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NECEvent2014_8_3_scaffold_414_8

Organism: NECEvent2014_8_3_Clostridium_perfringens_28_18

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 8772..13463

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
Cell wall binding repeat domain protein n=1 Tax=Clostridium perfringens (strain ATCC 13124 / NCTC 8237 / Type A) RepID=Q0TTU6_CLOP1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 96.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3241
  • Evalue 0.0
  • rbh
cell wall binding repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 96.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3241
  • Evalue 0.0
Cell wall binding repeat-containing protein {ECO:0000313|EMBL:EIA18241.1}; TaxID=883064 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium per similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.3
  • Coverage: 994.0
  • Bit_score: 2185
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4692
ATGAAAAAAGTAAGAGAGAAAGTAGCTATTGCCGTAGCTATAGCAAGTATAACTACTATATCTAGCTTTGTAATAAGCAATGGAAAGAAAGTTTATGCTGAAGAAGTAAGGGTTACAGCTACTGCTAATTTAGATAATATTAAGGATAATGGAAAACAATTAAAAAATGAAAGCCCTAAGGCAAATACGCAAGAAGATACAAATGTTAATAATGAAGATTTAAAAACTGATGAAAAAAAAGATATAAAAGAAGTTGAAAGTAATTTTGTAAAGAATGCTGAAAATAAAACAGAAAAAATCAATGAAGATAAAAGTTTAGAGAATAATAATAACAAGGTGTCTACTAAATTAGAGTCTAGTGATAAATGTGTAAAAGAAATTAAAAATGATAAAGATAGTAAAGACAAAGATTCTAAAGAAGTTAAAGATGAAAATGTAGAAAAAGTTCATAATAATAAAAAGGATACTTTAGAAGAAGTAGAAAATAAATCTGATCAAAATAATGAAGATAAAATAAATAGAGATAAGAAAGTAGAAGTAAAAAGTGAAGAAATAAAAAGTAAAGATAATGAAACTTCTAAAAGAGATGAAGAAAGCAAGAAAATAAAAGGCGAAAATAAGGAAGTTGAAATTAAGTTAGATAAAAATCAAGCTTTAAAAAGTGATTACATAAATATTAATGAATCTGGACAAGCGGTAATAGCACGTACAGAAAGTCAAAATAATAGTGTAACTGATGAAAATGAAAAGAATGGATGGCAAACAATAGGTGGTAAAACATATTATTTTGAAAATGGAAAGGTATCAACTGGAAAAAAAGAAGTATATGATACTAAGAATGGAGATTATAAAACATATTTTTTTAATGAGGATGGAACTCTTGTAAATAAGCCAGGAATTTGCACTTATACTGAATATTGGGGTGAAAAAAGAAAGGTCTATGTAAACAATAAAGGTGAAGTTGAAAATGGTTGGAAAACAATAGATGGTAAGACATATTATTTTGATCAATATAATGGTATGTTAACTAATGTTCATGAAATAGATAATGGTGATAAAAAAGAGTCATATTTATTTGATAATGATGGAGTTTTAAGAAAAGGCACTGGATTAAAAGAAATAGATGGGAAGTGGTATTACTTTAATAAGGATAATAGCTTAGCAAGTGGCTGGAAAACAATAGATGGTAAAACATATTATTTTGATACGTATAGTGGTAGAGCAAAGGGAAGTATAAGAATATATGATTCTAATCATGAAAAATACAAAGTGTACCTTTTTAATGAAGACGGAGCTCTTATAACTGAACCAGGTATTCACATTTATCATGAAAATTGGGGTGGAGAAAGAAAGATATACGTAAACAATAAAGGTGAAGTTCAAAGTGGATGGCAAATAATAGATGGTAAGACATATTATTTTGATGAAAGTAATGGTATGGTAACTTGGGTACATGAAATAAATGAGAATGATAAAAATAAATCATATTTATTTGATAAAGATGGAGTTTTAGTAAAGGGTTCTGGATGGAAAGAGATAAATGGAAATTGGTATTATCTTAATAATGATAATAGTTTATTAGAAGGTTGGAAAACAATAGATGATAGAACATATTATCTTGATAAATATAATGGAATGGTAAATGGGGTTTATGAAGTAAATAGTGGGGATAAAAAGGAAACTTATTTATTTAATAAAGATGGATCATTGGTAAAAGGCAATGGTTTAAAAGAAGTAAATGGTACATGGTACTACTTTAATAGTGATAATAGCTTAGAAAATGGCTGGAAAATAATAGATGGCAAAACATATTATTTTAATAAGTATGACGGTAGGTCAAGAGGATGTGTAAGAGTATATGATGATTTAAATCATGAAAAATACAAAGTATATTTCTTTAATGAAGATGGAGTCCTTATAACTGAACCAGGTATTCATACTTATCATGAAACTTGGGGTGGTGAAAGAAAAATATGCATAAATAATAAAGGTGAAGTCCAAAGTGGATGGCAAACAATAGATGGTAAAACATATTATTTTGATGAACATAATGGAATGGCAAAGGGAGTAAGTTGTATAAGTACCGGGGATAATTATGAAGTTTACTTATTTAATGAAGATGGAAGTTTAGTAACAGGAAATGGTTGGAAAGAGATAAATGGTAAGTGGTATTATTTCAACAATAATAATAGTTTAGCAAATGGGTGGAAGACTATTAATGGAAAGACATATTATTTTAGTTCTCACATGAGTATAGGACCAACTTTAATACAAGGTAATAGACCAGAAAAATTAGATTTATATTATTTTGGAGAAGATGGAGAATTAATAAATAGAAAAGGATGGGCAAAATTAAATGATGACTGGTTCTATTTCAATGATGATAGTTCATTAAAAACTAAGTGGCAAACAATAGGGGGAAAGACATATTATTTTAATGAAACAACAGGGGCTATGGCAACTGGTCAAAAAACTACTTATGATTACTTTAATCATGAGGAAAAAATATACTGTTTTACTTCTGATGGATCCTTGTTAAAAGGAAAAGGCTGGTTTAGTAAATATGATGAATATAATAATTATAAAAAAGTTTGGTTCTATATAGATGAAGATGGAGTTTTAAAAACAGGTTATCAAACAATTAATGGTAAGGATTATTATTTTTATTGTGATGGAAAAATGGCTACTGGAATAGTTAATGTTGAAGGTGTTACAGGAAACCCTAAGTTCTATTATTTTGATAATAATGGAGAGTTATTTAAAAAAGAGGGATGGAAAAAAATAAATGAAAAATGGTATTATTTAAATGAAGATGGATCTTTAGTTAATGAATGGAAAAAATCAGGAAGTGATTGGTATTATTTAAATCCTAATTATGGAATGGCTATTGGTCCTACAAAAGTTCAAGATGACATGTGTTTAGGTATTAATGTATATTATTTTGAAGAAGATGGAAGATTAACTAATAGAACTGGATGGATTAACCATATAAATGGAGAATTTAGTGATTGGTACTATGTTGAGAATGGTGGAAAGGCAGCATTAGGATGGAATAAAATCAATGGAACTTGGTACTATTTTAATAGTGATGCAAAAATGGTTACAGCTCCAACTAGAATATTTGATAAAGATAGTTCAAAAGATAAGATTTACTTCTTTGACAAGAATGGTGCATATAGAAGATATTCAGGATGGTATGAACTTAAACCTGTAGATGGAGAGCCATGTTGGTATTATTTTGGAGAAGATGGTTTAGCTAAAACAGGTTGGCAAACAATAAATGGAAATAAGTATTGGTTTGCACCTAATGGAATAATGTGTAAAGGAACTAGTACTATTTTTGAAAATGAAGTTGAAGATGGTTGTTATAAAGTAGATTTACCAACATATTTATTTAATGAAAGTGGAGCTTTAGTAACTAGTGAAGGATGGCATAAGGTTACTTTATATGATGAAGATAAATGGTGTTATATAGATAATACTGGAGTATGTAAAAAAGGATTAGCAAAAATAAATAATAAATATTATTATTTTGAACCTCATAAGGCGTTAATGGAAACTGGAGTAATTTCTATATATGGGTTTAATGGAAATAAGGAAGCAAATTATTTCTTTGATGATAGTGGAGCATTAAATACTTCAAAAGGATGGCATAAGTGCAAAGATAGATATAATTCTTATTATATTTGGTGTTATATTGATGATAATGGTGAATTGGCAGAGGGATTTAAAGAAATAAATGGAAATAAATATTATTTTAAGAATGGAGTTATGAGTACAGGAAATACTCAAATAGAGGGAAACCAATATTACTTTAATGAATCTGGATTGATAGCAAAAGGTTGGAGCCAGAATAAAGATGGAGAATATTACTATACAGATAATAATGGTATTATTCAAAAAGGATGGCAAAAAATCAATGGAATTTGGTATTATTTTAATGACGGTGGAGTAATGGCAACTGGTCCTAAATATATGTTTGATGAAAACACTTATGACACAAAACTATATTATTTTGATAATAGTGGAGCTCTACAATATAAAAAAGGTTGGGTTAATCATATTGGGAAATATAATAATGATTGGTACTATATAAACTCAAATAATGAATTATCAACTAGTTGGCAAAATATAAATGGAACATGGTATTATTTTTATGAAAATGGAAAAATGGCAAAAGGTTCAACTGCAGTTACTTATTCAAATGGTGATAAAAGATATTATTGTTTTGATAATAGTGGAGCATGGGTTACTAATCCAGGATGGCATTCATGGCAAGATGAAGGTAATAAGACATGTTGGGCTTATATAAATAATGATGGAAGCTTGGCTGAAGGGTGGAAAGAGATAAATAATAAATGGTATTATTTCTACAAAGAAAATAAAGTTATGGCTAAAGGTGCTGTTAAGGAATGGGATTATAAGACTAATAAACCATATATTCAACATTTCTTTAATGAAGATGGATCTTGGGATGCTTCAGAAGGATGGAAGTCATTTAAGAATTTAGAATACTCACCAGATTTACAATGGGCTTATGTTGAATCAAATGGAAGATTAGCTTCTGGATGGAAGATGATTGGTGGACAATGGTATTATTTTGATGAAGGTAATGGTTTCATGGTTACAGAAAAGAGAGATATTAATGGTAAGTTTTATGAATTTAATTCTAATGGTACTTTAAAAAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1564
MKKVREKVAIAVAIASITTISSFVISNGKKVYAEEVRVTATANLDNIKDNGKQLKNESPKANTQEDTNVNNEDLKTDEKKDIKEVESNFVKNAENKTEKINEDKSLENNNNKVSTKLESSDKCVKEIKNDKDSKDKDSKEVKDENVEKVHNNKKDTLEEVENKSDQNNEDKINRDKKVEVKSEEIKSKDNETSKRDEESKKIKGENKEVEIKLDKNQALKSDYININESGQAVIARTESQNNSVTDENEKNGWQTIGGKTYYFENGKVSTGKKEVYDTKNGDYKTYFFNEDGTLVNKPGICTYTEYWGEKRKVYVNNKGEVENGWKTIDGKTYYFDQYNGMLTNVHEIDNGDKKESYLFDNDGVLRKGTGLKEIDGKWYYFNKDNSLASGWKTIDGKTYYFDTYSGRAKGSIRIYDSNHEKYKVYLFNEDGALITEPGIHIYHENWGGERKIYVNNKGEVQSGWQIIDGKTYYFDESNGMVTWVHEINENDKNKSYLFDKDGVLVKGSGWKEINGNWYYLNNDNSLLEGWKTIDDRTYYLDKYNGMVNGVYEVNSGDKKETYLFNKDGSLVKGNGLKEVNGTWYYFNSDNSLENGWKIIDGKTYYFNKYDGRSRGCVRVYDDLNHEKYKVYFFNEDGVLITEPGIHTYHETWGGERKICINNKGEVQSGWQTIDGKTYYFDEHNGMAKGVSCISTGDNYEVYLFNEDGSLVTGNGWKEINGKWYYFNNNNSLANGWKTINGKTYYFSSHMSIGPTLIQGNRPEKLDLYYFGEDGELINRKGWAKLNDDWFYFNDDSSLKTKWQTIGGKTYYFNETTGAMATGQKTTYDYFNHEEKIYCFTSDGSLLKGKGWFSKYDEYNNYKKVWFYIDEDGVLKTGYQTINGKDYYFYCDGKMATGIVNVEGVTGNPKFYYFDNNGELFKKEGWKKINEKWYYLNEDGSLVNEWKKSGSDWYYLNPNYGMAIGPTKVQDDMCLGINVYYFEEDGRLTNRTGWINHINGEFSDWYYVENGGKAALGWNKINGTWYYFNSDAKMVTAPTRIFDKDSSKDKIYFFDKNGAYRRYSGWYELKPVDGEPCWYYFGEDGLAKTGWQTINGNKYWFAPNGIMCKGTSTIFENEVEDGCYKVDLPTYLFNESGALVTSEGWHKVTLYDEDKWCYIDNTGVCKKGLAKINNKYYYFEPHKALMETGVISIYGFNGNKEANYFFDDSGALNTSKGWHKCKDRYNSYYIWCYIDDNGELAEGFKEINGNKYYFKNGVMSTGNTQIEGNQYYFNESGLIAKGWSQNKDGEYYYTDNNGIIQKGWQKINGIWYYFNDGGVMATGPKYMFDENTYDTKLYYFDNSGALQYKKGWVNHIGKYNNDWYYINSNNELSTSWQNINGTWYYFYENGKMAKGSTAVTYSNGDKRYYCFDNSGAWVTNPGWHSWQDEGNKTCWAYINNDGSLAEGWKEINNKWYYFYKENKVMAKGAVKEWDYKTNKPYIQHFFNEDGSWDASEGWKSFKNLEYSPDLQWAYVESNGRLASGWKMIGGQWYYFDEGNGFMVTEKRDINGKFYEFNSNGTLKN*