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NECEvent2014_4_4_scaffold_84_46

Organism: NECEvent2014_4_4_Clostridium_perfringens_27_15

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(49984..52680)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cell wall binding repeat protein n=1 Tax=Clostridium perfringens NCTC 8239 RepID=B1RT96_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 98.7
  • Coverage: 898.0
  • Bit_score: 1908
  • Evalue 0.0
  • rbh
Cell wall binding repeat protein {ECO:0000313|EMBL:EDT71484.1}; TaxID=488537 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium perfringens D similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.4
  • Coverage: 898.0
  • Bit_score: 1905
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 73.7
  • Coverage: 426.0
  • Bit_score: 718
  • Evalue 1.80e-204

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2697
ATGAAAAAGGTAAAAGAAAAAATAGCTATTGCAGTATTGACAGGGGTAATTATGGGGGTGTCAGGTTCATTTGTATTTAGTGGAAGGAATATATATGCAAGTGAATTAAAGAGTACTTTAAGCGATGAACAAACTAGTCAAAAAAACGAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAACTTTAGAATTAAAAGAAGAAATACAATCAAGTAACAAGATGAAAGAAGAAAATAAAGATGTTATTAAGAAAGAAGAAATAGATAAGAAATTTGATAATAATGAAGTAAGAGAAAATAAAGTAACTACTTTTGATATTAAATCAAATGAAAAGTCTAAAGTTGAAAAATGTCATTGGTTTAAAAATGGAACAGATGGTGATGGAAGAACTATATGGTCATATAAAAATAAAGAAGGAAAAAATGTAGTTGGTTTAGCTGAGATTAATGGGGATAAATATTTCTTTGATGAATATGGTCGTATGCAAACCGGAATAATAAAAGATTATAAAAGTAATAAAATATATTATGCTGAATCAAATGGAGTTTTAAGCAATTATAAAGGTTGGAAAAAAATAGATGATGAATGGTATTATTTTAATGGCAATGGAACTTTAAAAACAGGATGGTTAAGCTTAGGAGGGAAAAGATATTACTTAAATGATCAAGATGGTAATATGGTAATAGGAGCTTTGGCTATAGAAGGTAAGCAATACTATTTTAATTCAAATGGAGAATTAATTAAAAAAACTGGCTGGTTAAAAGGTAAAAATTTAGAAACAGGCGGAATATGTTGGTATTATTTTGACGAAGAAGGAAATTTACAAAAAGGATTTAAGAATATAGATGGAGTAAACTATTATTTTACTGAAAATGGATTTATGGCTACAGGAGTTCAAAATGTTAAGCAAAAAGATGGTAATTATAAATTAATGCTTTTTAGTGAAAATGGTAAATTTATAGATAAAGCTGGTTGGTATGAAGTAAAGGATAGTTCAAATGATTCAAGTTGGTACTATATAAATAGTGATTATACTTTAGCAACAGGATTAAAGGAAATAAATAATAAATTGTATTACTTTGATCCAGATAGTGGAATGATGATTTCAAATAAACTTCAAGAAGTTGTGATGAAAGATGGAAGTAAAAAAGATTATTATTTTAATAATAACGGAGTTGCCTTAATAAACAATGAAGGATGGCAATCTCAAAAAGAAAATAATAAAATAATGTGGCAATATTTAAAAAATGAACAACCTGTAAGTGGATTACAAGAAATAAACGGAAAAACATATTATTTTAATGAAAATACTTCCTATATGGAAACTGGAGTTGTTGATACAGGAAAAGGAATTTATCTTTTTGATGATAATGGAGCAAAAGTTAATAAAACAGGATGGATTAAAAATAAAGGACACTGGTATTATTTAAATAATGATTCAACTGTAAAAAGAGATTGGTTAAACTCTGGGTATAGTTGGTATTATTTAAATGATAATGGAATAATGGCTACTCAATGGAAAAAAGTAAATAATTATTGGTATTATTTTGGCTCAAATGGAGCAATGCAAAAAGATTGGAAAGAAATAAATAGCAATTGGTATTACTTAAGAAATGATGGAATAATGACAACTCAATGGGAAAAAGTAAATAATTACTGGTACTATTTTGGCTCAAATGGAGCAATGCAAAAGGATTGGAAAGAAATAAACAATAATTGGTATTACTTGAGAGATGATGGAATAATGGCAACTCAATGGGAAAAAGTAAATAATTATTGGTATTATTTTGGCTCAAATGGAGCAATGCAAAAGGATTGGAAAGAAATAAACAATAATTGGTATTACTTGAGAGAAGATGGAATAATGGCAACTCAATGGGAAAAAGTAAATAATTATTGGTATTATTTTGGCTCAAATGGAGCAATGCAAAAAGATTGGAAAAAAATAAATAACAATTGGTATTACTTGAGAGATGATGGAATAATGACAACTCAATGGAACAAAATAAATGATTATTGGTATTACTTTAATGATGATGGGAAAATGATAAATAACCAATATGTTGATGGATGGAGAATAGATAATAATGGGGTAGCTCATTATGAAAAAGCTTTTAGAAATCCAAAGTTAGAAAATAGTAATCAAATAATAGTTGTAACGACAAATAATATGAGTACAAGTTATTGTAATATAGAAATTTATGAAAAGAATGATTCTGGTGAATGGAATAATATTGATAGTACAACTGGAAGAGTGGGAGCTAATGGACTTGCTTACATTGAAAATAGAGTTCAATCAACTAATACTACTCCAGCTGGTGTTATGAGCATAACAGGAGCTTTTGGAGTTAAGAATAATCCTGGAACAAAATTAGATTATATAAAGGTTAATAATAATATGTATTGGGATTTAAATAGCGAAAATTCTACATATAATAGATTGATTAATTATAATCCTGGTGGAGATTATGAGCATTTAATTTCTTATCCTAGACAATATGAATATTCTTTAATAACTGATTATAATCACAATCAGGTTCCAAACAAAGGAGGAGCAATTTTTGTACATTGTTTAGGAAGAGGGGCTACTGGAGGATGTGTTTCAATGCCTAGAGAAAAAATGATTGAAATATTAAAGTGGATAGATCCTAAGAAGAATCCTAAAATTTTAGTTATTCCTAAAGATGATTTAGATGACTATTGGTATTAA
PROTEIN sequence
Length: 899
MKKVKEKIAIAVLTGVIMGVSGSFVFSGRNIYASELKSTLSDEQTSQKNEKEKKEKTLELKEEIQSSNKMKEENKDVIKKEEIDKKFDNNEVRENKVTTFDIKSNEKSKVEKCHWFKNGTDGDGRTIWSYKNKEGKNVVGLAEINGDKYFFDEYGRMQTGIIKDYKSNKIYYAESNGVLSNYKGWKKIDDEWYYFNGNGTLKTGWLSLGGKRYYLNDQDGNMVIGALAIEGKQYYFNSNGELIKKTGWLKGKNLETGGICWYYFDEEGNLQKGFKNIDGVNYYFTENGFMATGVQNVKQKDGNYKLMLFSENGKFIDKAGWYEVKDSSNDSSWYYINSDYTLATGLKEINNKLYYFDPDSGMMISNKLQEVVMKDGSKKDYYFNNNGVALINNEGWQSQKENNKIMWQYLKNEQPVSGLQEINGKTYYFNENTSYMETGVVDTGKGIYLFDDNGAKVNKTGWIKNKGHWYYLNNDSTVKRDWLNSGYSWYYLNDNGIMATQWKKVNNYWYYFGSNGAMQKDWKEINSNWYYLRNDGIMTTQWEKVNNYWYYFGSNGAMQKDWKEINNNWYYLRDDGIMATQWEKVNNYWYYFGSNGAMQKDWKEINNNWYYLREDGIMATQWEKVNNYWYYFGSNGAMQKDWKKINNNWYYLRDDGIMTTQWNKINDYWYYFNDDGKMINNQYVDGWRIDNNGVAHYEKAFRNPKLENSNQIIVVTTNNMSTSYCNIEIYEKNDSGEWNNIDSTTGRVGANGLAYIENRVQSTNTTPAGVMSITGAFGVKNNPGTKLDYIKVNNNMYWDLNSENSTYNRLINYNPGGDYEHLISYPRQYEYSLITDYNHNQVPNKGGAIFVHCLGRGATGGCVSMPREKMIEILKWIDPKKNPKILVIPKDDLDDYWY*