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NECEvent2014_2_3_scaffold_65_26

Organism: NECEvent2014_2_3_Peptoclostridium_difficile_28_21

near complete RP 49 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 2
Location: comp(24384..26258)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PTS system sucrose-specific transporter subunit IIABC (EC:2.7.1.69) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 624.0
  • Bit_score: 1220
  • Evalue 0.0
PTS system, sucrose-specific IIABC component {ECO:0000313|EMBL:CAJ67297.1}; EC=2.7.1.69 {ECO:0000313|EMBL:CAJ67297.1};; TaxID=272563 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostre similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 624.0
  • Bit_score: 1220
  • Evalue 0.0
PTS system, sucrose-specific IIABC component n=61 Tax=Clostridium difficile RepID=T3IG09_CLODC similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 624.0
  • Bit_score: 1220
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Peptoclostridium difficile → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1875
ATGAATAAATATAATAAAATAGCAAATGAGCTTATTAAAATTATTGGTGAAGATAATATTATTTCTATTACACATTGTGCCACAAGATTAAGAGTGATGGTTAAAGATAGAGAAATTATTAATGATAAGAAAGTTGAAAAAGTTGATGAGGTTAAAGGGGTTTTCTTTACTTCTGGACAGTATCAAATTATTTTAGGAACAGGAATAGTTAATAAAGTTTATGCAGAAGTTGAAAAAATGGGATTAAAAACTTTATCAAAAAAAGAACAAGATGAATTAGTTAAAAATAATGAAACTGGATTTAAGAAAGTTATGAGAACTCTAGCAGATATATTTGTTCCTATTATTCCAGTTATTGCAGCAACAGGATTATTCTTGGGATTAAAGGGTTGTTTGTTTAATGATAATGTACTTGGATTATTTGGAATGTCTTCTGCAAATATTCCATTGTATATTCAGACACTTGTTTCGGTTCTTACAGAAACAGCATTTGCTTTTTTACCAGCAATTATTGTATGGTCAGCATTTAAAGTATTTGGAGGAACACCTGTTATTGGACTTGTTATTGGACTTATGTTAGTTTCCCCAATACTTCCTAATGCATATTCTGTTGCTGACCCATCAAATGAAATTGAAGCAATTATGGCATTTGGATTTATTCCTATTGTAGGTTGTCAAGGAAGTGTTTTAACAGCTATTGTTACAGCATTTATTGGAGCTAATCTTGAAAAATGGTTCCGTAAACATATGCCTAATGTATTAGACCTTATTTTCACACCATTTTTTGTTATGCTAATAACAATGTTAGTTATTTTGTTAGGTGTAGGCCCTATAATGCATACAATAGAATTAAAAATGGTTGATATCATCAGCTTATTGATTGATTTGCCTTTAGGAATTGGAGGATTTATTATTGGATTTACATATCCATTAGCTGTTATTACTGGCTTACATCATACTTATGTAATGATTGAAACATCACTATTAGCAAATACAGGATTTAATGCCCTTATTACTCTTTGTGCAATGTATGGATTTGCGAATATTGGAACATGTCTAGCATTTATGAAAAAATCTAAAAATAATCAAGTTAAACAAACTGCGGTTGGAGCAATGCTATCTCAACTTTTTGGTATAAGTGAGCCTGTTTTATTTGGGATTCAGCTTCGATATAATTTAAAGCCTTTGATTATTATGTGTGCATCTTCAGGTTTAGGAGCAGCAATATTATCAATTTTACATATTCAATCTAATTCATATGGATTAGCAGTTTTACCTTCTTATTTAATGTATATCTATGATGGATATAATTTAATCACATACTTATTAGTATCAATATTTGTGGTTGCATTCTGCTTTATTGTAACATGTTTATTTGGAGTGCCTAAAGAAGCTATAAATGAAGATGAAGACGAAGAATTAGTGTTTAATGAAAATAATGAAAACTTTGTGTCTCCAGCTAAGGGGAAAATTGTTGCATTAGAAAATGTACCAGATGAAACATTTTCTAAAAAAATGTTAGGTGATGGTTTTGCTATTGATATTATAGATGGAAAAATTGTTTCTCCTATTTCAGGTAAATTAGAAACAGTGTTTTCAAGTGGACATGCATTTGGGATTAAAGGAACTAATGGAGAAGTATTAATTCATGTTGGAATTGATACAGTTGCATTAAATGGAGATGGCTTTGATGTTGCTGTTAAACAAGGAGATATGGTTAAACAGGGGGATGTTCTTGTTAATGTTGATTTAAAGAGAATACATGAATTAGGAAAGTCTACTTTGACAATGGTATTGTTTCCAGATGGTAAGAAGGTAAATATTTTGGATATAAACAAGGATGTAAAAATAGGTCAAAGAATATGTGTTGAGTAG
PROTEIN sequence
Length: 625
MNKYNKIANELIKIIGEDNIISITHCATRLRVMVKDREIINDKKVEKVDEVKGVFFTSGQYQIILGTGIVNKVYAEVEKMGLKTLSKKEQDELVKNNETGFKKVMRTLADIFVPIIPVIAATGLFLGLKGCLFNDNVLGLFGMSSANIPLYIQTLVSVLTETAFAFLPAIIVWSAFKVFGGTPVIGLVIGLMLVSPILPNAYSVADPSNEIEAIMAFGFIPIVGCQGSVLTAIVTAFIGANLEKWFRKHMPNVLDLIFTPFFVMLITMLVILLGVGPIMHTIELKMVDIISLLIDLPLGIGGFIIGFTYPLAVITGLHHTYVMIETSLLANTGFNALITLCAMYGFANIGTCLAFMKKSKNNQVKQTAVGAMLSQLFGISEPVLFGIQLRYNLKPLIIMCASSGLGAAILSILHIQSNSYGLAVLPSYLMYIYDGYNLITYLLVSIFVVAFCFIVTCLFGVPKEAINEDEDEELVFNENNENFVSPAKGKIVALENVPDETFSKKMLGDGFAIDIIDGKIVSPISGKLETVFSSGHAFGIKGTNGEVLIHVGIDTVALNGDGFDVAVKQGDMVKQGDVLVNVDLKRIHELGKSTLTMVLFPDGKKVNILDINKDVKIGQRICVE*