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NECEvent2014_6_7_scaffold_393_4

Organism: NECEvent2014_6_7_Clostridium-rel_29_71_hint

partial RP 0 / 55 BSCG 0 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 2637..5336

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
collagen-binding protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.1
  • Coverage: 183.0
  • Bit_score: 72
  • Evalue 6.70e-10

Lists

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Notes

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Taxonomy

No taxonomy information

Sequences

DNA sequence
Length: 2700
ATGATTGGAGGAAGAAGAGCCATGAAAAGTAATAAGATGAAGAGAATATTAGTAGCCATACTTTGCATGGTAGTGGTGTTATCCAGTAATATTTCGGTGTTAGTAGAAGGAAAAAGTATTTCAACAGTTGAAATAAGCGCTGGTGAAAATGGGGATAACAATCCTCACAATCAGTTAGGCAATGATTTGAAAGAAACAACAAACAGAGTAGTAGAAAAAGCTTATAACTATGATGGAGAAAACCCAGATTTATCATTAGGAATTTATCCAGAACGTTATAAAATTTGGAGAGATGAAACTAACAGAGAACACTTAAATGAGGGGGAACTAAATAGATATACCTTTGGTGATTTTGGAGAAAGCTACGATATATTTAATATTTTAGCCAAGTACAATGCCTTTACCTTTGATTATTATGAAGGTACACACATTGTTGGACCAGTTGCAGCTGGTGGAGATGTTAAGGTTTCTATAGGTGGAACTACAACAAAAGTAGAATATCCACATACAGTTCCTTGCTACATTGGGGGTAACGCTGGGAATGGTAATACAATTATTACAACTTCTAATATGCCAATATTTATTAATGGAAACATAGCAGGAAATAAGAAATATTGGACAATGCAAGAATCTCCTACTTCACTTTATTACAATTATTATTATACAAATGATAATTATAAATATATTGATATGGCAGAGGCAAAAGCAAAAATTACTCAGCAAATGCAAGAGCTTATGGATTTTCAAGGGATTGATGTAACAGGACATTACATGGAGAAAATTTCAATTACTGATAAAGATATAGAAGAGATGAAAAGTTTAAAGCCTGGTGAAATTATTGAAAAAGAAGGATATACCTTGGAATGTAATGGATCAGTAGGTTATAGTTATGGAGTTCGTTTACAGCTTGGATACAACTTCGAAATTTCTTCAGTTAAAGATATTGATTATATTGTCTATGATTATGAAAGCTTACATGAAGTAGGTAATATGACAACATTTATAAATATCTTAGATTCTGGAGAATTTAATATGCCAGCTATATTTAAATCAGTTTCTGACAAATTAGGAGTAGATAAAGCTATTATTGGATCTGGAAATATAAAAGATGCTTATCAATTTGAGTCTATTGAGGTTGAAGAGGCCTTCAATATTGTTGGTTTTTTCCCTAATGCAACTAAGATTGTAGTAGGGGGAAGTATGAACAAATATGTTGGACATCTAGTAGCACCAAAAGCGCATGTTGAAGTAAATAGTGGTGACTTTAATGGTACTATGATCGCCGATAGTATTAAATCAAGTGCAGAAGGGCATATGTGGCCATTTAATGTTAAGTCTTTATTGGGATTTAGAAAAACAGTAAATGGATCAATACCAAATGAGAATGAAGTGTTTAAATTTAAAATAGAAAATATTTCAAAGCCTGAAACTGCAGAGAATATTCCAATTCAGTATGCTGAAAATACTATAAATGGATTAGTTACATTTGATCTTTCAGGTTTAACAAAGCGAGGGGAGTATATTTTCAAGATTTCAGAAGAATATACCAACACTCAGTACATTAAAAATGATAATGTGTATTATGCTAGATTTAATGTTTTACCATCAACAAGTACAGTAGGTGGTGTTAATATGTCAGCAAAGCTTGAAGGTTTTTATGAAGATGAGAAATGTACAATAAAGCATGATATGAATGGTAGTAATGTATTGTATAACAACTTTAGAGATCTTAAGGTTCAAAAGAAGTGGATTGACACAGAAGGAAATGAGTTGGACAAGCAATATTGGAAGCCAGTATCAGTTGAAATTCATAGAAAAGCAGTTAAAGATGAAGCTTTTCAGCCAACTGAAGATACTGTTGTAGATAATGTGGACATAAATGAATTAAAAAATAATACATTGGTAGAAAAAGTTACATTAAGTGAGGATAATGACTGGAAGCAAACTTTAATAGGAAATCAATATTTCTCATCAAAAATCCTAGAAGAAGATGGAAAGATAGTAAAATATGATTTTAGCTATTATGCAAAAGAGGTAGATGTACCAAGTAATGCTACTGTAAGCTATGAAAATAATGATGGAATTATTATTGGATGCATTATAGTTAAAAATCAAGTGGATTCAGTAGATTTGACTATACAGAAAAAGAGTAGCACAGGTAATAATGATTATCTATCTGGTGCAGAATTTAAACTCTATAAATCAAGTGATTTAAATGCACCATTAAAATTTACATTAAATAATGGTTATTATGTATTTAATGTAAATGGAGATAAGGAAACATTATTAACAGATGGTTCAGAAACAGGTAAAGACAGTGTTGGATTGTTAAAATTAAAAGATTTACCTTTTGGTGATTATGTTATACAAGAAACAAAACATCCTGAGGGGTTTGTAATTAATAGTCAATTTATCTTTATTCATGTTGATAGTAAGGGAAGCTATTATCAATTAATGGGTGATGAAAAAGTTCCTAATGAGACCATGGAGAAAGTAAACATTAATCATACATCCACTGATTTTAGTATTAAATTAGAATTTGCCGTTGAAAATACACCAAACATTGAGGTTCCAGAAACAGGTGGTACACCTAATGATATATATAAGAAGATTGGGTTATTGCTTACTTGTTTGGGAGCTATAATGCTTACAGTATATGAGGTAAAGTTCAATAAAAATAGAAAAAAGATAGGGTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 900
MIGGRRAMKSNKMKRILVAILCMVVVLSSNISVLVEGKSISTVEISAGENGDNNPHNQLGNDLKETTNRVVEKAYNYDGENPDLSLGIYPERYKIWRDETNREHLNEGELNRYTFGDFGESYDIFNILAKYNAFTFDYYEGTHIVGPVAAGGDVKVSIGGTTTKVEYPHTVPCYIGGNAGNGNTIITTSNMPIFINGNIAGNKKYWTMQESPTSLYYNYYYTNDNYKYIDMAEAKAKITQQMQELMDFQGIDVTGHYMEKISITDKDIEEMKSLKPGEIIEKEGYTLECNGSVGYSYGVRLQLGYNFEISSVKDIDYIVYDYESLHEVGNMTTFINILDSGEFNMPAIFKSVSDKLGVDKAIIGSGNIKDAYQFESIEVEEAFNIVGFFPNATKIVVGGSMNKYVGHLVAPKAHVEVNSGDFNGTMIADSIKSSAEGHMWPFNVKSLLGFRKTVNGSIPNENEVFKFKIENISKPETAENIPIQYAENTINGLVTFDLSGLTKRGEYIFKISEEYTNTQYIKNDNVYYARFNVLPSTSTVGGVNMSAKLEGFYEDEKCTIKHDMNGSNVLYNNFRDLKVQKKWIDTEGNELDKQYWKPVSVEIHRKAVKDEAFQPTEDTVVDNVDINELKNNTLVEKVTLSEDNDWKQTLIGNQYFSSKILEEDGKIVKYDFSYYAKEVDVPSNATVSYENNDGIIIGCIIVKNQVDSVDLTIQKKSSTGNNDYLSGAEFKLYKSSDLNAPLKFTLNNGYYVFNVNGDKETLLTDGSETGKDSVGLLKLKDLPFGDYVIQETKHPEGFVINSQFIFIHVDSKGSYYQLMGDEKVPNETMEKVNINHTSTDFSIKLEFAVENTPNIEVPETGGTPNDIYKKIGLLLTCLGAIMLTVYEVKFNKNRKKIGF*