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ar4r2_scaffold_3233_9

Organism: ALUMROCK_MS4_Gammaproteobacteria_45_49_curated

near complete RP 49 / 55 MC: 11 BSCG 49 / 51 MC: 10 ASCG 14 / 38 MC: 3
Location: 6947..8335

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
O-antigen polymerase n=1 Tax=Pseudomonas stutzeri B1SMN1 RepID=S6JIS0_PSEST similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 48.1
  • Coverage: 443.0
  • Bit_score: 402
  • Evalue 3.90e-109
  • rbh
Lipid A core-O-antigen ligase {ECO:0000313|EMBL:EXJ09366.1}; TaxID=1229521 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Oceanospirillales; Nitrincola.;" source="Nitrincola sp. AK23.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 54.5
  • Coverage: 440.0
  • Bit_score: 468
  • Evalue 6.20e-129
O-antigen polymerase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 37.3
  • Coverage: 434.0
  • Bit_score: 259
  • Evalue 1.20e-66

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Nitrincola sp. AK23 → Nitrincola → Oceanospirillales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1389
TTGGAATTCTCTCAATCAGCACTCTTAGTCAGGCAACCCTCGCGGTTAGAGCGTTTACTGGTGTTGTTACTCTTAGGCAGTTTATTGTTTGTGCCTTGGCCGTTTGGGTTAACACCAGATGTGGCTAAATCTGCTTTGGTGGTGTGGTTTTTAACGCTTGGTTTGCTTTGGTCTATTTATTTATTGCGTTCTGGCGTTAGTATTTTTGTTGGAAAGCAGTTGACCCAAGTGGCTTGGATAGCCATTGGTTTGTTATTGATGGTTCAGGCATGGGTGGCGCTTCAGCTCAATTGGACCTTAAGCGCTTACCATACCAGTATGGCGTTGCAATTGGGTTTGGTTTACACGCTTATTTTCGCCATGATTTTGTCGTTGTTTTATACACGAAAACGCTTGGTTATGTTGGCTGGTGTATTGATTGTGGGAGGTACCTTTCAGGCCTTCTACGGTGCGACTATGGTGCTGTCACACTATGAGATGATATGGTGGCATGAGAAGCTTGCTTCGGTCGGTAGTGCCTCGGGTACCTTTATTAATCGTAATCATTTCGCTGGCTATCTTGAGATGACAATCGCTGTTGCTATCGGTTTAATGCTGGCATTGCGGACGGGTGAAGCTTGGTCGTGGCGCGGAGTATTGGAATTGTTGCTCAGTCCTAAGCTGTTAATTCGTATGGCGCTGGTTGTGATGGTTATCGGTTTGGTGATGAGTCAGTCGCGCATGGGTAATACGGCATTTATGCTGAGTTTGCTGGTCATCGGACTGTTATTTGTGGTGGTTACACCGCAAAACCGCCCTAGAAATTTGTTGATCTTGGCGAGTTTAGTGATCATTGATGTGTTGATTATCAGTCAGTTTTTTGGCTTGGAGCGTTTGAAAGATCGGATTACCCAAACTGAGATTAGCGTCTCAACGGAATCGGGTAGCTTGGTGATTGATATTAATGATCTGCGTGGGTTGGCTGTAAAACAGAGTATTCCCTTGGCGATTGACAGCAGTCTTAAAGGGCAAGGGGCTGGGACATTTGAAATCGCGTTTATGTCTTGGGCTGGGCTAGATTTTGGCGGTCACTTCGACCACGCACATCAAGATTATTTACAATTCTGGATTGAGTACGGTGCTGTTGGATTCTTATTGTTATTGGCGTTTACTTTGCTAGTATTGTGGCATGCTTTTAAATCTATGCGTATGAGAGAGTCAAAGTTCAGAAGCGGCCTTGGCTTCGGGTTATTAATGGCATTAATCGCGATTGCGTTTCACTCTTTTAGTGACTTTAACTTGCAAATCCCTGCTAATGCCATCACCTTTATCGTGATTTGCGCAATGGCAATTTTGGCGGTGTATCATCGACGTGTCAATAGAAAAATAATGACTGAGGCGAGTGATTAA
PROTEIN sequence
Length: 463
LEFSQSALLVRQPSRLERLLVLLLLGSLLFVPWPFGLTPDVAKSALVVWFLTLGLLWSIYLLRSGVSIFVGKQLTQVAWIAIGLLLMVQAWVALQLNWTLSAYHTSMALQLGLVYTLIFAMILSLFYTRKRLVMLAGVLIVGGTFQAFYGATMVLSHYEMIWWHEKLASVGSASGTFINRNHFAGYLEMTIAVAIGLMLALRTGEAWSWRGVLELLLSPKLLIRMALVVMVIGLVMSQSRMGNTAFMLSLLVIGLLFVVVTPQNRPRNLLILASLVIIDVLIISQFFGLERLKDRITQTEISVSTESGSLVIDINDLRGLAVKQSIPLAIDSSLKGQGAGTFEIAFMSWAGLDFGGHFDHAHQDYLQFWIEYGAVGFLLLLAFTLLVLWHAFKSMRMRESKFRSGLGFGLLMALIAIAFHSFSDFNLQIPANAITFIVICAMAILAVYHRRVNRKIMTEASD*