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RIFOXYC2_FULL_Bacteroidetes_40_12_rifoxyc2_full_scaffold_220_41

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFOXYC2_FULL_40_12

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 14 / 38
Location: comp(46696..50310)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit Tax=GWE2_Bacteroidetes_40_63_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2430
  • Evalue 0.0
Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit id=1741832 bin=GWD2_Bacteroidetes_40_43 species=Flexibacter litoralis genus=Flexibacter taxon_order=Cytophagales taxon_class=Cytophagia phylum=Bacteroidetes tax=GWD2_Bacteroidetes_40_43 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=a63 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2430
  • Evalue 0.0
serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 24.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 354
  • Evalue 1.20e-94

Lists

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Notes

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Taxonomy

GWE2_Bacteroidetes_40_63_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3615
ATGTCTCAGGTCGGAAACCCCATTATTAATAATTACCATACCATAAACGGTTTTGCTTCAAACCAGGTTTGGGGAATTGTCCAAGATAAAAGTGGAACACTTTGTCTGGCTACCAATAAAGGAATTTCCCGTTTCGACGGTTTAAATTGGTCAATGATTCCTGTACCTTTAAATTCTTCAGTCCGTTCCATTGCTATTAGCGATAAGGGGAGAATATTTGTTGGTGCATCCCGCGAATTTGGTTTCCTTAAAGAGGAAGTTAATGGGCAATTGGTTTATGCCTCTCTTTCCGATTCCTTAAAGGAAAAGGAATTTTCTGCGGTGCTAAACACATTTGTAGTGGCCGATACAACCTATTTTATGGCCAATCATGAAAAAGTTTTTTGTTTTTTCGATGATTTGGTTCAAGAGGTAAATCTCCGGCATATTTCCTATTATCGTTCGTTCATAGTTGGCGATCAAGTCTGGCTATTGGATCCCTCTTTTGGAGTTGCTAAATTAATAGGGGATCAAATAGAATTCATTGATACAAACCCGGTCCCTCCTGACATCTACTTTTTAATCCCGTTCGATCAGGATCGCCTTTTGGCTGGTACACTCAAAGAGGGGTTATTTTTATATGATAAAAGTAAAAAGCTTTGGGCAAGATTTAAAACCGACAACGATCCCCTTTTAAAAAGTTCAAACCCATATACAGCTATTTGGCTTACCAACGGTAAGTTAGCCATCGCGAGTTTGAAAAACGGTGTTTTCATCCTGAATAATCGAGGTTCCATTGAAACCATTTACGATAAAGATCGTGGTTTGCTAAATAATTCTACCTATAGCCTTTATCAGGACTCGTATAACGATTTATGGATTGGCCAGGAAAAAGGTGTTTCACATATCGAACTTAGTGTGCCTTTTACAAAAATAGGTGAAAACTCAGGAATTGAAGGCACAGTACAAACTATTGGTTATTACTTCGGTCATTTATTTTGTGGAACTTCTAATGGGATTTACCATCTTCCTATTGAAAAAGCAGAGAAATACTACAATCATCATTTCAAATTGCTCCATCCCGACTATATATACAACCTTGATTATTGTAAAGTTGAGATACCGGGGGCTCCTGAACCCATTTTATTGGCTTCGTGTTTACGCGATTTAGTTTCTATTGATAAAAACTTGAATCTTAATTCTATTTATAAGATTTACGGATGCTATTCCATTTGCCCTTCACCTTTAAAGAAAGGCAGGGTCTTTCTTGGGAGTGCCTCAGGGGCTCAAGTGTTAGACATTCAATATGTTAACAATCAATTGAAGGTAATTAAGGTAATGGTGTTTCCCGATTTTAAAGAATCTGTCAGAAAAATACTTGCTACGCCCGAAGGTGATTTTTGGATACGGACCGCATTTAATGAGATTTATAAAATTGAATTTGATAACCCCGACGGAATAGTCAATTATTCAATACACAAATTTACTAAACTGAATCAAGAACAACCAGGATTGGTAATAACAGGGCTTTATCTGTTTTCAAAAAAAATTACAATTGCCACTAACCAAGGTATTTTTAGCACACTGCTAGAGGAGGGAAAGAACCTTGAAAAGAATTTTGTCCGTGATACCTCTTTTGGCATCAGTTATTTAACCGATAGCCTCCCGGTCCAGGCCCTTGCACAAGATCCTCTAGGTAATTTCTGGATGACCACCCCTAAGGGGTTATTATCTTACGAAGTATCAAGTAATTGGTTGAATGCCGGTTCTTTTAGCAGGCTCAACAACTACCAGATTCAAAACATAATCTCTATCGATCCGTTTGGCGTTTCATTTTTAACCGAGGATGAAATCTATTTCATCCATGAGCACGAGAAAAATAAGACTCAACCTACCATTGTTACCTATGTTTCGAGAATAAAAATCGGCGAGTCATTTAAAACCAGACATTTTTATCAACCGGATAGGGATCAAAGGCACCTAAATGAGGTGATCCCTTATAACCAAAATACTATTAGTTTTCAATTTGCTACCCCATTCTACCAAAATCCGGAATCCATAAAATGGAGTTATTTACTTGAGGGTTATGAGAATGGATGGAAAACAACGGACAAACCTCAAGTGGATTACTTTAACTTACCAAGTGGCAAATATACATTTAAAGTTAAAGCCCATCCTATATACGGAAATGAGAATCCACCCGATAGTTATAGCTTTACCGTACAAACACCTTGGTACAAAAAGACATTTTTTATTATCGTGTTTGTAATCCTGGGGAGCTTATTACTTTGGTTAATAATTACCATCTATACCCTGAAATTGAAGCGGGAAAAAAAGAAGTTGCAGGAGATAATTAAAGAAGCCATACGAAAAGAAGAAGAACAATACGAAGAGATAGAATCGCAATCAGATAAACTGATACAAGTTAATAAGGAGCTCGAAAAACTTTCCATTGTGGCAAGTAAAACCGATAACGCCGTCACAATTCTGAATGCTCATGGAAAAGTTGAATGGATTAATGATGGTTATATCCGGATGTACGGCTTTACGCTTGAAGAAATAAAGCTGAAGAATGATTTTCTGATTGGTGAAAATGCCACAGTTTCAATCAATGATATGGTAGACGTTTGGTATGGAAGGCGTATGCCTATTGTTTTTGAGAACCTGAAAAGGACAAAAAGTGGGCAAAAAATTTGGGCTCAAACAACGCTAACACCCCTTTTGGATCAAAATAAGGAATTATACCAGTTAATTGCCATTGATACCGATATCACGAAACTGAAACTCGCTGAAGCTGAGATTGCTGCTCAAAAGATTGAAATTGAGTCGCAAAGGGATTTAGCCGTTTCGCAGAGGGACGAAATTATCCAGCAAAAGATGGAGATTATTGATAGTATTAACTATGCAAACCGGATTCAAAAAGCAATATTGTTGGATGAAAAAGGGTTGCATACCGTTGTTAAAAATACTTTTGTCCTTTTCCTTCCCCGTGATATAGTTTCAGGTGATTTTTTCTGGGCTCACGATAATGGACATCAAAAAATTATTGCCACCGTTGACTGTACCGGGCACGGGGTCCCCGGCGCGTTTTTAAGTTTAATTGGAATTTCATTTTTAAATAACATTGTTAAAGAGAAGTCGGTTTTACAGCCTTATGAGATTTTAAACCTGCTCCGTGACCAGGTAATAAAGTCATTAGGCCAAACCGGGAAGGAGGGTGAGTCGAAAGATGGTATGGACATTTCTATCTGTTTAATTGATGAAAAGGAACATTCCGTTACCTTTGCCGGAGCCAACAGTCCGGCCTATTTATTTTCCCAAACTGGAGTAATTGAACTGGAAGCCAATAAGATGCCCATAAGCCTTTACATGCAAGAGTTTAACTCGTTTACCCAGCACAAATATTTCTATCAAAGTGGAGATATTCTGTATATGTTTACCGATGGATTTGCCGACCAATTTGGTGGCCCCATGGGTAAGAAGTATATGACAAAGACGTTAAAGAAATTTTTTAGAGAAATTTTTGATAAAGAATTATCAGTGCAGAAAGAACTTCTTTATAAAGAACACCTTGACTGGAAAGGTGTTTTAAATCAGATTGATGATATATTAATCGTGGGTATTAAATTTGATTAG
PROTEIN sequence
Length: 1205
MSQVGNPIINNYHTINGFASNQVWGIVQDKSGTLCLATNKGISRFDGLNWSMIPVPLNSSVRSIAISDKGRIFVGASREFGFLKEEVNGQLVYASLSDSLKEKEFSAVLNTFVVADTTYFMANHEKVFCFFDDLVQEVNLRHISYYRSFIVGDQVWLLDPSFGVAKLIGDQIEFIDTNPVPPDIYFLIPFDQDRLLAGTLKEGLFLYDKSKKLWARFKTDNDPLLKSSNPYTAIWLTNGKLAIASLKNGVFILNNRGSIETIYDKDRGLLNNSTYSLYQDSYNDLWIGQEKGVSHIELSVPFTKIGENSGIEGTVQTIGYYFGHLFCGTSNGIYHLPIEKAEKYYNHHFKLLHPDYIYNLDYCKVEIPGAPEPILLASCLRDLVSIDKNLNLNSIYKIYGCYSICPSPLKKGRVFLGSASGAQVLDIQYVNNQLKVIKVMVFPDFKESVRKILATPEGDFWIRTAFNEIYKIEFDNPDGIVNYSIHKFTKLNQEQPGLVITGLYLFSKKITIATNQGIFSTLLEEGKNLEKNFVRDTSFGISYLTDSLPVQALAQDPLGNFWMTTPKGLLSYEVSSNWLNAGSFSRLNNYQIQNIISIDPFGVSFLTEDEIYFIHEHEKNKTQPTIVTYVSRIKIGESFKTRHFYQPDRDQRHLNEVIPYNQNTISFQFATPFYQNPESIKWSYLLEGYENGWKTTDKPQVDYFNLPSGKYTFKVKAHPIYGNENPPDSYSFTVQTPWYKKTFFIIVFVILGSLLLWLIITIYTLKLKREKKKLQEIIKEAIRKEEEQYEEIESQSDKLIQVNKELEKLSIVASKTDNAVTILNAHGKVEWINDGYIRMYGFTLEEIKLKNDFLIGENATVSINDMVDVWYGRRMPIVFENLKRTKSGQKIWAQTTLTPLLDQNKELYQLIAIDTDITKLKLAEAEIAAQKIEIESQRDLAVSQRDEIIQQKMEIIDSINYANRIQKAILLDEKGLHTVVKNTFVLFLPRDIVSGDFFWAHDNGHQKIIATVDCTGHGVPGAFLSLIGISFLNNIVKEKSVLQPYEILNLLRDQVIKSLGQTGKEGESKDGMDISICLIDEKEHSVTFAGANSPAYLFSQTGVIELEANKMPISLYMQEFNSFTQHKYFYQSGDILYMFTDGFADQFGGPMGKKYMTKTLKKFFREIFDKELSVQKELLYKEHLDWKGVLNQIDDILIVGIKFD*