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NECEvent2014_2_3_scaffold_165_6

Organism: NECEvent2014_2_3_Peptoniphilus_harei-rel_34_8

near complete RP 50 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38 MC: 1
Location: 4122..8423

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Value Algorithm Source
DNA polymerase III PolC-type {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356}; Short=PolIII {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; EC=2.7.7.7 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; TaxID=908338 species="Bacteria; Firmicut similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1997
  • Evalue 0.0
polC; DNA polymerase III PolC-type (EC:2.7.7.7) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 58.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1636
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III subunit alpha n=1 Tax=Peptoniphilus sp. JC140 RepID=UPI000302A168 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 82.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2388
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Taxonomy

Peptoniphilus harei → Peptoniphilus → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4302
TTGGGTGATAATTTGATTTTATTAAAAGATATTTTACAAAAATTAAATACTTCATACGATAATATTTCAGAAGAGATTTTCATAGAATCTATTAAAAGAAATAAAAATACTAATGAAGCTTTTTTTGTTATTAATTCAAAAAGAGATTTAGAAGAAACTTTTAAAAATGAAATTGAAGATATCTTTTCCAAAAATCTTGATGAATACAAAATTTATATTGACTTCAAATCATCTTCTCTATACAAAAGCGAAGATGATTTAATTTGTGCAGAAATTTTGAAATACAACCCATCTTCAAAAATTTGGATAGATGATATTGAAATAAATAAAAATGAAAAAATAGGAACAATCGATATAACTCTACCTAGTGAAGAAGCTTTCTATAGCTTAAGTCAAAATGGATTCGCTAGCTATCTTCAAAAAGAATTAAAAATTTTTGGCGATTTTAATATTAAATTTGATTTTGTAAAAAATGAATTTGAAGAAGATACTATTGAGGACTTTATATGTCAAATAGAAGAAGCTGAAGAAGTAATATCCTCAAAACACGAGGAAGAAGTTAAGACCAAAATAGAAAAAAAATCAAAAGAGAAAACTGCTAAAAAATCTGACTCCTATGGCAAAAAGGACCTTGGAACAATCGAAAGAGTAATCGATGTGAATGTAAACTCCCAAAAAGTTAGTGTTGAAGTTGATATATTTAATATTGAAAGCAGAGAATTAAAAAATGGTAACTTCTTAATCTCACTTTCTATTACAGACTACACATCTTCTACTTTAGCAAAAATATTTTTGAAACCTGAAAAAACTGAAGAATTTCTTGAAAGCTTCAATAAAGGAGACCATGTAATAATAACAGGAAATGTTTCTTATGATAATTTTTCTAGGTGTGACACTATCATGATCAGATATATTGAAAAGAGAGACAAGGTCATTCGAAGGGATTATTCAGATGATAAGAGAACAGAACTTAGAATTCACTCAAAGATGTCTCAAATGTCAGGTGTAACCTCCTTTACTGATTTTGCAAATAGAGCAAAACTTTGGGGACACGATTCAATAGGTATTGCCGATACAAATGATGTCCAAGGTTTCCCAGAAGCTATGGAGGCCGCAGAAAAAACTGGATTAAAAATTCTATACGGTACTGATATTAACTTTGTTGATGACAAAGAAAAAATTGTTACAAATTACGAAGAGGGAAAAACTTATGATACTTATGTGGTTTTTGATATAGAAACCACAGGACTTTCTTCAAGAAATGATAAAATTACAGAAATTGGTGCCGTTAAGATTAAAAACGGAATGATAGTAGATAGATTTTCACAACTTATTAATCCAGAAAAGGAAATACCACAAGTTGTTGTTGAACTAACAGGGATTAGTAATGCTATGGTTGAAAATGAACCTACTATAGAAGAAGTAATTCTCAAATTCTATGACTTTGCTAAAGATACAGTTTTAGTAGCTCATAATGCTAAATTTGATATATCTTTTATTAGACGAGAATATGCAAATAAAAATCTAGTGTTTAATCATCCTATTCTAGATACTCTTGTACTTGCAAGGGCAACAATGACCGACATGAAGAGATTTAATCTAGGAACACTTTGTAAAAATCTTGGAGTATCCCTTGTGGGAGCTCACAGAGCAGTTAATGATGCTGAAGCTACTGCAGAAGTCTTTATTAAGTTAATCGAAAAATTAAAGAGAGAAGAAGAATTTAATTTTGACAATTTAAATAAAGAAATAGTAAACATAGATTCTAAACGTTTATTCGAGTCATCTTTATTATTAGTAGTGAAAAATGAAATTGGCTTAAAAAATTTATACATGTTAATTTCTGATTCTCATATGAAATATTTTAACTTTGTTGCAAAAGTACCAAGAAGCCTTTTGGATAAATACCGCGAAGGAATATTAGTAGGATCAGGTAATGCTAACTCAGAATTATTTGATGCTATATATAGGATGTGTCCTCAAGAAGAATTGCTTGAGATTGCAAAATATTATGACTTCTTAGAAATCCAACCAGCAAGTGATAATATTCTTGCAATTGAAGATGGTAAATATACTATTGAAGATATAAGAGAAATAAATAAAAAGATAATTTCCATAGGAGAAGAATTAAATATACCTGTTGTTGCTGATTCAGACACTTATTATCTTGAAGATTCTGAAGACGTATTAAGAAGAATTGTGCTAAACGGTAAACCAGGTAGACCAGATCCTAGAGCTAGCAGAAATCAAAAATTTTATTTTAAAACAACAGAAGAAATGCTAGATGAGTTCTCTTACTTAGGACAAGACAAGGCTTATGAAGTTGTAGTAACTAATACTAATAAATTGAAGAACTCAATTAAAGATATTAAGCCAATTCCTGATGGAACTTATCCTCCAGTTATTGAAGGCTCTGATGATAGTCTAAGGGAAATGACCTATAAAAAAGCCCACGATATTTATGGAGATGAACTCCCAAAAATTGTTGAAGACAGACTAGAAAAAGAACTCAAGTCAATTATTTCAAATGGTTATTCAGTTCTCTATATAATTGCTCAAAAACTTGTAAAAAAATCTAACGACGATGGTTTCTTAGTAGGATCAAGAGGTTCTGTTGGTTCATCCTTTGTTGCAACAATGGCAGACATAACAGAAGTAAATCCTCTTCCACCACATTATATTTGCCCTAATTGTAAATATTCTGAATTTACAGAAGACTTAACTTATGGCAGTGGAGTTGATATGCCAGACAAAGTTTGTCCTAAGTGCGGCAGTCCTCTTAAAAAGGATGGACATAACATTCCTTTTGAAGTTTTCTTAGGTTTTTATGGTGACAAGGAGCCAGATATTGATTTAAATTTTGCAGGTGAATATCAACCAAGGGCACACAAGTACACTGAAGAATTGTTTGGCGAGGGTTATGTATTTAGAGCAGGAACTATTGGAAAAATAGCAGATAAGACTGCTTATGGTTATGTAAAAAAATATTTTGAAAACAAACATATTTCTCCTATCGAAATCGACAGACTATCACGAGCTATAACCGATGGAAAAAGAACAAGTGGACAACATCCAGGCGGCGTAATGATTGTCCCTAAAACAAATTCTATTTTTGATTTTACTCCAATTCAATATCCTGCAGATGATCCAAGCTCCGGAGTAATAACAACTCACTTTGATTATAACTTTATTCATGGAAAGATCTTAAAACTAGATATACTTGGTCACGATGGTCCAACAATTATTAAAATGTTAGAAGACTTTACAGGAATTGATTCCAATACTATAAGACTTGATGATAAAGAAACACTTTCTATCTTTAATAGTGCAGAAGCCTTTAATATGGATGAAGAAGTTTTCTCTTGCAAGACAGGAACCCTCGGGATACCTGAGTTTGGAACTTCCTTTGTTATATCAATGCTATTAGAAACAAATCCGAAAAACTTTGCAGACCTTGTTAGAATTTCTGGTTTATCTCATGGTACTGATGTATGGATTTCGAATGCACAAGAGTTAGTTGACTCTGGTAGAGCTGAGCTTAAAGATGTAATAGCCACTAGAGAAGATATTATGGTCTATCTAATAAATGCTGGTGCTGAAAATAAAATGGCCTTTGACACAATGGAAAAGGTTAGAAAGGGCAAGGGACTAACTGAAGAACAAGAAAGTATTATGAAGAACTTAGACCTGCCTGAATGGTATATTGATTCTTGTAAAAAAATTAAGTATATGTTCCCTAAGGCCCACGCAGTGGCTTATGTTATGTTGTCCTTTAGAATTGCATACTATAAATTAAATTATCCTTTGGCATTCTATGCAACTTTCTTTACAATTAAGTTAACTGATTTTAATGGAGAAAATATTATTGAAGGACCGAACTTTTTGAAAAATAGAATTAAAATGCTAAGAGAGATTGAAAAGCCAACAGCCAAAGACAAGGGTGAAATAAGAGTGTCTGAAGTTGCACTTGAAATGTATGCAAGAGGTTTTCAATTCTTAAAGGCAGACATTTATAAATCTAAGGCTTCTAAGTTCACTATAGAGGATGGAAAAATTAGAATGCCTATAAGAGCAGTGCCTGGAATTGGTGAAAACTGTGCAAATAAGATAGAACAAGAATCACAAAAATCAAAGTATTTATCTATCGAAGACTTTTCAAAAAGAACTGGAGCAGGAAATTCCGTTATAACAATTCTACAAAAAAACGGAATGCTTGAAGACTTAGATGAAACAAACCAAATTTCATTATTTAATTTTTGAAAAACTTGTATTTATAGCATTTTATGATATAATTTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1434
LGDNLILLKDILQKLNTSYDNISEEIFIESIKRNKNTNEAFFVINSKRDLEETFKNEIEDIFSKNLDEYKIYIDFKSSSLYKSEDDLICAEILKYNPSSKIWIDDIEINKNEKIGTIDITLPSEEAFYSLSQNGFASYLQKELKIFGDFNIKFDFVKNEFEEDTIEDFICQIEEAEEVISSKHEEEVKTKIEKKSKEKTAKKSDSYGKKDLGTIERVIDVNVNSQKVSVEVDIFNIESRELKNGNFLISLSITDYTSSTLAKIFLKPEKTEEFLESFNKGDHVIITGNVSYDNFSRCDTIMIRYIEKRDKVIRRDYSDDKRTELRIHSKMSQMSGVTSFTDFANRAKLWGHDSIGIADTNDVQGFPEAMEAAEKTGLKILYGTDINFVDDKEKIVTNYEEGKTYDTYVVFDIETTGLSSRNDKITEIGAVKIKNGMIVDRFSQLINPEKEIPQVVVELTGISNAMVENEPTIEEVILKFYDFAKDTVLVAHNAKFDISFIRREYANKNLVFNHPILDTLVLARATMTDMKRFNLGTLCKNLGVSLVGAHRAVNDAEATAEVFIKLIEKLKREEEFNFDNLNKEIVNIDSKRLFESSLLLVVKNEIGLKNLYMLISDSHMKYFNFVAKVPRSLLDKYREGILVGSGNANSELFDAIYRMCPQEELLEIAKYYDFLEIQPASDNILAIEDGKYTIEDIREINKKIISIGEELNIPVVADSDTYYLEDSEDVLRRIVLNGKPGRPDPRASRNQKFYFKTTEEMLDEFSYLGQDKAYEVVVTNTNKLKNSIKDIKPIPDGTYPPVIEGSDDSLREMTYKKAHDIYGDELPKIVEDRLEKELKSIISNGYSVLYIIAQKLVKKSNDDGFLVGSRGSVGSSFVATMADITEVNPLPPHYICPNCKYSEFTEDLTYGSGVDMPDKVCPKCGSPLKKDGHNIPFEVFLGFYGDKEPDIDLNFAGEYQPRAHKYTEELFGEGYVFRAGTIGKIADKTAYGYVKKYFENKHISPIEIDRLSRAITDGKRTSGQHPGGVMIVPKTNSIFDFTPIQYPADDPSSGVITTHFDYNFIHGKILKLDILGHDGPTIIKMLEDFTGIDSNTIRLDDKETLSIFNSAEAFNMDEEVFSCKTGTLGIPEFGTSFVISMLLETNPKNFADLVRISGLSHGTDVWISNAQELVDSGRAELKDVIATREDIMVYLINAGAENKMAFDTMEKVRKGKGLTEEQESIMKNLDLPEWYIDSCKKIKYMFPKAHAVAYVMLSFRIAYYKLNYPLAFYATFFTIKLTDFNGENIIEGPNFLKNRIKMLREIEKPTAKDKGEIRVSEVALEMYARGFQFLKADIYKSKASKFTIEDGKIRMPIRAVPGIGENCANKIEQESQKSKYLSIEDFSKRTGAGNSVITILQKNGMLEDLDETNQISLFNF*KTCIYSIL*YNFK*