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NECEvent2014_8_3_scaffold_90_13

Organism: NECEvent2014_8_3_Clostridium_butyricum_28_57

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(14399..17626)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
UPI0003D5B34B related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI0003D5B34B similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 98.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2131
  • Evalue 0.0
  • rbh
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:KJZ83855.1}; TaxID=1523154 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sp. IBUN125C.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2142
  • Evalue 0.0
sensor histidine kinase/response regulator similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 50.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1064
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. IBUN125C → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3228
GTGATAATCATTAATAAATTGAAAAATACCATTTTAAAAATATCAGTTATTTTTTTTATTTTAAATCTGTTTACAAGTATTAGTGTTATAAAAGCTGAGGCGTATAGCAACATAGTCTTTAAAAATATAACCATTGAAGACGGACTTGCACAGGCAACTGTTGAATGTATGATTCAAGACAGCAGGGGATATATGTGGTTTGGAACCAATGATGGATTAAGCAGATATAATGGGCATGAATTTGAAGTATATAGAAACGAAATTGGTGTAGACAATAGTATTGTAAATAACTATATTGTATGTATGAATGAAGACCGGGATGGAAACTTATGGATTGGAACCATAGATGGAGCAAGTAAAATTAATTTGTCTACCAATGAGATAACAAATTATAAAAATTCAAGTGGATTATCTAACAATAATGTAACTGAAATACTTGTTACTAAAGATGGAGAAATTCTATTAGCTACAATTGATGGACTGAATATATATGATAAGACTAATGATAGATTTACAAGAATATTTAATAATGAGTATATTAAAGATCAAGAAATTTATTCTTTAGATGAAGATATTAATGGAGATATATGGCTTGGTGGCTCAAAGAATATTACAAAGATAAATTTAAAAAATAATACTTGTGAGGATTTTTCTGATATAAATAAAGAGTATGAAAAAATTAATGACTGTGCTTATAAAGTTTTATGTGATGATAAATATATATGGGTTGGAACAATAAGTAATGGTTTGTATAAAATTAACATTGAAACTTCCCAAACAGAAACCATTAATTTAAGTAATAGCAAGATTTCAAGCAATAACATACATACTATTATGAAAGATAAAAATGGAATAATGTGGATTGGTACGGATTCTGGATTAGTAAAATATGATTCTAAAAATGATGAGTATAATACCTATGTTAATAAAGCTTACGATAAATATTCTTTAGTTGACGATTATGTTTACTCAGTGATACAAGATAGAAGTGGGCTTATATGGGTGGGAACCTATGCTGGAGTAAGTATGTTTGAACCTGAAAATAAGATAGAACACTATAAAGTAGATCCATTATCACATTCAAGTATAAATGAAAATCTTATACATGGTATATATGAAGATGATGATGGACTAATATGGATTGGAACAAATACAAAAGGAGTAAATGTATTAGATAGAAAAAATGAAAATATATATGATATATCAGAGTTTACAAATGGAACTGCATTAAGCAGTAATTCAATAAATGATATTAGTGGACATGCAAATAAAATCTTTATTGCAACAAACAATGGTTTAAATATATATGACAAAAATACAAGAAAAATCTCAGTGTATAATGAAAAGCAGGGGCTTAATGCAAAAAAGATAAGGAATATAACATATGATGATTCTGGTGTATTATGGATTGGTACAACAAATGGAATCAATATATTGAATTTAGAAACTGATGAAATCACAGATTTAAATTATATTTTGGATAAATACTCATTAGATGATAGATATTCAGAATGTATTTTCAAAGATAGCGAAGGATTCTATTGGCTTGGTAGTTTCTTAAATGGTGGATTAATAAAAATAGATCCATACAATAATACTGCTATTCAATATAAGCATGAAGGAAAAGATGGTGATTTATCTAACAATACTGTAAGAACAATTATTGAAGATGATGAGAAAAATATATGGGTTGGTACAAGTGGAGGACTTAATAAATTAGATAAAGAAACTGGTAAGTTTAAGACGTATACAACAAGTGATGGACTTGCTAATAATAATATATATGGTATTGTAATTGATGAAACTGGAAACTTATGGATGAGTACAAATCTTGGTATTTCAAAATTAGATAGAGAAAAAGATAGATTTTTTAATTTAAATATAACTGATGGTTTACAGAGTAACGAATTCAATGGTCATTCTTATGGAAAATTAAAAAGTGGAGAATTAATTTTTGGTGGTATAAATGGATTAAATATATTTAATCCAGATGAAATATTGAATAATATGTATATACCTAGAGTTGAATTTGATAGATTTAGAGTAAATGGTAGAACTATAGATACATTACAAGATGCTAAGTTGAATTATAATGAAAATACAATTGGAATTAAATTTTTTCTACCGGATTATAAAAATATAAAAAATATACAATATTATTATTCATTAGAAGGAGCCGGTAATGATTGGTCTCTAGTTAATACTAATGAACTTGTCTTAAGCAATCTTGGAAGCGGCACTTACATTTTTAGGGTGAAAGCAAGAAATAGCAGTGGGATTTTTAGTGAAGAAAGTAGTTTCAAATTTACTATAAAACCTCCATTTTGGAGAAGTGCTGAATTTATATTAATATATATATTGATAGGTGTAAGTTTAGTAGTATTAATAGTTAAAAGTAAAAATACTAAGATGAGATTGTTAGATGATATGGTAAGTAAGAGAACTAGAGAATTAAGTGATGAAATGGAAAAAAATACAGAATTACTAAATAAGATCATAAATCTAGAAAAAAGAAAAAATGCATACTTAGTAAACATATCTCATGATTTAAGAACACCATTAAATGTTTTATCGTCTATTCATCAACTTATAAACCAATTAAATAAAAGTGAAGCAGGTATTGAAAGAGAAAAACTTGATTATTACATGAACATATTTGGTAAGAACGTTGATAGACTTCTTAAATTGATAAATGACTTGATAGATTCATCAAAGATAGAGCATGGCAATTATCATATAAATATAGGCAAGTATAATATTGTTTATATTGTAGAAGATACAGCACTATCACTTAAAGATTATGTTGAAAGTAAAAATATAGAATTAATAATCGATCCAGAGGTAGAAGAATGTTTCATTGAATGTGATTCTAATGAAATAGAGAGATGTATAATAAATCTTGTTAATAATGCTGCTAAATTTACAGATGAAGGTGGACGTATATTAGTATCTGTTGTTGAACTTGAAAATGAAGTTAAGATTATGGTAAGTGATACTGGAATAGGTATAGATGAAAAACATCTTGAAACTGTATTTGATAGATTTAATCAAGTAATTGACTCGAATAAAGAAACAAAAGGTGGAAGTGGACTAGGTCTTACAATAACAAAACTTATTGTAGGATTACATAATGGAAGGATATTTGCAGAGAGTGAAATAAATGTAGGAAGCAAATTTACAATAATACTTCCTAAAAAACAGCCAAAAGAAAAAGTTGAAAAAATTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1076
VIIINKLKNTILKISVIFFILNLFTSISVIKAEAYSNIVFKNITIEDGLAQATVECMIQDSRGYMWFGTNDGLSRYNGHEFEVYRNEIGVDNSIVNNYIVCMNEDRDGNLWIGTIDGASKINLSTNEITNYKNSSGLSNNNVTEILVTKDGEILLATIDGLNIYDKTNDRFTRIFNNEYIKDQEIYSLDEDINGDIWLGGSKNITKINLKNNTCEDFSDINKEYEKINDCAYKVLCDDKYIWVGTISNGLYKINIETSQTETINLSNSKISSNNIHTIMKDKNGIMWIGTDSGLVKYDSKNDEYNTYVNKAYDKYSLVDDYVYSVIQDRSGLIWVGTYAGVSMFEPENKIEHYKVDPLSHSSINENLIHGIYEDDDGLIWIGTNTKGVNVLDRKNENIYDISEFTNGTALSSNSINDISGHANKIFIATNNGLNIYDKNTRKISVYNEKQGLNAKKIRNITYDDSGVLWIGTTNGINILNLETDEITDLNYILDKYSLDDRYSECIFKDSEGFYWLGSFLNGGLIKIDPYNNTAIQYKHEGKDGDLSNNTVRTIIEDDEKNIWVGTSGGLNKLDKETGKFKTYTTSDGLANNNIYGIVIDETGNLWMSTNLGISKLDREKDRFFNLNITDGLQSNEFNGHSYGKLKSGELIFGGINGLNIFNPDEILNNMYIPRVEFDRFRVNGRTIDTLQDAKLNYNENTIGIKFFLPDYKNIKNIQYYYSLEGAGNDWSLVNTNELVLSNLGSGTYIFRVKARNSSGIFSEESSFKFTIKPPFWRSAEFILIYILIGVSLVVLIVKSKNTKMRLLDDMVSKRTRELSDEMEKNTELLNKIINLEKRKNAYLVNISHDLRTPLNVLSSIHQLINQLNKSEAGIEREKLDYYMNIFGKNVDRLLKLINDLIDSSKIEHGNYHINIGKYNIVYIVEDTALSLKDYVESKNIELIIDPEVEECFIECDSNEIERCIINLVNNAAKFTDEGGRILVSVVELENEVKIMVSDTGIGIDEKHLETVFDRFNQVIDSNKETKGGSGLGLTITKLIVGLHNGRIFAESEINVGSKFTIILPKKQPKEKVEKI*