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NECEvent2014_8_5_scaffold_884_2

Organism: NECEvent2014_8_5_Clostridium_perfringens_28_24

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 1878..3659

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
ABC transporter, permease/ATP-binding protein n=1 Tax=Clostridium perfringens E str. JGS1987 RepID=B1BNS9_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 98.7
  • Coverage: 593.0
  • Bit_score: 1127
  • Evalue 0.0
  • rbh
ABC transporter, permease/ATP-binding protein {ECO:0000313|EMBL:EDT16764.1}; TaxID=451755 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium p similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.7
  • Coverage: 593.0
  • Bit_score: 1127
  • Evalue 0.0
ABC transporter similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 98.7
  • Coverage: 593.0
  • Bit_score: 1122
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1782
ATGAATAAGTTTAAATCAGTAGTAAAAAAGATTTCTCCTTTTGTTGGTAAGTATAAGTGGGCTTTTTTAGGAGCTATTTTATTTATAATTTCAGCAGCTGTTTTCACTGCTATAGCACCAAGAACAGAGGGATTAATAATAACTCAATTAACTAAGGATTTTGAGGGGATTGTAAGAGGAGTTTCTGGAGCTTCAGTTAACTTTAATTATATTTTTAAGGTATTAATCTTATTATTATTAGTTTACGCAGGTGGTACAGGATCAACTCTTATAGCAAGTTTCTTATTAACTAATGCAATTCAAAATACCATGAAAAATATTAGAAATGAAGTTGAGAAAAAAATAAATAGACTTCCAATAAGATATTTTGATGGTAATAGTTATGGAGATGTATTAAGTAGAATCACTAATGATGTAGATACCATCTCTAATGCATTGCAGCAAAGTTTTGTGCAGGTAATAAATGCATTTTTATCTGTAGGATTAGCTTTAATAATGATGTATTCCATAAATATTAAGCTAGCATTAATTGCAACTTTAATAATACCTTTAAGTATTTTAATTACAAAGATAATAGTTTCTAAATCACAGAAATTATTTAATAATCAACAAAAGGCTTTAGGAAATCTTAATGGAAAAGTACAAGAGATGTACACAGGCTTTAATGAATTAAAGTTATATGGAAAAGAAGATGATGCCTTAAATGAATTTGTAAAGGTAAATGAAGAGTTAAGAGAAACTGGGTTTAAAGCTCAATTTATATCTGGTATAATGTCACCTTTAATAAGTCTTGTTACTTATTTAGGAATAGCTGTAATAGGGGTAGTAGGTTCTATAATAGCTATAGGTGGTGGAATTACCGTTGGTAATCTTCAAGCCTTTATACGTTATATTTGGCAAATAAATCAGCCTTTATCTCAAGTAACTCAATTATCTTCAGCAATACAATCAGCAGTTGCTGCCTTTAATAGGGTTTTTGAATTCTTAGAGGAAAAAGAAGAGGTTAAAGATCCTAATAATGCTATAAAAATTGAGAAGCCAAAGGGAGATGTAACCTTTGACCATGTTAAGTTTGGATATAAGGAAGATAAGCCACTTATAAAAGATTTAAGCGTAGATGTTAAAAGCGGTCAAATGGTTGCTATTGTTGGAAAAACTGGGGCAGGTAAAACTACTCTTATTAATCTTTTAATGAGATTTTATGATGTTCAAGGGGGTTCAATTAAAATAGACGGTGTTGATATTAGAGATATGAAACGTGAAGATTTAAGAGGTATGTTTGGTATGGTTCTTCAAGACACTTGGCTATTTAATGGAACTATTTATGATAATATTAGATATGGTAGATTTGATGCCACTAAAGAAGAGATAATAGAGGCAGCAAAGGTTGCAAATGTTCATCATTTTATAAAAACATTACCTGGCGGATACAATATGTTATTAAATGAAGAGGCTTCAAATGTATCTCAGGGAGAAAAACAACTTTTAACCATAGCTAGAGCAATTTTAAAAGATCCAGCTATATTAATACTAGATGAGGCCACAAGTTCAGTTGATACTAGATTAGAATTATTACTTCAAAAGGCTATGAGAAATATAATGAAGGATAGAACTAGCTTTGTTATAGCTCACAGACTTTCAACTATAAGAAGTGCAGATTTAATATTAGTAATGAATGATGGTAATATAATTGAACAGGGAACTCATGAAGAGTTAATGAAGCAAGGTGGTTATTACGAAAGTCTTTATAATAGTCAGTTTGCTAGTAAAGAAGCAAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 594
MNKFKSVVKKISPFVGKYKWAFLGAILFIISAAVFTAIAPRTEGLIITQLTKDFEGIVRGVSGASVNFNYIFKVLILLLLVYAGGTGSTLIASFLLTNAIQNTMKNIRNEVEKKINRLPIRYFDGNSYGDVLSRITNDVDTISNALQQSFVQVINAFLSVGLALIMMYSINIKLALIATLIIPLSILITKIIVSKSQKLFNNQQKALGNLNGKVQEMYTGFNELKLYGKEDDALNEFVKVNEELRETGFKAQFISGIMSPLISLVTYLGIAVIGVVGSIIAIGGGITVGNLQAFIRYIWQINQPLSQVTQLSSAIQSAVAAFNRVFEFLEEKEEVKDPNNAIKIEKPKGDVTFDHVKFGYKEDKPLIKDLSVDVKSGQMVAIVGKTGAGKTTLINLLMRFYDVQGGSIKIDGVDIRDMKREDLRGMFGMVLQDTWLFNGTIYDNIRYGRFDATKEEIIEAAKVANVHHFIKTLPGGYNMLLNEEASNVSQGEKQLLTIARAILKDPAILILDEATSSVDTRLELLLQKAMRNIMKDRTSFVIAHRLSTIRSADLILVMNDGNIIEQGTHEELMKQGGYYESLYNSQFASKEAN*