ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

You do not have permission to do that.

Please email help@ggkbase.berkeley.edu for help.

L1_008_000M1_scaffold_170_12

Organism: dasL1_008_000M1_concoct_89_fa

near complete RP 47 / 55 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 23368..29370

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
RCC1 repeat-containing protein n=1 Tax=Myxococcus stipitatus (strain DSM 14675 / JCM 12634 / Mx s8) RepID=L7U7G8_MYXSD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 32.4
  • Coverage: 1044.0
  • Bit_score: 516
  • Evalue 6.20e-143
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EPR11514.1}; TaxID=1330534 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Ruminococcaceae; Ruminiclostridium.;" source="[Clostridium] papyrosolvens C7.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 33.8
  • Coverage: 1309.0
  • Bit_score: 588
  • Evalue 2.30e-164
RCC1 repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.4
  • Coverage: 1044.0
  • Bit_score: 516
  • Evalue 1.70e-143

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

[Clostridium] papyrosolvens → Ruminiclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6003
GTGCTTTTATTGGTTGTTGTAGTATTATTTATTCAAGCGGTTTTGCCAGTAAACGCAAATGTTTTTAGTGTATCATTAAATAATCAAATGATAAAATACGATGCCTTATCATTTGATAATGAATTTAATACGGCCGAGGATGTAGATAATAATATACCAAGTGATGAAAAAGAGCTTATGCAGGTTGAACAAGAGATTTTATATTCAGAAAAGCAAAATAAGGATAGATATATAATTAAATATAAAGACGCTAATAAAAAAGATATATCAAAACTTAAAAATGTAAGTGAAACTGCATATCAAAAAGGAATGGAAAAAAGAGAAAAGGAGGAGTCTGAACGGTTAAGAAGGTTTAAAAATATTGATAAAGAGAAGCTTGTAAGACTTAAAATGAAAGAGAACAGAATAAAAACTGAATCTAATGAAAATGTTACTGTTAGCAAACTTACGGACAATACAGAAGAATTCGAAGTTATAGAGTTAAATGAAAGTGTAAATTCTGATACATTTATAGATAATATTATAAATGAACTAGGAGATGTGGTTGAATATTTACAACCTGATTATGTGATGGATATGTTTGGAAAAACAAACACAGAATTAATAACTGAATCTGATAGTCAAACAGTAACTGCAGATAATATAATTGAAGATTCTAGTATTAGTGACGATTATAATTCATTAAATATTACAGAGACTTCTATAACAGATGAAACACTTGAGCCAGAATCAAATGAGTACGATAGACTATATAATATAGATAAAGATTTAAATATGGCTTTGGAGATAAGTCGTGGTGATAATGTGACAGTAGCAGTCATAGATACAGGAATTGATGTAAATCACCCATATTTATCCGAACATATAACAGAGGGATGGAATTTTGTTAATGATGTCAATGAAGTATATAATGTAGATTTGGGATTAGAACAATCGCATGGAACACATATAGCCGGAATAATTGCAAAGATTGTTCCTAATGCAAAGATAGTTCCATTAAAAGTATTTGAAAATGGTAAAGCACGCACTAGCGATATAATAAAAGCAATAAAATATGCAAAAGAGAATGGGGTAACTATAGTAAACTGTAGTTTTGGAAGTACGGATGATAATAAGGCATTAAAAGAATCTATTGAGCAATCAGGATTATTCTTTGTATGCGCTTCTGGAAACAATAAAATAAATATAGATGAGACGCCGATATACCCGGCAGCTTTTAACTTACCAAATACAATTAGTGTAGCGTCGTTGAATCAAGGATTGGGAATGTCATATTTTTCAAACTATGGTGTTAACAGTGTTGATATATCAGCTGTTGGTAGTGACGTATATAGTTGTTTGCCAAATGGCGAATATGGTACAATGGATGGAACCAGTATGTCGGCTGCACTTGTAACGGGGGCTGCAGCATTGGCTCAGAGTATTGGAGTTGATACTTTAAAGGAGACTCTAAAGAATACATCTGATAAACTTACGTGTTTAAAGGATAGTGTGATTGATGGAAACAAGCTCAGTCTTTACGGTGCGGTTACAGGAGTTCCGGCAATAAAAGAAGAGGTCAATATAATTCCGGATGATGATTTTGAGATTAAGGACTATCAGAAAACATCTACGGAAAGCTGGGAGTTGTTTAGCAGTCTGGAAAATAAACAAGTTGTTGTTGAGGGCGAAAATACATATTTCTTGAAAAGCAATGGTTCTGTCTGGGCTGCAGGCAATAATAGTTATGGTCAGCTTGGTAACTTGACTTTTACAGAAAGTAATATACCCGTACAGGTTTATGGTTTATTTGATGTAAAGCAAATTTCAGCAGGAAATGGTTTTTGTATTGCGGTATGTGATTGTGGATACGTATGGTATTGGGGTGAAAATCAAAATATAGCAAAAAGAATAAATGAATTATATAGTATTGACTCTGTAAGTGCGAGTTACTATAATAAGTATGCCATTAAAACAGACGGTAGTGTGTTTGCCTGGGGGGATAATGCCTATGGTAGTTTAGGTAACGGAAACAAGGAAATAGTATATTCTCCTGAGCAACTCAGTATTACAAACGTAAAGCAAGTTGTGGGTACTCCTAAATCGACTATTTTTTTAAAAAATGATGGAACTGTATGGGCTTGTGGTTCAAATGTACATAAGATTCTTGGCGATGGCTCGGAAAAGACACAGACATTACCTGTTAAAGTTATGAATGTATCTAATATTATAAAAGTATCGTGTGGTACAAATCATGCTGTGGCTTTAACTAATCAAGGAGAGGTATATGTTTGGGGAACAAATAGTAGAGGTCAATTAGGAATGCCGGAAATAACAGAGGACAGCAATGCAGTACTAACTGTTTTCACGGATGTAATTGATATAGGTGCTGATGGAGATTATACAATTATTATTAAAAATGATGGGACAGCGTGGTCATTTGGATATAATTACTATGGACAATTAGGTATAGGAAATAGGATAAACAAAACGTCACCAGAACAAATTAGTACATTGTCTAATATAACAAAAGTTATCTTGTCATATAGTCATGCAGCTGCCATTGATAGTTATGGGAATGTGTGGATGTGGGGAGACAATTCATATGGTCAATTTGGTAATGGTACTTTTTATCCTACTTTAATTGTTGGGTATTGGAATAATTTAAGCAATGCAAGAACCAGAATGTCTGCAGGGAAAAATCATTGTTTATATGTTAGCTCTGGTGGGGAATTATATGTATCTGGCTCTAATGAATATGGTCAGCTCGGAAACGGAACAAATCTAGATTCTGATTTTAGCTGTGTTCAGTTACTTGAAGATATAGTAGAGGTTGCAGCGGGAGATTATTTTAGTGTTGCACTAAGAGCAGATGGAACCGTATGGACATGGGGGTTAAATAATAAGGGACAATTAGGAGACGGAACAAATCAAAACAGTAATATTCCTCATCAAATTTTATCTGATATTGTTAGTATATCAGCAGGGAAAAATCATGCTTTAGCTGTAACTAATAATAATACATTGATGATGTGGGGGTCAAATGAATACAGTCAAATTGGTATAAATGGAGAATTTATAAATGTTCCGAAAGAAACAGGAATTGATATTATTAAAGCATTCGCAGGAGGGGACAATAGTTTCTATTTAAAAGGAAACGGAACTTTATATGGTTGCGGAAAAAACGATAAATATCAAGCTGGATTTGATTATGGGTTTGATATTGTAGGATTTGGTGAAATTGAAGAAGTTCGCGACAAGGATATATTAGACATATCTGTTGGTGAAAACCATACGGTTATGTTGGACATAAAGGGAAATGTTTATTCATGGGGAGACAATTCATATGGGCAATTAGGTATTTCAGAGGATACTCCTTATGTTCATAAAGTTCCTATAACTGGAGTTGAAAAAATAATTACTAAATATAATTCTACATTTGCAATAGATAAGGATGGTAATACATATTCATGGGGTGATAATACTTATAAACAATTAGGATATGAAACTGAAAACATATATTCATATATACCACAAACAATTAACACTGATTTTAATAGCATTGCCGCAGGAGAACTATCCACATGGATTAGCGATGAATTAGGTTATATATATAAGTGGGGATATATGCCAAACGGAAATCCTGATATGTATGTAAATCAACAGAGTTACAATCCACTTAAAATACCATTTGGAAGTAAATTTATCCAAGTTGATGCAAAAAGAAATAGTGTGGTAGCTTTAGATGAAAACGGAAACGTATACACATGGGGAGACGGTTCATATTATGATTTAGGTCATGGTCAGGAAAATAAAAATATAAACTATCCTCAAAAAGTTGAAGGGTTACCTAAAATAGTAAAAGTAGCAAAAGGCAAAAATCATACACTGGCACTTGACGAAAATGGATATGTTTGGGGTTGGGGCAATAATTCAAGTGGTGAACTTGGAAATGATCTTAAAGGTAAGGTATATATACCAACTAAGATTTCAAGAATAGATCATATTACCGATATATCAGCCGGAACTGGATTCAGTGCAGCAATAAGAGAATATGATGGTTCGTCTAAAATATGGACATGGGGAAATTCAACTGACGGAAAGCTTGGCGAGCGAGGAGAATATTTACCTGGAACACCAGCTGAAGTAATGGTAATTGATGCTGTAGAAAAGGTGTCGTGTGGTGATAAATTTATGGCGGTGATATCTAATGGTAGTGTAGTCTCGTGGGGAGCAAACGACTATGGGCAACTGGGAAATGATGCTGATATTAGAGCTTCGGAACCGCATTTGGTGGCGGGCGATTTTAAACAGATATCAACAGATTCAGAACATATTTTAGCCTTAGGGGTTGATAATAAAGTGTGCTCGTGGGGAAAGAATTCTATTGGTCAACTAGGACTTGGTGATAAAAATAACAGAAATATTCCTACCGCCATACAAAGTATAAACAACGTAGAATCGGTCGGTACCGCATATGCCCACAGCATGGCAGTACTTAATAATGGGACAGTGTATGCGTGGGGGGAAGGCAGGGACGGACAACTTGGAAATGGTAATAATGGAACCAGTAAAACACCGGTTAAGGTCGGAGAATTTAATAATGTTATACAAGCTACAGGTGGTGGGGCATTTTCAATTGTACTTGATAAAGATGGTCAATTATGGTCGTTTGGCAAAAATGATTTTGGTCAGCTTGGAATTATAAGCGAAGTTCCTGTAAATATGAGTATAACTAATATGAATAATAATATTAATACTTCGATTAAAGAGAATACTTTATCTATAAATGGATATACAACCGGACAGGGTGGTAAACAAGTATTTATAAGGGTTCTAAATCCCAGTAATGGAATAGAAGTTTTAGAGCAAGTGACAAGTAATAAGGTTGGATATTATTCATTATCCATACCTTTAAAGGGAAATATGAATGGGACATATCAAGTATTTGCTACTATTGAAGGGGAGCCTGAAATACAAAGTTCGTTTTTTAATATAGGTCATGAGTCTGACATTACCCAAATTTGTCCAGAACCGCCGAATAATATTGCGGTACCTACATTGCTTTCCATTCAAGCGCCAAGTATACTAAAAGGTGATTCGTCATATGGTGTAAAAGCTACAATTCAAAATGATTCAGAGGAGAAAACTCAGAATGTAATGGTATTAACTGCATTATATGACGGTAATGATAAACTTGTTGACTATTCTAGTGTGCATTTGGAAATTGCTTCAGGGGAAATAGGGAGTCTATTACCACAATTATATGTGCCTGCAAATGTAAATGATTATAAAGTTAAGATATTTGTTTGTGAAGGAAATGATATAAGATATGGCAGTATGATGCCGCTTAGCCTTTCAAAGACGATTAAAAATAATATGCAACCGTTGGTATCTGACAGTGAACTACAGGAATCCAAGCTTCCCTCAATAGAGTTAACAGAAAACATGGATGTTTTAGATACAACTAGATTTTTATCTGAGACTGAGGCAGAGTTATCATCAATTTCGACAATTGATGATATCGATGTTGATGTAACATTATCATGTAACGGAGTTTATTGTGAAAATGTATTAAAACAAGGCAGCGATGTAAAAGTTGATGTCAGTATAACTAATAATAGATCGTCGAGTATACCGTTAAATTGCTTTTTTTATGTTCTTAAAAAAGTTCCATCTTTGTTGACGTTTTATGATAGTTGTGAATTAACTATAGAACCGGGAGAGACAAGAGAGTTTTCAAATACCTGTGCACTGAGTCAATTTGATTTAAGCCAATACAATTCCAAAATTTCAATCTTAGGTATGGGCGGAGGTATAGATATGCAGCCTGCTATACCTGTCATTATTCTCTCAAATGATAAACAGGATTTTTTCGGAAATGACAATGATAAAGCGACAAATGTTGGCATTGGAAGGCAAATAGTTGGTGATATCAACTTTTTAAATGATATAGATTGTATAAAATTTGTACCTAATGAAACTGGTTATTATGTTATACAGTCATATGGTAATACAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 2001
