ggKbase home page

scnpilot_solids2_trim150_scaffold_133_93

Organism: SCNPILOT_SOLID2_TRIM150_Phage_3

RP 0 / 55 BSCG 2 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(94513..96939)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Lysozyme {ECO:0000256|RuleBase:RU003788}; EC=3.2.1.17 {ECO:0000256|RuleBase:RU003788};; TaxID=631 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Yersinia.;" source="Yersinia intermedia.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 46.9
  • Coverage: 143.0
  • Bit_score: 128
  • Evalue 6.00e-26
gene0068; phage lysozyme; K01185 lysozyme [EC:3.2.1.17] similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 47.5
  • Coverage: 139.0
  • Bit_score: 120
  • Evalue 2.10e-24
Lysozyme n=1 Tax=Pantoea stewartii subsp. stewartii DC283 RepID=H3R8Z1_ERWST similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 49.6
  • Coverage: 139.0
  • Bit_score: 125
  • Evalue 2.10e-25

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Yersinia intermedia → Yersinia → Enterobacteriales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2427
ATGCCTACACAACAACCTGTTCAAAATCCGATATTAAATTTCTCATCTTACACCGTCAAAAATATATTGATGGCTTACACTACTACATCTGATGCAGTTAATACTAAAATAGATTACACAGTAGGGAAACCCGGATCAATTGTTAAAGGTGCTGGGTGTGGGAAAGATGGCGTTGTTGTCGTTAATGAATTTGTAGATTATCAATTCATAATTCATTCTCATGATAACGAATTCACGTTTCATTCGTATTTTGATCATTCTACGTCTTCAATGACAGGATCAATAACGATTGTGGATAAAGTAGCTGGATTATTTCAGGATTTTTTAAGAACTGAAGTCGCCAAGAAATTAAATGTATCTCAAACTCATATTATATTTGCATTAAAAACTTATATTATTGGAACGAAAAAAGATCATAGTGAACAAATTATTCCTATTAAACCATTAATTTTCCATATGTATAATTTAACACAATCATTTAATAAAGAATATCCATTAAATTATTATACGTTAATGTATGTTGCAGATTATAATACTTTTGCACTTTTGCCAAACTACTCAAACACATTCCAGATGACTATCACTCATAAAAATAGTTCTTCACCAAGTGATTTTTCAGCATCAAATTTAAATATTCCACCATCAACGCCCAATATTGTTCCTACAAATACTCCACGATTAACTCCAACTGTTACTATTACTAACACAGTACCGATTTCACCTACTCCAACAATTACTGGTGGTACAAATCCATGTACATTAACAATAAGTGAAAATGGTAGAAGCATTATCAAAAATTTTGAAGGTTTAAGTTTGACAGCGTATTTTGATGTTAACGCATGGGCTATTGGATATGGTCATCGTCGTGGAGTTAATGAAGGTGACATCATAGACAATTCACAAGCAGAACAATTTTTGACGGAAGATTTACAATGGGTCAATGCGTATGTATGTAATAATGTAAAAGTTCCATTAAACCAAAATCAATATGATGCATTATGCAGTTTAACTTATAATGTGGGAAGTTATCCTACATTATTATCCAATTTAAATGCTGGTGATTATAATCAAGCTAAAAATGATTTTGCTTTATATTGCAATAGTGGTGGAAAAGTTAATCAAGCATTGGTTAACCGTAGAGCACAAGAAGCTGCATTATTTGACGGACAACCTCTACCGACAGGAAATCAACCATTACCATTACAACCAAGTGCCGGGTTAGCTACTACACGCACGATAAACACAGATGCCAGATATCGCGGCTTAACTTCTAATAGAAACACACGCATATCTAATAACAAAACGATGTTAACCTTAAAAGATATTATGGAAGGTTTTGAATCGGCATTAAAAGATACTACAACACCGCCAGAACCAAGATTATCATCATGGATGGCATCTATTAATCAAAATTATGTAAATCCATTAATCCCCGATGATCAGAAGAAATCAAAAGGTGTATTACCTATAGATTATTATATTAGATTAGACGACGTGTATAATGATTATGTAATTGATAATAGAAACATTCCATTCGAACAAAATGACCAATCACAACTTATTGGTGGAATCAAATCATTCCAAGTAAAACCGGGAAAAATGATTACAAAAACCATAAACAATTTAATGAAATTATCTAATCAAGTTGGTGAAGATGCTAGAGATGATATTGACAATCAAAAAAGCTACAAATGTAATATTTCAACTATAAAAACATGCGACGAGAAATATCAATTTGATATTCATATCACACGTTATGTTGTTCCTAAAAATAATGGCACAATTGACACTGGACCGGGAATAGGTGAAGGAGCCTATAAACCTTTAGAATTTTCATATCAAGAAACATCAAAGACTCGTGACATTCTTGATGTTGGAATGTCGTTATTTTCAAATAACTCATTAGGCATTTTAAGTCAGCCTAATAACAGTCAAGACAATAGAGCTTTGTATGGCAATCGTGAACAAATTATGTTAGAAAGAAATCCAGAACAAGAATTCTTCAAAACATCATATAGTGGTGTCAGAGGCATGGCGAATCCAAAAAATTATGGATTGGAAAGACCTAATGGCCCTGTTTATATTGATAATCTTATAAAAACTAATTTAGCACAAACAACAAAATTAATGATAACTATCATGGGTAATCCATATTTGTTGTCAGATTTATTCCGCAATCCTATAAAGGTTATGTCAGAAGATGACGATAATCCATATTATTATAAGTATCCAGAATATTATCCCATGTATGCAAAATTGAACATTTTCATAAAACCATCTACCACCATCGGAGAAAAATTAGATAAAAATACACCTAAAAAATATTATTACAGTGGATATTATCATTTGGGTAAAGTGAAAACTAGTATCACTTCAAGTTTCTTTAATCAAATATTAGAATTATATAGAACGGATGACGTGACATGA
PROTEIN sequence
Length: 809
MPTQQPVQNPILNFSSYTVKNILMAYTTTSDAVNTKIDYTVGKPGSIVKGAGCGKDGVVVVNEFVDYQFIIHSHDNEFTFHSYFDHSTSSMTGSITIVDKVAGLFQDFLRTEVAKKLNVSQTHIIFALKTYIIGTKKDHSEQIIPIKPLIFHMYNLTQSFNKEYPLNYYTLMYVADYNTFALLPNYSNTFQMTITHKNSSSPSDFSASNLNIPPSTPNIVPTNTPRLTPTVTITNTVPISPTPTITGGTNPCTLTISENGRSIIKNFEGLSLTAYFDVNAWAIGYGHRRGVNEGDIIDNSQAEQFLTEDLQWVNAYVCNNVKVPLNQNQYDALCSLTYNVGSYPTLLSNLNAGDYNQAKNDFALYCNSGGKVNQALVNRRAQEAALFDGQPLPTGNQPLPLQPSAGLATTRTINTDARYRGLTSNRNTRISNNKTMLTLKDIMEGFESALKDTTTPPEPRLSSWMASINQNYVNPLIPDDQKKSKGVLPIDYYIRLDDVYNDYVIDNRNIPFEQNDQSQLIGGIKSFQVKPGKMITKTINNLMKLSNQVGEDARDDIDNQKSYKCNISTIKTCDEKYQFDIHITRYVVPKNNGTIDTGPGIGEGAYKPLEFSYQETSKTRDILDVGMSLFSNNSLGILSQPNNSQDNRALYGNREQIMLERNPEQEFFKTSYSGVRGMANPKNYGLERPNGPVYIDNLIKTNLAQTTKLMITIMGNPYLLSDLFRNPIKVMSEDDDNPYYYKYPEYYPMYAKLNIFIKPSTTIGEKLDKNTPKKYYYSGYYHLGKVKTSITSSFFNQILELYRTDDVT*