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gwc2_scaffold_40_35

Organism: PER_GWC2_39_14

near complete RP 50 / 55 MC: 8 BSCG 48 / 51 MC: 2 ASCG 9 / 38 MC: 1
Location: comp(36528..39881)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Transcription-repair coupling factor n=1 Tax=Thermobaculum terrenum (strain ATCC BAA-798 / YNP1) RepID=D1CBU7_THET1 similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 39.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 658
  • Evalue 3.00e+00
  • rbh
Transcription-repair coupling factor Tax=zPERA2_38_36 UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2197
  • Evalue 0.0
transcription-repair coupling factor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 39.3
  • Coverage: 947.0
  • Bit_score: 659
  • Evalue 2.10e-186

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

zPERA2_38_36 → Peregrinibacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3354
GTGATTAAGCAAAACTCTTTCGTTACGCGTTTTACGTATCCATTGCATGATGGTGTTATTGAGTCGTTCAAAAAAAACGGCAATTTGATTGTTTCCGGAGCGAATGGACACACCTCAAAAGCACTTGTTGCTCTTGATTTTATCGAGAACGCTGACGGTTTGCCGAAAACTTTTTTATGGATTACCGATAACTGTATCGAGAGGGATATTATTCATAAAGAGCTCGAAAGGCTTGGCGGTGTTAACGCTATTTCCGTTGATGCGCCGATGTATAGTTCGGATGCTTTTGCTCAGAAGGAAGGGGTTTTCAATGGTCAGCGCTGTGATGCGATTAATATTTCTAGATTTTTATCAAAAATAGTTTCAAAGGTTAATAATTTTATAATTGTTCCTTATTATTTTTTGATGAAAAGTTTTCCTGCGCCCGGGGTTATTAAGGGTGGTGTTTTTAAAATTACTTCCGGAGAGGAGGTTGATATGGTTAAAACCTTTGAGAGGTTGATTGATATTGGCTATGAGGTTGGTGATGATATGCAAACTTTAAAACAGGGGCAGTATTTTAAGAGCGGCGGGAATATGACGGTTTGGCCTATCAATAGCGAAAGCCTTGTTAATATTGAAATCGATTTTGATAAAATTGGAAAAATAAATTTATTAAAACCTGTTGTTTGTGAAAACGAAAAGTCTGTGAATTTTGTTGAGATTTATCCGATTATTTTAAGCGGTTATACGGTTTCGATAACTGATTATATTGATAAAAGTACTTTTGTTATTGAGGATGAGCTTGACGTTCCGGATGATTTTTTTGATGAGTATAATGAAATGTCCAATAGTCTTTTTGGAGATAATCAATATTTAAAATTTACGCCTTTCCATGAAGACACTTCAAATCATTCACGTTTGCATTATTTGAGTATCACGAAATACCGCGATACTTTTGAGTTTACGACGGATCTGCGTGATAAAAGGGAGAGCGGTTGGCAGATTTTGATTTTTACGAAAAATAAAGACGAGCTTCGAAATATATTCAATGAACATAAGTTGGATTTTTCAGATAAGGTGGACGTTTTTGATAAAAACGTAGGCAGAATCACATTTGTTGATGTTGCCAGGGAAGATAATTTTCCTTATGCGTTCCAAAACCCTACTTTGAAATTGGCTCTTATTACAGATAAAGAAATTTCGATTATTAGGGATGCGAAAAAGAAAGCAATTTCCCAGAAAGTTATTTTGGACTTCTTGACAGGGCTTAAACCTGGGGACTTTGTCGTTCATGCTGATCATGGTATTGCGAAATTTTTGGGACTTGATCAAAAAACGATCGAAGGAATCACGCGTGAATATTTGGTTCTTGGATATGCGGAAAATGATAAATTGTTTGTGCCAATTGATCAGTCGGATAAGGTTAGTAAATATATTGGATCGAGCGATTTGATGCCAAAATTGACACGTCTTGGGTCTGTTGAATGGACGAATATTACAAATAAAGTTAAGAAAGAAACCGAGTCGATTGCGAAAGAATTATTGCAACTTTATGCGTCTAGAAGAGTTGCGCACGGAATTAAATTTAAAATTGATGACGAGGCTCAGGCGCGGTTCGAAGAGAAGTTTCCATATGAGGCAACGCCCGGGCAAATTAAAGCTTTTGAAGAAGTTAAAAAGAAAATGGAATCTCCTGAGCCGATGGATTTGCTTGTTTGTGGAGACGTTGGATTTGGAAAAACCGAGGTTGCGATGCGTGCGGCGTTTAAGGCTGTTAGAAGCGGAAAACAGGTTGCCTTGATTTCTCCAATTACGATTTTGGCGGATCAACATTATAGATCTTTTACAAAACGTATGGATGAATTTGGCGTAAGGATTGACATGTTGAGTAGGTTTAAAACCAAAAAAGAGCAGGATGTGATTGTTAAAAAATTGGAAAAAGGGGAGATAGATATTGTGATTGGAACGCATCGATTGCTTCAGCCGGATATCAAATTTAAAAATCTTGGTTTGCTTGTTGTTGATGAAGAGCAAAGATTTGGAGTTAAACAAAAAGAGGCTTTGAAAAAGTTGCGCACGGAAATGGATATTCTTGTTTTGACTGCGACGCCGATTCCAAGAACTTTAAATATTGCTTTGAATAAATTGCGCGATATTGTGACGATTACAACTCCACCACCGGGGCGTTTGCCTGTTATTACAGAGGTTAGACAGTTTTCTATGACATTGATTCGTGAGGCGATTTTGGCGGAAGTTAAGCGCGGAGGGCAGATGTATTTTTTGCATAATAGGGTTCAAACGATTGATGGAATGGCGGATAAATTGCGATCGCTTGTCCCGGAAGCGAGATTTATTGTTTCACACGGGAAATTGAATAGCGATGAATTGGAGGAGAGGATTATTGATTTTAAAGATCATAAATATGATGTTCTTGTGACTTCTACTATTATTGAAAATGGGATTGATTTGGCGAGTGCGAATACCTTGATTGTTAATCACGCGGAGAAGTTTGGATTGTCACAATTGTATCAATTGCGAGGTCGCGTGGGACGTAGCAGGACGCAAGCTTACGCTTACTTTATGTATCATGGGCAGAGATTGCCACTTGACGCAAAAAGAAGGTTAAAAGCGATTGTCGAAGCTTCTGATTTGGGTAGTGGTTTTCAGATTGCAATGAAGGATTTGGAGATTCGCGGAGCCGGTGATATTTTGGGCGTTAATCAGCATGGAGTTGTGAACGTGGTTGGTGTGAGTTTGTTTATTCGTATGCTGAATAAGGCGGTTGAAGACTTGAAAGCGGGGCGCACGACTGATAATAAAGATGAGATTCCGGAAGTGTCTGTTGAATTGCCGTTAACAGCCTTCATACCTGATAATTACATCGTTAGTTCAAAGGATAAAATTAATATTTATCAGAGAATGTCTGCGGCGGATACGTTGCAGTATGTTGGTGAAATTAAGGATGATGTTGTCGAGGAATATGGGCAATTGCCACGTGAAGTTTTGAATTTATTTAAAATTATAGAGTTGAAATTATATGCAAAACAGGCCGGAATCGTGAATTTGAAAACCGAGAATATGCATGGCGGGAAACAGGAAATTGTGCTTTATATGTCGGATAAAGTGAAGGCCGGGAATATTGCGAGTTTGTTGAATTACAATCCAAAATGGCAAATTTCCGGAAGCAAATTGCGTGTTTTGATTAAAGATTTGGGCATGGATTGGCCGGAAGAGTTAAAAGAATGTTTGATAAAGTTGGGCAAGGTTTTGCTGAGTGCGGCAACGGGGGCGGATGTTGCGAATCCGCCGGTTCAATCGAAGCCGGAGGTGCAAAATTCGAAACAAATTCCAAGCACGAATAGTGGGATTTGA
PROTEIN sequence
Length: 1118
VIKQNSFVTRFTYPLHDGVIESFKKNGNLIVSGANGHTSKALVALDFIENADGLPKTFLWITDNCIERDIIHKELERLGGVNAISVDAPMYSSDAFAQKEGVFNGQRCDAINISRFLSKIVSKVNNFIIVPYYFLMKSFPAPGVIKGGVFKITSGEEVDMVKTFERLIDIGYEVGDDMQTLKQGQYFKSGGNMTVWPINSESLVNIEIDFDKIGKINLLKPVVCENEKSVNFVEIYPIILSGYTVSITDYIDKSTFVIEDELDVPDDFFDEYNEMSNSLFGDNQYLKFTPFHEDTSNHSRLHYLSITKYRDTFEFTTDLRDKRESGWQILIFTKNKDELRNIFNEHKLDFSDKVDVFDKNVGRITFVDVAREDNFPYAFQNPTLKLALITDKEISIIRDAKKKAISQKVILDFLTGLKPGDFVVHADHGIAKFLGLDQKTIEGITREYLVLGYAENDKLFVPIDQSDKVSKYIGSSDLMPKLTRLGSVEWTNITNKVKKETESIAKELLQLYASRRVAHGIKFKIDDEAQARFEEKFPYEATPGQIKAFEEVKKKMESPEPMDLLVCGDVGFGKTEVAMRAAFKAVRSGKQVALISPITILADQHYRSFTKRMDEFGVRIDMLSRFKTKKEQDVIVKKLEKGEIDIVIGTHRLLQPDIKFKNLGLLVVDEEQRFGVKQKEALKKLRTEMDILVLTATPIPRTLNIALNKLRDIVTITTPPPGRLPVITEVRQFSMTLIREAILAEVKRGGQMYFLHNRVQTIDGMADKLRSLVPEARFIVSHGKLNSDELEERIIDFKDHKYDVLVTSTIIENGIDLASANTLIVNHAEKFGLSQLYQLRGRVGRSRTQAYAYFMYHGQRLPLDAKRRLKAIVEASDLGSGFQIAMKDLEIRGAGDILGVNQHGVVNVVGVSLFIRMLNKAVEDLKAGRTTDNKDEIPEVSVELPLTAFIPDNYIVSSKDKINIYQRMSAADTLQYVGEIKDDVVEEYGQLPREVLNLFKIIELKLYAKQAGIVNLKTENMHGGKQEIVLYMSDKVKAGNIASLLNYNPKWQISGSKLRVLIKDLGMDWPEELKECLIKLGKVLLSAATGADVANPPVQSKPEVQNSKQIPSTNSGI*