ggKbase home page

Infant_1_CR_22_29

Organism: Infant_1_CR

near complete RP 50 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(30094..31401)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative 23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase RumA {ECO:0000313|EMBL:EDS20011.1}; TaxID=445974 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Erysipelatocl UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 435.0
  • Bit_score: 856
  • Evalue 1.30e-245
23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase RumA n=4 Tax=Erysipelotrichaceae RepID=G9QZG9_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 856
  • Evalue 3.00e+00
yfjO; RNA methyltransferase (EC:2.1.1.-) KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.5
  • Coverage: 444.0
  • Bit_score: 221
  • Evalue 4.30e-55

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Erysipelatoclostridium ramosum → Erysipelatoclostridium → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1308
ATGAAGAAAAATGTAGAAATTAAAAAATTAGGGATTAATGGTGAAGGTATCGGGTATATTGATCGAAAGATCGTTTTTGTTCCTGGAGCGTTGCCACAAGAAGAAGTTATTGTTGAAATTAGTAAACAGACTAGAACTTATAGCGAAGGGAAATTACTACAAGTAGTAAAACCATCAAAAGATCGTGTTACGCCTAAGTGTCGTTCGTATGATAATTGTCAAGGGTGTACGATGTTGCATTTAAGTTATTTCAAGCAGTTGAATGCAAAAAAAGAAGCTGTACGCGAATCAATTAGAAAATATACAGAGTATGATTTATCAAGAACAATTTTTAAAGATGTAATTGCGGCGCCTAGTCAAGAGGGCTTTATTACTGCTGTTAATTTGCCTATTGTTGATTTTAAAGGGAAAATTAGTTTTGGAATCTATCAACGTGATAGTAAATATTTAACATTAATGACAAGATGTTTTAAACAACATCCAATAATTAATGAGTGTTTATTAAAATTAGAAGAGATTTTAACTACAAATAAATGTAAAACATATAGTGATAAATTTAGAACAGGATTAAGGTTTTTAAAGGTTAAATTAATTGATAATAAATTACAATTAGTTTTTATTACAGGTCGTGATGGGTTGAAGGAAGAAATTGTTAAAGAAATTAGTCAATTGCCACATGTTGCTAGTATCTTCATGTCTGTTAATACTTCAAAGCATCAAGAGTTTGATGAGTTAGGATATTCAAAATTATATGGGGCAACGAGACTAGAGTTGCACGATGATAAAAATCAATATCTAGTATCGGTTAAAAGTAAATTACCAGAAAATATTGAGATGATGTGGAAACAAAATCAAACAATTAAATCATTAGTACAGGACAGTCAAAAAATAATTTCGTTGAATTGTGGAATTGGGTTATTAGAACTTAATCTTGATCAAGAAATTGTAGCGATTGATGAAAAAAGATATCAAATTGATGATGCTAAATTAAATGCTAAGTATTTAAAGAAGGAAAATGTTACTTTTATTGCTGGTGACCTAGATAGTAAAATTGTTACATACGCTAAAAAGAAAGTCTATGATACTTTAATTATTCAAAATGAACGTTATGGATTAAGTGATACAATCAAAGATACAATTAAAATTGCTAAATTTAAAACAATTATCTATGCTTGTCAGTCACATTCAACTTTAGCAAAGGATTTAGCTGATTTAGAAAAAAATTACAAATTGGAAAGAATTATTGGCTTAGATACATCTTGTCATAATTCATACCTAACAACGATTGTAAAATTGGTTCGAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 436
MKKNVEIKKLGINGEGIGYIDRKIVFVPGALPQEEVIVEISKQTRTYSEGKLLQVVKPSKDRVTPKCRSYDNCQGCTMLHLSYFKQLNAKKEAVRESIRKYTEYDLSRTIFKDVIAAPSQEGFITAVNLPIVDFKGKISFGIYQRDSKYLTLMTRCFKQHPIINECLLKLEEILTTNKCKTYSDKFRTGLRFLKVKLIDNKLQLVFITGRDGLKEEIVKEISQLPHVASIFMSVNTSKHQEFDELGYSKLYGATRLELHDDKNQYLVSVKSKLPENIEMMWKQNQTIKSLVQDSQKIISLNCGIGLLELNLDQEIVAIDEKRYQIDDAKLNAKYLKKENVTFIAGDLDSKIVTYAKKKVYDTLIIQNERYGLSDTIKDTIKIAKFKTIIYACQSHSTLAKDLADLEKNYKLERIIGLDTSCHNSYLTTIVKLVRK*