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scn_reactorb_scaffold_15261_18

Organism: 2019_SCN_bioreactor_inoc_reactorb_Clostridiales_33_7

near complete RP 39 / 55 MC: 1 BSCG 45 / 51 MC: 3 ASCG 12 / 38 MC: 3
Location: 17251..19686

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DEAD_2 domain protein n=1 Tax=Thermoanaerobacterium xylanolyticum (strain ATCC 49914 / DSM 7097 / LX-11) RepID=F6BJ55_THEXL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 44.2
  • Coverage: 813.0
  • Bit_score: 677
  • Evalue 1.10e-191
DEAD_2 domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 44.2
  • Coverage: 813.0
  • Bit_score: 677
  • Evalue 3.10e-192
DEAD_2 domain protein {ECO:0000313|EMBL:AEF17872.1}; TaxID=858215 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Thermoanaerobacterales; Thermoanaerobacterales Family III. Incertae Sedis; Thermoanaerobacterium.;" source="Thermoanaerobacterium xylanolyticum (strain ATCC 49914 / DSM 7097 /; LX-11).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 44.2
  • Coverage: 813.0
  • Bit_score: 677
  • Evalue 1.60e-191

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Thermoanaerobacterium xylanolyticum → Thermoanaerobacterium → Thermoanaerobacterales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2436
ATGAATAAAATTAAACTATCAGTTAGAGAATTGGTCGGATATGTTTATATGAGCGGTGATATCGGACAAGAGTCTATTAGTTTTGAAAGAGCATTGGAAGGTACGAGAATTCATAAGCTTATACAAAACCAAATGGGTGATGAATATAAAAAAGAATATTATTTAAAGCATGAATTTAGTTATAATGATATAGATTTTGCGATAGAGGGCAGAGCCGACGGAATTATCACTAATGAAAACGGTATAATTATTGATGAGATAAAATCTACCTATAAGCCGATAGATATGATAGATGAGTTTAACTATGATTATTCACATATGGCTCAGGCATTATGCTATGCCTATTTTTATTGTTCTAATGAATCATTAGATTCTATTTCTGTGCAGCTTAGGTACTGTAATATTGATACTGAGGAAATTAAAGCAATAAAAAATGATTATACATTTAATGAGCTTAAGGCAATATTTTATGACTTAATTGATGTTTATCTGGAGTGGGCGAGACTTAGAGTTGAGCATTATGTTTCAAAAAAAGATACAATAGACGAGGTTATATTCCCATTCGAAAGCTATAGACAGGGGCAAAGAGATTTATTAGTCGCTGTATATCAGACGATTAACAGCAAGAAAAAGCTATTTGTTCAAGCTCCAACAGGTGTTGGAAAAACAATATCAGTGCTTTTCCCTGCGATTAAAGCCTTAAATAGCAATAACAACAGCAAGATATATTATTTAACAGCAAAATCATCTACAAAGCAAATGGCAGAGGATACAATTCAGAAGCTCCATGTCAGAGGACTTAAGCTTAGGACAACTGTAATTACTGCTAAAGAAAAAATATGCTGTAATGACAGCTTTAATTGTGATGCTGAGGTATGTCCTTATGCAAAGGGCTACTATAACAAGCTTAATAAGGTATTGTTAAATGCGATAAAGTCTGAATATATGTATAATAAAGAATACATAGAAAAAATAGCGGAGGAATATGTGGTATGTCCATTTGAGCTTAGTCTAGAGCTTGGATATTCCTCTGATGTCGTGATTTGTGATTATAATTATTACTTTGATCCAAGAGTTGCCTTTAAAAGAGAGGATTTTCAAGATAATACAAATGATATTTTGTTAATTGATGAGGCTCACAACTTAGAGGATAGAACAAGAAATATGTATTCCTGTGAGATTATAAAGGAAAAATTTTATGAGGTATATAAGGAAATAAAGTCAGTGTCTCACTTAGATAAAACAATTGTAAAAAGTCTAAAAAATATTAATGATGAATTTATCTCATTGAAAAAAGAATTAAAACAAGATGATGAGGATATCGAAAGCGATGAAAATAATAAAGAGAATGTAAACGGTATAAATAATAAATCCCCTGGGAACAAGGTGTTGGAAGCTTCTCCTGAAAATTTGCTGAAAGCTTTGAGAGCCTTTGTAACAAAAACAGAAAAATGGATGAACGATAAAAAGCTCTATAAAAATGAAAAGCTGGAAGAATTGTATTTTGAAAGTATGTTTTTTCTTAAGCTGTCAGAGCTGTTTGATGAAAATTCTTGCTACTATTTGGAAAAATCCTCTAGCATATTTAAAATAAAAATATTTTTAATAAATACATCTGAGATATTGAGCAGTATTTTAAAAAATGCTTATTCTGCTATATTTTTTTCTGCGACCTTGACTCCGTTAAGATACTACAGACAGATATTAGGAGGAGATGTCAAGGAGGATAAGCTGCTTATGCTGGATTCGCCTTTTGATGCCGATAGATTGAGTTTAGTTGTAAGCGGTAATTTATCTATGAAGTATACAGTAAGGGATAGCAATATAGAGAAGATTTGTGAGTATATACATACTGTGATTAGCAATAAGTCAGGAAATTATATAGTATTCTTTCCGTCCTATGCATTTTTAAATAAAGTATCCGAGGTTTATTACAGCCTATATGAGGATAAGAATGAGGAACAAGGGATTCTTTATATAAAAAATTCTGCTTCACTGCAAGAAAGTGAACAGCTTGAGATATTAGATAAATTTTATAGTGAGAGAAATATTGTGCTATTTACAGTAGTTGGGGGAGTTTTTTCTGAGGGAATTAATTTACCTAATGATATGCTGATAGGAACAATTGTAATCGGAACGGGTATACCGCAAATATCATTTGAAAGAAATTTGATAAAGGATTTTTTTGATAAAAAATATAAGTGCGGATATGATTTTGCTTATAAATATCCTGGATTTAATAAGATTTTACAGTCAGTCGGTAGAGTTATAAGGACAGAAGAGGACAGAGGTTTTGCTCTTTTGATGGATTCGAGATTACTGCAAAACACATACTTAGAGTTGTTTCCAAATCATTGGAAGAATTATAAACGGATATATAATACAGAGCAGTTGAAAAATTTGCTGGATGAATTTTGGAGTTGGGATGAGAAATAG
PROTEIN sequence
Length: 812
MNKIKLSVRELVGYVYMSGDIGQESISFERALEGTRIHKLIQNQMGDEYKKEYYLKHEFSYNDIDFAIEGRADGIITNENGIIIDEIKSTYKPIDMIDEFNYDYSHMAQALCYAYFYCSNESLDSISVQLRYCNIDTEEIKAIKNDYTFNELKAIFYDLIDVYLEWARLRVEHYVSKKDTIDEVIFPFESYRQGQRDLLVAVYQTINSKKKLFVQAPTGVGKTISVLFPAIKALNSNNNSKIYYLTAKSSTKQMAEDTIQKLHVRGLKLRTTVITAKEKICCNDSFNCDAEVCPYAKGYYNKLNKVLLNAIKSEYMYNKEYIEKIAEEYVVCPFELSLELGYSSDVVICDYNYYFDPRVAFKREDFQDNTNDILLIDEAHNLEDRTRNMYSCEIIKEKFYEVYKEIKSVSHLDKTIVKSLKNINDEFISLKKELKQDDEDIESDENNKENVNGINNKSPGNKVLEASPENLLKALRAFVTKTEKWMNDKKLYKNEKLEELYFESMFFLKLSELFDENSCYYLEKSSSIFKIKIFLINTSEILSSILKNAYSAIFFSATLTPLRYYRQILGGDVKEDKLLMLDSPFDADRLSLVVSGNLSMKYTVRDSNIEKICEYIHTVISNKSGNYIVFFPSYAFLNKVSEVYYSLYEDKNEEQGILYIKNSASLQESEQLEILDKFYSERNIVLFTVVGGVFSEGINLPNDMLIGTIVIGTGIPQISFERNLIKDFFDKKYKCGYDFAYKYPGFNKILQSVGRVIRTEEDRGFALLMDSRLLQNTYLELFPNHWKNYKRIYNTEQLKNLLDEFWSWDEK*