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NECEvent2014_2_3_scaffold_164_11

Organism: NECEvent2014_2_3_Peptoclostridium_difficile_28_21

near complete RP 49 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 2
Location: 9908..13042

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative multidrug efflux pump n=2 Tax=Clostridium difficile RepID=U3WC04_CLODI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1974
  • Evalue 0.0
  • rbh
Putative multidrug efflux pump {ECO:0000313|EMBL:CAJ69292.1}; TaxID=272563 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" source="Peptoclostridium similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1976
  • Evalue 0.0
multidrug efflux pump similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1976
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Peptoclostridium difficile → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3135
ATGAATTTAACACAGACTTCCGTTAAACGTCCTCTCACAATCATAATGGTCTTTTTAGTATTAATAGTTTTTGGTGGTATTGGATATAAAAAAATGTCAATAAATCTAATGCCTGATATAGAAATACCAGTTGTAATGGTCATGACTACTTGGACAGGTGCTGGTCCTCAAGACGTTGATGAACAAGTTAGTCAAAAAGTTGATGAAAGTTTATCTGCCGTTTCAAATGTAAAATCTACTATATCAAGTTCACAAGAAAGTGTTTCTATGGTAGTTGCTCAGTTTGAATTTGGAACTAATTTGGATGAAATAATGAATGATGTTAGGTCTAAAGTTGATGCATTACAGACCAGCCTCCCAGATGATGCAGCTAAACCAACAGTTTTAAAGCTGGATATGAATGCACAGGCCATAGGTCAACTTGTCATATCTGGAGGAAATGAAAATAGTTCACAAGCCTTAAGAAAATACGCTGAAGATGTAATTCAGCCTAAAATAGAATCCATAGATGGTGTTACTTCAGCAGACCTTAAAGGTGGAAAAAAAGCACAGGTTAATGTAATAGCTGACCCAGCTGTTCTTTCAAATTATGGAGTTAGTTTATCCACTATAAAAGGTGTCTTATCCTCTAGTAATAAAACATTCCCTTATGGTTCAATTACTCAAGGTGAGGATAAAATAGTTTTAAGAGCGATTGATAAATTAGAATCCCTAGATGATATAAAACAGATTCAAATTCCTGTAAAAGGAGGAAATACAGTTAGATTAGATAATCTTTGTAGTGTAGATTATGGATATGCAGACAAAGATAGTATTTATAGATACAATGGAAAAGACAGTTTGGTAATAGATATTTCTAAACAACAAGATGCCAACACTGTAAAAGTTATGCAGAGTGCATACAAATACGTAGATGAATTGAATAAGGAAAATCCTCAATTTAAAATTAAAATTGCTAATGATACAAGTTCATACATAAGTGAATCAATAAACAGTGTAATGAGCAACTTGCTTATAAGTGCTGTTATCGCATTTATTGTAATATTTGCTTTCCTAAAAAGTGTAAGAGCTTCACTAGTTGTTGCAGTTGCAATACCAATTTCTATAATAGGTGCTATAGCAATTCTCTACTTTACTGGTGAAAGTTTAAATCTTATTACTGCAAGTTCATTGGTAATTTCAGTTGGTATGGTTGTTGATAATGCTACAGTTGTAATTGAAAATATATTTAAATATAGGAAAAGTGGCAGATTGAGTCTTGATGATTGTGCTATTGAGGGAACAAGAACTGTAACAAATGCAATACTTGCATCAACATTGACCACAATAGCAATATTCTTACCTATCATGTTTACAGAAGGTATAGCTAAAATAACTTTTGGGGCATTAGGTAAAACACTAATAGCTTCACTAGCATTCTCCTTTATAGGTGCAATTACACTCGTTCCTAGTGTATTTGCAAAATTAAGCAGAGGAAAAAATAGTCAAAAGATGCAAGAAAAAGATAGTCCTATATTTGATAAGGTAAGTGAAGCATATAAAAAATTATTAAGTGTATGTTTGAGACATCAACGCTTAGTTGTAATATCAAGTTTACTTATTTTTGTAGCTTCCTTATTTGGAATGGGATTTATAGGTATGGACTTTATGCCTGCAGCAGACAAGGGTGAATTATCTATTTCTATAGAACTTCCAAAAGGTCTTAGCCTAGAATCCAATGATTACTATGTATCTATGACTGAGAAAAAAGTCTCAGATATTCCAGAAATTAAAACTTTAATAACAACTTTGACATCAGATTCAAATAATAGTAAAGCAAGTATAGCAATTGAATTAGAATCTCAAAAAAATAGAAAAAGAACTACTGATGAAATAGAAAAAGAGATAATTGATAGAGTGGCTACTGTACCAGATTGTAAAATAAATGTAAGTCAAAACAGTAGTGTTATGGGTGGAGCTGGAGGAGCAGACTTCACATTAGAAATGAAAGGTCCTGATTTAGATGTATTAAAAATACTGGGAAAAGAAGCTGAAAAAGAATTTAGCTCTATAAAAGGATTTAGAAATGTTGAAACTTCTCTTACAGATACAACACAAGAAGCTCAATTTACTATAGATAAACATAAGGCTCAAGAATATGGTGTAAATACTGCTGAAATTGCAGGCATGTTACGTACAGCAATAAATGGTGACTCCGTAACCACTGCTACTATTGATGATTACAAAGTGGATGTAAACCTAAAATTTAAAGCAGATACTATTGATAGCTTAGAAGATATAAAGCAACTAAAAGTAAACTCTGCAACTGGAAAAGAAGTTCCTCTTGGTGCTTTTTCAGATATAAAAATGGCAGATGGTCTACAATCTATATCTAGGACTGATGGAGATTTTTCTGTAAATATAACTGCTACACTTGACAATTTAGATGCTGGTACTGCTACAAAACTAGCACTAGAAAAAACGAATAAAATGGTAATTCCTAAAGATTACTCTATAGGTGTTGGTGGTGAAACAGAAATGATGAATGAATCTATGGCAAGTCTTGGATTTTCAATGGTCATAGCTATAGCATTAGTTTATATGGTAATGGTAGCTCAGTTTGAATCATTTAGTAAACCATTTATAATCATGTTCTGTGTTCCATTTGCATTCGTTGGAGTTGTGCTTTCGCTTCTAGTTAGTGGTCAAAGTTTAAGTACTGTCGGTATGCTAGGTATAATCTTACTTATTGGTATTGTTGTTAATAATGGTATAGTTCTTATTGACTACATAGAGCAACTTAGAAAAACAAATCGTAACAATGATTTAATTGGTTTGGTTTCAATTGGTTGTGCAGCAAGATTAAGACCAGTCTTAATGACTACAGCAACAACAATTTTAGGTATGTTGCCAACAGCACTATCTCTTGGTGAAGGTGGAGAAACTATGCAACCACTAGCCATAGTTATAATGGGTGGTCTAACTGTATCTACACTTATAACTTTGGTGCTTATACCTACTATATACTTAATATTTGATAAATGGGAAAATAAGTTTTCAGACAAAATGCCTAAAATATTTGGTAAGATAACAGATAAAATAGGAAGTATAAAACGTAAAATAATAAAGAAACCAAAATTGAAAGCTAAAGTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1045
MNLTQTSVKRPLTIIMVFLVLIVFGGIGYKKMSINLMPDIEIPVVMVMTTWTGAGPQDVDEQVSQKVDESLSAVSNVKSTISSSQESVSMVVAQFEFGTNLDEIMNDVRSKVDALQTSLPDDAAKPTVLKLDMNAQAIGQLVISGGNENSSQALRKYAEDVIQPKIESIDGVTSADLKGGKKAQVNVIADPAVLSNYGVSLSTIKGVLSSSNKTFPYGSITQGEDKIVLRAIDKLESLDDIKQIQIPVKGGNTVRLDNLCSVDYGYADKDSIYRYNGKDSLVIDISKQQDANTVKVMQSAYKYVDELNKENPQFKIKIANDTSSYISESINSVMSNLLISAVIAFIVIFAFLKSVRASLVVAVAIPISIIGAIAILYFTGESLNLITASSLVISVGMVVDNATVVIENIFKYRKSGRLSLDDCAIEGTRTVTNAILASTLTTIAIFLPIMFTEGIAKITFGALGKTLIASLAFSFIGAITLVPSVFAKLSRGKNSQKMQEKDSPIFDKVSEAYKKLLSVCLRHQRLVVISSLLIFVASLFGMGFIGMDFMPAADKGELSISIELPKGLSLESNDYYVSMTEKKVSDIPEIKTLITTLTSDSNNSKASIAIELESQKNRKRTTDEIEKEIIDRVATVPDCKINVSQNSSVMGGAGGADFTLEMKGPDLDVLKILGKEAEKEFSSIKGFRNVETSLTDTTQEAQFTIDKHKAQEYGVNTAEIAGMLRTAINGDSVTTATIDDYKVDVNLKFKADTIDSLEDIKQLKVNSATGKEVPLGAFSDIKMADGLQSISRTDGDFSVNITATLDNLDAGTATKLALEKTNKMVIPKDYSIGVGGETEMMNESMASLGFSMVIAIALVYMVMVAQFESFSKPFIIMFCVPFAFVGVVLSLLVSGQSLSTVGMLGIILLIGIVVNNGIVLIDYIEQLRKTNRNNDLIGLVSIGCAARLRPVLMTTATTILGMLPTALSLGEGGETMQPLAIVIMGGLTVSTLITLVLIPTIYLIFDKWENKFSDKMPKIFGKITDKIGSIKRKIIKKPKLKAKV*