ggKbase home page

BSR_inoc_135743_15

Organism: BSR_inoc_Arcobacter_butzleri_29_10

near complete RP 49 / 55 BSCG 49 / 51 ASCG 7 / 38
Location: 14729..19255

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322}; Short=RNAP subunit beta' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322};; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322};; RNA polymerase subunit beta' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322}; Transcriptase subunit beta' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322}; TaxID=1036172 species="Bacteria; Proteobacteria; Epsilonproteobacteria; Campylobacterales; Campylobacteraceae; Arcobacter.;" source="Arcobacter butzleri 7h1h.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 89.6
  • Coverage: 1508.0
  • Bit_score: 2692
  • Evalue 0.0
rpoC; DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 89.6
  • Coverage: 1508.0
  • Bit_score: 2692
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' n=1 Tax=Arcobacter butzleri ED-1 RepID=G2HPZ8_9PROT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 89.7
  • Coverage: 1508.0
  • Bit_score: 2692
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Arcobacter butzleri → Arcobacter → Campylobacterales → Epsilonproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4527
ATGAGTAATAATGAAAAAGTGCTATCACCAATAGATATAAAAGAGTTAGAAAGACCACAAGATTTTTCTGCTTTTCAATTAAAGTTAGCAAGTCCAGAGAAAATTCTATCTTGGTCTTGTGGAGAGGTTAAAAAACCTGAAACTATTAACTATAGAACACTAAAACCAGAGAGAGATGGACTATTTTGTGCAAAAATCTTTGGACCAGTAAAAGATTATGAGTGTTTATGTGGTAAATATAAAAAGATGAGATACAAAGGTGTTGTTTGTGAAAAATGTGGAGTTGAAGTAACTTCATCAAAAGTTAGAAGACACAGAATGGGACATATTGAATTAGTATCTCCTGTTGCTCATATTTGGATGGTATCATCTCTTCCTTCAAGAATTGGAACACTTTTAGGTGTTAAATTAAAAGATTTAGAAAGAGTTCTATATTATGAAGCATACATTGTAAATAGTGCTGGTGAAGCATTTTATGATGGTGAAAGAACTAAAAAAATTGAAAAATATGATATTTTAAATGAAGAGCAATATAGAACTGTTGCAGATTTGTTTGAACACACTGGTTTTGAAGCAAAAATGGGTGGAGAGATTATTAGAGATCTTTTAGCTGAGCTTGATCTGTTTGAGCTATTAACTTTATTAAAAGATGAGATGCAAACAACTAAATCAGATGCAAAAAGAAAAACAATAATCAAAAGATTAAAAGTTGTTGAAAACTTCATCAATAGTGGAAATAGACCTGAGTGGATGATGCTTACAATGCTTCCAGTTTTACCGCCAGATTTAAGACCACTTGTTTCTCTTGATGGTGGAAAATTTGCAGTTTCAGACGTTAATGGCCTTTATAGAAGAGTGATTAATAGAAATAACAGATTAAAAAGATTAACAGAACTTGATGCTCCTGAAATTATTATTAGAAATGAAAAAAGAATGCTTCAAGAAGCTGTTGATGCTTTATTTGATAATGGTAAAACAGCAAATGCTGTTAAAGGTGCAAATAAAAGACCTTTAAAATCTTTAAGTGAGATTATCAAAGGAAAACAAGGACGATTCAGACAAAACTTACTTGGAAAAAGGGTTGACTTCTCAGGAAGATCTGTTATTGTTGTTGGACCAAATTTAAATATGGATCAATGTGGTATTCCTAAAAAAATGGCACTTGAACTATTTAAACCACATTTAATGGCAAAATTAGAGGAAAAAGGTTACGCAACAACTTTAAAAGCTGCAAAAAGATTGATTGAATCTGAAACAAATGAAGTTTGGGAGTGTTTAAATGAGATAGTTGATGAGTATCCAATTTTATTAAATAGAGCTCCAACACTTCATAAATTATCTATTCAAGCTTTCCACCCTGTTTTAATTGATGGAAAAGCTATTAGATTACATCCGCTTGTTTGTGCTGCATTTAATGCTGACTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCACGTACCACTTTCTCAAGAGGCTGTTGCTGAAGCTAAGATTTTAATGATGAGCTCAATGAATATTTTATTACCAGCAAGTGGTAGAGCAATTGCAGTTCCATCTCAAGATATGATTTTAGGTATATATTATCTATCATTAGAGAAAGAGGGTGTAAAAGGTTCTCATAAACTATTTACTGATGTAAATGAAGTAAAAATTGCGTTAGATATGAATCAAATTGATTTACATGCAAAAATTAGAACAAAAATTGATGGAAAAATTGTAAAAACAACAGTTGGAAGATTAATAATTCATGAAATTCTACCATCTTTTGTTCCAATGAGTCTATGGAATAAAGTTTTAAAGAAAAAAGATATCGGTGCATTAGTAGATTATATCTATAAAGAGGCTGGTTATGAAGTAACTCCAAGATTCTTAGACAACTTAAAAAATCTAGGATTTAAGTATGCAACTACTGCTGGTATTTCAATATCAATTGATGATATTATTGTTCCAGATAGTAAAGTTTCTCATATTACAAAATCTAAAAAAGATGTTATTGAGGTACAAAAACAGTTCTCTCAAGGTCTATTAACTGAGCAAGAGAGATATAATAAAACTATTGATATCTGGACTGAAGCTAATAATAAACTTGGGTTAGAGATGATGGATTTAGTTAAAACAGATAAAGATGGATTTAACTCTATTTATATGATGGCAGATTCAGGAGCAAGAGGTAGTGCAACTCAAATTAGACAGCTTTCAGGTATGAGGGGTCTTATGGCTAAGCCAGATGGTTCTATTATTGAAACACCAATTATCTCTAACTTTAAAGAGGGTCTTAATGTTCTTGAGTACTTTATCTCTACTCACGGAGCTAGAAAAGGACTTGCGGATACAGCTTTAAAAACAGCAAATGCTGGATATTTAACAAGAAAGCTTATTGATGTTTCTCAAAATGTAAGAATTACAGAAGAGGATTGTGGAACTCATGAAGGTATTGAAATTACTGATATTACATCTGGAAATGAGTTAATCGAGTCTTTAGATGAGAGAATTACAGGAAGAGTTATTGCTGAAGATATTATTGATCCAATCTCTAATGAGATTTTATTTAATGAAGGAACTTTAATAACTGAAGAGTTTGCAAAAATAGTAAAAGAGTCTGAAGTTAAATCTGTAATTATTAGAACTCCGCTTACTTGTAAAACAGAAAATGGACTTTGTTCAAAATGTTATGGACTAAATCTTGGTGAGCAAAGAAAAGCAAAACCAGGTGAAGCTGTTGGAGTTGTTGCTGCTCAATCAATTGGAGAGCCAGGAACTCAGCTAACACTTAGAACTTTCCACGTTGGAGGAACTGCAAGTGCTACTCAAACTGAAAGAGAGTTAAAAGCTGATAAAGAAGGTTTCATTAGATACTACAATATCAAAAAATATGAAACTAAAGATGGGAAAACTATTGTTGCAAATAGAAGAAATGCTGGAATTTTATTAGTTGAACCAAAAATTAATGCACCATTTAAAGGTAAAGTTACAGTTGAAACAGTTCATGATGAGATTGTATTAACAATATCAAATGGTAAAGATAAAAAAGAGTATTTCTTAAGAAAAAGTGATGTTGCAAAAGTAAATGAGCTTGCAGGAATTTCTGGAAAAATTGAAGGAAAACTTTATATTCCTCATGCAAATGGTCAAGAAGTAGATAATAACGATTCTATAGTTGAAATTATTAAAGATGGATGGAATGTACCAAATAGAATCCCATTTGCAGCTGAATTAAAAGTTGAAGATGGAGCACCAATTACATCTAAAGTTGTTTCAGCAGCTAAAGGTATTGTTAAATATTATAAATTAATAGGTGATTATTTAGAGAGAAGACATGATATTAAATCTGGTGATAAAGTTGTAGAAAAAGGTCTTTTTGCAGTAGTTGCAGATAAAGAAGATAGAGAAGCTGCAAGATACTATATCTCAAGAGGTTCATCAATAATTTTAAATGATAATAGTGAAGTTGAAAAAGGTACTCAAATTTCTTCACCAACAGTTTCAGAACAGACTGTAATTGCAGAGTGGGATCCATATGCTAACCCAATTATTGCTGAAGAGTCTGGAGTTGTAACTTTTGAAGATATTATTCCAGGTGTTACTGTTTCTGAGCAATTTGATGAGTTAACAGGAACATCTAAGCTAGTTGTTAATGAGTATATTCCAAGTGGATATAAACCAACAGTATTATTAGCAACAGTTTCAGGTGAGATTATTAGATATGTACTAGAGTCAAAAGCATCTTTAAATATTCAAGAGGGAAGCAAAGTAGAGGTTGCAGATATTATTGCTAAAACTCCAAAGGCTACACAAAAATCAAAAGATATTACTGGAGGTCTTCCAAGAGTATCTGAGTTATTTGAAGCAAGACGACCAAAAAGTATAGCTGTATTAGCATCGTTTGATGGAACTGTAAGTTTTGGAAAACCACTAAGAAATAAACAAAGATTATTAATCTCTGATATTATGGGTGGACAAACAGAGTACTTAATTGAAAAAGGAAAACAAATCCTTGTTCATGAAGGTGAATTCGTACACGCTGGTGAAGCATTAACAGATGGTCAAGTATCGCCTCATGATGTATTAAGAATTATGGGTGAAAAAGCACTTCATTATTTTATTGTATCTGAAGTACAACAAGTTTATAGATCTCAAGGGGTTAATATTGCAGATAAACATATTGAGGTAATTTTATCTCAAATGTTAAGACAAGTATCAATTCTTGATGGTGGAGATACTAAATTTATTGTTGGTGATATGATCTCTAAAAAGAGATTTAAAATTGAGAATGAAAAAATTGTAAGAATGGGTGGAAGACCAGCTATTGCTGAGCCTTTATTGCTTGGTATTACAAGAGCTGCTGTTACAAGTGATAGTATCATTTCAGCTGCATCATTCCAAGAGACAACAAAAGTATTAACAGAAGCTGCAATTAGTGCAAAAATGGATATGCTTGAAGATCTTAAAGAGAATGTTGTAATAGGAAGAACAATTCCTGTTGGAACAGGTCTATATAAAGATCAAAAAGTAAAATTCACAGAAGTTGAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1509
MSNNEKVLSPIDIKELERPQDFSAFQLKLASPEKILSWSCGEVKKPETINYRTLKPERDGLFCAKIFGPVKDYECLCGKYKKMRYKGVVCEKCGVEVTSSKVRRHRMGHIELVSPVAHIWMVSSLPSRIGTLLGVKLKDLERVLYYEAYIVNSAGEAFYDGERTKKIEKYDILNEEQYRTVADLFEHTGFEAKMGGEIIRDLLAELDLFELLTLLKDEMQTTKSDAKRKTIIKRLKVVENFINSGNRPEWMMLTMLPVLPPDLRPLVSLDGGKFAVSDVNGLYRRVINRNNRLKRLTELDAPEIIIRNEKRMLQEAVDALFDNGKTANAVKGANKRPLKSLSEIIKGKQGRFRQNLLGKRVDFSGRSVIVVGPNLNMDQCGIPKKMALELFKPHLMAKLEEKGYATTLKAAKRLIESETNEVWECLNEIVDEYPILLNRAPTLHKLSIQAFHPVLIDGKAIRLHPLVCAAFNADFDGDQMAVHVPLSQEAVAEAKILMMSSMNILLPASGRAIAVPSQDMILGIYYLSLEKEGVKGSHKLFTDVNEVKIALDMNQIDLHAKIRTKIDGKIVKTTVGRLIIHEILPSFVPMSLWNKVLKKKDIGALVDYIYKEAGYEVTPRFLDNLKNLGFKYATTAGISISIDDIIVPDSKVSHITKSKKDVIEVQKQFSQGLLTEQERYNKTIDIWTEANNKLGLEMMDLVKTDKDGFNSIYMMADSGARGSATQIRQLSGMRGLMAKPDGSIIETPIISNFKEGLNVLEYFISTHGARKGLADTALKTANAGYLTRKLIDVSQNVRITEEDCGTHEGIEITDITSGNELIESLDERITGRVIAEDIIDPISNEILFNEGTLITEEFAKIVKESEVKSVIIRTPLTCKTENGLCSKCYGLNLGEQRKAKPGEAVGVVAAQSIGEPGTQLTLRTFHVGGTASATQTERELKADKEGFIRYYNIKKYETKDGKTIVANRRNAGILLVEPKINAPFKGKVTVETVHDEIVLTISNGKDKKEYFLRKSDVAKVNELAGISGKIEGKLYIPHANGQEVDNNDSIVEIIKDGWNVPNRIPFAAELKVEDGAPITSKVVSAAKGIVKYYKLIGDYLERRHDIKSGDKVVEKGLFAVVADKEDREAARYYISRGSSIILNDNSEVEKGTQISSPTVSEQTVIAEWDPYANPIIAEESGVVTFEDIIPGVTVSEQFDELTGTSKLVVNEYIPSGYKPTVLLATVSGEIIRYVLESKASLNIQEGSKVEVADIIAKTPKATQKSKDITGGLPRVSELFEARRPKSIAVLASFDGTVSFGKPLRNKQRLLISDIMGGQTEYLIEKGKQILVHEGEFVHAGEALTDGQVSPHDVLRIMGEKALHYFIVSEVQQVYRSQGVNIADKHIEVILSQMLRQVSILDGGDTKFIVGDMISKKRFKIENEKIVRMGGRPAIAEPLLLGITRAAVTSDSIISAASFQETTKVLTEAAISAKMDMLEDLKENVVIGRTIPVGTGLYKDQKVKFTEVE*