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rifcsphigho2_02_scaffold_63_1

Organism: RIFCSPHIGHO2_02_FULL_Fluviicola_43_260

near complete RP 53 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 2..7102

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Value Algorithm Source
PKD domain-containing protein Tax=RIFCSPHIGHO2_02_FULL_Fluviicola_43_260_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 4792
  • Evalue 0.0
NHL repeat containing protein id=3866368 bin=GWA2_Bacteroidetes_32_17 species=unknown genus=unknown taxon_order=unknown taxon_class=unknown phylum=unknown tax=GWA2_Bacteroidetes_32_17 organism_group=Bacteroidetes similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 33.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 712
  • Evalue 1.20e-201
PKD domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 37.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 578
  • Evalue 7.60e-162

Lists

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Notes

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Taxonomy

R_Fluviicola_43_260 → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 7101
GCGAATCCTAACTACACAGGCGGTACCCAAAGCTATACATGGACCGTTCCGAATGGAGTCAACAGCTCACAAGCGCTGATTCGTGTCTCTGATTTTGCCAACGCTGCGGTGTTGGATGTGAGCAATGCGAATTTCAACATCGCGCCAAGCAATGATATTACGGTTACTGCGCCTAATGGTGGGGAAATGATCAATGCGCTTACGACTACCACGATTACCTGGACTAATCTTCCTTCGGTTTCAGGATTGTACAATGTGCAGTATTTTAACGGTAGTTCATGGGTATCACTTGCCACCAACATTTCGGGCAATTCTTACAACTGGAGCGTTCCAAATCTTCCTGCAACAACTTGCCTGGTTCGCGTGATCGATGCGGTGAATACCTGTAAGCTCGATCAGTCGGATGCGACGTTTACCATCGTAGCGGCAACACCATTATTGCTTTCACCGAACGGAGGTGAGAATATCAAAGCGGGTTGTTATACTCAGATTACCTGGGATCCGACCCGTTTTTACACCAATGTACGCATTGATTATTCAGCTGATGGCGGAACTACCTGGAACAATCTTACAGCGAGTTATTCCAATGGTGGATCGTATGACTGGCTGGTGCCGCACAATTATGGTTCCAACTACCTGATTAAAATTGCCAATATCACCGACTTACTGACGTATGATGTGAGTGATGCGGTTTTCTCGGTGGTGAATCCTATCCAGGTAGTAACTCCGAATGGTGGTGAAACACTTTACGGTTGTGCTCCTTACACGATTAGCTGGACAAAAGGTTGTCAGTCACAATTCCGTTTGCATTATTCCATTGATAACGGAGCCAACTGGATTTCGATTGCCAATCCTAACAACACGGGAAGTACAACACAAACGTATGCATGGACCGTTCCGAATGGTATCAACAGTTCGCAAGCGTTGATTCGCGTTTCTGATTTTGCCAACGCTGCGGTTTTGGATATGAGCAATGCCAATTTCACCATAGCGCCAAGCAATGATATTACGGTTACCGCACCCAATGGCGGGGAAATCCTGAACGCACTTACATCTACAACCATTACCTGGACCAACCTTCCTTCAGCTTCGGGGTTGTATAATGTACAGTATTTCAACGGCAGTTCATGGGTAACACTTGCGAGCAATATTTCGGGCAATTCTTACAATTGGACAGTGCCGAATGTTCCTGCGACGACTTGCCTTGTTCGGGTTATTGATGCGGTGAATACCTGTAAATTGGATCAGTCGAATGCAACGTTTACTATTTTAGCGGCAACCCCGTTATTGCTTTCACCGAACGGAGGTGAGAATATCAAGGCCGGTTGTTACACGCAAATTACCTGGGATCCGGCTCGTTTTTACACCAATGTGCGCATCGATTATTCAGCTGATGGCGGAATTACCTGGAACAACCTTACGGCCAGCTATTCCAATGGCGGCTCGTATGACTGGCTGGTGCCGCACAATTACGGTTCTAATTACCTCATCAAAATTGCTAATATCACCGACTTGCTGACCTATGATTTGAGCAACGCGACATTCTCTGTTGTGAATCCGATCCAGGTGCTGACTCCTAACGGTGGCGAAACGCTTTACGGATGTTCTTCTTATAACATCACATGGACCAGCGGTTGTCAATCGCAATTCCGCTTGCATTATTCGATTGATAACGGGACTACCTGGAATTCGATTGCAAACCCGAATTATACAGGTGGCACACAAAGTTATACCTGGACAGTTCCAAATGGTATTAACAGCTCACAGGCATTGATCCGCGTTTCGGATTTTTCCAATGCAGCCGTATTAGATGTAAGTAATACCAATTTCACTATAGCACCAAGCAACGATATTGTGGTAACATCGCCGAATGGCGGAGAAACCTTCCAGGGATTGAGTACACAAATGATTACGTGGACCAATCTTCCGTCTGCTTCGGGCTTGTACAATATTCAGTATTTCAACGGAAGTTCATGGGTAACAGCAGCGTCGAACGTTTCGGGGAATGCCTACAACTGGACTGTTCCGAATGTACCAGCAACAACGTACCTGGTTCGTGTAATTGATGCGGTAAATACATGTAAACTCGATCAGTCGAATGCCACGTTTACTGTTACTCCAGCCACACCGATTGTACTCACACCGAATGGTGGAGAATCTATTTATGCGGCAACGAATTACAACATTACGTGGAATAGCGCCACTTATTATTCGACTGTTCGCATCGATTACTCAACCGATAACGGATTCTCCTGGAATACGGTAGTCGCCAGTACGTCCAATAGCGGATCGTATAGCTGGTCGGTTCCGAACGTAGCTTCTACGCAATGCCTGGTGAAAGTGAGCAATACGGCAAACCTGATGGTCAATGATGTCAGCAATGCGGTGTTCCAGATTAAACCTGCCGTTCGGATCATCACACCAAACGGAAGCGACGGCATCACGGAATGGGGCGGATGTACGGTTACTTCGATCACTTTCGATCATACACCGGCTTACAGCACCTGGAATATCAAGTATTCCCTGAATGGCGGTGCTACCTGGGTTACAGTGATCAACAACTGGTCGCAAACAGCCAATCCGGCAACGTATAACTGGAACATTCCGAATACATCTTCGTCACAGGTACTTGTAAAAGTAGAACCTGCCTTGAATGTCAGTTATGCCGATGTAAGCGATGCGCCGATTACGATCAGTAAACCGGTAATTATCGTGCAGCCTAATTTCGGTGGAATTATGCAGGTGGGATCGACTTACAACATCAGCTGGATCTCTGACGGTATTTCCAATCTGTACGATATTTTCTTCTCGGACAACGGTGGCTCAACCTGGTCTACGGTTGTGATGGGATACAATACATCTACGAATACCTATCCGTGGACAGTTCCGAACGCAGCGTCAACCAACTGTCTGATCCGTGTGCGCGACAATATCAATTCCTGTAAGGAAGACACCAGCAACGTACCATTTACGATTAGCAATGTGGCACCTGCGCTCACGGTACTTTCACCGAATGGTGGCGAAAATCTCAGTGGTTGTAATGATCAGCTGATTACCTGGGCCGAATTGTCTCCGCACGGCACATACGATTTACATTATTCCACCAACAGTGGTAGTACATGGATTCCCATTGAGTTGAATTATGCCACGGGAAGTATGTCTTATCAATGGGTGGTTCCTAACATCAACGCTCCGTCGGTATTGATACGAGTGAAGGCTACAGGAACAGCCATTGAAGACCTGAGCGATGCGCTTTTAAGTATTTCACCCGGTAATCTGGTGGTAACAACAAACGATGTTACGGTTTGTGGTGGAACACCTGTGCAATTGAACGCTACAGGAGCTTCTACCTATAGCTGGAGTCCGACTGTAGGGTTGAGTGATCCGCTGATCGCTAATCCGGTTGCAACACCTACTGTTACTACGACTTATATCGTGGAATCGGTCAACGGAACGTGTACGCTTACGGATTCGGTAACGATCACCACCAATTCTTCTGGAGTTGTTCCGGTGAGCGTTGCGATTGCCGCTTCTCCTGTTTCGACGATTTGTACAGGAACAAGCGTTACGTTTACGGCAACCCCGGTAAATGAAGGCAGTACGCCGTCTTATCAATGGATGCTTAACGGAGCACCAGCCGGCACCAATAGCAATACGTATGTAAATGCTTCGCTTTCGGATAATGACCAGGTTCAGGTCGTATTGACTTCCAACCAGGCATGTGTCACCGGCAATCCGGCATCATCAAATATTATTGTGATGGATGTGGAATCAAGTGCCACGCCTTCGGTTTCTGTCAATGCTTCCGCTACAAACATTTGTACCGGAACAAATGTGACATTTACTGCAATTCCGGTCAACGGAGGCAGTAATCCAGCCTATCAATGGCTTGTAAACGGCTCGAATGTTGGAGCGAATTCTGCGATTTATTCGTCAGCTTCATTAAATAATACGGATGTGGTAACGGTTACCATGACTTCCAATTCTGTTTGTGCAATCGGCGGACCGGTTACAAGTACCGGAATTACCATGACTGTTGGAATGATCCCGGCACAGCCATTGGCTATTTCAGGTAGCGCTTCGGTTTGTGAAGGAACCGGTGTTTCGTATTTCGTTGCTCCGGTTGCCGGCGCTTTATCTTATGATTGGATCTTGCCTGCAGGTTGGAGTGGAACGAGCACCACCAATTCTATCAATTGCATTGCTACTTCTTCGGGAGGATTCGTTACCGTTTCAGCGTCGAATACCTGTGGCAGCAGTCCGCTTCAAACGTTGGGAATAACGACGCATTCACTACCAGTGGTCAGTGCAAATGCTTCTGTCGCTTCTTTATGTGCAGGACAACCATTGACACTTACGGGAACCGGAGCAAGTTCGTATAACTGGGACAACAGCGTCAGCAATGGCGTGGTGTTTAATCCGCTGGTTACAACAACGTATACTGTTACGGGAACCGACATCAATGGCTGTACAGACAACGATCAGATTACAGTTACTGTAAATGCGCTACCGAATGTAATGGCGAATACTACTGCATCCGCAGTTTGTTCAGGAAACCCGATCACGCTTTCGGGTAGCGGTGCAACAAGTTATGTGTGGAACAATGGCGTAACGAACAATGTTTCATTTGTTCCTTCCGCAACCACCACTTATACCGTAACGGGAACAGATGCTGCGGGATGTTCTAATTCTACCGGAGTTACTGTAACAGTTAACAATTCACCGCTCGTTCAGGCAGGAAACGATCAAACGGTTTGTCAGGGAACAGCTGTCACGCTTGCTGGTTCGGGAGCCAGTTCCTATACATGGGATAACGGCATCACGAATAATACGCCGTTTACTACGATGGCTACTGCAACATATATTGTTACGGGAACAGACGGAAATGGCTGTACGGATAAAGATACGGTTGGGGTAAATGTGAATACGTCGCCAACAGTAACAGCGAGTGCAACTGCAGCAGCTATTTGTATCGGAACACCTGTGACTTTAACCGGAAG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PROTEIN sequence
Length: 2367
