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NECEvent2014_10_1_scaffold_5_82

Organism: NECEvent2014_10_1_Escherichia_coli_52_196

near complete RP 53 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 2
Location: 94037..95302

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
O-antigen ligase n=35 Tax=Escherichia coli RepID=I7AXT1_ECOLX similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 421.0
  • Bit_score: 807
  • Evalue 6.30e-231
  • rbh
lipopolysaccharide core biosynthesis protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 421.0
  • Bit_score: 807
  • Evalue 1.80e-231
Ligase {ECO:0000313|EMBL:AJO85680.1}; O-antigen ligase {ECO:0000313|EMBL:AFN85580.1}; TaxID=562 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherich similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 421.0
  • Bit_score: 807
  • Evalue 8.80e-231

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Escherichia coli → Escherichia → Enterobacteriales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1266
ATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACTCTCTTAAATCATCAATGATTTTAGAGATAATAACTTATATATTATGTTTTTTTTCAATGATAATTGCATTCGTTGATAATACTTTCAGCATAAAAATATATAATATCACTGCTATAGTTTGCTTAGTGGCACTAATTTTACGTGGCAGACAAGAAAATTATAATATAAAAAACCTTATTCTTCCCCTTTCTATATTTTTAATAGGCTTACTTGATTTAATTTGGTATTCTGCGTTTAAAATAGATAATTCGCCATTTCGTGCTACTTACCATAGTTATTTAAATACTGCCAAAATTTTTATATTTGGTTCTTTTATTGTTTTCTTGACACTAACTAGCCAGCTAAAATCAAAAAAAGAGAGTGTATTATACACTTTATATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACTATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAACCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATTAGCTAGCATAGTAATTATATTTAATAAACCAATACAGAATCGCTATAATGAAGCATTAAATGATTTAAACAGTTATACCAATGCTAATAGCGTGACTTCCCTAGGTGCAAGACTGGCAATGTACGAAATTGGTTTAAATATATTCATAAAGTCACCTTTTTCATTTAGATCAGCAGAGTCACGCGCTGAAAATATGAATTTGTTAGTTGCAGAACACAACAGGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTATTTCCATCCTTTTCCTCTATTTTTCACTGTTTTATACAGCATATAAAAGACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCGTTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTTATTAATAATCGTAACAATACTATTAATCAAGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 422
MLTSFKLHSLKPYSLKSSMILEIITYILCFFSMIIAFVDNTFSIKIYNITAIVCLVALILRGRQENYNIKNLILPLSIFLIGLLDLIWYSAFKIDNSPFRATYHSYLNTAKIFIFGSFIVFLTLTSQLKSKKESVLYTLYSLSFLIAGYAMYINSIHENDRISFGVGTATGAAYSTMLIGIVSGVAILYTKKNHPFLFLLNSCAVLYVLALTQTRATLLLFPIICVAALIAYYNKSPKKFTSSIVLLIAILASIVIIFNKPIQNRYNEALNDLNSYTNANSVTSLGARLAMYEIGLNIFIKSPFSFRSAESRAENMNLLVAEHNRLRGALEFSNVHLHNEIIEAGSLKGLMGIISILFLYFSLFYTAYKRRALGLLILTLGIVGIGLSDVIIWARSIPIIVISAIVLLLVINNRNNTINQE*