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NECEvent2014_10_1_scaffold_49_23

Organism: NECEvent2014_10_1_Lactobacillus_crispatus_36_608

near complete RP 50 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: 21254..25564

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Value Algorithm Source
DNA polymerase III PolC-type {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356}; Short=PolIII {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; EC=2.7.7.7 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; TaxID=748671 species="Bacteria; Firmicut similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2898
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III polC-type n=1 Tax=Lactobacillus crispatus (strain ST1) RepID=D5GY65_LACCS similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2899
  • Evalue 0.0
  • rbh
polC; DNA polymerase iii, alpha subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2898
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Lactobacillus crispatus → Lactobacillus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4311
GTGGCAAATAAAAACGATCTTTTCTTAAAATTGCTCAAACAGGTTCAATTTCCTGATAGTTTTGAAGACAATGCACTTCTACAAAAAGGGAAAATTGAAAACGTGGATGTTTACGCTAAAGAACACAGGTGGGATATCCACGTTTTTTTTGATACTCCCTTGATGTATGACACCTATGTAGCATTAAGAAAAGCTGTAGAAGAAACTTTTTCTTCTTTTGTAAATGTAAGATTTTATGTTGGAACAGCTGATGGTTCTGATCAATATTTACCAGATTATTGGCATTATGTAGTTCAAAATTCAAATATTTTGCAACCTGTGGCTCGTGAATTTTTGGCTGGCCAAAAACCTAAAAAAGTTGATGGCCGCTGGGTTATTCCAGTTGATAATAATGTGATTGATGGTTTAATTGAGCAGAAGGCTTTAGATGATTTAGCTGAAGAGATGCGTGATTATGGCTTCTTTAATTTGAAATTTATAACTCAGCTGGATCAGACAAGTTCTAAAAACAATTTAGAAAGTTTGCAGGAGTTGCAACAAGAGCATGAAAAAAGCATGCAGGAAGTCTTTGAGAAGACGCCAGACAAACCTAAACCGCAACAACCTAAACAGTATCCAACTAGACGTACTAATTATGGTAAACGTAAATTAGATGAAAATGCTCCAATTACACAAATTAAAGAGCTGGAAGATGGCGTACGTAATGTAGTAATTGAGGGAAATATTTTTAATGTTGAAACTCGTGAGCTTAAATCTGGTGCAATCATTTTTTCTGGCGAAATTACGGATTATAGTGATTCAATTGCATTTAAGAAATTTGTTTCTAATAAAGATGAAATTGAAGAGCTATCTGCAATTAAACCAGGAACTTGGGCTAAAATGCAGGGGTCAGTTGCTGATGATCAATATATACATGATGTAGTTTTTAATATTAGTAGCTTAGAGACTGTCGAGCATGTTGGGCGAACTGAAAAATACGAAGGTGAGCCTAAACGAGTTGAACTACATGTTCATACTAATATGAGTCAGGTTGACGCAACTAATACTCCGACAGACTTTATTAAAACTGCTAAGAAGTTTGGACAAAAGGCAATTGCGATTACCGATCATGGTGATGTTCAATCATTCCCTGAAGCATATAGCAGTGGTAAAGCACTGGACATGAAAATATTGTATGGTGTAGAAGCTAATATGATTGATGATCATGCTTTACTAGTTTTGAATCCTGCACCGATGACCTATGAAGACCGCGAGTTTGTAATTTTTGACGTTGAAACTACGGGGTTGTCATCTGTTTACGACACAATTATCGAGATTGGTGCGGTTAAGATGAAGAACGGAGAAGTGCTTGAACGTTTTGATAAGTTCATTAATCCGCACCATCCTTTAAGTGAGCAAACTATTAATTTGACTTCAATTACAGATGAAATGGTTGGCGCAGCCGATGATGAAGCAGTTGTCATTAAGCAATTCCAAGACTTTTATGGCGATCGACCACTGTGTGGACATAACGTTCAATTTGATGTTGGGTTTGTTAATGCAGCATTAAGACGTGCAGGGCTAAAAGAAATTACTCAGCCAGTAGTTGATACACTTGAAGTATCGCGTTTACTACATCCAGAGCAGAGTCGTCATACTTTAGATTCATTAGCTAAGAAGTATAATGTTTCTTTGGAACACCATCACCGGGCAAATCAGGATGCTGAAGCAACTGGCTATTTAATGTTTAAATTGTTAGATGCTTTTAATAAAAAGTATCATGAAAATAATTTGAATAATTTGAATGGCTATGCAGCACATGGTGAAGTTTATAAACGAGCCCGTCCTTCCCATATGACAGTTTTGGCAAAGGATCAAGCTGGATTAAAGAATCTTTACAAATTAGTATCAATTGCCAGCACGAAGGACTTTTTCCGTATTCCTCGTACGCCGAAGTCAGATTTGGCTCGTTTGCATGATGGTTTACTTTATGGTTCTGGTTGTTGGCAAGGCGATGTCTTTATCGCAATGATGCAAAAAGGTTACGACGAAGCAAGAGAAAAAGCTAAATTTTATGATTATCTTGAAGTTCAACCTCCAGCAACCTATTCGCAATTAATTGCTGATGGTTTGATTAAGGATGAAGATCAATTACATGAAATTATTGAAAATATTATTAAATTAGGGAAGGAATTAAATAAGCCTGTAGTTGCAACTAGCGATGCCCACTACGTTGACCAAAAGGACGCTATTTATCGTAAAATCTTGATTGCGGCTCAGAGATCAAACCCTAGTCGAAATAAGCCGCAGCCAGATTTGCATTTCTATTCAACACAGGAAATGCTAGATGCATTTTCATTCTTAGGCGAAGATGTGGCTAAGGAAATTGTTATTGACAATACCAATAAAATTGCTGATGAATTGTCAGAAATTCAGCCAATTAAAGATGGGTTATACCCACCACATATTGAACATGCCGATGAAGAAATGAAGAAGTTGACCTATGATAAGGCTTATGAATTATATGGTAAGCCATTACCGAAGATTGTTAAGGATCGAATAGATTTGGAATTAAATTCCATTATTTCGAATGGTTATGCGGTTATTTACTTGATTTCTCAGCGTTTAGTAGCTAAGTCAAATAAAGATGGCTATTTGGTAGGTTCTCGTGGTTCTGTTGGCTCTAGTCTAGTAGCAACGATGTCAGGAATTACTGAAGTTAATCCGTTAGCTCCACACTATCGTTGTCCTAACTGTAAGTATTCACAATTCTTTGAAAATGGGGAATATGGTTCTGGTTTTGACTTGCCTGATAAAGATTGTCCAAAATGTGGAACTCCATTAGTTAAAGATGGACAAGATATTCCATTTGCGACTTTCTTAGGATTTCACGGCGATAAGGTTCCTGATATCGATTTGAACTTCTCAGGTGACTATCAACCAGTAGCCCATAATTTTATTCGAGTAATGTTTGGACCAGATAATTCATATCGTGCTGGAACGATTGCGACTGTTGCGGATAAGACTGCTTACGGTTATGCTAAACACTACGATGAAGAGCATGATTTAAAGCTAAGAAATGCGGAATTAGACCGTTTGGCAGCTGGTGTCCGTGGTGTCAAAAGAACTACTGGTCAACACCCTGCAGGAATTGTTGTAGTGCCCGATGATATGGACATTTATGATTTTACGCCGGTATCGTATCCAGCCGATGATGTAAATGCCGCTTGGTTGATTACTCACTATGACTTCCACTCTATTCATGATAATATTTTGAAGTTTGATATTCTGGGACATGATGATCCAACTATGATTCGTCACTTGCAGGATTTGTCTGGGATTGATCCATTGACTATTCCACCCGATGACCCTGGAGTCATGTCATTATTTTCTAGTCCTGATATTTTAGGTGTTACTCCAGAGCAGATTCAATCAGAAACTGGAACTTTGGGTGTTCCAGAATTTGGTACCCGTTTTGTTAGAGGAATGCTTGAGGAGACTAAGCCAACGACATTTTCTGAATTATTACAGATTTCAGGTTTGTCCCATGGGACTGATGTATGGCTAGGAAATGCTGAGGACTTAATCAATCAAGGAATTTGCAAACTGAAAAATGTAATTGGTTGTCGTGACAACATCATGATGGACTTAATTCACTGGGGCGTTAAGCCAGAAGTTGCCTTTTCAACAATGGAATCCGTTCGTCATGGTCGTGGTATCAGCGATGAAAATATGGCTATTTTAAAGAAAAATAAGAATATTCCAGATTGGTATATTCCTTCTTGTCTGAAGATCAAGTACATGTTCCCTAAGGCTCACGCTACGGCTTACATTTTAATGGCTCTACGAATTGCTTGGTTTAAAGTATATTATCCTGAAATCTATTACACAGCTTACTTTTCAGTTCGTGCCGATCTATTTGATTTGGTTGCAATGAGTCATGGTAAGAATACTGTTAAGGCTGCAATGAAGGAAATTCAGGATAAAGGAAACGATGCATCAGCTAAGGATAAGAGTTTGATGACCGTGCTAGAAATAGCTAATGAATGTCTAGAACGAGGGATTAAGATCAAAATGGTTGATATTGATCAATCTGAAGCAACTGACTTTAAGATCTTAGATAAGCATACAATTTTAGCACCGTTCAATGCTGTTCCTGGTTTGGGGGATAATGCAGCTAAGCAGATTGTAGCTGCTCGTGCAGAAAAGAAGTTTTTGTCTAAAGAAGATTTAGCTAAGCGCGGTAAAGTATCACAAACAATTATGAATTATTTCGAAGAAAATGGTGTCTTGGAAGGGATGCCAGATGAAAATCAATTATCACTTTTCTGA
PROTEIN sequence
Length: 1437
VANKNDLFLKLLKQVQFPDSFEDNALLQKGKIENVDVYAKEHRWDIHVFFDTPLMYDTYVALRKAVEETFSSFVNVRFYVGTADGSDQYLPDYWHYVVQNSNILQPVAREFLAGQKPKKVDGRWVIPVDNNVIDGLIEQKALDDLAEEMRDYGFFNLKFITQLDQTSSKNNLESLQELQQEHEKSMQEVFEKTPDKPKPQQPKQYPTRRTNYGKRKLDENAPITQIKELEDGVRNVVIEGNIFNVETRELKSGAIIFSGEITDYSDSIAFKKFVSNKDEIEELSAIKPGTWAKMQGSVADDQYIHDVVFNISSLETVEHVGRTEKYEGEPKRVELHVHTNMSQVDATNTPTDFIKTAKKFGQKAIAITDHGDVQSFPEAYSSGKALDMKILYGVEANMIDDHALLVLNPAPMTYEDREFVIFDVETTGLSSVYDTIIEIGAVKMKNGEVLERFDKFINPHHPLSEQTINLTSITDEMVGAADDEAVVIKQFQDFYGDRPLCGHNVQFDVGFVNAALRRAGLKEITQPVVDTLEVSRLLHPEQSRHTLDSLAKKYNVSLEHHHRANQDAEATGYLMFKLLDAFNKKYHENNLNNLNGYAAHGEVYKRARPSHMTVLAKDQAGLKNLYKLVSIASTKDFFRIPRTPKSDLARLHDGLLYGSGCWQGDVFIAMMQKGYDEAREKAKFYDYLEVQPPATYSQLIADGLIKDEDQLHEIIENIIKLGKELNKPVVATSDAHYVDQKDAIYRKILIAAQRSNPSRNKPQPDLHFYSTQEMLDAFSFLGEDVAKEIVIDNTNKIADELSEIQPIKDGLYPPHIEHADEEMKKLTYDKAYELYGKPLPKIVKDRIDLELNSIISNGYAVIYLISQRLVAKSNKDGYLVGSRGSVGSSLVATMSGITEVNPLAPHYRCPNCKYSQFFENGEYGSGFDLPDKDCPKCGTPLVKDGQDIPFATFLGFHGDKVPDIDLNFSGDYQPVAHNFIRVMFGPDNSYRAGTIATVADKTAYGYAKHYDEEHDLKLRNAELDRLAAGVRGVKRTTGQHPAGIVVVPDDMDIYDFTPVSYPADDVNAAWLITHYDFHSIHDNILKFDILGHDDPTMIRHLQDLSGIDPLTIPPDDPGVMSLFSSPDILGVTPEQIQSETGTLGVPEFGTRFVRGMLEETKPTTFSELLQISGLSHGTDVWLGNAEDLINQGICKLKNVIGCRDNIMMDLIHWGVKPEVAFSTMESVRHGRGISDENMAILKKNKNIPDWYIPSCLKIKYMFPKAHATAYILMALRIAWFKVYYPEIYYTAYFSVRADLFDLVAMSHGKNTVKAAMKEIQDKGNDASAKDKSLMTVLEIANECLERGIKIKMVDIDQSEATDFKILDKHTILAPFNAVPGLGDNAAKQIVAARAEKKFLSKEDLAKRGKVSQTIMNYFEENGVLEGMPDENQLSLF*