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BD02T64_scaffold_1178_10

Organism: BD02T64_Colwellia_psychrerythraea_38_180_partial

partial RP 29 / 55 MC: 4 BSCG 30 / 51 MC: 3 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: 10420..13026

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor n=1 Tax=Pseudoalteromonas luteoviolacea B = ATCC 29581 RepID=L8D2T7_9GAMM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 68.7
  • Coverage: 872.0
  • Bit_score: 1243
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:KGJ89929.1}; Flags: Precursor;; TaxID=28229 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Alteromonadales; Colwelliaceae; Colwellia.;" source="Colwe similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 85.0
  • Coverage: 864.0
  • Bit_score: 1518
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 77.5
  • Coverage: 867.0
  • Bit_score: 1375
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Colwellia psychrerythraea → Colwellia → Alteromonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2607
TTGTTCCTTACCCTGAAAGTTTTATTTACTAAAAAGCATGCACTTGCTTTAAGCATTTCAACCGCACTCTTAACGACTACAAGTTTCACCACAGCTGCTGCAGAACAAGAAATTGAAGTAGAACGTATTGAAATTACCGGCTCACATATTAAGCGACAAGATATGGAAGGTCCTTCACCGGTAACAAGTTTATCACAAGAAGACATACAGAAGTCTGGTGTCACAGACCTTATTAGTTTATTTACTAAACTACCTATTTCAGGCCAAGGTACTTTCTCTACACAAGCTAACAGTAGTGATGATACTGCTAATGGTGGTTCATCTGTATCATTGCGCGGCTTAGGTGCAGATTCCACTCTAATATTAATTAATGGCCGCCGTGTATCGGTGTCACCATTTGCTAAAGGCATAGATACCTCGTTTGTTGATATTAATAACATCCCACTATCGGCAATCAAGCGCGTCGATATTCTTAAAGATGGTGCATCAGCAACTTATGGCTCAGACGCTGTTGCAGGTGTTATTAACATCGTTTTAAGAGATGATATAGAAGGTGCTGAGCTGTCAGCAAAAATTGGTTCAACTGCCGATGGTGGTGGCGATGAGAAAAGTGTGAACTTAGTTTTCGGTAATAGTTCTGAAAACGCCAGCCATACCTTTGTATTAGAATATTTTAATCGTGATGAAATTTTATATTCAGACCGAGATTATTCAGCTACCGCTAACCAAGCTGCCCGTACTGGCGATCCTGATGCTACCGACTTTAGAAGCTCAGCAGGTATTCCAGGTACTATCGCGTTAGCAGATGACCCTTCAAACCGATTAATCGATCTTTACGGTAACGATCAGTGTGCACCTGAATACCAAGATTTTGCCAACAACCTTTGTCGTTATGACTACGCTCCACATATGACCATGATTCCCGCTGCAGAGCGCTTTAGCTGGAACTATATGGGCAAATACGAAATAAATGAAAACGTGCGAGCGTTTGGTGAATTAAATGGTCAAAATTCTAAATCGACTGTGAGAGGTGCAGGTAGCCCTAGCTTCAACGAATTATTTATGAGTGGTGATAACATTAATCATCCATTTGCTGACATGCCAGAGCATGAATTTTATGGTCAAGACCTAACAATGCGTCGTAGAACCGTTGATATAGGTAACCGTGAAAAGCGCGTTGATTCAGACTACTATCGTGCAATTCTTGGTTTACAAGGTGAAATTAATGACTGGAGCTGGGAAGCCGCCTATAGCTACATAAAAAGTAGCTCAGTTGAACGTGGTGTCGATGGTTTCCCTAACTCTCGTCGTGTACAAGAAGCGATAGACAGTGGTTTATGGAACCCATTTGAACCTTCAAGTAATTCACAAGAATCATTAGACTTCATTGAAACTACGACCACTCGTGTTGGTAAATCGACCATGAAGTCTCTCGATTTCAAAATTTCTGGTGCTGTCTTTGAAATGCCTCATGGTGATGTATATTTTGCCCTTGGTAGTGAATATCGTGAGGAAACGATTAGTGATAACCCGGATGATCAATTTTTGCGTGGTGAAGTATTTGGTACTGAAGCGACTCAAGCCAATGGTTCACGTGACAACTTGGCATTCTTTGGTGAATTGGCCATTCCGGTATTAGACAATTTAGAAGTACAATTAGCTGTTCGTCATGAAGATTATAGTGATTTTGGTACAACAACTGATCCTAAAGTTTCATTTTTATGGACCCCTACTGAAGACTTAAGTGTTCGGGGCTCTTACGGTACCGCCTTTCGTGCACCATCGCTTCATCAGTTAGGCTTAGGTCGAACTGACGAATCACCAAACTTAGTAGATAGCTTACGTTGTGCTGCTATCGGAAACCAAGATAGAGCTTGTGAGCCGCAAGAATACACTGCAGTATTTGAAGGTAACCCAGATTTAGGTCCAGAAACATCTAAAAGTTATAACTTTGGGGTAATCTACAACTTCAGTAATGATGTAAACTTTTCAATTGATTACTACAACTATGACATTAGCGATATTATTGACTCAGATACACAATTTGTTATCGATAACTTTGGTTTAGATTCTACCATTGTAGTGCGTCGCCCTACTTCTATTGCAAACGATCCAGGTGAAGTAATTCAAGTAAATGATAGTTTCCAAAACATTGGCGATTTAAAAACATCGGGTATTGATTTAGATTTACGCTATGCATTTGAAACAAACATGGGTGAATTTAAACTCGGTTATGTAATGAATTATGTCTTGAATTTTGAAGATTACAAAAATACTGAAGAAGGTGGGTTCGAGCAACCGCAAATGCGCTGGACAGCTTCTGCTGACTGGGTATTAGATGATATTAGTGCAACAGCAGCAATTAACTACATTGATTCATTTGAGCAAGAAGCATCGCTTAACTTGAACAAAGAAGTTGATTCTATGACCACACTTGATGCTTCGGTTAATTATTTTGGTATTGATAATTTAGTACTTACGTTAGGTGCGACTAATTTAACCAATGAAAAACCGCCTTTCGCTTATCATGACTTTATGGGCTTTGCCGTTAATGTGCACAGTGGTCAAGGCCGCTTTGCTTACGCTCAAGCAAAATATAAGTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 869
LFLTLKVLFTKKHALALSISTALLTTTSFTTAAAEQEIEVERIEITGSHIKRQDMEGPSPVTSLSQEDIQKSGVTDLISLFTKLPISGQGTFSTQANSSDDTANGGSSVSLRGLGADSTLILINGRRVSVSPFAKGIDTSFVDINNIPLSAIKRVDILKDGASATYGSDAVAGVINIVLRDDIEGAELSAKIGSTADGGGDEKSVNLVFGNSSENASHTFVLEYFNRDEILYSDRDYSATANQAARTGDPDATDFRSSAGIPGTIALADDPSNRLIDLYGNDQCAPEYQDFANNLCRYDYAPHMTMIPAAERFSWNYMGKYEINENVRAFGELNGQNSKSTVRGAGSPSFNELFMSGDNINHPFADMPEHEFYGQDLTMRRRTVDIGNREKRVDSDYYRAILGLQGEINDWSWEAAYSYIKSSSVERGVDGFPNSRRVQEAIDSGLWNPFEPSSNSQESLDFIETTTTRVGKSTMKSLDFKISGAVFEMPHGDVYFALGSEYREETISDNPDDQFLRGEVFGTEATQANGSRDNLAFFGELAIPVLDNLEVQLAVRHEDYSDFGTTTDPKVSFLWTPTEDLSVRGSYGTAFRAPSLHQLGLGRTDESPNLVDSLRCAAIGNQDRACEPQEYTAVFEGNPDLGPETSKSYNFGVIYNFSNDVNFSIDYYNYDISDIIDSDTQFVIDNFGLDSTIVVRRPTSIANDPGEVIQVNDSFQNIGDLKTSGIDLDLRYAFETNMGEFKLGYVMNYVLNFEDYKNTEEGGFEQPQMRWTASADWVLDDISATAAINYIDSFEQEASLNLNKEVDSMTTLDASVNYFGIDNLVLTLGATNLTNEKPPFAYHDFMGFAVNVHSGQGRFAYAQAKYKF*