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BD02T64_scaffold_1009_26

Organism: BD02T64_Gammaproteobacteria_43_57_partial

partial RP 25 / 55 MC: 3 BSCG 27 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38 MC: 2
Location: comp(22931..26464)

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Value Algorithm Source
Type VI secretion protein IcmF n=1 Tax=Cellvibrio sp. BR RepID=I3I5E0_9GAMM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 41.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 998
  • Evalue 5.40e-288
Type VI secretion protein IcmF {ECO:0000313|EMBL:EIK43275.1}; TaxID=1134474 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Cellvibrio.;" source="Cellvibrio similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 41.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 998
  • Evalue 7.60e-288
icmF; type VI secretion protein IcmF similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 41.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 976
  • Evalue 8.10e-282

Lists

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Taxonomy

Cellvibrio sp. BR → Cellvibrio → Pseudomonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3534
ATGAAACGTATCATAGGGTTTATTACAGATAAGCGCGTATTAACGATTATCGGTTTAATCGCGTTGGCGGTATTGATTTGGCTAGGAGGGCCTTTTGTCCGTTTTGGCGAGGACAATTTTGCACCGCTTGGTTCTGTTGTTGCGCGTTTAGTCGCTATCATTGTGCTGTTAGGGCTTTGGGGGCTGACAACATTGTTGGGCCAATGGCAAAACAAGCAGCGTACCGCGAATTTGTTGAATGAAGTACAAGGGCTGGATGCAGGCAATGATGATGGTGCTCAGACCAATCAAAGCGGTGAGGAGGTAGCGGTTCTTCAAAAGCGTTTTACTGATGCGTTATCGGTTTTAAAGAAAACAAAATTTCAGCATAAAAGTGGCAGTAAGGCATTGTATGATTTGCCTTGGTATATTGTTATCGGGCCTCCAGGGTCAGGAAAAACAACAGCATTGGTGAATTCAGGATTGGAATTTCCGTTGTCTGATCAGCTGGGGAAAGGTGCTATCGGTGGTATTGGTGGTACGCGAAACTGCGATTGGTGGTTCACTAATGAAGCCGTTATTCTAGATACTGCTGGCCGTTACACAACGCAAGATTCACATAAGGTTGTTGATAGTAAAGCGTGGCAAGGCTTCCTGGATTTACTGGTAAAACACCGTAAACGAAGGCCGATTAATGGCGCGATTATCGCTATCAGTATTCAAGATATCTTAACTCAAACATCGGATGAACGTTTATATCACGCGAGAACCATTCGTTCTCGTATTGATGAGTTAGTCGATCACTTGGGTATTAATTTTCCCATTTACGTCACTTTTACTAAATGTGATTTGGTTGCCGGTTTTAGCGAGTTTTTTGAAGAGTTTGGTTTAGAGCAGCGAGAGCAAGTATGGGGTATGACGTTCCCGTTACCAGACGAAGGGAAACCTCAGGCGTTTGATAACAAACTCTTTGAGTATAAATATTCTGAATTATTAAGCCGTTTACAGCCACAGGTCTTGGATCGAGTGCAGCGGGAGCGAGACCCTCAGCGACGTGCATTGATCTATAATTTCCCGAATCAGTTTGAGACAATGCGTTCCCCTATTGAGGATTTTCTAACACAAACCTTTGGCTTGAATCGGTTTCAAACGCAACCGTTATTACGTGGCGTTTACTTTTCCAGTGGTACTCAAGAAGGAACACCGATTGATCGAATGATGTCTTCGGTAGCCTCTAATTTTGGGTTGCCATCAGAAGCTGTGCGTTTAACGCCAGGTCAAGGTAAGGCATTTTTCATTAACCGTTTGTTCACCAATGTTATCTTCCCTGAAGCTGAGATGGTGGGTTCTAATAGACAATATGAGCTACTGCTTAAATGGATGCGACGAGGTGCCTTTGGCGGCTTGGCGTTGTTATTTGTGGTAAGTATTATTGTATGGACAGCAGCCTATAGCCGGAATCAGACCTACTTAGAACAAGTTGCTGAGCACCTAGACCGTTATAAAGATTTTGAAGTTAATATTAGCGACAACAATCACGACTTACGTTTGATTATTCCCGCGTTGCAAGAGTTGAAAAGAGCCAGTGAAATATATGAGCAAGAAAGTTTGCCTTGGTTGGCTGGGCTCGGGTTACACGACTCTCGTGTTGAAGTCTCAGCGAAAAAAACGTATTTAGAGAAGCTACGAGCGTTGTTGTTACCAAGGATTGATTGGCGATTCCAGCAGTACCTTTTGGCTGCAAAATCAACGGATCCTCGGCTACATGAGTCGCTACTCGCATATTTAATGTTGGGTGACAGTGAGCGGTTTGATCCTGCTGTTGTGAAAGATTGGCTGTTAAGTGATTGGGAAAGTCAATTTAGAGGTCAAGATGAAGTACAGCAGGTATTGACCAAGCATTTAGATGTATTGCTTTCAAGTCCACTAGAGCCTCTGGCATTAAATAAGCTGGCGTTGGACAGAGGAAGGGCAGAGCTTCGAAAAGTACCTGTTGCAGAAATGATATATAACCGAATTAAAAGCGACCCTACTTTTAGCCGAGAGGTGGATTTAAGGGGATTGCTGGGCGATAGCACACGTACTGTTTTTGCAAACAAGAAAAATAGTACGCTATTTAGTATGCCCTTTATGTTTACCAAAGAAGGGTATAAAGCGGTTGATTTGTCGAAAGACTCCCCGGTTATTAAAGAAATGTTTTCAGATCGTTGGATACTGGGTGATGAAGCGACGGCGGTTTATAACAACAATGAGTTAGGCAAAATTACAGATCGAATTCGAGGCCATTATATGGCTGAGTATATTGATCGTTGGGGGCGTTTTTTAAACGGAATGTCCGTCAATGCTTTCTCGGATTTACAGCAAAGTCGTCGTATCTTGGCTTTGTTAGCCGACCCTGTGTATTCGCCAATTTTGGCGGTCTTAAAAGTGACGTCGGAAAATACAGAGCTGTCCCCGAGAGTGCCATCCGTTAAGCTCAAAAATAAGAAGGCCGGTGCTATTGCTAGTTTCTTTAGTGGGGATGAGGGCACGGGTGAAGGAGGTGTCTTTAAGCAGACTCCGGTGGACAAGCATTTTAGAGAGTTGAACTTATTGTCTGCTGCCGCTACTGGTGCGCCAACGCGCATTAGTGGAACCTTGCTGTCATTACGTAATGTTCAGGCGTATCTGGATGAGATAATCCTAGCGCCAGATATCACTGAAGCGGCATACAATGCTGCAAAAGGCCGGATGCTTGCAGGCGGAGGAGATGTAATTAAACAGCTACGCATTGATGCGTCCAGTTTGCCATCTTCTGTTCAGCGTTGGTTATTTGCCGTTGCCGATGAAACGTGGCGCTTGGTGTTGCTTAACGCTAAAGCGCATGTGAGCAATGAGTGGAAGAGTCAGGTTTACCGTAAATATGTTGCAGCGTTATCTAATCGCTATCCATTGTATAGAAATGCAGTGGATGAATTGGCGGTGTATGATTTTGCAGAATTCTTTAAACCCGAAGGCATTCATGATCGTTTTGTGCAGAAGTATATTTCTCCTTTTGTGGAAGTGGATGATGCGTGGGGGGTAAAGCGTTTGGATGGCAGAGGGTTAGCCATAGCTCCAGAAAGTATTGATCAGATGCGACGAGCTGTGCAAATTAAAGGTATGTTGTTTGCGACAAACCCAACATCCCCAAGCTTTAGCTTTAAGATGAAACCTTATCGTATGGATTCTAGTGTCCGTAAATTTGAGATGTCTTTTGGTGACCAACGTTTACGGTATACTCATGGGCCAAAAATTTCTAAAAGTATGAATTGGCCAGGAGACGGCGGGACTAATGTAAGAATGACATTTGAAGATCTTAACGATTCTATTAAACGCGTCACTTATGACGGGCCTTGGGCATTACTGAGGTTGTTGGATGAGTCGACAATCAGCCAGACACGGCGATCTAATGTATACCATGTGACTTTCTCAACTCTCGGCCGAAAAGCAACGTGGCAAGTGACAGCAAGAAGTGTGAATAACCCATTCCAATCACAGTCTATTTCTCGTTATCGTTGTCCGGAGGCGCTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1178
MKRIIGFITDKRVLTIIGLIALAVLIWLGGPFVRFGEDNFAPLGSVVARLVAIIVLLGLWGLTTLLGQWQNKQRTANLLNEVQGLDAGNDDGAQTNQSGEEVAVLQKRFTDALSVLKKTKFQHKSGSKALYDLPWYIVIGPPGSGKTTALVNSGLEFPLSDQLGKGAIGGIGGTRNCDWWFTNEAVILDTAGRYTTQDSHKVVDSKAWQGFLDLLVKHRKRRPINGAIIAISIQDILTQTSDERLYHARTIRSRIDELVDHLGINFPIYVTFTKCDLVAGFSEFFEEFGLEQREQVWGMTFPLPDEGKPQAFDNKLFEYKYSELLSRLQPQVLDRVQRERDPQRRALIYNFPNQFETMRSPIEDFLTQTFGLNRFQTQPLLRGVYFSSGTQEGTPIDRMMSSVASNFGLPSEAVRLTPGQGKAFFINRLFTNVIFPEAEMVGSNRQYELLLKWMRRGAFGGLALLFVVSIIVWTAAYSRNQTYLEQVAEHLDRYKDFEVNISDNNHDLRLIIPALQELKRASEIYEQESLPWLAGLGLHDSRVEVSAKKTYLEKLRALLLPRIDWRFQQYLLAAKSTDPRLHESLLAYLMLGDSERFDPAVVKDWLLSDWESQFRGQDEVQQVLTKHLDVLLSSPLEPLALNKLALDRGRAELRKVPVAEMIYNRIKSDPTFSREVDLRGLLGDSTRTVFANKKNSTLFSMPFMFTKEGYKAVDLSKDSPVIKEMFSDRWILGDEATAVYNNNELGKITDRIRGHYMAEYIDRWGRFLNGMSVNAFSDLQQSRRILALLADPVYSPILAVLKVTSENTELSPRVPSVKLKNKKAGAIASFFSGDEGTGEGGVFKQTPVDKHFRELNLLSAAATGAPTRISGTLLSLRNVQAYLDEIILAPDITEAAYNAAKGRMLAGGGDVIKQLRIDASSLPSSVQRWLFAVADETWRLVLLNAKAHVSNEWKSQVYRKYVAALSNRYPLYRNAVDELAVYDFAEFFKPEGIHDRFVQKYISPFVEVDDAWGVKRLDGRGLAIAPESIDQMRRAVQIKGMLFATNPTSPSFSFKMKPYRMDSSVRKFEMSFGDQRLRYTHGPKISKSMNWPGDGGTNVRMTFEDLNDSIKRVTYDGPWALLRLLDESTISQTRRSNVYHVTFSTLGRKATWQVTARSVNNPFQSQSISRYRCPEAL*