ANPNYTGGTQSYTWTVPNGVNSSQALIRVSDFANAAVLDVSNANFNIAPSNDITVTAPNGGEMINALTTTTITWTNLPSVSGLYNVQYFNGSSWVSLATNISGNSYNWSVPNLPATTCLVRVIDAVNTCKLDQSDATFTIVAATPLLLSPNGGENIKAGCYTQITWDPTRFYTNVRIDYSADGGTTWNNLTASYSNGGSYDWLVPHNYGSNYLIKIANITDLLTYDVSDAVFSVVNPIQVVTPNGGETLYGCAPYTISWTKGCQSQFRLHYSIDNGANWISIANPNNTGSTTQTYAWTVPNGINSSQALIRVSDFANAAVLDMSNANFTIAPSNDITVTAPNGGEILNALTSTTITWTNLPSASGLYNVQYFNGSSWVTLASNISGNSYNWTVPNVPATTCLVRVIDAVNTCKLDQSNATFTILAATPLLLSPNGGENIKAGCYTQITWDPARFYTNVRIDYSADGGITWNNLTASYSNGGSYDWLVPHNYGSNYLIKIANITDLLTYDLSNATFSVVNPIQVLTPNGGETLYGCSSYNITWTSGCQSQFRLHYSIDNGTTWNSIANPNYTGGTQSYTWTVPNGINSSQALIRVSDFSNAAVLDVSNTNFTIAPSNDIVVTSPNGGETFQGLSTQMITWTNLPSASGLYNIQYFNGSSWVTAASNVSGNAYNWTVPNVPATTYLVRVIDAVNTCKLDQSNATFTVTPATPIVLTPNGGESIYAATNYNITWNSATYYSTVRIDYSTDNGFSWNTVVASTSNSGSYSWSVPNVASTQCLVKVSNTANLMVNDVSNAVFQIKPAVRIITPNGSDGITEWGGCTVTSITFDHTPAYSTWNIKYSLNGGATWVTVINNWSQTANPATYNWNIPNTSSSQVLVKVEPALNVSYADVSDAPITISKPVIIVQPNFGGIMQVGSTYNISWISDGISNLYDIFFSDNGGSTWSTVVMGYNTSTNTYPWTVPNAASTNCLIRVRDNINSCKEDTSNVPFTISNVAPALTVLSPNGGENLSGCNDQLITWAELSPHGTYDLHYSTNSGSTWIPIELNYATGSMSYQWVVPNINAPSVLIRVKATGTAIEDLSDALLSISPGNLVVTTNDVTVCGGTPVQLNATGASTYSWSPTVGLSDPLIANPVATPTVTTTYIVESVNGTCTLTDSVTITTNSSGVVPVSVAIAASPVSTICTGTSVTFTATPVNEGSTPSYQWMLNGAPAGTNSNTYVNASLSDNDQVQVVLTSNQACVTGNPASSNIIVMDVESSATPSVSVNASATNICTGTNVTFTAIPVNGGSNPAYQWLVNGSNVGANSAIYSSASLNNTDVVTVTMTSNSVCAIGGPVTSTGITMTVGMIPAQPLAISGSASVCEGTGVSYFVAPVAGALSYDWILPAGWSGTSTTNSINCIATSSGGFVTVSASNTCGSSPLQTLGITTHSLPVVSANASVASLCAGQPLTLTGTGASSYNWDNSVSNGVVFNPLVTTTYTVTGTDINGCTDNDQITVTVNALPNVMANTTASAVCSGNPITLSGSGATSYVWNNGVTNNVSFVPSATTTYTVTGTDAAGCSNSTGVTVTVNNSPLVQAGNDQTVCQGTAVTLAGSGASSYTWDNGITNNTPFTTMATATYIVTGTDGNGCTDKDTVGVNVNTSPTVTASATAAAICIGTPVTLTGSGATSYSWNNGVINNNAFSPSATQTYTVTGTDGNGCTDTDQITISVNGLPTVVANATSTNLCPGSPVTLTGSGANSYTWSNGVLNGVAITPAATTNYTVTGTDANGCSNTAQVTVNVFSTPSVQAGNDQTVCEGTAVTLAGSGANSYTWDNGITNNTAFTAMNTTTYIVTGTDGNGCTDKDTVIVNVNVAPVVTASSSASAVCIGTPVTLNGNGATSYTWNNGVTNNSAFSPSATQTYTVTGTDGNGCTDTDQITVSVNALPNVAANATDTDLCAGENVILTGSGANNYSWNNGALNGAAFVPSSTTTYTVTGTDANGCSNTSQVTVNVNALPVIETSGTATICEGTSASITASGGLTYSWNNGAGNGTTVNVSPASTTVYTVTGTDINGCTDTDLFAVTVVPAPVISIGGDEAICEGGSVAITASGATTLNWDNGAGSGTSVTVSPVATTVYTVTGTDGACSATAQVTVTVNELPTITTSGTSPVCEGESVSLTAAGGVSYDWDNGAGSGSPVLVTPASSVTYTVTVTDANGCVNTDQIFVEVNPAPTPVITNNAGVLQTGNYTTYQWYVNNSPTPGATSQTWTYTENGDYYVVVTDGNGCTGTAAEITISDASLAEADEHGIVCYPNPATNHLSIQFGDLAGEKTVRLFDLSGKLVLETTTQEMLMTIDLEVATGYYTVVISAEGQQLELSKKLIVQN*