ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

SCNpilot_cont_500_bf_scaffold_273_curated_2

Organism: scnpilot_dereplicated_Chloroflexi_2

near complete RP 51 / 55 MC: 4 BSCG 50 / 51 MC: 3 ASCG 12 / 38 MC: 1
Location: 1830..6746

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Conserved repeat protein n=1 Tax=Clostridium pasteurianum BC1 RepID=R4K027_CLOPA similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 25.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 260
  • Evalue 8.50e-66
conserved repeat protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 260
  • Evalue 2.70e-66
Conserved repeat protein {ECO:0000313|EMBL:AGK95923.1}; Flags: Precursor;; TaxID=86416 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium pasteurianum BC1.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 25.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 260
  • Evalue 1.20e-65

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium pasteurianum → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4917
ATGAAACTTAGCAAATTATTTAAAAGGAACCACTCGAACATATCAAAATTATATTTATGTCTACCAATCCTTTTTAGCTTTGTGATATTTCTAGGTAGCTTTGTAGTTTTAACAAATACCCAGGCTGCCGATGAAGCTTTGGTAGATGTGCCAGGCAGTCTATCAAGTGATCTCGGAACAACAATCAAATCCCCTAACGCCATTCCTAAAAGCAATTCTGAAATTTTTTCGGTATCTATAGCGCTCCAACCTCGTAATACAGCCCGATTAGAAGAAATTGCGATTGGAGTTCAAAACCCCTCAAGTCCAAACTATAACAAATTTCTTAGTGACAATGATTTTCTCCAGGAGTATTCACCAACTTTCCAAGATATTGATTTATTCAAGAATTATTTTCAAAAAACAGGGTTACAAATAACCTACATCAGCACGGATCGGCTGGTATTAACTATCTCTGGTACCCTTGAACAACTTGATTCCGCTTTTAATACGAAGAGTGAAAAAAGAGTTGCCTCCAACAGTTCCGAAGGATTTATTAATGTTGTACCACTTAAACTACCTGCAAATTTGGTAGCAAGACTAAAAGGAATTGCCGGTTTCGATACCTTGCATAAACCGATTGCAAATCATGTAATTAAACCAGTTGCGCCTTCTCCTAACTATGCTGATGCAGGTTATAACACACCTAATTCTCTGAGATCTACCTATAATATTACTAATAGTGGTTACAATGGGTCAGGGGCTAAGGTTGGTATTGTATTCTGGAGTGCTCCAATTCAAAGTGACCTTAACCTGTGGCAGAACTACTTTGGACATCCCCTAAATATAAATATTGTCGGCAATTCTACTCCAAATAGTGATGCGGACGAAGCAAATTTGGATGTACAGTTGGTACATACCGCCGCACCTAATGCTACCATCCGCTTTTTCGTAGCGGCCCATGCAAGTGACTCGGATTTGATAACCGCCACGTCCACAGCGATCAATGATAATATACAAGTTTTAAGTAACAGCTGGGGAAGATGCGAACCTTCAATTAGCCAGAGTACCATAAATGCCTTTCACAACCTTTACATGACTGCCGCCGCCCGAGGTATTGCCGTCTTTGCCAGTAGCGGAGATAATGGGGTTTTTGAATGTCAGAATTCAGGTGGCACTCCTTTAGCTGGGTATGGGAGTTATCCTGCGACAGACAATTTTGTAACGGCAGTTGGAGGTACAAGGTTAATTCGAGAAAATAGCAATGATACGTGGCTGAATGAAACTGGTTGGAATTGCCCGGTTATAGGAGGTTCAAACGATTATTCCTGTATTAGATCATATGATGGCGCATCTGGAGGGGGTGGGATAAGCTCTTTTTTTGCCAGGCCGGTTTACCAAAGTTCGATTACACCCCCTTACGCTTCAAAGTTTGTTTACAACCCCTCTTCTTCAATGCGGGTGGTACCCGATATTAGTATGGATGCTGATCCGAACAGCGGCTCTCTCTTCTATTATAAAGGTCAGCTTTATTATGCGGGAGGAACGAGCGCCAGCGCGCCTCTCCTGGCAGGAATAACCGCACTAGCTGTTCAAAGGGCCGAAGGCTTAGTGGGGAATATCAATAGTTTTATTTATTCCAATTACCAGGGGGCAAATTGGCATTTTGATATTACGGATGGTTACAATGGGGTTTACGCTGCTTATAACTGGGATTATGTTACCGGGCTCGGTTCTATAAAAGATGTGGGAAGCTTTCTACGAACCTTTATTGTGTTACCAACAAATATTATTCTACAGGTAACTCCCAATCCTGCCCCTTATGGCACTCCTGTAACCTTTGTTGCTACTATAACTACAAACGGGAGAGGAGTTCCTGCAGGAAATATTAATTTTTATGAAAATAGTACTTTTTTGAGCGCAGCACCCATAAGTAATAAGGGTACGGCTTTTTTTACAAATGCTAACCTTTCACCAGGTAATCATATTGTTTACGCCCAGTTTCAAGGAGACGGGAACTTTAGCCCAAGCAATTCCACTCCCTTAACCCTGGTTATAAATAAGCCGCTTGTAAATATCGGGATTTCAACAAACTCAATACTGGAATTAGCAGGTAACCCGATAACTATTACCGCCAAGATTTCCCCACTTATACAAAGCTTGAATTTACCTACCCCTGGTGGAACCCTCACTTTTAAGGATTACAACAATATCCTTTCTACTATGACTTTGCCTGAAAGTGGTATCGCCGAATATAACACCAATTCTTTAGCGCCCGGCAGGCACGAAATTAAGGTTGAATACAACGGTGATACAACGTTCGCAAGAGCAACTTCTAATCAAATTATTGAAACTATAAAAGTAATTCAAACACTTTTTATTGTCAACGATGCTGAAGACCAGGGAGCAGAACTTAATGGAGACACTGAAGGAACACTTTCCTATGCTTTGAAACACGCAAATTCAGGTGACGCTATAACCTTTGATGGCATTGGATTTATCCAGGTTAAAGGCCAACTTCCGGCTGTAAAAAACGGTGTGTGGATAAAAGGTTGGTGCGGCACCGGTGGACCGGCGGTTATCATAAATGGATTGCTTGCTCCGCCACATACAAATGGTTTAACTCTTGAAGGTAATAACGCTATTTCAGGGATTGAAATCAGTGGCTTCAAAGGCTCCCAACTTATTCTAGCTGGATCACGCAATGGTTTCTGGTGTAGCTCAAACAAAGTAGGTGGCGAAGCGGCGTTTACAAATGAATCTGGCATAAATTTAACCTTTTCGGCTGATCCAATTGCTTTTGGAGCTTCTCTAATAATCACAGCCGAAGTCAAAACCCTCTTTTTGGAAAATAGTGTGCCAACTGGTAGTATAGAATTCTATGACGGTGATACGTTGCTGGGCACCACCAGCTTAAACACTGGGGACGTATCTTCTGCAAACCTTGTTATTTCAAACTTGAATACCGGCACTCACAACATACGAGCAATTTATTCTGGTGATAGTAATTTCAAACAATCTTATTCTCCTTCTGCAAGTTTATTGATAGATAAAGCTGATTCGCTTGCTAATCTGACATCGTCACATAATCCAGTATATCAAGGGATACCGGTTACCCTAACTGCTAGTATTAGCTCAACTACGTCAACTAACCTCAAACCGACCGGTAATGTCACCTTTAAGGAGGGCCCAAACATTCTCGGTACGGCACCTGTCAATAACGGTATTGCAACCTTTACTTTTAATACTCTAGGAGCGGGTGACCATACTCTAAGCGCAGAATATTCCGGCGATAGTAATTTCAATTCCAGTTTATCTTCCACAATAAACCAAACTGTTAATCAGGCTACCCTGGTTGGCACAGGGAGTCCGGCTAGTTGTAACGAGACGGCGCTTGGAACAGCTCTGGCACATGGTGGGAAGGTTGCCTTTTATTGCGGGAATAGCCCCTTTACAATCACACTAACCAGTCAAAAAACAATTGGAATTGATGCCGTTTTAGATGGGGAAGCTAATGTTACCCTTAGCGGAGGCAATACTACTCGACTCTTTTATGTGAATAATGGGATCCACTTCGGGTTAGAAAACATAAATATTGTAAATGGACATTTGAGCGGGGCAGCCAAAGGTGGGGCAATCTACAATGATGGAGGAATTCTTAATACTACTAACACAACCTTTAAAGGTAACAATATAACGGTAGTAGGCCGAGATAATGAATACAGTTACGGAGGAGCAATTTATAACCTAAACGGCACCTTAAATATTGAAACCAGTAATTTCATATCTAATTTTATGACTGTTGGTGGGAATTGTTTAAGTACTTGTGGAGTATTAGGTATTGGTATTTTCAATGATGGTGCTAATAGCTCTATAAATATTACCTCGACCATCTTTAATCAAAATTATAGTTCAAGTTCTAACCAATTAACTTTTTTAGGTGCTGTCTTACATAGCGCTAATGGGACTATCGATGTCGAAAACAGCACATTTACAGATAATACAATTAACCCTTATACAAATCCAATATGTTGCTATAACCAAAGTATTGCTGGTGCCACCGCAATTCAAAATTATGTTGGCACGATGACTATAAAAAACACAATATTTTCCGGTAACAAAAGTGTTCAATCCGACCTAACCAGAGCCAATTCCCAAGGGTTTTTTGGGCCTATTTACAATTCTGGCTCTCTAACTATAGAAATGAGTAAATTTACCGACAATCAGGGAGCCATTTTTAATAATACTGGTGGCTCACTAACAATAAATAATACCTTGTTTTCAAATAATAATTACAATGTCTCTGATTCGTTTTACGCCGGGGGAGTAACAAACTATTCAGGATTGATTAAAATCAATGGGAGTACCTTTTCAGGAAATAGTACAAAAGGTACAGGAGGGGCAATTTATAATCATATTGCGAATGGGCAGGTAATTATTAGTAACAGCACAATTGATAGCAATACTGCCTCTTACGGAGGAGCTATTGTTAATGATAATGATGGCAGTACTATAACTATTTATAATTCCACCATTTCAAATAATACTGATTTTGCGGGAACAGGAGTAGGAATTGTAGATTATGGTTATAGTTCAATTGGAATAAGTATATGGAATAGCATTATTTCCAATAGTGCAGGTAACCCAAATTGCAACGATTATTACTTAAATGGAAGTAATAATATAGATAGTAGCAATAACTGCAGATTTACCTCGCCCTCAAGTAATTTAAGCAATACCAATCCACTCCTTGATGAATTAAAAGATAATGGTGGCCCTACCTTGACAAGAGCTTTGTTACCAGACAGCCCAGCGATTGGGTTTGGTAGTCCAAGTATTTGCTCAGCAATACCTGTAAATGGTGTTGATCAGCGTGGCTTCCCTAGACCTCAACCTGAAAATAGTATGTGTGATACAGGGGCGTTTGAGAAGGATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1639
MKLSKLFKRNHSNISKLYLCLPILFSFVIFLGSFVVLTNTQAADEALVDVPGSLSSDLGTTIKSPNAIPKSNSEIFSVSIALQPRNTARLEEIAIGVQNPSSPNYNKFLSDNDFLQEYSPTFQDIDLFKNYFQKTGLQITYISTDRLVLTISGTLEQLDSAFNTKSEKRVASNSSEGFINVVPLKLPANLVARLKGIAGFDTLHKPIANHVIKPVAPSPNYADAGYNTPNSLRSTYNITNSGYNGSGAKVGIVFWSAPIQSDLNLWQNYFGHPLNINIVGNSTPNSDADEANLDVQLVHTAAPNATIRFFVAAHASDSDLITATSTAINDNIQVLSNSWGRCEPSISQSTINAFHNLYMTAAARGIAVFASSGDNGVFECQNSGGTPLAGYGSYPATDNFVTAVGGTRLIRENSNDTWLNETGWNCPVIGGSNDYSCIRSYDGASGGGGISSFFARPVYQSSITPPYASKFVYNPSSSMRVVPDISMDADPNSGSLFYYKGQLYYAGGTSASAPLLAGITALAVQRAEGLVGNINSFIYSNYQGANWHFDITDGYNGVYAAYNWDYVTGLGSIKDVGSFLRTFIVLPTNIILQVTPNPAPYGTPVTFVATITTNGRGVPAGNINFYENSTFLSAAPISNKGTAFFTNANLSPGNHIVYAQFQGDGNFSPSNSTPLTLVINKPLVNIGISTNSILELAGNPITITAKISPLIQSLNLPTPGGTLTFKDYNNILSTMTLPESGIAEYNTNSLAPGRHEIKVEYNGDTTFARATSNQIIETIKVIQTLFIVNDAEDQGAELNGDTEGTLSYALKHANSGDAITFDGIGFIQVKGQLPAVKNGVWIKGWCGTGGPAVIINGLLAPPHTNGLTLEGNNAISGIEISGFKGSQLILAGSRNGFWCSSNKVGGEAAFTNESGINLTFSADPIAFGASLIITAEVKTLFLENSVPTGSIEFYDGDTLLGTTSLNTGDVSSANLVISNLNTGTHNIRAIYSGDSNFKQSYSPSASLLIDKADSLANLTSSHNPVYQGIPVTLTASISSTTSTNLKPTGNVTFKEGPNILGTAPVNNGIATFTFNTLGAGDHTLSAEYSGDSNFNSSLSSTINQTVNQATLVGTGSPASCNETALGTALAHGGKVAFYCGNSPFTITLTSQKTIGIDAVLDGEANVTLSGGNTTRLFYVNNGIHFGLENINIVNGHLSGAAKGGAIYNDGGILNTTNTTFKGNNITVVGRDNEYSYGGAIYNLNGTLNIETSNFISNFMTVGGNCLSTCGVLGIGIFNDGANSSINITSTIFNQNYSSSSNQLTFLGAVLHSANGTIDVENSTFTDNTINPYTNPICCYNQSIAGATAIQNYVGTMTIKNTIFSGNKSVQSDLTRANSQGFFGPIYNSGSLTIEMSKFTDNQGAIFNNTGGSLTINNTLFSNNNYNVSDSFYAGGVTNYSGLIKINGSTFSGNSTKGTGGAIYNHIANGQVIISNSTIDSNTASYGGAIVNDNDGSTITIYNSTISNNTDFAGTGVGIVDYGYSSIGISIWNSIISNSAGNPNCNDYYLNGSNNIDSSNNCRFTSPSSNLSNTNPLLDELKDNGGPTLTRALLPDSPAIGFGSPSICSAIPVNGVDQRGFPRPQPENSMCDTGAFEKD*