ggKbase home page

L1_008_000M1_scaffold_1643_36

Organism: L1_008_000M1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 20 / 38 MC: 16
Location: 30078..32108

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Efflux ABC transporter permease protein n=1 Tax=Clostridium sp. CAG:417 RepID=R6SQT2_9CLOT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 77.1
  • Coverage: 680.0
  • Bit_score: 1045
  • Evalue 0.0
Efflux ABC transporter permease protein {ECO:0000313|EMBL:CDC62260.1}; TaxID=1262804 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium; environmental samples.;" source="Clostridium sp. CAG:417.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 77.1
  • Coverage: 680.0
  • Bit_score: 1045
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 53.4
  • Coverage: 689.0
  • Bit_score: 717
  • Evalue 3.00e-204

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. CAG:417 → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2031
ATGCTCTTTAAGTTATCATTAAAAAATATTAGTAAGAGTATAAAGGATTATGCCATCTATTTCTTTACTCTGATACTAGGTGTTGCGATTTTTTATGTGTTCAATGCAATAGATGATCAGTCAGTTATGATGAAGGTATCATCAACAACAGCAGAAATAATAAAACTTATGACCAATGTTCTTTCTGGTGTTAGCGTGTTTGTATATATAATATTAGCGTTTTTAATTGTTTATGCAAGTAGATTCTTAATAAAAAGAAGAAATAAAGAATTTGGAGTTTATTTAACGCTTGGAATGAGCAAAAAGAAAATATCCTTAATATTATTTATTGAAACATTAATAATAGGTATAGTTTCATTGGTAGTTGGTTTAGGAATAGGTTTTTTATTATCACAATTGATGAGTATTTTGGTTGCTAATATGTTTGAAGCAGATTTAACTAGATTTCAATTCGTATTTTCAACAAATGCTTGTATTAAAACTTTGATTTATTTTAGTATTATGTATTTTGTAGTTATGATATTTAATACTATAAATATTAGTAAATGTAAATTGATAGATTTAATGCATTCTAACAAAAAATCTGAAAAAATAAAATTAAAAAATCCATTGTTCTGTACAATAGTGTTTATTATTTCTTGCATAGCACTAGGATTTGCTTATTATCAGGTTACTGGTGGCATTGAGAAAATGACTAATGCAAATAGTATTTTTGTTCCTATAGGAGTAGGTGCTATTTCAACTTTCTTTGTGTTTTGGTCTTTATCGGGCTTGCTTTTAAAAATATTTATAAGTATGAAGAACACCTATTATAAAGGGTTAAATAGTTTCACCCTTAGACAGTTTTCAAGTAAAATAAATACTATGACTTTTTCTATGACAATAATATGTTTGATGTTATTTATAACGATTTGTGTACTATCAAGTGCTTTGTCAATGAAGAATTCTTTAAATAAAAATGTGGTAGAATTTTCTCCAAGGGATGTAGAAATTTCAAAACCTGCAAATGTTGATTTAGAAGATAGTGATTTTACTGATAAACAAATAGAAAATTATAAATTAAGTTTTGAAGAAATTTTTACAAAGAATGGATTTGATTTTAAAAAATTTAAAAATATAGTTTATTTTTCTTTGTATGCTGATGATTATGTTACTTTAAAGTCTACATTAGGAACTTATTATAAAACTGCAAAGAAAAATTATCCTTTTTTAAGATATGATGATTATATTGTTTTAATGAAAAATAGTGACTATAATAACTTAGCTAATAATTTTAATTTAGAAAAAATCAATTTAAATAGTGATCAATATGCTGTTGTTGGGAACTATAAAGAAATGATTGATATTAAGAATGAAGCTTTAAAAAGAAATACAGAGATTATAGTTAATCAAAGAATATATTTACCAAAATATAAAAAAGCAATTAATGGTTTTTATGAAATGGGTAGTCAAAAGTCAGAGATTGGGTTTATTGTTTTACCAGATGATGCTTTAAATGAAAATCAAAAGATATCTAACAAAATGGTTGCTGATTATAATGGAAATCAAGATGATATAGAGAAAGATGTTACTTCATTTTTAAATAATACTAGTAAATACATCATAACATTTAATACTAAGAAAGATATAAGAGATGCAAGTGTTGGACTTGGTGCTATTGTTACATTTTTAGGCTTGTATCTTGGAATTATATTTTTGATATCGTGTGCTGCTATTTTAGCTTTAAAAGAATTATCAGAGTCAAGTGACAATGTAGAAAAATTTGTTGTGTTAAGAAAAATTGGTGTAGATGAACAAGAATTAAATAAAGCTCTTTTTAAACAAATTGGAATATTTTTTATGTTTCCACTTATACTAGCTATAATTCATTCAATATTTGGTGTTATGTTTTGTAATAATATTTTAAAAACAATGGGTGTTAGTTTTAATTTAAAATCAGTTATAATAACATCTTTATTTATAATATTTATATATGGAGGTTATTTCTTTATAACTTATATATGTAGTAAAAATATAATTAAGGAAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 677
MLFKLSLKNISKSIKDYAIYFFTLILGVAIFYVFNAIDDQSVMMKVSSTTAEIIKLMTNVLSGVSVFVYIILAFLIVYASRFLIKRRNKEFGVYLTLGMSKKKISLILFIETLIIGIVSLVVGLGIGFLLSQLMSILVANMFEADLTRFQFVFSTNACIKTLIYFSIMYFVVMIFNTINISKCKLIDLMHSNKKSEKIKLKNPLFCTIVFIISCIALGFAYYQVTGGIEKMTNANSIFVPIGVGAISTFFVFWSLSGLLLKIFISMKNTYYKGLNSFTLRQFSSKINTMTFSMTIICLMLFITICVLSSALSMKNSLNKNVVEFSPRDVEISKPANVDLEDSDFTDKQIENYKLSFEEIFTKNGFDFKKFKNIVYFSLYADDYVTLKSTLGTYYKTAKKNYPFLRYDDYIVLMKNSDYNNLANNFNLEKINLNSDQYAVVGNYKEMIDIKNEALKRNTEIIVNQRIYLPKYKKAINGFYEMGSQKSEIGFIVLPDDALNENQKISNKMVADYNGNQDDIEKDVTSFLNNTSKYIITFNTKKDIRDASVGLGAIVTFLGLYLGIIFLISCAAILALKELSESSDNVEKFVVLRKIGVDEQELNKALFKQIGIFFMFPLILAIIHSIFGVMFCNNILKTMGVSFNLKSVIITSLFIIFIYGGYFFITYICSKNIIKEK*