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PLM4_32_b1_sep16_scaffold_49_25

Organism: PLM4_32_b1_sep16_Flavobacteriales_Flavobacteriia_35_11

near complete RP 52 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: 27691..30711

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family Tax=Flavobacterium sp. CF136 RepID=J3C7D5_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 64.9
  • Coverage: 1007.0
  • Bit_score: 1353
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:KIA85872.1}; species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.;" source="Flavobacterium sp. AED.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 67.3
  • Coverage: 1007.0
  • Bit_score: 1367
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor, plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 64.3
  • Coverage: 1007.0
  • Bit_score: 1345
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Flavobacterium sp. AED → Flavobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3021
ATGATTATTTTTACGACGCAGGTAACTCTTGCTCAAGTAAAAAAAATCAATGGTTTTGTTTCTGATGCTACGGGTGCTCCAATACCGGGTGCGAATATTAACGTAAAAGGAGAAACTAATGGAGCTTCAACAGATTTTGATGGTAAATTTACAATTGAAGTTAAAGCCGGTAGCACATTAGTAATTTCATATTTAGGATATGAAACGCAAAATGTAGAAGTAGGCGAGTCTTCTACTATCAATGTAAAGTTGAACGCTGCAGGTTCTACTGCACTTACTGAAGTAGTAGTAACATCGTTAGGTATCAAGAAAACTAGAAAATCTTTAACCTATTCTGCTCAAGAATTAAAAGGGGAAGAGCTTGTTAGAGCAAAAGATCCGAATTTAATGAACACAATTGCGGGTAAAATTGCCGGTGTTGCTGTGACGAAAAGTGCTGGTGGTACTGGAGGTTCTACAAAAGTTACTATTCGTGGAAATTCATCTACCACAAACAACAATCCTTTATATGTTGTTGATGGTGTGCCAATGTTAAATATATCGTCTTTTCAACCAAATGAATCTTTTGGCGCTATGCAAGGAGGTAATCGTGATGGTGGAGATATAATTGGGTTGTTGAATCCAGATGATTTTGAGGGTATGACAATACTTAAAGGAGCATCTGCAACAGCTTTGTATGGTAGCCAAGGTGCGAGAGGAGTTGTTTTGTTGACTTCAAAAAAACCACATGAAGGTGTTTCTACTTTCAGAGCTTCTTCAAATACAACAGTTGAAACGGCGGCCTATTTGCCTAAATTTCAAACTTCTTACATTGCTGCGCCAAAGGCAGATGTGACTTGGGGTCCTAAAGGAGAAACTCCCGATCACACAAGAGACTTTTTTGATACTGGAGTTACTCAAATATCTTCTTTTGGATTTGCTACAGGTTCTCAAAATTCTTCTACTAATGTTTCCTATGCTAATACTTCAGCTGATGGTATAATGCCAAGTAACAGTTTGAGTAAAAACAACTTTAGTATCAGACAAATGGGTAAATTTTTTGGTGATAAATTGACCATTAATGCTAATGCGAATTATACCTCTCAATATGTGACAAACAGACCTGTAAGCGGTTTGTATTTTAATGCGCTTACAGGTCTTTATTTAATGCCAAGAGGATATGATTTTGAACATTATAAGAATAATTTCGAAGTATTTGATCCTTCTCGTAATATGATGGTTCAAAACTGGATGACTGATAGAGATATTGAACAAAATCCATATTGGATAATTAATCGTAATAAATCTAAAGATTCTAATGTTTACATGAATGGCTCTTTTGGATTAAATTACAAAGTTAATGGATGGCTTTCTATTGGATCTAGATATAACTACGATAGAGTTTCTTCTGAATTTGATAAAGAAATTTATGCTTCCACTCAAGGTACTTTATCGCATCCAAAAGGTAGATATATCAACATTAATAACTTAAGTACTCAAAATTATGGTGATTTGATTGCTACAATTAATACTAAAATTACTGACGACCTTACATTTTTTGCAAACGTAGGAACAAGTTTTACTAAAAGTTCGATTAATGATGAAACAGTTTTAGACTCTGATCCTTCTGGTTTAGGAGTTACTAACTGGTTTACTCTCCATAATTTTAATTCTAACGCAGGGAATTTTCAAAATTTCGGATCGCGTAGAGAACAACAATCCGTATTTGCTGCTGCAACTTTTGGTTACAAAAACATGTTGTATTTAGATGTAACTGGACGTAATGATTGGTCTTCTACATTGGCTAATACTGGAAATATGTCATTCTTTTATCCTTCTGTAGGTGCTACTGCTATCTTATCTGAAATGATAAAAATGCCTGAATCAATTTCATTTGGTAAAGTTCGTGCTTCATATGCACAAGTTGGTAATGATATTCCAGCGTTTTACACTTCTCCAACATCTGTGTATGCTGCTTTAAATCCAACTAACTATAATCCAACTGTTGGCCCAAGACCTGGTACTACTTTGAAGCCGGAAAGTCAAAATTCTTATGAATTGGGTACTGAATGGAGATTTGTTAATAATAGATTTGGAATTGAATTGACTTATTATAATAATGAAACTAAAGATCAATTGCTTACAATTCCAGCTCCAGCAACAAATGCTGAAGGATATCAAAATTATGCTTACAATGGAGGTATAATTAAAAATAATGGTTTTGAAATATTGGTGAATGCTAGAATTGTTGATAATGATAAGTTTAAATGGGATGCTACTGTAAATTATTCTAAAAACAATAATAAAGTTACTGGTTTACCAGAGGAATTAGGTGGTACAGTTGTTTTAACTCCTCCAGGTGTTAATAACTATAGATATTCATTAATTAATGGTCGTCCATTTGGAGTTATTGAAGGTATCAATATTGATAGAGATGATCAAGGAAGAATCAAATTGGATAAAGATGGCAAAATCATGAAAACTGGTTTTCAAGAAGTTGGAAATGCAAATCCAGACTATATGCTTGGTTTTTCTAACTCATTCAAATTGGGGAACTATTTCTTAAACTTTACCATTGATGGCCGTTTTGGAGGAAATGTAATGAGCTTGACCGAAGCAATAAATGATGAGTTTGGTGTTTCTAAAGTAACAGGAGATGCAAGAAATGCCGGTGGTGTTGATGTGAATGCAGTCTATACTGATGGTCCTAAAAAAGGTCAGCCTTTTGCAGGGAAATATGATACAGAAAGCTACTATTCTCAAATTGGAGGTAGAGCTGGTGCAACTGGTGAATATGTTTACAATGCCACAAATGTTAGCATGAGAGAATTGGCTTTAGGTTATACTTTTGATCTTAAAAACAACAAAATTTTTAAATCAGCTAATTTATCTTTAGTAGGTAGAAATTTATTTTTCTTTTACAAAGACGCTCCATTTGACCCAAATATTTCTTTGAGTACTGGTAATGGTTTACAAGGTATTGATGTGTATGCTGCACCATCTACAAGAAGTATTGGTCTTAACTTAAATGCAACTTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1007
MIIFTTQVTLAQVKKINGFVSDATGAPIPGANINVKGETNGASTDFDGKFTIEVKAGSTLVISYLGYETQNVEVGESSTINVKLNAAGSTALTEVVVTSLGIKKTRKSLTYSAQELKGEELVRAKDPNLMNTIAGKIAGVAVTKSAGGTGGSTKVTIRGNSSTTNNNPLYVVDGVPMLNISSFQPNESFGAMQGGNRDGGDIIGLLNPDDFEGMTILKGASATALYGSQGARGVVLLTSKKPHEGVSTFRASSNTTVETAAYLPKFQTSYIAAPKADVTWGPKGETPDHTRDFFDTGVTQISSFGFATGSQNSSTNVSYANTSADGIMPSNSLSKNNFSIRQMGKFFGDKLTINANANYTSQYVTNRPVSGLYFNALTGLYLMPRGYDFEHYKNNFEVFDPSRNMMVQNWMTDRDIEQNPYWIINRNKSKDSNVYMNGSFGLNYKVNGWLSIGSRYNYDRVSSEFDKEIYASTQGTLSHPKGRYININNLSTQNYGDLIATINTKITDDLTFFANVGTSFTKSSINDETVLDSDPSGLGVTNWFTLHNFNSNAGNFQNFGSRREQQSVFAAATFGYKNMLYLDVTGRNDWSSTLANTGNMSFFYPSVGATAILSEMIKMPESISFGKVRASYAQVGNDIPAFYTSPTSVYAALNPTNYNPTVGPRPGTTLKPESQNSYELGTEWRFVNNRFGIELTYYNNETKDQLLTIPAPATNAEGYQNYAYNGGIIKNNGFEILVNARIVDNDKFKWDATVNYSKNNNKVTGLPEELGGTVVLTPPGVNNYRYSLINGRPFGVIEGINIDRDDQGRIKLDKDGKIMKTGFQEVGNANPDYMLGFSNSFKLGNYFLNFTIDGRFGGNVMSLTEAINDEFGVSKVTGDARNAGGVDVNAVYTDGPKKGQPFAGKYDTESYYSQIGGRAGATGEYVYNATNVSMRELALGYTFDLKNNKIFKSANLSLVGRNLFFFYKDAPFDPNISLSTGNGLQGIDVYAAPSTRSIGLNLNATF*