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SCNpilot_expt_1000_bf_scaffold_3305_curated_2

Organism: scnpilot_dereplicated_Sphingobacteriales_5

near complete RP 46 / 55 MC: 2 BSCG 41 / 51 MC: 1 ASCG 9 / 38
Location: comp(1686..4622)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor plug n=1 Tax=Pedobacter heparinus (strain ATCC 13125 / DSM 2366 / NCIB 9290) RepID=C6Y305_PEDHD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 49.2
  • Coverage: 978.0
  • Bit_score: 953
  • Evalue 1.30e-274
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 49.2
  • Coverage: 978.0
  • Bit_score: 953
  • Evalue 4.00e-275
TonB-dependent receptor plug {ECO:0000313|EMBL:ACU03218.1}; TaxID=485917 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter heparinus (strain ATCC 13125 / DSM 2366 / NCIB 9290).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.2
  • Coverage: 978.0
  • Bit_score: 953
  • Evalue 1.80e-274

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pedobacter heparinus → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2937
ATGAGGATTATTTGCTTGTTCGGAGTATGTCTTTTTTTATGTTGGTCTGCTTCAGCTTATGCACAAAATGGAAATGTACAGGGTCGCGTTACAGATCAGACAACCGGTAACCCCATAAACGGGGTATCAGTATTTATTGAAGGAACACGGGACGCTACCGCAACCAATGAAAACGGCGATTATTCTATTCTTGGCCAGACCGGTAAAAAAATTATTTTTACGCATGTGAACTATCAGGAGGGAAGTTTAAAAATTGGAACTTCATCAGTCTATAATATGGAACTTATACCTAAGGGAGATACCCTTGGAGATGTAGTTGTAGTAGGTTATGGTACGCAACGCCGTCGAGATGTAACAGGTTCTGTTGCCTCCTTATCAAAAGACAGGTTACAACAACTTCCCAATTCTAATCTATATCAGGCCATACAAGGCTCGGTACCGGGCGTTTTTATTGCAACAACATCTGCGGGCGCAGAAGGTAGTGGGATGTCGGTATTGATCAGAGGACGAAAATCTATTACAGCAAATACAGATCCGCTAATTATACTTGATGGCATTCCTTTCACCGGCAGTATTTCAGACATCAATCCTAATGATATTGAAAGTGTCGATATTCTTAAAGATGCATCGGCTGTGGCAATTTATGGCTCCCGCGGCTCAAACGGTGTTTTTATTGTCACCAGTAAACAAGGGAAAAAAGGAGTATCCATTACATACGACGGCTTTTACTCTATACAAACACTCACTAATAAGCCGCGATTATTAACAGGGCCAGAGTTTTATGACTTTAAAAAGAATAGAAAAAATTCTAATAATGTTATTACTCCACAAGAACAGGCTGTTTATGATTCGGGAAAATGGATTGATTGGTACGATTTGGCCACTCAAAAAGGTATAAGGAGGCAACACTCATTGGCAGTATCAGGCGGCGCCGAAAAAATTAATTATTACGTTGGCGGTACCTATTTAAATGTTACCGGAGTTTCTAAAAACGACGATTTCAAACGTTATTCTTTAAAGCCTTCTTTAAACATCAAAGTTACTCCCTGGTTAACGTTTGGCTCAACCTCTCAGTTATCTTTTATTGACAGATCTGGCTTACCTGTACAGTTTGATGATGTTTCAAATACCGGCAGTGGGGCCAATTTTTTTAATCCGTTGACACAGCCTTATGACTCAAGTGGAAGTATAGCTGTTTATGCTTACGAAGATTATACGCAGGCAGGTAACCCTTTGAGTAATTTACTTGTTCTAAATACAGATAACGCTTATAAAGTTTTTACAGCAAACAATATAAAAATTGATTTTCCTTTTTTACAGGGGCTTTCATACAAATTAAATACAGGTTTAGAATATGATAACATAGCCCGTAAAACTTATTACGGAAGAAATGTTGCTGACGGTTTAGAGTTGAAAGGACGTGCGGTCAATTATAATTCGATTAGCAGAAGTTTTACAGTTGAAAATATTTTGAACTATGCCCGACAGTTAAAAAAGCATAATTTAGATGTAGTGCTGCTATATAGTAGCCAGTCAGAGGATTTTGACAGGGATCAGTTGACAGGAACAGGCTTCCCCAACGATGTATTGACAAATTATCAAATGAATTCAGCCAGTCTTCTTGTGCCAGCCATTTCAAATACAAAGTCGAATCTTATATCCCAGATGATAAGGCTTAATTATGGTTTTGACAGCAGGTATTTACTAACCTTAACCACAAGAAGGGACGGATACTCCGCTTTTGGCGAAGGGAAAAAATATGGAATATTTCCTTCCGTAGCAGTGGCATGGAATATTGCGAGTGAGCCATTTATCGCCAATTCCGATCTTTTCGATTTGTTAAAATTAAGAGCATCATACGGTGAAAATGGTAATCAGGCTGTAAGCCCTTATTCATCGCAGGCAACTCTAACCTCAGCTCCATATTTGAGTGGAGGTGTTGTGTATCCCGGTTATATTCCCGATAGATTAGGCAACGAAAACCTTGGTTGGGAATCAACCACTTCTGCAACAATCGGGCTTGATTGGGGAGTATTAAAAAACAGAATCCGCGGGTCGATTGACTATTATCAGTCCAAAACACACGACTTATTATTGCGCCGGATCATTTCTTCTGTTCATGGCAGTGAATCTATTGTACAAAATATTGGCAAAACCGCCAATCAGGGGATAGAGATAGGAATAACCTCAACAAATATCGAAACCGATAATTTTAAATGGACAAGTAATGTAAATTTTTCTTTCAACAAAAATGAAATTCTGGAGCTTTACGGTACAAAAACAGATGATATTGTTAACAGGTGGTTTATTGGGCAGCCGATAAGGGTGTATTACGGGTTAGAATATGATGGGATATTTAGAACGGCAGAAGAAGTTGCGGCATCCGCGCAAAAAGATGCTCAACCCGGCTGGGTAAAAGTAAAAGACATAAATGGCGATTCGATAATCAATACAGCATCGGACAGAGTCTTACTTGGCCAGTTAGATCCAAAATACATTTGGGGGTTTTCAAATAATTTGAGTTACAGGAATTTGGCTCTCAGTGTTTTTATTCATGGCGTTGGGGGCAATCAAAAAGCAAACCCTTTTCTTTCTGATAATGTTTTTGGGGATATACGTAGAAACACAACAAAAAAAGACTGGTGGTCAGAATCAAATCCAAGCGGAACCCATTTTGCAAACGATCAAAACGCCAACAAGCTAAGTGTGTATCCGTATGAAAATGGAAGTTTTGTTCGCTTAAAAGATATTTCACTCAGCTATACGTTTCCAAACCAAATAATTCAAAAGGCTAAATTGACGAATCTTAAAATTTATGTAACTGCCCGAAATCTGGCAACTTTCACAAAGTATCAGGGGCTTGATCCCGAATTGGATAATCAATTTGGTTTGCCTTTACAAAAAGAATTTTTATTTGGACTCACTTTGACTTTATAA
PROTEIN sequence
Length: 979
MRIICLFGVCLFLCWSASAYAQNGNVQGRVTDQTTGNPINGVSVFIEGTRDATATNENGDYSILGQTGKKIIFTHVNYQEGSLKIGTSSVYNMELIPKGDTLGDVVVVGYGTQRRRDVTGSVASLSKDRLQQLPNSNLYQAIQGSVPGVFIATTSAGAEGSGMSVLIRGRKSITANTDPLIILDGIPFTGSISDINPNDIESVDILKDASAVAIYGSRGSNGVFIVTSKQGKKGVSITYDGFYSIQTLTNKPRLLTGPEFYDFKKNRKNSNNVITPQEQAVYDSGKWIDWYDLATQKGIRRQHSLAVSGGAEKINYYVGGTYLNVTGVSKNDDFKRYSLKPSLNIKVTPWLTFGSTSQLSFIDRSGLPVQFDDVSNTGSGANFFNPLTQPYDSSGSIAVYAYEDYTQAGNPLSNLLVLNTDNAYKVFTANNIKIDFPFLQGLSYKLNTGLEYDNIARKTYYGRNVADGLELKGRAVNYNSISRSFTVENILNYARQLKKHNLDVVLLYSSQSEDFDRDQLTGTGFPNDVLTNYQMNSASLLVPAISNTKSNLISQMIRLNYGFDSRYLLTLTTRRDGYSAFGEGKKYGIFPSVAVAWNIASEPFIANSDLFDLLKLRASYGENGNQAVSPYSSQATLTSAPYLSGGVVYPGYIPDRLGNENLGWESTTSATIGLDWGVLKNRIRGSIDYYQSKTHDLLLRRIISSVHGSESIVQNIGKTANQGIEIGITSTNIETDNFKWTSNVNFSFNKNEILELYGTKTDDIVNRWFIGQPIRVYYGLEYDGIFRTAEEVAASAQKDAQPGWVKVKDINGDSIINTASDRVLLGQLDPKYIWGFSNNLSYRNLALSVFIHGVGGNQKANPFLSDNVFGDIRRNTTKKDWWSESNPSGTHFANDQNANKLSVYPYENGSFVRLKDISLSYTFPNQIIQKAKLTNLKIYVTARNLATFTKYQGLDPELDNQFGLPLQKEFLFGLTLTL*