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NECEvent2014_6_5_scaffold_329_13

Organism: NECEvent2014_6_5_Clostridium_paraputrificum_30_193

near complete RP 48 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: comp(11835..13163)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
mate efflux family protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 67.2
  • Coverage: 442.0
  • Bit_score: 603
  • Evalue 5.40e-170
Mate efflux family protein {ECO:0000313|EMBL:ACD23595.1}; Multi antimicrobial extrusion protein (Na(+)/drug antiporter), MATE family of MDR efflux pumps {ECO:0000313|EMBL:CDH91515.1}; TaxID=935198 spe similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 67.2
  • Coverage: 442.0
  • Bit_score: 603
  • Evalue 2.70e-169

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium botulinum → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1329
ATGCAAAAAATAGATTTAACTAAGGGGAAGGTAACAAAAGTCCTATTAGCTACAGCAATACCTATTATGGGTAGTTCTCTTCTACAGTTTACTTATAATCTTGTAGATATGCTTTTTGTTGGAAGGCTAGGAAGTGATGCAGTGGCAAGTGTTGGATCTTCAAGCTTTTTTATAGGTCTTGGATATTCTATAAATGCTATTGTTGTTATTGGTACAGGGATTAAAGTTGCTCATTCAATAGGGAATAGCGATGAAATTAAAACTAAAGGATATATTAATTCTGGACTTATACTAAATTTTATAATTGGATTAATATATTCCTTGCTTTTAGTCTTGCTTGGTAAGGAGTTAATATCTTTTTTAGATTTAGGAAATCTAAGGGTTGAAAGAGATGGATATATATATTTAGCACTTAGTGCACCAATGCTTTTCTTTGCATTTTTCAATTTACTGTATACTAGAATATTATCTAGTTATGGTAATAATAAAATTGCACTTAAAATTAACGCTGTTGGAGTTCTAACAAACATTATTTTAGATCCAATTTTAATATATACTTTTGGTTTTGGTGTAAAGGGAGCAGCTATTGCAACCTTAATATCAAATGTATTAATGTTTGTACTTTATAACATAAAATCAAATAAAATGTTATATTATGATTTTAAAATAAAATATAGTTTACAAAAGATAATAGAGATAATAAAGCTTGGTTTTCCTATGTCCTTTCAAAGAGTGCTTTTCACTCTTGTAAATATTTCTCTTGCGAAGATAATAAGTAACTTTGGTTCAGATGCTATAGCAGCACAGAAGATTGGACTTCAAATAGAATCCATTACCTTCATGGTTATAGGCGGATTAAATGGTGCCATTTCAAGTTTTGCAGGTCAGAATTTTGGTGCAAAAAAATATAAAAGAATCTTAGATGGATATAATAGTTCATTAAGAATAGGATTAATATATTCCTTGTTTATGGCATTAATTTTTATATTTATCCCAGGTTCTCTAGTTAGTTTATTTATTAAGGAGGACAATACTGCAAGTATTGCATGTGGTTATCTACAGATAGTTGGCTTATCTCAGCTATTTAGCACTATTGAAATGGTGTCAAATGGTTTGTTTACAGGAGTTGGTAAGCCTAAGATACCAGCTATAATAAGCATAATATTTACAGTTTTAAGGATACCAATGGCACTAATATTTATAAGAATTATTGGTGTTAATGGTATATGGTTAAGTATTGCACTATCAAGTGTTTTAAAAGGAATAACAGCTTATTTATTATATATAGTTACAGTTAGGAAGGAGTATACAAATGCTAAATACATTTAA
PROTEIN sequence
Length: 443
MQKIDLTKGKVTKVLLATAIPIMGSSLLQFTYNLVDMLFVGRLGSDAVASVGSSSFFIGLGYSINAIVVIGTGIKVAHSIGNSDEIKTKGYINSGLILNFIIGLIYSLLLVLLGKELISFLDLGNLRVERDGYIYLALSAPMLFFAFFNLLYTRILSSYGNNKIALKINAVGVLTNIILDPILIYTFGFGVKGAAIATLISNVLMFVLYNIKSNKMLYYDFKIKYSLQKIIEIIKLGFPMSFQRVLFTLVNISLAKIISNFGSDAIAAQKIGLQIESITFMVIGGLNGAISSFAGQNFGAKKYKRILDGYNSSLRIGLIYSLFMALIFIFIPGSLVSLFIKEDNTASIACGYLQIVGLSQLFSTIEMVSNGLFTGVGKPKIPAIISIIFTVLRIPMALIFIRIIGVNGIWLSIALSSVLKGITAYLLYIVTVRKEYTNAKYI*