ggKbase home page

L2_031_000G1_scaffold_151_28

Organism: L2_031_000G1_public_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 18 / 38 MC: 17
Location: comp(32308..35511)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Clostridium butyricum 60E.3 RepID=R0AEI4_CLOBU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 1067.0
  • Bit_score: 2008
  • Evalue 0.0
RND multidrug efflux transporter Acriflavin resistance protein {ECO:0000313|EMBL:KJZ87139.1}; TaxID=1523154 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sp. IBUN125C.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 1067.0
  • Bit_score: 2011
  • Evalue 0.0
putative multidrug efflux pump, membrane protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 65.8
  • Coverage: 1072.0
  • Bit_score: 1382
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. IBUN125C → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3204
ATGAGTATGACAAAAACTTCCGTTAAACGTCCTCTTACAATAATAATGGTATTTTTAGTAGTATTAATGTTTGGTGGAATTGGGTATAGTAAAATGCCTGCTAACTTAATGCCAGATATTGATGTGCCAGTTGCTTTAGTAATGACTCAATGGTCTGGAGCTGGTCCAGAAGATATTGATGATCAAATATCAGAACCTATAGAAAAAAGTCTTTCGTCAATTTCAAATGTAAAGACAACTGTTTCCAAGTCCAGTGAAGGTGTATCGATGGTTGTTGCACAATTTGAATATGGAACTGATGTTGATGAAAAACTTAATGACATAAGAAGTAAAATAGATACAGTAAAAATGACACTTCCTGATGATGTTGACACACCAAGTATTTTAAAAATGGATATGAATGCACAGGCCATTGCACAGATAGTTGTAAGTGGAGAGGGTAGTTCAGATGACATAATGAAATATGCAGAAGATACAGTTCAGGTTAAATTAGAATCTATAGATGGTATAACTTCAGCGGATATTAATGGTGGAGATAAGACACAGATAAATGTCATTGCAAATCCTACTATACTTTCAAGTTACGGTGTATCATTAGATACAATTAAAGGTCTTTTATCGGCAACAAATAAGAGTTATCCTTATGGATCAATAACTCAAGGAGATGACAAAATTGTTATCAGAAGTGTTGATAAAGTTGAAGCTTTAGAAGATATTAAGGCAATTCAAATTCCTATGTCAAATGGTGAAACTGTAAGTCTTGATAAGATATGTACAGTTGAGTTTGGGACTGTAGATAAGCAATCAATTTATAGATACAATGGTCAAGAAAGTTTAGTTATGGATGTACAGAAGCAGCAAGATGCAAATACTGTACAGGTTATGAAAAATGTTAATTCAAAAATATCTGAACTTAATAATGAGAATTCACAATTTAATTTAAAAATAGTTAATGATACTAGTGAATATATAAATAGCTCAATAAATGACGTAATGAAGAATCTTATTTTAAGTGCAGTAATTGCCTTCTTTGTTATATTACTTTTCTTAAAGAGCGGAAGGGCTTCATTTGTTGTTGCAGTTTCTATACCAACATCAATAATTGGTGCAATTGCATTACTTTATTTTACAGGTGAAACATTGAACATGGTAACATTAAGTTCCCTTGTAATAGCAGTTGGTATGGTTGTTGACAACGCCACAGTTGTTATTGAAAATATATTTAAGTATAGAAAAGATCCTAATTTATCTTTAGAAGAAGCAGCTATTCAAGGTACAAATACGGTTTCAACTGCTGTAATGGCTTCAACATTAACAACAGTAGCTATATTCTTACCAATATTGTTTACTGAAGGATTTACAAAGATAATGTTTGGTTCATTGGCTAAAACACTTATTTTTGCATTAACTTTATCATTAATAGTTGCACTTACTTTAGTACCAAGTATATTTGCAAAACTTAGTGGTGGTAAGAATGGTGCAAAGATGGAGGAAAAACCATCTCCTATATTTGATAAAATAAGTGAGGGTTATAAAAATATTATAGTTTTAGCATTAAAACATAAAGCAGTAGTTATTTTAATAAGTGTAGGTATGTTTATTGGAGCAATAGTTTTAGGTGCAACTGGAGCAATAGGTATGGACTTTATGTCAAGTGGTGATGAAGGTATGGTTAGTATATCTATAAAATTACCAGAAGGCTTAGATTTAGAACCAAGTGATTATTATGTATCTATGGCAGAAGAGAAAGTATCTGATATTCCAGAAATTGAAACCATGATAACTCAAATAGGATCAGGCTCAGCAATGGGGTCAGGTGGTTCTACAGCAAGTATAAGTTTGGATTTAGTATCTTCGAAAGAAAGAAAGAGAACAACAGATGAAATTGAACAAGATGTAGTAGAAAGATTAAAAGTAATACCTGACTGTGAAATCAATGTAAGTCAGACTAGTAGTATGTCTATGGGTGGAAGCGGAGATGCTCAAGTAGATATTAAAGGTCCAGATTTAGATGTATTAGAAGAAATAGTTAATCAAGCAAAAGCTAATGTTGAAAAAGTATCTGGATTTAGAAATATAGAAACTTCTCTTGCGGATTCAAATAAGGAAGCTCAATTTAAGATTGATAAAAGAAAAGCTTCATTATTAGGAATAAATACATCGTCAATAGCATCTACATTACGTACAGCAATTAGTGGATCAGATGCTACAACAGTAACAATTGATGATTATGATTATGATGTAAATTTAAAATTCAAGGATTCAAGCATAAATAGTATAGATGACATTGGACAAATAAAAGTAACATCAGCAAGTGGTCAGCAAGTGCCTTTAAATGCATTTGCAGAAATTAAAATGGCTGATGGATTAAAATCAATTTCAAGAACAGATGGTGACTATTCAGTATCAATTACAGCAAAAGCTGATAATATGGATACAAGTACAGCATCAAGACTGTTGACTCAAGCAGTAAATGAAGTTGATATGCCTAGAGATTATAGTATTGATGTTGGTGGATCAGCTGAAATGATGAATGAATCAATGAGTAGCCTTGTAATGGCAATGGTTATCGCGTTAATTCTTGTTTATATGGTAATGGTAGCTCAATTTGAGTCATTTAGTAAGCCTTTTATAATAATGTTTAGTATACCTTTTGCTTTTGTTGGAGTAGTGATTGCATTAGTAATTTCACGTATTTCATTAAATGTAGTTGGAATGCTGGGAGCTATATTACTGGTAGGTATAGTTGTTAATAATGGTATAGTTTTAATCGACTATATTGGTCAGCTTAGGGAGGCTAAAGTTCAAGGAACACTTGAAGATATAGTTGCAAAGGGATGTGCAGCAAGACTTAGACCAGTATTGATGACAACAATGACTACTGTTGTTGGTATGATACCAAGTGCATTGGCATTTGGTGAAGGTGGAGACATGATGCAACCTCTTGCAGTTGTAATTATTGGTGGTCTTTCAGTATCAACACTTGTAACACTAGTATTAATACCAACAGTATACTTAATATTTGATAAGATTGAAAATTCATTGAGAAGTAAATTTGGACAAATATTTGATAAAATAAAAATTCCTCATATTGGACCTAAAAAGTCTAAAATGGACATAAACATATTATCTAAAGATATTGAGGATAAAAAAGAATCAAAAAATGATGATGCTCATGAAAAAGATTCAGATTTAAAGAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1068
MSMTKTSVKRPLTIIMVFLVVLMFGGIGYSKMPANLMPDIDVPVALVMTQWSGAGPEDIDDQISEPIEKSLSSISNVKTTVSKSSEGVSMVVAQFEYGTDVDEKLNDIRSKIDTVKMTLPDDVDTPSILKMDMNAQAIAQIVVSGEGSSDDIMKYAEDTVQVKLESIDGITSADINGGDKTQINVIANPTILSSYGVSLDTIKGLLSATNKSYPYGSITQGDDKIVIRSVDKVEALEDIKAIQIPMSNGETVSLDKICTVEFGTVDKQSIYRYNGQESLVMDVQKQQDANTVQVMKNVNSKISELNNENSQFNLKIVNDTSEYINSSINDVMKNLILSAVIAFFVILLFLKSGRASFVVAVSIPTSIIGAIALLYFTGETLNMVTLSSLVIAVGMVVDNATVVIENIFKYRKDPNLSLEEAAIQGTNTVSTAVMASTLTTVAIFLPILFTEGFTKIMFGSLAKTLIFALTLSLIVALTLVPSIFAKLSGGKNGAKMEEKPSPIFDKISEGYKNIIVLALKHKAVVILISVGMFIGAIVLGATGAIGMDFMSSGDEGMVSISIKLPEGLDLEPSDYYVSMAEEKVSDIPEIETMITQIGSGSAMGSGGSTASISLDLVSSKERKRTTDEIEQDVVERLKVIPDCEINVSQTSSMSMGGSGDAQVDIKGPDLDVLEEIVNQAKANVEKVSGFRNIETSLADSNKEAQFKIDKRKASLLGINTSSIASTLRTAISGSDATTVTIDDYDYDVNLKFKDSSINSIDDIGQIKVTSASGQQVPLNAFAEIKMADGLKSISRTDGDYSVSITAKADNMDTSTASRLLTQAVNEVDMPRDYSIDVGGSAEMMNESMSSLVMAMVIALILVYMVMVAQFESFSKPFIIMFSIPFAFVGVVIALVISRISLNVVGMLGAILLVGIVVNNGIVLIDYIGQLREAKVQGTLEDIVAKGCAARLRPVLMTTMTTVVGMIPSALAFGEGGDMMQPLAVVIIGGLSVSTLVTLVLIPTVYLIFDKIENSLRSKFGQIFDKIKIPHIGPKKSKMDINILSKDIEDKKESKNDDAHEKDSDLKK*