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BD02T64_scaffold_107_29

Organism: BD02T64_Colwellia_psychrerythraea_38_180_partial

partial RP 29 / 55 MC: 4 BSCG 30 / 51 MC: 3 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: 39623..42661

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Colwellia piezophila RepID=UPI000372454F similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 66.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1397
  • Evalue 0.0
  • rbh
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:ACA86544.1}; Flags: Precursor;; TaxID=392500 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Alteromonadales; Shewanellaceae; Shewanella.;" source="Sh similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 63.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1304
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 63.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1304
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Shewanella woodyi → Shewanella → Alteromonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3039
ATGAATAAGAAACCCCTTAGCATCGCGATACAAACTGCCCTATGTACAGTGTTAGCGACAGGTGCAATTAGTGCGCAGGTATTTGCAGCAGAGCAGGATATATCAAAGCCGGTTGCTGAAAATGTCTCTAATGAAGAAACCACAAAGGTTGAAGTAGATGAGAAAATAACCGTGACAGGTTCACGTTTACGCCGTGAAAACTTCACTGTTGCAACACCATTAGCGAGTATGGGTCAAGAGGCAATTGAAGATACCGGTATCGGCTCATTATCAGATATCCTTATTGATGAATTACCGCAAATCTCTGAAGGTACCAGTAATTCAAATTCACAATCACAAGTATCAGGCACTGGTCTTTCAACAATCGATTTACGTGAATTAGGTACTAGCCGTACGTTAACGTTAATTGATGGTCGTCGTGTGGTTTCAAATTCATACTCAGGTAATTATGTCAGCTTATCGACTATCCCATCAGGACTAGTACAGAAAGTTGAAGTTATCACGGGTGGTGCTTCAGCAACTTATGGCTCTGATGCTGTTGCTGGTGTAGTAAACATTATTACTCAACAAGATAGTGAAGGTTTCACTGCTAAAGTTCGCGGTGGTGAATCAGTTGAAGGTGGTGCCAAGGAATTTGGTATTGATCTTGATTACGGAACCGAATTTAACGACGGTGCTGGCTACCTTTTCGTAGCAACAAGCTACGACAAAGAATACGGTATGACCTTTGATGATCGTGACCGTGCACAATTACAAGATTCATGGGATTACGACGAAGACCTAATGTGTAACCTTATGCAAACTGCAGATGGCGATCAATGTATGCGTGATATAACGCAAGCTGATTGGCGTAGTTTAAGTGACTCTATTCCAGGTGGTGTTTTCAATGAATCTTCAAGTACAAAGGATGGTGGCGGTTACTGGTATAATAGTGACGGCTATCAAGGTAAAACATGGAAAGAAGAGCGTGACGGTATCAACACTAACCAGTTTGTAATGTTACGTGTTCCTGATGAAAAAGCATCTGCTGCAATAAAGATTGATTACGACCTAACTGACAATGTTATGTTTTATGGTCAATTGCAATACAGTTACAACCGCTCAATTAACCATAAAGCACCAGAAAGTGAAGATGAATGTGATTCAGTTGTAACTCGTGACCTTGAAACAGGTGAGTTCGGTAAAGATTGTATCGGCCATATACCCAGTGACAACCCCTATATGCCAGAAGAGATTCGTAATGAATCAAGTAAAAGAGGTGATTGGGATCGTAACTTTGCTGAAGTAGGCAATATTACAACGGATAATAAACGTACTACAATTCGTTCGTGGGCTGGATTACAAGGCACAATGTTTGACGATAGCTGGGATTGGGATTTATCGGTAGGTTATGGTAAGTTTCAACAAAGGCAAACTCGTTATAATGAGGTATATGTTGCTAATGTTCGTAATGCTTTACATGTAGAAGATGACGGTAATGGTGGCTACCAATGTGATGACGCAGATGCGCGTGCCGCTGGTTGTGTACCAATTAACCTATTTGGTGAAGGTTCAATAACCACTGAAGCTGCGGACTATATTCGTGCTAACCCAACGATTAATTCTGATATTGAGCAAACCTCGGTACTTGGTTATATTGCCGGTGATTTATTTGAACTACCAGCAGGCCCTGTCGCTACAGTGTTTGGTTTTGAGTGGCGTAAAGACTTCCAAAGTGTGTCAACAAACGTACCTGAAGGTGGTATTACCTTTAACTATGTGCCAGATTTTGATGGCGATGTAACGGTAAGTGAAGTTTTTGCGGAAGCAGGCTTGCCATTACTTAACAATGTTACCGGTGTTAAAAGTTTATCCGCCAACGTTTCGGCACGTCTTGCTGATTATAGTTGGGGTGGTACTGGTTTAATTGGTAGTTACACTGCGGGTGTAATCTATGAACCAACAGATGGTTACGTGGTTCGTGCAAACTGGTCAAGAGCACAACGTGCGCCAACTATTACTGAGTTATTATCTCCACCTCGTGGCGATTACGATACATTTGATGATATATGTCAGGAAGTAACGGCAACATCACAGGGTACAATAGATGATAACTGCCGTACTCACCCAGGTATTGCAGCAGAAATCGCTGCTGAAGGTGAGTTTGATATTAGCGATAATGGTTACTCCCCGGGCGTTGGAAATCCAGATTTGAAAGAAGAAACAGCTGATACCGTCACTTTTGGTTTTAGTATCGCACCAGAGTTTCTTGAAGATTTCAGTTTATCGGTAGATTACTATGATATTGTCATCGAAGATGCAATGTCTGAGTTTGATAACGAAGATATTTTAGCTTTCTGTTATGATTCTTCATTACCGTTTGGTGCTGATAACTCATTCTGTCAAGATATCAAACGTGACCCTTCAGACGGCCAGTTAATTGAAGTTCAGCAACGTGTTTACAACGTTGATGAAATCAGAACTAGCGGTGTTGATTTAGAGGCCGTATATCGAGTTGATTTGAATGAATTTGGTCGCTTGAAGTTTAAAACTAACTGGACACATGTATTCAGGTATGAAGAAACAAATACCGGTCCTGATGGTCAATACACAGAAGACTCTTTAGGCTCATTAGGTAGTGACTTATTTGAAGACTTAGCTTCTGCTTCAGCAACTTGGTATAAAGATGGCTGGCGCGTACGTTGGAGCATTAAGTACAAGAGTGGCGTAGTTTCGAGTCATTCTCGTTATGATGAATTCTACGGCGAAGGCGGTATCTTCGAAGAGTATGAAGCTAATTGTGCTGCAGATGCTAGTGCGTGTGTTGACAACCCTGAAGCTCCATTTGCTTTAGATCTTCCATCGTACGTAAGAAACGATTTATCAGCTTCATACAAGTTCGATTTACCTAATGACGGTGAAGTTCGTTTATTCGGTGGTGTGAACAACATCTTTGATAATAACGGACCGTTTATTATTGGTGGTAAAGGTAACTATGATAGTAACTACGGTGGCGGTAAAGGCCGTTTTGTTTACCTTGGCGCAGAAGTTAAATTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1013
MNKKPLSIAIQTALCTVLATGAISAQVFAAEQDISKPVAENVSNEETTKVEVDEKITVTGSRLRRENFTVATPLASMGQEAIEDTGIGSLSDILIDELPQISEGTSNSNSQSQVSGTGLSTIDLRELGTSRTLTLIDGRRVVSNSYSGNYVSLSTIPSGLVQKVEVITGGASATYGSDAVAGVVNIITQQDSEGFTAKVRGGESVEGGAKEFGIDLDYGTEFNDGAGYLFVATSYDKEYGMTFDDRDRAQLQDSWDYDEDLMCNLMQTADGDQCMRDITQADWRSLSDSIPGGVFNESSSTKDGGGYWYNSDGYQGKTWKEERDGINTNQFVMLRVPDEKASAAIKIDYDLTDNVMFYGQLQYSYNRSINHKAPESEDECDSVVTRDLETGEFGKDCIGHIPSDNPYMPEEIRNESSKRGDWDRNFAEVGNITTDNKRTTIRSWAGLQGTMFDDSWDWDLSVGYGKFQQRQTRYNEVYVANVRNALHVEDDGNGGYQCDDADARAAGCVPINLFGEGSITTEAADYIRANPTINSDIEQTSVLGYIAGDLFELPAGPVATVFGFEWRKDFQSVSTNVPEGGITFNYVPDFDGDVTVSEVFAEAGLPLLNNVTGVKSLSANVSARLADYSWGGTGLIGSYTAGVIYEPTDGYVVRANWSRAQRAPTITELLSPPRGDYDTFDDICQEVTATSQGTIDDNCRTHPGIAAEIAAEGEFDISDNGYSPGVGNPDLKEETADTVTFGFSIAPEFLEDFSLSVDYYDIVIEDAMSEFDNEDILAFCYDSSLPFGADNSFCQDIKRDPSDGQLIEVQQRVYNVDEIRTSGVDLEAVYRVDLNEFGRLKFKTNWTHVFRYEETNTGPDGQYTEDSLGSLGSDLFEDLASASATWYKDGWRVRWSIKYKSGVVSSHSRYDEFYGEGGIFEEYEANCAADASACVDNPEAPFALDLPSYVRNDLSASYKFDLPNDGEVRLFGGVNNIFDNNGPFIIGGKGNYDSNYGGGKGRFVYLGAEVKF*