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NECEvent2014_10_1_scaffold_96_14

Organism: NECEvent2014_10_1_Lactobacillus_gasseri_34_15

near complete RP 49 / 55 MC: 8 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 12799..16296

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Value Algorithm Source
Transcription-repair-coupling factor {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969}; Short=TRCF {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969};; EC=3.6.4.- {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969};; TaxID=1403312 species="Bacteria; F similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
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  • Bit_score: 2277
  • Evalue 0.0
Transcription-repair-coupling factor n=1 Tax=Lactobacillus gasseri K7 RepID=S1RX00_9LACO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2280
  • Evalue 0.0
  • rbh
transcription-repair coupling factor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2277
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Taxonomy

Lactobacillus gasseri → Lactobacillus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3498
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PROTEIN sequence
Length: 1166
MNITELLNKDKDLNNFINKVPKEKRSLLTGVNSGAFSAVLMQMLSTWQRPLILVEDSEDKAQMLLDELGNLLPDNMVFSFPVDATIATQTAIASPDELSQRLQTLKFLTEKRAGIVVVTPQALQYKLSDPRDFTKAKQVFKPEAEFDLDELTAWFTQAGYRRENIVARPGEFARRGDILDVYPLDQENPFRIEFFGDEVDTVKEFDAATQRSLEEKDIVSIGPALDRVFSSRNLHEAVKKIKQDMKESIAKEENVKNHFVKAIDLLEADGLPENYAFLVDYLLPKSFNLIDYLDKNGLLLFDDWQAIKKNVADVDAQNEAFISEEIKAGAMLNSQKLRHNFEQVVQKVKQAQVIFSLFQKGMGRLKFDQILNFTTREVQQFFSQMPLIKSELKRFANEENTVILQADSATRAKQITQNLVDYGVDLPIVKSDQVLVKKAQITVGDFAHGFALPSLNLVYLTERELFNQRPHHRKRIKTLENAQRLRNYNELKPGDYVVHVNHGIGRFEGIKTLDVDGKKRDYITITYQHHDQLFVPADQLGLVQKYVASEGKVPHINKLGSAEWAKTKKRVQSKVEDIADDLIELYAKRESEKGFAFSPDDDLQKEFEDAFPYPETPDQLRSIREIKADMESPKPMDRLLVGDVGFGKTEVALRAAFKAIRDGKQVAFLAPTTILAQQHFETMQDRFKNFPVNCALLSRFQTPAEVKEIIEGVKNGQIDMVVGTHRLLSKDVKFKDLGLLIVDEEQRFGVKHKERLKELKANIDVLTLTATPIPRTLHMSMVGVRDLSVMETPPTNRYPIQTYVMEEMPSVVREAVLREMKRNGQVFFLHNRIDDIDKVVSRLEELIPEAKIEYIHGRMSENQMEDIMYRFSRNEFDILVTTTIIETGVDMPNVNTMIVENADHYGLSQLYQLRGRIGRSARLAYAYFLYQPNKVLTEIGEKRLSAIRDFTELGSGFKIAMRDLSIRGAGNMLGKQQHGFIDSVGYDLYAQMLDDAIKKRKGKKVAVKSNAEVQFNLEAYIPDDYIADQEQKIEFYKKIKGINDQKEAESIADELIDRFGDYPLAVENLLNVSKVKADADLAQVVAINQKSDDKLQVIFNNRASEELEGPNIFKALEHVSLRARINMDPQKRMNVMLELEKKMSTRQLFNELHIFLAAASDIVQR*