VLLLVVVVLFIQAVLPVNANVFSVSLNNQMIKYDALSFDNEFNTAEDVDNNIPSDEKELMQVEQEILYSEKQNKDRYIIKYKDANKKDISKLKNVSETAYQKGMEKREKEESERLRRFKNIDKEKLVRLKMKENRIKTESNENVTVSKLTDNTEEFEVIELNESVNSDTFIDNIINELGDVVEYLQPDYVMDMFGKTNTELITESDSQTVTADNIIEDSSISDDYNSLNITETSITDETLEPESNEYDRLYNIDKDLNMALEISRGDNVTVAVIDTGIDVNHPYLSEHITEGWNFVNDVNEVYNVDLGLEQSHGTHIAGIIAKIVPNAKIVPLKVFENGKARTSDIIKAIKYAKENGVTIVNCSFGSTDDNKALKESIEQSGLFFVCASGNNKINIDETPIYPAAFNLPNTISVASLNQGLGMSYFSNYGVNSVDISAVGSDVYSCLPNGEYGTMDGTSMSAALVTGAAALAQSIGVDTLKETLKNTSDKLTCLKDSVIDGNKLSLYGAVTGVPAIKEEVNIIPDDDFEIKDYQKTSTESWELFSSLENKQVVVEGENTYFLKSNGSVWAAGNNSYGQLGNLTFTESNIPVQVYGLFDVKQISAGNGFCIAVCDCGYVWYWGENQNIAKRINELYSIDSVSASYYNKYAIKTDGSVFAWGDNAYGSLGNGNKEIVYSPEQLSITNVKQVVGTPKSTIFLKNDGTVWACGSNVHKILGDGSEKTQTLPVKVMNVSNIIKVSCGTNHAVALTNQGEVYVWGTNSRGQLGMPEITEDSNAVLTVFTDVIDIGADGDYTIIIKNDGTAWSFGYNYYGQLGIGNRINKTSPEQISTLSNITKVILSYSHAAAIDSYGNVWMWGDNSYGQFGNGTFYPTLIVGYWNNLSNARTRMSAGKNHCLYVSSGGELYVSGSNEYGQLGNGTNLDSDFSCVQLLEDIVEVAAGDYFSVALRADGTVWTWGLNNKGQLGDGTNQNSNIPHQILSDIVSISAGKNHALAVTNNNTLMMWGSNEYSQIGINGEFINVPKETGIDIIKAFAGGDNSFYLKGNGTLYGCGKNDKYQAGFDYGFDIVGFGEIEEVRDKDILDISVGENHTVMLDIKGNVYSWGDNSYGQLGISEDTPYVHKVPITGVEKIITKYNSTFAIDKDGNTYSWGDNTYKQLGYETENIYSYIPQTINTDFNSIAAGELSTWISDELGYIYKWGYMPNGNPDMYVNQQSYNPLKIPFGSKFIQVDAKRNSVVALDENGNVYTWGDGSYYDLGHGQENKNINYPQKVEGLPKIVKVAKGKNHTLALDENGYVWGWGNNSSGELGNDLKGKVYIPTKISRIDHITDISAGTGFSAAIREYDGSSKIWTWGNSTDGKLGERGEYLPGTPAEVMVIDAVEKVSCGDKFMAVISNGSVVSWGANDYGQLGNDADIRASEPHLVAGDFKQISTDSEHILALGVDNKVCSWGKNSIGQLGLGDKNNRNIPTAIQSINNVESVGTAYAHSMAVLNNGTVYAWGEGRDGQLGNGNNGTSKTPVKVGEFNNVIQATGGGAFSIVLDKDGQLWSFGKNDFGQLGIISEVPVNMSITNMNNNINTSIKENTLSINGYTTGQGGKQVFIRVLNPSNGIEVLEQVTSNKVGYYSLSIPLKGNMNGTYQVFATIEGEPEIQSSFFNIGHESDITQICPEPPNNIAVPTLLSIQAPSILKGDSSYGVKATIQNDSEEKTQNVMVLTALYDGNDKLVDYSSVHLEIASGEIGSLLPQLYVPANVNDYKVKIFVCEGNDIRYGSMMPLSLSKTIKNNMQPLVSDSELQESKLPSIELTENMDVLDTTRFLSETEAELSSISTIDDIDVDVTLSCNGVYCENVLKQGSDVKVDVSITNNRSSSIPLNCFFYVLKKVPSLLTFYDSCELTIEPGETREFSNTCALSQFDLSQYNSKISILGMGGGIDMQPAIPVIILSNDKQDFFGNDNDKATNVGIGRQIVGDINFLNDIDCIKFVPNETGYYVIQSYGNTK*