ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

scnpilot_solids2_trim150_scaffold_117_curated_83

Organism: solids_Bacteroidetes_1

near complete RP 49 / 55 BSCG 46 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: comp(106476..111059)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
PKD domain containing protein id=4128364 bin=GWF2_Bacteroidetes_38_335 species=Haliscomenobacter hydrossis genus=Haliscomenobacter taxon_order=Sphingobacteriales taxon_class=Sphingobacteriia phylum=Bacteroidetes tax=GWF2_Bacteroidetes_38_335 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=a11 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 25.9
  • Coverage: 873.0
  • Bit_score: 252
  • Evalue 3.70e-63
conserved repeat domain protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 24.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 229
  • Evalue 8.10e-57
Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_35_15_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 25.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 341
  • Evalue 6.50e-90

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_35_15_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4584
ATGAAAAATTTATTTACGATTATATGCAGCGCATTTCTAACGGTTAGCAGTTTTGCTCAGATAAATTGTCCTAACTTTGGGAACTTTCAAACAATTATATTTAATGGTTGCACACCACTGCCGTACAATTATTCAACAGTAAACGGAGTAATAACTACCACACCGTTGGTAACTGCACTTTCGAATTATGCAAGTTGTGGTGCATCAATAGAAAACAATCAATTTTTTGCATTTAATGCAACTGCTACAACCATGGCATTTACAATAAATCCGGGAACTGTTTCCGGAGGGCTGCAGGCGTGGATTTATAGCACAAATGATTGTATTACACCAACTGTATTAGCATGTAATAGCAATGGTTTTACTACGCCAACAACTTTAAGTTCAAGTAGTTTTATTCCAGGACAAACCTATTACATAATGATTGATGGATTTGCAGGAGCAACCGGAAACTACTCGTTTTCCAACATTACACCTGCACCGGGCAGCGGTGGCCAAAATGGTAGCACATTTCCATTAGCTTTTAATATTGATTCAGCCTCATGTGGGCTCACAGATGGTAGTTTGGAAATAACAGCAACAGGTGCAACGGCTCCATACACTTATTCGGTAAATGGAAGCCCGTTTCAATCGAGTAACATTTTTACCGGTTTAGCTGGTGGAGTTTACAATATAGTAGTAAAAGATAATAGTTCTTGTTCTTCTTTGGATACAATTAGTGTACCGGCTCGTGATACACGTGCTTCTGAAGATTTAATTTATTGTGCAAGTGCCGGACCTGTAACTATTACTGCAGTTGGTGGTACACAGTTTACATGGACACCGCAAACGGGAATTGTTTCCTCTTCACAAAACGGAGCTACAATTGTAGTTGCACCTTCACAATCTACAACTTATGTGGTTTCCAGCAACGAACCTCAGCAGCAATGTAAATATTTAGATACTGTGCATGTAACAGTAGCCGGTAGTTTTGCAACCGCTGTTTCAGCAACCAAAACAACAATTTGTTTAAATGAAAGTTCAACACTTAGTGTAGTGGCTACACCCTCTACAGAAGGACCGTTTACTTATAGTTGGACTCCGGTGTTGAATAACGCTTCTCCAAGCGCTGCAACAACTATTGTTCGCCCAACAACTACTACACAGTACAACTTGTTAGTTACTTCAAGAGATGGTTGTAAAATGAATGATAGTATTTCAATTGATGTACAAGGTTTTGGACCCAAAGTGAAAATAACACCAAGTGCAAATTATGTTTGTCCGGGCACAACTGTTCAACTAAACTCAGAGATTGTAGCAATACAAACAGGACCGAGTCAAGATCCGGGTAATGCTTGCCCTAATTGCAATTTCCCTTTTCCTTTTCCTCAAATTGGAACAGGAACAGCAACTTCTTCAAGCAACCCTACTCCATTTAAATCATTGTGGCACGATGGCAGAACTCAATATATCTATTTAGCGAGCGAAATGCAGAATGCCGGTATGACAGCCGGAGTTATTACTGATTTGCAATTCTATGTAGCAAGTAAAGGAAGTGGCACAACTCCGTTTTCGGGATTTACAGTTAAAATGGGAGGTACAACATTAACTCAGTTGCCTAATAGCTTTGTAACTCAAAATATGTATGTAGTTCACACCAGTAACTATACAACTACTGCAAATTCATGGAACAATATACCATTAAATATTCCTTTTAATTGGGACGGGCAAACCAATTTAATTATTGAAGTTTGTTACGATAACACTACATGGACAGGCTATGATTATATTCAATACAGCACAGCATTTACTAATGCCACTATCTATAACTATAAAGATAACGATGTTGGATGTACATTGCCTTACCAATACAATACAAATCTTCGCCCCAATTTAAAAATGGTTTATGGTGAATTGCCGTTAAATAATGTTTCGCTTTTGTGGACTCCTTCACAAGGTTTAAGCAGCGATACTGCACAGAACCCATTTGCAACAATTACTAGTGATATTTCGTATAAACTTACAGTTGTTGATGGAACTTGTTCGGGCGATACAACAATTCAAATGTTTGTTGATACAGGAACAAAAATTAAAGCTGTTGATGATATGATTGTATGTAACACAAGCGAGGCAATGCTTACGGCTCAAGTGCTTAATAAAGTTCAGCCAACTTGTGTAGCAGATTATTCGGTTGTATCTACTGCTGCTAATTATTTAAGTGGAACGGGAAAAGTGCCTGTGCCATTTTCAACAGCTTCAACAGGGAATAATAGAAATGCCACAATACAATTGCCATTTAAGTTTAATTACTACTGTGCAGGCTATGATTCATTTGTGGTAAATGAAAATGGATTTATTACTTTTTCAAACTTTAATGGTTCTGGAGCTACTCCTGTAGCAATGCCTGCAGCCGGAACACCTAATAATACTATTGCAGGTTTGTGGTTCGATTTGAATGCAAATGCAAATGGCGGAGGAAGTGGAACTGTTTCTACTTTTGTAACAGGCTCTTATCCATATCGTACCTACACAATTGAGTGGGATAATGTATTGGCACAAGGGTTAGGAACAACAGTTAGCTTCCAAATTCAACTTTTTGAAACAACAAATAATGTGGAAGTACATGTAAATCCATTTTCTGCAGCTTCCAATAAAGTTATTGGTATTGAAAATGTAGGAGGCACGGTAGGCACTACGCCAACTGGGCGAAATGCTGTTAATTTCTCATTAGCAGCCGCAGAAGGTTGGAAGTTTATTCCAAATGTACAAGGTGCAGGTTTTGTGGCTTTCCAATGGAGCCCCACAAGTACTTTAAGCTCTGAATTTGGAGATACAGTATATGCTACGCCAAATGGCAAAACAGAGTATGTTGTTTCCGGCTTATTCTCAAATGGCTGTATAACTACAGACACAGTAAGCGTAGATGTAAAACATTTTCCTTACACACTTACTGCGGTTGCAGATACTTTGTGTCCGGGAGAAACCAGTACATTAACGTTTACAGGAGGTGGACTTTCTTCTATTTCATGGAGTCCGGCCAATTTGGTTAGTTCTCCAAATGCAGCAGTTACCACGGCTTCACCTACAGCACCAACTAATTTTGTAGTAGTAGCTGCGGATACTGCCGGTTGTGTAGTTAGAGACACTTTGCCTGTTTTTGTAAAATCAAATGGGGCAGTTTCTTTAGGTAACGATACTTCAATTTGCTATAATCAATCATTAACATTAAACCCGGGAAGCGGTTTTGTACAACATACTTGGAATCCTGGTGGAGAAACTACACAGACTTTAACTGTTAATACCAATGGTAATTATTTTGTAGTGCTTTCTGATGGAAAATGCACATTTAATTCCGATACAATAAATGTAAAGGTAATACCGTCAATTACACTGCAAGCATATAGTGATACAACTTTGTGTGCCGGGCAAACAGCTAATTTGAGTGCAGAAATCGGCTATACAAATTACTTGTGGAGTACAGGAGCACAAACAAACAACATCAATGTAAATGCTGCCGGATTTTACACTTATTCTGTAGTAGATTCATTTGGTTGTAAACAATTTTCAGATACTGCGGAAGTAAAAGTTACCAATGCTCCGGTGATAAATTTGGTAGCAACTCCACAGAGAATTTGTTCTGGTGAGTCTTCTGTGTTAAATGCAGGCAGTTTACAAGGCGTTACTTATACATGGACCAAACCAAATGATAATAATCAATACCAAGGCGATACAACTATTGCACCAAGCGTAGGAACTTACACTGTAACGGCAAGCGATCATGGTTGTGCTTCTTCGGGCTCAATAGATATTTTGGCAGCAAGCAATCCTGTGGTTTCAGTTGGAGGAGATGTGAATGTATGTGCTTGTGATACCTCAATCACATTAAATAGCGGCAGCACCGATGCGTTGGATTCATTCTTGTGGAATACAGGAGAAACATCTTCTTCGGTATCTGTTTCAAGTTCAAATGAATATGTTGTAGCAGTAATTTCACAGTATGGTTGCATAAGCCGCGATACCGTAAATGTTGGTATTCGCTGTTTAAAAGTTGTAGCTACAGCTGATAAACATGAAATAATAAAAGGGCAATCTGCTACTATTTCTGCTGATAGCATTTCCTATAATGGCACTTTTGGATATGCTTGGCAACCTGAAAGTTTCTTGGCAGACCCAACTGCAAGTTCAACTGCTGCAACTCCGGATAGTTCAATTACTTACTTGGTGAAAATTACTGATACAGAAAACGGCTGCGTAGCAACTGATACGGTTAGAATTTCTGTAACACTGCCGGGAGTTTATGCATTCCCAAGTGTATTCTCTCCAAATGGAGATGGTAAAAATGACCGTTTTGGACCATATCTGCCAGCAGGTTCTTCAGCTAAGTTCTCTTATTTTAAAGTATATAACAAGTGGGGACAAATGGTGTATGAGTGCAACGATTGTGATTTTACACAATCTACAACTGGCTGGGACGGTGTATTTAAAGGTTCTGAACAACCTGTTGGTTCTTACCTATTTGTAACCGAAGTGAAGGTGCCAAACAACAATGACCCAACCAAGTATGATACTCAGGTAATTAATAAATCATTTACCTTAGTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1528
MKNLFTIICSAFLTVSSFAQINCPNFGNFQTIIFNGCTPLPYNYSTVNGVITTTPLVTALSNYASCGASIENNQFFAFNATATTMAFTINPGTVSGGLQAWIYSTNDCITPTVLACNSNGFTTPTTLSSSSFIPGQTYYIMIDGFAGATGNYSFSNITPAPGSGGQNGSTFPLAFNIDSASCGLTDGSLEITATGATAPYTYSVNGSPFQSSNIFTGLAGGVYNIVVKDNSSCSSLDTISVPARDTRASEDLIYCASAGPVTITAVGGTQFTWTPQTGIVSSSQNGATIVVAPSQSTTYVVSSNEPQQQCKYLDTVHVTVAGSFATAVSATKTTICLNESSTLSVVATPSTEGPFTYSWTPVLNNASPSAATTIVRPTTTTQYNLLVTSRDGCKMNDSISIDVQGFGPKVKITPSANYVCPGTTVQLNSEIVAIQTGPSQDPGNACPNCNFPFPFPQIGTGTATSSSNPTPFKSLWHDGRTQYIYLASEMQNAGMTAGVITDLQFYVASKGSGTTPFSGFTVKMGGTTLTQLPNSFVTQNMYVVHTSNYTTTANSWNNIPLNIPFNWDGQTNLIIEVCYDNTTWTGYDYIQYSTAFTNATIYNYKDNDVGCTLPYQYNTNLRPNLKMVYGELPLNNVSLLWTPSQGLSSDTAQNPFATITSDISYKLTVVDGTCSGDTTIQMFVDTGTKIKAVDDMIVCNTSEAMLTAQVLNKVQPTCVADYSVVSTAANYLSGTGKVPVPFSTASTGNNRNATIQLPFKFNYYCAGYDSFVVNENGFITFSNFNGSGATPVAMPAAGTPNNTIAGLWFDLNANANGGGSGTVSTFVTGSYPYRTYTIEWDNVLAQGLGTTVSFQIQLFETTNNVEVHVNPFSAASNKVIGIENVGGTVGTTPTGRNAVNFSLAAAEGWKFIPNVQGAGFVAFQWSPTSTLSSEFGDTVYATPNGKTEYVVSGLFSNGCITTDTVSVDVKHFPYTLTAVADTLCPGETSTLTFTGGGLSSISWSPANLVSSPNAAVTTASPTAPTNFVVVAADTAGCVVRDTLPVFVKSNGAVSLGNDTSICYNQSLTLNPGSGFVQHTWNPGGETTQTLTVNTNGNYFVVLSDGKCTFNSDTINVKVIPSITLQAYSDTTLCAGQTANLSAEIGYTNYLWSTGAQTNNINVNAAGFYTYSVVDSFGCKQFSDTAEVKVTNAPVINLVATPQRICSGESSVLNAGSLQGVTYTWTKPNDNNQYQGDTTIAPSVGTYTVTASDHGCASSGSIDILAASNPVVSVGGDVNVCACDTSITLNSGSTDALDSFLWNTGETSSSVSVSSSNEYVVAVISQYGCISRDTVNVGIRCLKVVATADKHEIIKGQSATISADSISYNGTFGYAWQPESFLADPTASSTAATPDSSITYLVKITDTENGCVATDTVRISVTLPGVYAFPSVFSPNGDGKNDRFGPYLPAGSSAKFSYFKVYNKWGQMVYECNDCDFTQSTTGWDGVFKGSEQPVGSYLFVTEVKVPNNNDPTKYDTQVINKSFTLVK*