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ar4r2_scaffold_3233_8

Organism: ALUMROCK_MS4_Gammaproteobacteria_45_49_curated

near complete RP 49 / 55 MC: 11 BSCG 49 / 51 MC: 10 ASCG 14 / 38 MC: 3
Location: 4953..6872

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
membrane protein n=1 Tax=Marinobacterium stanieri RepID=UPI00025592B4 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.5
  • Coverage: 644.0
  • Bit_score: 567
  • Evalue 9.70e-159
  • rbh
Capsular biosynthesis protein {ECO:0000313|EMBL:AKH20835.1}; TaxID=1543721 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Sedimenticola.;" source="Sedimenticola sp. SIP-G1.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.5
  • Coverage: 626.0
  • Bit_score: 564
  • Evalue 1.20e-157
polysaccharide biosynthesis protein CapD similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.2
  • Coverage: 633.0
  • Bit_score: 555
  • Evalue 1.10e-155
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Sedimenticola sp. SIP-G1 → Sedimenticola → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1920
ATGATTAATTGGGCTTTATCTAAGCTAATTCATACTTCTCGGGCTAATAAACGACTCATTTCGCTGGCCATCGATGTAGTTGGTTTGTTCACTATGTCCATTGTGGCTATTTGGATTCGCTTGGGCGAATTTACGGGTGAACTGACTCAGTACTTGTTGGCAATTTTTTTATTGATCTTGGTCGCTTTACCTATTTTTATCACCACTGGTTTGTATCGGATGGTGACACGTTACGTGGGTCATAAATTCACCCATACGGTTTACTTAAGCGTGACTAAGGCGTTTGTGATTTGGGCAGTAATTTTATTATTGTTCGATATTGCTTATCCACGCACGGCTATTTTTATTGATGGTTTGTTGGTGCTTTTGTACGTAACAGGCACAAGGTTGATAGCAAGGCGTTTGGTGTTTAAGGCTTTAACGCGCAATCTACCTGCTTTAGATAAGAAAAAAGTACTCATTTTTGGTGCGGGTAATGCGGGACAACAGTTGTTTACCTCTATTTTACGTATGCCCAGTATTTACGCGGTAGGCTTTGTTGATGATGATAAAAACTATCATTATCAGGAGATTAATTGTGCGTTGGTTTATCCCAGGGAAGCGATTCCAGAGCTAATTAAAGATCACGGTGTGACAGAAATTTATTTGGCCATTCCAACGCTAGACCGCAAAGCGCGTAAGGAGTTGTTGGAGTGGTTGACCGATTTCCCTGTTAAGGTGTTGACGATTCCGACCATTGACCAGATTGCATCTGGTGAGGTCAGCTTTACTGACCTTAAAGAGGTGAGTATTGATGAACTGCTGGGCAGAAAGCCTGTTGATCCGCGTCAGGATTTATTAGATGCCTGTATTTTAGGTAAGTCGGTATTGGTTTCTGGTGCGGGTGGCTCGATTGGTTCTGAGTTGTGTCGACAGGTGTTGGCATTAAAACCAACGCGTTTGGTATTATTTGAAATAAGCGAGTTTGCGCTTTACACCATTGAACAAGAGTTGCGCCCTTTAGCGACTGAACTGGGTGTGTGTATCGCACCCATATTAGGTAATGTACAAGACGAACGCCAAGTTAGAGATACCCTGAATCAGTTTGCTGTCGAGACGGTCTATCATGCGGCTGCCTATAAGCATGTGCCTTTGGTTGAGCATAATATTGAAAAAGGCGTATTAAATAATACCTTTGGTACCTTTACCATGGCAAAAGTGGCGGCTGAATTGGGCGTAACGGATTTTGTACTGATTTCGACCGATAAGGCGGTGCGGCCCACCAATGTTATGGGCGCAAGTAAACGCATGGCTGAATTGACCCTGCAGGCGCTACAAGAGCAGTATGCTTCGACCCGATTTGTTATGGTGCGGTTTGGTAATGTGCTTGGCTCTTCGGGTTCGGTTATTCCGCTGTTTAAAAAACAAATCGAAGCAGGTGGCCCTGTTACCGTGACACATCCAGAGATCACGCGTTATTTTATGACCATTCCAGAAGCGGCGTCTTTGGTCATCCAGGCGGGTTCTATGGGGGTCGGTGGCGATGTGTTTGTCTTGGACATGGGGGAACCTGTTAAAATCAGTGAATTAGCTGCTCGTTTGATTCACTTATCGGGTCACGAAGTGATGAATGATAAAGGACAGGGTACGATTGAAATACGTTATTCTGGCTTGCGTCCTGGTGAAAAGTTGTATGAAGAGTTGTTGATTGGTGATGGTGCTGAAGTCACAGATCATCCTAAAATCATGAAGGCGCACGAGACTTATGTGCCTTTGTCTGAATTAGAACCTGCTTTGATGGCACTTAAAAAGCTATTGGCACAGAAGCAATTTGAAGAGGGCTTAGTGCAAATTTCACAATTGGTTTCTGGATTTAATCATAATGGTCGTATTGTTGACTGTTATCAGAGTAAAAATGCGATTTGTGGACAAGCTAGCTAA
PROTEIN sequence
Length: 640
MINWALSKLIHTSRANKRLISLAIDVVGLFTMSIVAIWIRLGEFTGELTQYLLAIFLLILVALPIFITTGLYRMVTRYVGHKFTHTVYLSVTKAFVIWAVILLLFDIAYPRTAIFIDGLLVLLYVTGTRLIARRLVFKALTRNLPALDKKKVLIFGAGNAGQQLFTSILRMPSIYAVGFVDDDKNYHYQEINCALVYPREAIPELIKDHGVTEIYLAIPTLDRKARKELLEWLTDFPVKVLTIPTIDQIASGEVSFTDLKEVSIDELLGRKPVDPRQDLLDACILGKSVLVSGAGGSIGSELCRQVLALKPTRLVLFEISEFALYTIEQELRPLATELGVCIAPILGNVQDERQVRDTLNQFAVETVYHAAAYKHVPLVEHNIEKGVLNNTFGTFTMAKVAAELGVTDFVLISTDKAVRPTNVMGASKRMAELTLQALQEQYASTRFVMVRFGNVLGSSGSVIPLFKKQIEAGGPVTVTHPEITRYFMTIPEAASLVIQAGSMGVGGDVFVLDMGEPVKISELAARLIHLSGHEVMNDKGQGTIEIRYSGLRPGEKLYEELLIGDGAEVTDHPKIMKAHETYVPLSELEPALMALKKLLAQKQFEEGLVQISQLVSGFNHNGRIVDCYQSKNAICGQAS*