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RIFOXYC2_FULL_Bacteroidetes_40_12_rifoxyc2_full_scaffold_189_18

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFOXYC2_FULL_40_12

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 14 / 38
Location: comp(26119..29493)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family Tax=GWE2_Bacteroidetes_40_63_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2262
  • Evalue 0.0
Putative uncharacterized protein id=1763151 bin=GWD2_Bacteroidetes_40_43 species=Dysgonomonas mossii genus=Dysgonomonas taxon_order=Bacteroidales taxon_class=Bacteroidia phylum=Bacteroidetes tax=GWD2_Bacteroidetes_40_43 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=a63 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2262
  • Evalue 0.0
membrane protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 54.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1144
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

GWE2_Bacteroidetes_40_63_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3375
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PROTEIN sequence
Length: 1125
MITRKLIGLLVAFAILPTLLVAQTERISINMTDVTLNDVLNEIEKQTSFSFLVNEKIIDVTRKVDAVYKDVSITEILDNLFKDGTIQYVISNRQIILTPKKDNPQQEKVKPIKVSGRITDIGTNEPLPGVNIRIQGTSVGAITDFEGNYSLEVPDANTSLIFSFIGYKTQTIALVGKSEVDIKMEVDTKGLDEVVVTALGIKREVKAIGYSVQAVEGEGLQTVKTVDVGTSLTGKVAGLNVLNSTEFAEEPTVLIRGEEPILVIDGVPYANMTLRDIPSDDIESLSILKGATASALYGYRGQTGAIMITTKKGSEKKGLTVSLNSSNMFAAGFLAIPEAQSVYGREVELINGELSAVTNGDGSWGPPLEGQMVIQWDPIEKVRKSMPYLPVGKDNFKNFLEPGYILNNNINISHQSEIGSFRVSATSVQNKGQYPNSMFNKFTYSMSGDIKADNFTLASSMSYNKHTSPNIGFNGYTGYDPMYSLLIWSAPDFNVLDLQDYWITPNVSQNNSFSDTNNNPYFDRNERTHSLDKDILNASITLSYSFAPWLKATIRSGYDTYSNRQVITVPMSSLISAGSATVVNNGNQVWGESTLGSYNIGLGRGYSFNNDFLLTGIHELGKFSIDGLLGGSIAYNQDEGTDSRTQGGIKVPGFYSLAGSVENPIVESNIYRKQVNSLFGRLVLSWNKLIYVDATYRNDWSSTLSKKNRMYTYPSLSGSFIASELLPEIDWLSLWKLRASWTVARDIPSIYEINSVYNITQNGWGTLSSATLPTTIRNDDVYAEGSATWELGTAVNIYKNRASVDIAYYQKRKYDGLEYAEISSASGYYNNYINSDTEYTKKGWEVTLNTTPYKTKELTWDVAFNWTTYATYYTALDELIEDHPWIDEGKRTDAYVTYDYQYDPSGNIIHRNGVPLYSLYPSNIGYSDPDWIWGITNRVSYKNWDASISIDGRVGGLTKTVTEMYMWRSGSHPKSVVPERYLDATVSGSRNYIGQGVMVESGSATYDVYGNIITDDRVFVPNDVATTYQNYINTLHSGTAWGGNPSTVDVYDATFFKIRELAITYKLPTTICSKMMMQSASVSAIGQNLFLWAKQFKYSDPDGGYENFSDPSIRYVGLNLKVVF*