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ar4r2_scaffold_206_60

Organism: ALUMROCK_MS4_Beggiotoa_37_524_curated

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: comp(86133..88748)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative collagen-binding protein (Fragment) n=1 Tax=Beggiatoa alba B18LD RepID=I3CHM1_9GAMM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.4
  • Coverage: 661.0
  • Bit_score: 567
  • Evalue 2.30e-158
Putative collagen-binding protein {ECO:0000313|EMBL:EIJ43114.1}; Flags: Fragment;; TaxID=395493 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Thiotrichales; Thiotrichaceae; Beggiatoa.;" source="Beggiatoa alba B18LD.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 48.5
  • Coverage: 647.0
  • Bit_score: 567
  • Evalue 1.90e-158
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 36.0
  • Coverage: 778.0
  • Bit_score: 404
  • Evalue 5.50e-110

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Beggiatoa alba → Beggiatoa → Thiotrichales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2616
TATTCTGGAACGGCTCAATTAGGTGATTATGTGTGGATTGATACTGATGGTGATGGTATTCAAGATGCTAATGAAACTGGTTTAGCCGGTGTAACAGTTCAGGCAGTGTGGGGTGGTGCAGATGGTAATTTAAATACCACAACTGACAATATCATTTTAACCACAACAACGGATAGTACTGGTCATTACCAATTCAATGGCTTACCACCTGGGGCTTATCAGGTTACGGTAATCAATGCACTGTCTAATTTGACACCGGTCACTGGCAGTCAATCCATCGGTCTAGGCACAGCCAACGTGACTTTAGCCGCGAATGGCAATCGACAAGATATTGATTTTGGTTACACACCTTCTGGCACAATCGGCGATCAAGTATGGTATGACGTTGATGGAGATGGTATTTTTGATCCAAACGAGCCCATTTTACCGAATGTGCCCGTAACCTTAAGATCGGCTGGAAACGACGGTGTTTTAAACACTGCCGACGATGTTGTCACTACCATCATGACTGACGGTAATGGTCGATACCAGTTCAGTGGACTACCCGCTGGCATTTACCAAGTCACAGTGCCAACACCAAATGGTACTCAGCTAACAATCCCTAATAGCAGCAATCCTGTCACTTTAACCAGTGGTCAACACATTGATACGGTCGATTTTGGTTATTCTGGAACGGCTCAATTAGGTGATTATGTGTGGATTGATACTGATGGTGATGGTATTCAAGATGCTAATGAAACTGGTTTAGCCGGTGTAACAGTTCAGGCAGTGTGGGGTGGTGCAGATGGTAATTTAAATACCACAACTGACAATATCATTTTAACCACAACAACGGATAGTACTGGTCATTACCAATTCAATGGCTTACCACCTGGGGCTTATCAGGTTACGGTAATCAATGCACTGTCTAATTTGACACCGGTCACTGGCAGTCAATCCATCGGTCTAGGCACAGCCAACGTGACTTTAGCCGCGAATGGCAATCGACAAGATATTGATTTTGGTTACACACCTTCTGGCACAATCGGCGATCAAGTATGGTATGACGTTGATGGAGATGGTATTTTTGATCCAAACGAGCCCATTTTACCGAATGTGCCCGTAACCTTAAGATCGGCTGGAAACGACGGTGTTTTAAACACTGCCGACGATGTTGTCACTACCATCATGACTGACGGTAATGGTCGATACCAGTTCAGTGGACTACCCGCTGGCATTTACCAAGTCACAGTGCCAACACCAAATGGTACTCAGCTAACAATCCCTAATAGCAGCAATCCTGTCACTTTAACCAGTGGTCAACACATTGATACGGTCGATTTTGGTTATTCTGGAACGGCTCAATTAGGTGATTATGTGTGGATTGATACTGATGGTGATGGTATTCAAGACAGCAATGAAACTGGTTTAGCTAATGTCACGATTCAAGCGGTTTGGGGTGGTGCAGATGGTAATTTAAGTACAACTGCTGACAATATCATTTTAACCACAACAACGGATAGTACTGGTCATTACCAATTCAATGGCTTACCACCGGGTAATTATGAAGTAACGGTGCTTTGGGGTATACCTAATGGATTGAGTCCTATTGTGAGAACTGAGTCAATTGGATTGGGTAAGGCAGTGATTTCTTTGTCTCCTCATGGTAGTCGGCAGGATGTGGATTTTGGATATGTCTTTGTTCCGGATTATGTAATTACTAAGGATGATGGGCTTTCTGAGGTGTCGCCGGGGGATGTGGTAAGTTATCGTATTGAGGTGGTTAATGCAGGTGCTGCAACGGGTACTCAGGTCGTGGTTACTGATGTATTGCCTTCTGGTTTGATTGATGTGACTGCAAGTGATGGTGGAGAGGTGGCTAGTGGTCAGGTTGTTTGGGTATTTGATACGTTGGCTGTCGGTGAATCTAGGGTGTTGTCTGTCAAGGCTACTGTGGCTTCTGAGGTGAGTGCTTCTGTGTTGGTTAATAGGGCTTTTGTGTTTGATGATGGTAGTCATGGTCCTGATCCTACTCCTGAAAATAATATAACGGATGATCCTGATATTGTTGTATTTCCTGAAGTGCCTGAAGATGATAAGCCAGATGTTCCTACAGATGGTAGTATTCCACCGTCTAATGAGATTCCTCCAAATGGTAATATTCCACCGTCTAACGGGATTCCGCCAAATGGTnnnnnnnnGGGATTCCGCCAAATGGTAATATTCCACCGTCTAATGAGATTCCTCCAAATGGTAATATTCCACCGTCTAATGAGATTCCTCCAAATGGTAGTATTCCACCGTCTGATGGGATTCCGCCAAATGGTAGTATTCCACCGTCTAACGGGATTCCGCCAAACGGTAGTATTCCGCCGTCTGATGGGATTCCTCCAGTTGATGGTGATATTCCACCGTCTAATGGGATTCCACCGGTTGATGGTGATATTCCACCGTCTGATGGGATTCCGCCGATTTTTGGTGATATTCCTCCGGGAACGACTATTTTATTGTTGCCACCTGAAGTCTTTACTTATAACTCGTTATATGATGAAAGACCTTATGATGAAGACGAAATTGAGAAGATTATTTTTGGAGATCATCGTGATTTGGAGTGGACTCTTCCACCTTTACCTATAG
PROTEIN sequence
Length: 872
YSGTAQLGDYVWIDTDGDGIQDANETGLAGVTVQAVWGGADGNLNTTTDNIILTTTTDSTGHYQFNGLPPGAYQVTVINALSNLTPVTGSQSIGLGTANVTLAANGNRQDIDFGYTPSGTIGDQVWYDVDGDGIFDPNEPILPNVPVTLRSAGNDGVLNTADDVVTTIMTDGNGRYQFSGLPAGIYQVTVPTPNGTQLTIPNSSNPVTLTSGQHIDTVDFGYSGTAQLGDYVWIDTDGDGIQDANETGLAGVTVQAVWGGADGNLNTTTDNIILTTTTDSTGHYQFNGLPPGAYQVTVINALSNLTPVTGSQSIGLGTANVTLAANGNRQDIDFGYTPSGTIGDQVWYDVDGDGIFDPNEPILPNVPVTLRSAGNDGVLNTADDVVTTIMTDGNGRYQFSGLPAGIYQVTVPTPNGTQLTIPNSSNPVTLTSGQHIDTVDFGYSGTAQLGDYVWIDTDGDGIQDSNETGLANVTIQAVWGGADGNLSTTADNIILTTTTDSTGHYQFNGLPPGNYEVTVLWGIPNGLSPIVRTESIGLGKAVISLSPHGSRQDVDFGYVFVPDYVITKDDGLSEVSPGDVVSYRIEVVNAGAATGTQVVVTDVLPSGLIDVTASDGGEVASGQVVWVFDTLAVGESRVLSVKATVASEVSASVLVNRAFVFDDGSHGPDPTPENNITDDPDIVVFPEVPEDDKPDVPTDGSIPPSNEIPPNGNIPPSNGIPPNGXXXGFRQMVIFHRLMRFLQMVIFHRLMRFLQMVVFHRLMGFRQMVVFHRLTGFRQTVVFRRLMGFLQLMVIFHRLMGFHRLMVIFHRLMGFRRFLVIFLRERLFYCCHLKSLLITRYMMKDLMMKTKLRRLFLEIIVIWSGLFHLYL*