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NECEvent2014_8_3_scaffold_603_9

Organism: NECEvent2014_8_3_Clostridium_paraputrificum_30_11

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 5898..10532

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Value Algorithm Source
Alpha-1,3-galactosidase B domain protein n=1 Tax=Erysipelothrix rhusiopathiae ATCC 19414 RepID=E7FY30_ERYRH similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 44.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1280
  • Evalue 0.0
  • rbh
Alpha-1,3-galactosidase B domain protein {ECO:0000313|EMBL:EFY08404.1}; TaxID=525280 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Erysipelothrix.;" source= similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 44.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1280
  • Evalue 0.0
pectin lyase fold-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 44.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1277
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Erysipelothrix rhusiopathiae → Erysipelothrix → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4635
ATGATAGTTTTAAATTTTACTGTAAAAATAATATCAACTCATAAGGAGGAAAAAATGAAACGTATATTTCGAAAAGCAATAGTTTATTTTACTGTACTAGCAGTACTTATTTCAAATGTAAGTATTTCATCAGTAAAAGCTATGGAAAAAAGTGATGAAGGAATCATAGTTTATGCAAGTGATTATGGACTTGATTCAACAGGTGAAAAAGATAATGCTAAAGCTTTAGTTAATATGTTTGAAGCTATTAGGGAAATAGGTGAGAATGGGGATAAGGTTACTTTAAAGTTTGATAAAGGTATTTATCAAATTCATAAAGAGAATGCTCCAGTAAGAGAGGTACATACATCAAATACAGATAGTGTACGTTTTCCTAACAAATCAATTGGTATTTTAATTGAGAACCAAAATAATTTAACTATAGATGGAAATGGATCACAGTTTATTATTAATGGTGATATGATGGCCTTAGCTATTATGCACTCAGAGAATATAACAGTAAAAAATGTAAATATAGATTATCAAATTCCTACAACTTCTGAGATGACTGTGCTTGATTATGATAATGAAAATAAGACTATAGATTATTTTATTCCTGAATATCTTAATTATGAAATTCAAGGAGCGAATATTATATGGAAGTCAGAACAAAAATCTGATGGAGGGTACTATTGGACAGAAAAAAATGATCATCGTAATTATGGTATATCAGTAAAGTATCCAACAGAGTTAATGGGAAGATCATATTATTCAAATAGTAATCCATTTACAAATGCACAATCAATAGAGCAGCTAGATGATTCGAGAGTTAGAATTAAATACTCTTCAAACCCAGCATTTGAAGTTGTAAAGGGAATGAATTTTCAATTAGTATCAAACGCTGAGCGTCCAACAGCTGGTGCTTTTGTATGGGAAAGCAAAGATATTAATGTAATTAATACAAAGATATCATACATGCATGGATTTGGATTCTTAGTTCAAATGGCAGAAAACGTTTCTTTTGATGGTATACGTATGGAAACAGATATTGAAACAGGACGTAATACTTCAAGCTTTGCTGATGGAATTCATATTTCAGGTGCAAAGGGAAAGATAGAAATAAAAAATTCCTTCTTCAATAATACTCATGATGATCCTATCAATATTCATGGGACATTTACTCGTGTTGAAGAAAAGTTAGATAGCAATACATTGAGATTAAAATATATTCATAATCAACAAGGAGGATTTCCACAATATCATCCAGGAGATAAGGTGGTATTTTATAGTCGTGATACACTAGAATCAAGAGATGAAGAAAAGGAATATACAGTAAAAAGTGTAGAAGGACCATCAAAAGATAATCTTAAAGAGATGATTGTTGAATTTGAAGAAGAAGTACCAGATTATTTAACAGAGAAAGTTGGAAATGAACCAAAGTTTGTAGCTGAAAATGCAACATATACTCCAGAGATTTATATTAAAAACAACGAGTTTAAAAATGTATTTACTCGTATGATCTTAGCAACATCACGTAAGAAGATAGTTATTGAAGACAATTATTTTGAAGCTCCTTCAATGGCAACATTATTTTTCTCAAATGACTCTGATGAATGGTATGAATCAGGTCCAATTCGTGATCTAGAAATAAGAAATAATACATTTAAAATACGTAGCTTAGGTCGTACTTGGTGGAAGTATGCTCCAGCAATATATTTTCATCCAGTAACTAAAGGTGGAGGATTACCAGATGAATCCAACCCTATTCATAAGAATATTTTGATTGAAGAAAATAAGTTTTATTTAGAAAGTGATGGGGCTTTACGTGCTGAAAGTGTTGAGAATCTAACATTTAGAAATAATGAAATATATAGATTAGATCCAAGTGTTGATTTAAGTATAGAAGGTTCTAACAAATTATATGTAGGTAACAATAGCAATTTAGAACTAACTTATGATGGAAATGTTGTAACTGGTCCAACATCATTACCAGGAGGTCCAGAATCTAATTCAGGAACTGTAGCTAATGTATTAGAATTTAAAAATAGTAAAAATGTTGTTGTAGAAAACAATTATTATGATGATGGATTAAGAAAGAATGTATTAATTGAGGGGATGGATAGCAAAAATTTAAAGCTTAAAGATGATTTAAATGTACTAAATAATAGAGAAAAAACTGAACCTTCAGATGTTGTTAGTAATATACAATATGCATCAACTAATCCTGAAGTGGTAAGTATTGATAGTAATGGGAAGATGACTGCAAACAAAGAAGGTACAGCAGAGGTATTTGCATATTATGTTTGGAATGGTACCATTATTGAGTCTAATAAGAAGGAAATAACAGTTTTAAGCTCTGAAAATACTTTCGAGAATGAATTGGAATTTAAATCAGAGGTAATTACTATTGATGGAGACAATGGTACAAGCTTTGAGTTTAAAGAAGATATTAATCCAAGTGAAGTAGAATATACAATTCATGATTCTCAAATTGTAAAATTAGAAGGAAACACCTTTTATGGTTTAAAAACAGGTTTAGCAAGAATTACAGTAAGATATAAGGGAAGTGAAAAAACAGTCTTTGCTATAGTAAATGGTAAAGATGATCAAAAGGTTTTAAACTCTTTAATAAATATTGAAGATAAAGATAGTAATTCAACTGCTTCAGATGATAGCATTACAATAACTCGTAAAGCAGGTAATGATTTGTGGGGAAGTGATAATACATTAAATAATTTAGTTACTATTGATTTGGAAAATGTTGATATTAATAATTTTACAGGGTTAGTAACAATTGATGGATTACCAGGACGTATGGCAAATAACTGGGACTCAGCATATTTCTTAATTATGAAAAAGAATGCAAATGGAACTGTTGATCGTAATAACTATTTATCTGTAGGTAAACGTGCTCATGCTGATGGATTTGGAACTGTTCATGAAGTTAATGCTATAGGAAGTGAGCATGCAACAGGGGATGTTAGTGAAAATGAAATTAAAAAAGCAACTTTTGCAATAGAAAAGCAAGGCAAAACAGTTAATTTATATTCTATAGTTGATGGCAAGAGGAATAAGGTACAAAGCGTTGATATATCAAGCTTTGGAGATGATCTTAAGCTTGCAGTTGCATGTTGGGGAGCTGGACAAACTAATAAAAATGTTACAGTTACAGATATTAAATTAGGAGAAGGAAATATTGATGAAGTTTTACTGAAGGATTCATTACCAATTATGACTAATGATGATTCTAAGTTTGTAATTTCTAATTTAAGTCATTCATCTGATAGTAATGATAATATTAATATTAGCTTTGATTCAACTCATAAAGGTAATAATATGTTAATAGTTAGTGAGCCTGGTAATAACACATATGTTGTAAGTGGAAATAGCTTTAAAGCTACAGAAAATGGAGAGTATAAGGTGTTTGCGGTATCGCAACTATCTAGTGGTAAATATTCAAATGTAATTAGTAAAACATTTAATTATAAGCCACAATCTCAAAAAGGCTTTTATCTAAATGGTATAAAAATAGTTGATGGAGATACCATTACTATACCAGAGGAGTTAACAAAGTTATATTTAATAAACTATGATAATAATACTAAGTCAGTAATAGATGTTACAGGTAAGGATACAGTTAGTGGCGATTTTGGAACTATTAAATTAGAGAAAATAAAAAGTAACAAAGCAGGAATTGAGTCAATTAATGCTGTTGGATATGGTGAAATTAATATATCAAGCAAAAATTCCTTTATTAATACTAATAAAAAAGATAATTCTATAACATTTAATGTTAAATTATCAGAAGGTACAGACAAGCTTTTAGCAAAGAATTATGACCATGGAATAAATTATGAAGTGGTTCAGAATGGAAATAATGCAAAGGTTACTGTTCCTGTTTATAATGGAGTAGTTAGTATTGCTTTTGAAGCTGTTGCTAAGGATAGAGTAACTAAAGATATTCATAGTGTTCATGTTATGCGTTATGCGGACATTTTAGAAGGATTTAATAAAATTGATGTTAATGGAAGTACTCTAGATATTTCAGAAGAGAAAGTTGATTTAGGTAACAAGACTAATAAAATTTCAGTTAAGGCAGATGCTAATGATGTAAATGCAGAAATAACAGTTATGAAGCGTAATAACAATGGACTTAATGAAATATCACAAGGTGTAGATACAGTAGTTGAAAATGGAGATGAGATCATTGTAAGAATAATCCATGAAAATAAACGTATGATGGAGTTTAAGACTCTTACAGTAGAAAATTCAAAGGAGCCTGAATTAGATATCAAGTCATTATTAGATTTAATAAAAGAAGCAGAAGATATTGACTTATCCAATAAAACAGAAGAAAGTAAGGTCAAATTCCTAGAAGTATTAGATGAAGTAAAAGCAGAAGTTAATGAAGGAATTACTTCTAGTGATGAATTGGAAGAATTAATAGATAAGCTTCAGAAGGCGATTAATGGTCTTGAAGATAAAGAAGAAACTCCAAATGGTGGGAGTAATGATGAAATTGAAGATGATAAAACAGAGTCATCAAATCTACCTAAAACAGGAGATGAAAGTTTGGGACTATTAGTACTTGCTCTAGTTGTATTAAGTGGAGTAACCATTATATTAATGAGCAGAGAAAAGTCTAGTAGTAAATAG
PROTEIN sequence
Length: 1545
MIVLNFTVKIISTHKEEKMKRIFRKAIVYFTVLAVLISNVSISSVKAMEKSDEGIIVYASDYGLDSTGEKDNAKALVNMFEAIREIGENGDKVTLKFDKGIYQIHKENAPVREVHTSNTDSVRFPNKSIGILIENQNNLTIDGNGSQFIINGDMMALAIMHSENITVKNVNIDYQIPTTSEMTVLDYDNENKTIDYFIPEYLNYEIQGANIIWKSEQKSDGGYYWTEKNDHRNYGISVKYPTELMGRSYYSNSNPFTNAQSIEQLDDSRVRIKYSSNPAFEVVKGMNFQLVSNAERPTAGAFVWESKDINVINTKISYMHGFGFLVQMAENVSFDGIRMETDIETGRNTSSFADGIHISGAKGKIEIKNSFFNNTHDDPINIHGTFTRVEEKLDSNTLRLKYIHNQQGGFPQYHPGDKVVFYSRDTLESRDEEKEYTVKSVEGPSKDNLKEMIVEFEEEVPDYLTEKVGNEPKFVAENATYTPEIYIKNNEFKNVFTRMILATSRKKIVIEDNYFEAPSMATLFFSNDSDEWYESGPIRDLEIRNNTFKIRSLGRTWWKYAPAIYFHPVTKGGGLPDESNPIHKNILIEENKFYLESDGALRAESVENLTFRNNEIYRLDPSVDLSIEGSNKLYVGNNSNLELTYDGNVVTGPTSLPGGPESNSGTVANVLEFKNSKNVVVENNYYDDGLRKNVLIEGMDSKNLKLKDDLNVLNNREKTEPSDVVSNIQYASTNPEVVSIDSNGKMTANKEGTAEVFAYYVWNGTIIESNKKEITVLSSENTFENELEFKSEVITIDGDNGTSFEFKEDINPSEVEYTIHDSQIVKLEGNTFYGLKTGLARITVRYKGSEKTVFAIVNGKDDQKVLNSLINIEDKDSNSTASDDSITITRKAGNDLWGSDNTLNNLVTIDLENVDINNFTGLVTIDGLPGRMANNWDSAYFLIMKKNANGTVDRNNYLSVGKRAHADGFGTVHEVNAIGSEHATGDVSENEIKKATFAIEKQGKTVNLYSIVDGKRNKVQSVDISSFGDDLKLAVACWGAGQTNKNVTVTDIKLGEGNIDEVLLKDSLPIMTNDDSKFVISNLSHSSDSNDNINISFDSTHKGNNMLIVSEPGNNTYVVSGNSFKATENGEYKVFAVSQLSSGKYSNVISKTFNYKPQSQKGFYLNGIKIVDGDTITIPEELTKLYLINYDNNTKSVIDVTGKDTVSGDFGTIKLEKIKSNKAGIESINAVGYGEINISSKNSFINTNKKDNSITFNVKLSEGTDKLLAKNYDHGINYEVVQNGNNAKVTVPVYNGVVSIAFEAVAKDRVTKDIHSVHVMRYADILEGFNKIDVNGSTLDISEEKVDLGNKTNKISVKADANDVNAEITVMKRNNNGLNEISQGVDTVVENGDEIIVRIIHENKRMMEFKTLTVENSKEPELDIKSLLDLIKEAEDIDLSNKTEESKVKFLEVLDEVKAEVNEGITSSDELEELIDKLQKAINGLEDKEETPNGGSNDEIEDDKTESSNLPKTGDESLGLLVLALVVLSGVTIILMSREKSSSK*