLYGHFSIPSFLTDLKTKFTEWKDQFFSFYQPVDELLNRHLAVDQFLQNNVDKLGEELFGKTFLIMLGLRIDPLEKGIYGKGEIDDKIRITLINGILNVRNDCEYMASLVSQSHGNANVHYIFHPTQGWGADMVLAFRVKLGHISPQAALLARTWKSLIREMGGIEGNGTIYHYAHSMGGSDTAAAQSLLTEEEKQMIKVISFGSATLIQKDGFQSVTNYVSKHDAVPLSDPIGFIKAMLDRNTNVIFIGQYLGLPFIDHPFNAETYQLIVQALGEAFVNEYGCVNENK*