ggKbase home page

rifcsphigho2_01_scaffold_17167_16

Organism: RIFCSPHIGHO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_34_23

partial RP 31 / 55 MC: 6 BSCG 19 / 51 MC: 1 ASCG 27 / 38
Location: comp(8722..12795)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Sorangium cellulosum (strain So ce56) RepID=A9FHR2_SORC5 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 30.9
  • Coverage: 262.0
  • Bit_score: 112
  • Evalue 4.10e-21
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.9
  • Coverage: 262.0
  • Bit_score: 112
  • Evalue 1.10e-21
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:CAN98241.1}; TaxID=448385 species="Bacteria; Proteobacteria; Deltaproteobacteria; Myxococcales; Sorangiineae; Polyangiaceae; Sorangium.;" source="Sorangium ce similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 30.9
  • Coverage: 262.0
  • Bit_score: 112
  • Evalue 5.70e-21

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Sorangium cellulosum → Sorangium → Myxococcales → Deltaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4074
ATGAGGGTGATGTTACTTGCGGTATTTGCTTTAGTTTTATTATTGGGGGCGTTTACGACTTATTATTTTAATGATAAAGTTTTAACTGCGCCTGAAGATGGATTTGATATTACGGACACTATGGCTCCTGTCGGGGCTTCACTGCCTGGAGAAAATGGAGTAATTTTTGCGAATGGAATTTACACCTTGACTTATTCTGAAAATGGAAATATTTTAACGCAATATGAAATAGACACTAATAATGATGATATTGAGAATGGGATGTTTTCTGTTAAAGAAAAGATTTCTGAACTAGAAACCGAACAACAGTTTTATCCTGTAAAAAAGGCTGGAACTAGGTATAGGCTTAGAGACCCTTTGGCTACTAATCCTCTTATTTGGCCAACCAACTTTGTGCAGACATTAAATCCAGTGATAACATTTACCCATTCATTATCTAATGAAGGAATTATTGAATTAAGATATCGTGAAATAATAGAAAGGTCTGAACAGGTAAATATCGAGAAACGTTATTTATTGAGCATAAAGGGCAAGACGCTTGTGCTTCAAGTAGAAGCATTAAACCCTCCCCCTTCTCCTTTTGGATATTATCAAGATTTTGTTTTTGATAGTAATGTTATGCCAAATAATCCTTCTCCTTCTAATATTGCATTATCTTATGCAGAGTGGGCTCCTATAACTATTGCAGGACCCTTGAATAATAGATATTATCAAACAATTTATTTTGACTACACTAAAAGTAATTCTAATAGCTGGCCTTGGCTTAGAAATTATATAAACTCCCCAATAAATAGTTATATGTTTGCTTACACTCCCTCATATTCTGAGGGCATTGCCGGAAATTATAATTCTCTTTCGGAGACATTTTATATTACTTTAAGTAAAAATATTAATGATGTAATTCCTAAGATTAATAGACCTGCCCCGCAATATAGAAGTGAATTAAATAATAGGATACCTCTTGAATTATGGCGCATTTATATGCCTGCTGTTTTGAGTTCTACGGCTGAAAGACCTTTTGAAAGAGCAAGAACTCAAGTAATTGATGTTTTGAAATCTTATGGTCTTGAAGATTTGTTAGTTACTCTGACTGCATGGAGACACAGGAATGTTGTGGGTACTTGTGGAGATTCTGGGCCTATAGCCTATCCCGCTGAGAGTAGTTGGGGAGGTTCTGAAAAGATGTTAGAACTCTCGAGGGTTGCTCAAAGTTATGGGTATCTATTTGGACTTTATCAAATCCATACTGATATGTATGATACTGGATTATGGGAACCTGAAAATCTTCTTCTTAATCGTGCTGGCGATTGGGTAAATTATGGTTGGACCAACACTAACTGCCCTCCAACAAGACTTTCCCCTAGAGGAAATTTAATTTCCCAACCATTAATTATCAAACCCGACAAATGGATGCATTATGCTCAATTAGATACGCCAAACATTAAACAAGATTATGAAGTAAGTTCTGTGTTTTTAGATGTTCATCCGAAATTACTTTATCCTACGTTCATAGATTATGATTTAGGCTCTTCTGTAACTGCAAAATCTCCTAAAATTATTAATCAAATTATAGACTCTCTTTTAACGTATTTAAGGAGCCAGGTTAATGGTCCAATCGTAGGAGAGGGCGGTTCTTCGGAATCATATCCTACAGACACATTGCATGCAGGATATATTGAAGGGGTCGAGGGAGAGGGAGTAGCTAGAAGGATTAATAATATTTATTTGGCTCCTCATGAGACTCCTGTAATTCCTGATTTTGAGCTCAGGCATATTAAACCTCTTATGGTAAGATTCGGAATGGGATATGCTAACCGTTGGACCAAACCAGAGGAAGTAGTAGAGCCTAAAATTAATATCTTAACTTATCCTTGGGATAAATATATTGCAACTCAATTTGCTTTCGGACATAGCGGATATTTGAACGACGAGTATCTTTATGCAGATACATGCTCTCCATCCAATACTGAATGCTGGGGTTCTGTTGGATCTTGGAGTGGTAATCCAACACAATATGAGAGAGACTTAGCTAAAAATACGATTAACTTATTTGTAAAACAATATTATAATGCTAAAGCCTTTCAAGAATTATATCTTTCGTCAGATATATTGGAAATTAAATATTTAAATTCCTCTGGAAATTTGGTTTCTTTGTCTAGTGCAATCGATGAAGGTGTTGATTTTTACAACCCTAGAATTTATTTAAAATACCGAGATGGTACTGAAGTTTGGATTAATAGGGACCAGGCTCTGGGAAATGTTTGGACAGTAAACGCTGATGGTGTTACTTACTACCTTCCTGCAAACGGATGGCTTGGTATTAATTCTGTTGCAAACTTCTTGGAGTATTCGGCTTTAGTTGATAACAATGGAAATCCTGACCCTAATGGATATAGAGTAGATTATGTTAGAAGTAATGATTATATTATGGCAGATGGTCGTGGTGTTGAGACTAATTTTGGAAATGGATTCAATAATGTTCCTCTTATTTCTACTTATTTTACTGTTGTTAAGCCTAACGGGTGGACATTGTTGGAACAAGCCAATAGAGGTTTTCAAGTAACTTCTACGGAATTTTGTGGGAATAATATTTGTGGAGTTGGAGAGACTTGTAGTTCTTGTGTTATTGATTGTAGAACTTGTGCACCTATTTGCGGGAATGGAATTGTTGAAACTGAGGAAGTATGTGATGGGGGAGTTCAAAGTTGTACTATTAACGGATATGCTGGAACTCAGACTTGTAGCTCTAGTTGTACATGGAATTCTTGTACTACTACGCTGAGTTGCGGAGATACTTTTTGCAATGGTGCTGAGACTTGTTTTAGTTGTGAGGGAGATTGTGGAACATGTCCTAACTCTAATCCTTATATTGAGAGCATTAATCCAAATACGATAATAAACACCGAGTTTAGAAATGTTCAGATTTTGGGAAGAGACTTTTACCCCCGCGCAATTGAATTTGATGGATTGGAGTACCCTTCTTTTTATGGATGGACTGTTTCGCCTAATCGCAATATGATAAATATGATAATTCCTTCAGGATATCCTGGAGGAGATAAGACAATAAGAGTTATCAATACAAACAATGTTATTTCAAATGCAAAAACTCTTAGAATAAATTATAGATTTAATTATGATTTATCATTAAGTCCATCTTCGATAGTTTTAGCCCCAGGAGCCAGCCAGGAAATTCAAGCAATAGTCAATGTTCTACCTTTTGTTGGTATTGAAGAGGTATCATTTTCTGTGGTGTCAGATCCTCAAATATCTTACCAATTTGTTGGAGTAGATAGGTGTACTGCTGAGCCTTCTGGCGAAGAAATAAAGTGCTCAATAAGAATAATACTTACAGCTTCACCTTATTTAAATTTGCAAACATACAATGTCCAAATTACAGGAAGATCTTTGACAACAAACCCTCAAACAGAGATTCTTGATATTAATGCCTTGCCTGATGCTCCTAGTAATCTGGTTGTTGTGGCACTAGACTCTTCTTCGCTTAAATTAGATTGGATAGATAATAGTAATAATGAAAATGGGTTTAAATTAGATTATAAATTACATTCTTCGTCTTCTTGGGGGACTGTTGATTTACCTACCCCTAATACTGAAACATATACGCATAGTGGATTGAGTGCTAGTACTGAGTATGATTATAGAGTTTTTGCTTATAATCAGTTTGGTAATTCTGAACTTTCTAATGTTGTTTCTGGAACTACTAATCCAGGCGGTTCTTCTAGTAGTTCTAGTAGTAACGATAAAAAAGATAATGATAATGATACTTTTGTAGACTACCCTTATGATCCGGGATGTTTGAATAAAGAAGATAATATTGAATTAGACTCTGTATTAGTAAATATAAATAAACATTCTAACTCGACATTGAAAAATGATTCTACTATTGATGACGGTGATGATATTCAGCCTGTTGAAAAAGATAAAGAGATAAGGCTGGTTTTCTGGCTGACTATTTTAGTTCTTGTTTTAGGAATGGCTGTTGCTGTGATAATTACTGTTCGTTCAATTAGACAGCATAAGAGGCTTAAAGAGATTTATTCTCATGTGCATAACTAA
PROTEIN sequence
Length: 1358
MRVMLLAVFALVLLLGAFTTYYFNDKVLTAPEDGFDITDTMAPVGASLPGENGVIFANGIYTLTYSENGNILTQYEIDTNNDDIENGMFSVKEKISELETEQQFYPVKKAGTRYRLRDPLATNPLIWPTNFVQTLNPVITFTHSLSNEGIIELRYREIIERSEQVNIEKRYLLSIKGKTLVLQVEALNPPPSPFGYYQDFVFDSNVMPNNPSPSNIALSYAEWAPITIAGPLNNRYYQTIYFDYTKSNSNSWPWLRNYINSPINSYMFAYTPSYSEGIAGNYNSLSETFYITLSKNINDVIPKINRPAPQYRSELNNRIPLELWRIYMPAVLSSTAERPFERARTQVIDVLKSYGLEDLLVTLTAWRHRNVVGTCGDSGPIAYPAESSWGGSEKMLELSRVAQSYGYLFGLYQIHTDMYDTGLWEPENLLLNRAGDWVNYGWTNTNCPPTRLSPRGNLISQPLIIKPDKWMHYAQLDTPNIKQDYEVSSVFLDVHPKLLYPTFIDYDLGSSVTAKSPKIINQIIDSLLTYLRSQVNGPIVGEGGSSESYPTDTLHAGYIEGVEGEGVARRINNIYLAPHETPVIPDFELRHIKPLMVRFGMGYANRWTKPEEVVEPKINILTYPWDKYIATQFAFGHSGYLNDEYLYADTCSPSNTECWGSVGSWSGNPTQYERDLAKNTINLFVKQYYNAKAFQELYLSSDILEIKYLNSSGNLVSLSSAIDEGVDFYNPRIYLKYRDGTEVWINRDQALGNVWTVNADGVTYYLPANGWLGINSVANFLEYSALVDNNGNPDPNGYRVDYVRSNDYIMADGRGVETNFGNGFNNVPLISTYFTVVKPNGWTLLEQANRGFQVTSTEFCGNNICGVGETCSSCVIDCRTCAPICGNGIVETEEVCDGGVQSCTINGYAGTQTCSSSCTWNSCTTTLSCGDTFCNGAETCFSCEGDCGTCPNSNPYIESINPNTIINTEFRNVQILGRDFYPRAIEFDGLEYPSFYGWTVSPNRNMINMIIPSGYPGGDKTIRVINTNNVISNAKTLRINYRFNYDLSLSPSSIVLAPGASQEIQAIVNVLPFVGIEEVSFSVVSDPQISYQFVGVDRCTAEPSGEEIKCSIRIILTASPYLNLQTYNVQITGRSLTTNPQTEILDINALPDAPSNLVVVALDSSSLKLDWIDNSNNENGFKLDYKLHSSSSWGTVDLPTPNTETYTHSGLSASTEYDYRVFAYNQFGNSELSNVVSGTTNPGGSSSSSSSNDKKDNDNDTFVDYPYDPGCLNKEDNIELDSVLVNINKHSNSTLKNDSTIDDGDDIQPVEKDKEIRLVFWLTILVLVLGMAVAVIITVRSIRQHKRLKEIYSHVHN*