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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_479_curated_23

Organism: solids_Sphingobacteriales_4

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: comp(25576..28845)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-denpendent receptor n=1 Tax=Flavobacteriaceae bacterium S85 RepID=UPI0002559D85 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 38.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 753
  • Evalue 3.60e-214
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 40.0
  • Coverage: 992.0
  • Bit_score: 747
  • Evalue 8.20e-213
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:ACU62253.1}; TaxID=485918 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Chitinophagaceae; Chitinophaga.;" source="Chitinophaga pinensis (strain ATCC 43595 / DSM 2588 / NCIB 11800 / UQM; 2034).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 40.0
  • Coverage: 992.0
  • Bit_score: 747
  • Evalue 3.70e-212

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Chitinophaga pinensis → Chitinophaga → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3270
ATGAAAATTACCACTATTCTTCTGCTTTCGGCCTGTTTATCTGTAAGTGCAGGCTCTCTTGCGCAGAAAGTAACCTTATTACAAAAAAATGTGAAGCTCGAAAAAGTTTTCAAAGAGATCAGAAAACAGACCGGCTATGTATTTTTTTATGACACCCGGATATTGCAGAGAGCAAGATCTGTAGATATCCATGTAGAGAATGTGCCGGTAGAAGAAGCGCTTAAAGAGAGCCTTCGGGGGCAGCCGCTTGATTTTTCCATTGAGCGGAAAACGATCACCATTTTTCAAAAGGCGGATTATTCTTTGAATAAAAAGCCGGTGAATGTTGAATATCCGGATATGGAGATGCTTACTCCCCTTAATATTATTACGGGAACAGTAAAAGATGATAAGGGGCAACCTCTTGAAGGGGCAACTATCTTAGTGAAAGGCGCCCAGATTGGAACTAAATCTGACGTAAACGGCAACTTTTCTATAACCGCAGAACCTAATTCAACTTTAATTATTTCTTATGTGGGATTTGAGTCTATAGAAGTAAATATAGGAAACCGGACCAACAATATATCAGTGCAGTTGAAACCATCGGTCGTAACTGGCGGTGAAGTAGTGGTAGTGGGGTATGGAACACAAAGCAAACGAAACATCACATCTTCCATAAGTTCCGTATCATCAAAAGATATTTCGAATTATCCGGTGCAGCAGGTGGGCCAAGCCTTACAAGGGAAAGTAGCTGGATTACAAATTATTCAAAATTCAGGTTCACCAGGCTCCGCATTGACAGTCAGGATAAGAGGAATAGGAACAGTCAACAATAGCGATCCTTTATATGTGATTGATGGTAATTTAGGGGCTAATCCGAGTAATTTAGATCCTAATAATATTGAAACAATTGAAGTATTAAAAAGCGCCTCTGCTGCAGCAATTTATGGAGCACAGGGTGCTAATGGAGTAATACTGATAACAACAAAGACAGGTGTTAAAGGACCTGCGCAAATAAATGCAAATCTTTATAGTGGAATTCAGCAGGCCCATAGGTTTATGCCAATGATGAATGCTAAGCAATACGCTACTATTTATAACGAAGCATTAGTTAATGGTGGAAGAGCGCCTTTATTCACAAATGTTGAATCATTAGGCGTTGGAACTGATTGGCAAGATGCGATTTATAGAGTAGCCCCCGTAAATAATGTGGAACTTTCTGCCAGCGGCGGCACCGAACAAGGAAAGTATTATATTTCGGCCGGTTATTTTGATCAGAAAGGAATTGTTCTTTCAACTGATTATAAAAGAATTAATTTCAGAATTAATTCGGAATATAAATTAAGACCCGCTATCACTCTGGGGGAAAATTTATCATTGAGTTATGCAGTGCAAAATACAATTTTTGCACGTGGTATAAATCCGGTGGCTAATTCATGGAGAATGGACCCAACTGCTCCCATTAAAAATCCTGATGGTACCTGGGGATATCCAAAATTTGCAGACACCAAAAATCCTGTGGCTGAACTTTATTTTAATAATAATACAGACAAAATACCTGTTTTCAATGGAAGTGTTTATTTAGATATTAAGCCCTTTAAAAATCTGGTTTACCGAAGTCAGATTAATGTTAATTTAGGTTTTACCAATAATTACAATTTTCTTCCTACCTATGATGTTTTTCCATTAATGCGGAATCTGACTGCCCAGTTATCACGGAGTGACTATAAAACGACGAATTACGACTGGCAAAATACGTTAACATTTAAAAAAATTCAAGGACATCATGATATTACTGTTCTTGGCGGTATTACAGTGCAATCAAGTTCTTCAGAAAATATCTCTGCTTCCGGACAAGGTGTACCTGTAAACGCCAATACAGATGAAAATTTGCGCTATTTAGATCTCGCAAAACTCGGACAAACTGTATCAGGAGGTGGAGGTGATTTTAGTATGTTATCATTTTTAGGAAGAGTGAATTATAGTTACAAGGGTACTTACTTGTTCACCGGTAATTTTCGTGCAGATGGATCTTCCAGATTCGGGCGGAATAACAGGTTTGGTTACTTTCCTTCATTATCGGCGGGATGGAGAATTTCTGATGAAAGTTTTATGGAAAATATTTCTTTTATAAATGATCTTAAAATAAGAGCAGGCTGGGGAATGCTGGGAAACCAAAACTCTCTATCTAATTATAGTTTTGCTAATAGTTTAACCTCTAACCTGAATTATGTATTTGGGTCAAATGTCGTACAAGGGCAGGCACTTACAAGCCAAGGAAATCCAGATTTAAAATGGGAAGCTACAACAGAAACTGAAGTAGGTTTCGATTTTACCGGTTTTGAACACCGGCTTACTTTATCCGTGGGTTACTACAATAGAAAGACAACAGATATGTTGTTAAGAGTCCCAATCCCTGCTTTTACCGGAGTTCAGACGCCAGGGTTTACCAACGGGGGAGATGTGTTGAATAAAGGTATTGAAGTTTCTCTCGGATATCGAAAAACAACCCCAGGTGCATTCTTATACGATGTTTCAGCTAATTTATCGCACAATACCAATCAGGTAACAAGGTTAAGTAATTCTTTGGCTTTCATTACCAGTGGAAACGCCAGAACTACTGTTGGTTCTTCTATAGGTGAATTTTATGGATACGTGATGGATGGGCTATTTCAAACCAATGCTGATGTACAAAAACATGCTTTTCAGAGTAATGGGACTGCTCCGGGTGATATCCGATTTAAAGATTTGAATGATGACGGGGTGATTGATCAGAATGATAGAACAACAATTGGTAACCCCTGGCCTGAATTAATGTATGGGGCTACTGCTAATTTTGGATGGAAACAGTTTGATTTGAGTTTAGCATTACAGGGAGTATATGGAAATGACATTTATGCAAATTGGAAGTCAGGAACTGAAGGAAGTAATTTTTTCAATTATGACCTAAGGATGCTTAATGCCTGGAAAAGTGAAGGGTCTAGCAATTCTATCCCTAAGGTCAACGTGAATAATCCTAATAATAATCTGAGAGAATCTACCTATTTCGTTGAAAATGGATCTTATTTACGCTTGAAACATATACAGCTTGGATATACTTTGCCCTTGAAGAATAAAAATGTATTTAAGAAAATAAGGATTTATATCGCATCAGAAAATCTGCTTACGTTTACCAAATATCCTGGTTTTGACCCTGAAATTAGTAATGGATCTTCGTTGAGTATCGGGCAGGATAGCGGATTATATCCACAGCCCCAAACTATTACAGCAGGTGTGAATCTCGACCTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1090
MKITTILLLSACLSVSAGSLAQKVTLLQKNVKLEKVFKEIRKQTGYVFFYDTRILQRARSVDIHVENVPVEEALKESLRGQPLDFSIERKTITIFQKADYSLNKKPVNVEYPDMEMLTPLNIITGTVKDDKGQPLEGATILVKGAQIGTKSDVNGNFSITAEPNSTLIISYVGFESIEVNIGNRTNNISVQLKPSVVTGGEVVVVGYGTQSKRNITSSISSVSSKDISNYPVQQVGQALQGKVAGLQIIQNSGSPGSALTVRIRGIGTVNNSDPLYVIDGNLGANPSNLDPNNIETIEVLKSASAAAIYGAQGANGVILITTKTGVKGPAQINANLYSGIQQAHRFMPMMNAKQYATIYNEALVNGGRAPLFTNVESLGVGTDWQDAIYRVAPVNNVELSASGGTEQGKYYISAGYFDQKGIVLSTDYKRINFRINSEYKLRPAITLGENLSLSYAVQNTIFARGINPVANSWRMDPTAPIKNPDGTWGYPKFADTKNPVAELYFNNNTDKIPVFNGSVYLDIKPFKNLVYRSQINVNLGFTNNYNFLPTYDVFPLMRNLTAQLSRSDYKTTNYDWQNTLTFKKIQGHHDITVLGGITVQSSSSENISASGQGVPVNANTDENLRYLDLAKLGQTVSGGGGDFSMLSFLGRVNYSYKGTYLFTGNFRADGSSRFGRNNRFGYFPSLSAGWRISDESFMENISFINDLKIRAGWGMLGNQNSLSNYSFANSLTSNLNYVFGSNVVQGQALTSQGNPDLKWEATTETEVGFDFTGFEHRLTLSVGYYNRKTTDMLLRVPIPAFTGVQTPGFTNGGDVLNKGIEVSLGYRKTTPGAFLYDVSANLSHNTNQVTRLSNSLAFITSGNARTTVGSSIGEFYGYVMDGLFQTNADVQKHAFQSNGTAPGDIRFKDLNDDGVIDQNDRTTIGNPWPELMYGATANFGWKQFDLSLALQGVYGNDIYANWKSGTEGSNFFNYDLRMLNAWKSEGSSNSIPKVNVNNPNNNLRESTYFVENGSYLRLKHIQLGYTLPLKNKNVFKKIRIYIASENLLTFTKYPGFDPEISNGSSLSIGQDSGLYPQPQTITAGVNLDL*