ggKbase home page

rifcsplowo2_02_scaffold_2881_3

Organism: RIFCSPLOWO2_02_FULL_Archaea_Pacearchaeota_30_10

near complete RP 31 / 55 MC: 2 BSCG 21 / 51 MC: 1 ASCG 31 / 38 MC: 3
Location: 2170..5673

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
CARDB protein KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.9
  • Coverage: 416.0
  • Bit_score: 118
  • Evalue 1.40e-23
CARDB domain-containing protein Tax=CG_Pacearch_05 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 53.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1230
  • Evalue 0.0
CARDB domain-containing protein id=5240524 bin=GW2011_AR10_complete species=GW2011_AR10 genus=GW2011_AR10 taxon_order=GW2011_AR10 taxon_class=GW2011_AR10 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR10_complete organism_group=Archaeon organism_desc=closed, complete GWA2_AR10 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.9
  • Coverage: 416.0
  • Bit_score: 118
  • Evalue 4.90e-23

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

CG_Pacearch_05 → Pacearchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 3504
ATGATTTTAAAAAATCTTAATAGTTTTAGAATTACTTTAATTTTAGTTATTATTTTGTTCAACATTAATTTAATTTTCTCCGCAACGGACTCTGATTTATCTAATAATAATATGAGCATTCAGATTAACATTAGAGATACTGCAGAATTAAAAATAAACTTTATAGCTGTGGATTATACTTCCAATAATATATCTAATTTCATCAGTTCATCTAAAGAAAATATAGACTTTATAAATTCAACTTATCCTCTGGCGAAGGATAAATTTATACCCATAGTTTCATCAAATATAAATTTTAGTTCGAATGTAGGAGGAAAATTAAATCAAATTGAGAAACTCATTTTATTATTAAGATTATATTCAATGGGGAGATTAGAAGGTAAAGATTATAAGAGAATAATGGGAATTGTACAAGAAGGTTGGTTTTCTCAACGTAACGATACTATCAAGGGATATTCACTCTCTTTATTAAAAACAGGTATAGTAGAGGATTCATTTAGACATGGGTCCGCACATGAATTAGCACATACCATAGGATTCCCTTTAGGTCTTTGTGAGGAATATTTGAATAGTACCTGGCAAAAACAAGATAATATTCCATTATTTTCTTGTCCCAATGGAGATTCCAATCCTGATAACGGTAATTTAGACGGCGAATGCTTAATATACCCTTATGGGTGTCCAACTGAAACATTTGAAAGATTAGTACCTTGGTTAAATAATACAAATTCTACTGAGATTATTCAGATGCGAAATTTTATGGGGCCATCGGGTAATGAAGATTTAAGATGGGTGAGTAAAGATTCTTATAACTATCTTTTAAATAAATTTTCAGCGAGCGAGGACATAGAACAAAGTAATATGATTATTTTAGTCTCTGGTTTAATTGATAAAAACGGTACTATTATATTCAATTCTTTTTACACTTTAAATGAAACATCTGTCCTTAATGAATCTGATCCGAACGGAAATTATTCAGTGATAATTAAATCTGGGGCTTCAACATATTACACTCATAAATTTGAGCCTATTTTTAGAATTGAAAATATTGGTGGAGAAGACGAAGATACAAATGTTACTGCCTTTGCTATCCTCCTTCCTTTCAACAACAGCGTTACTAAAATAATACTTCAAAACTCAACAACGATTCTTGCTGAAAAAAATGTCTCGAATAATTATCCAAACGTATCATTTACAACTGATTTTACAAACAAATTTTTTAATAATACTTTTACTGTGGGATGGAATGCAAGTGATATTGATAATGATAATCTAACATATGCTATTTTAATCAGTGATGATGGTGGACTGAATTACACAACATTGGCTTTAGACATTAATCAGACAAATTTAACTATTGAAAATAGTTTTCTGAAAAATGGTTCAAATTATAAAGTAAAAGTATTAGCGACAGATGGAGTTAAAACTTCTGAGGCGATTAGCAATTCTAGTTTTAGTATTCAACCAGATCCTAATATAGAATTAATTTTTCCAACGAATGAAACAAGACTACAAACAAATAATGTTACTTTTATGTATAGGACTTTTGTTTTAAATTCGACCATAACTAATTGTTCTTTATTCATTAATGGAGTTAGAAATCTAACTAATTCAACACCAATTGTTCAAGATGAAATTATGAATTTTACTAAGGTATTAGTAAACGATAATTATAATTGGGCGATACGATGTGGAGATTCTCAAGGGTATATTGGAGAAACGCATACATATGAATTGAATATAGGAAATGTTACTACAAGAATTATTGATATCCTTTCTTTAGAGGAACAGGAATTCGGAAAAAATGTTTCAATAAATGTTAGTTTAACAATGCCTGAAAATGTATCCTTAGTCACTTTAAATATAACAAACCCTAACGGTACTGTTTACAGCTACAATCTAACAAATATATCCTCAAATGTATGGAGGATAAATAATTTTACAGATAACGTTAATGGAACTTATAATTTCACTTTTTATGTTAGTTATAACGACAATATTTCTGTAAGTGGATCAGATATTTTTGTGATGGTGGAGGAAATAACAAACCTTAAGTATTGCTCAATTCTTGATAAAGAGAATACTATCTATTATCTTCAAAAAGATGTTCAGTCGCAAGCAACTTGTTTTAATATCACCGCACATAATATTACCTTAGAAGGAATGAATAATGTTGTTCATTACGCTGAGAATTCTAAAGGACACGGAATATATACCATAGGATATAATAATATTACTATAAATAATATTGAGATAAGAATGAATAATAAAACTTTAACTGATAATAGAGGGATATATTTTGTTAATAGTAAATATAACAAAATTGCCAATAGCACATTGGTTATTAAAGGAGCTAATAATACTGATGTCAGGAATCATGCTATTGAATTAAGGAATACAAGTGATTCGATAATAAGTAATAATGAAGTTATTAGCTATAACCAAAGAGGTTATGGGATTTATTTGCAGGCACAAATAAAAGAAAATTCTGGCAATAATTTAGTAGAGGATAATGTTATCACTACATATAGGAATTTGGAATTCGGCGTTTATGTGCATGGAGTAAATGGTGGGGATTCTACTGGCACAAATATAACAAATAATTCTATAAGGGCATATGGTTTTACATCTTATGGGATATTTATTGAGGCATCAGGCCCATCTTCCACAGATTCGAACATATTACAAGAAGATTCTATTATTACATCTGGGACTGCCCATGGGATTCGTATAATAGATTCTTCCCATAATTTCATTAAAGACTCAAATATTTCCGCATCTAATGAAAATGATGTGGAAATTCTTTCAGGTACAAATAACACCTTCTTAAATGTAACCTATATAGATGAATTTGTTAGTGGTAATTTTACAAGAAAATGGTATTTGAATGTTAAAGTGAATGCTACCAATGGAAGCGATATATCGCAAGCAAATGTATCTGGATTTAATCGTACTTATAATCAGCAATTTTCAGAATTAACGAATTCTACAGGAGAAATAAATAAAAAAGAATTAATTGAATATATCATTAATGGAGGAAATAAAGTATACTACACAAATTACACAATTAATGTAACAAAATCTGGTTTTGATAGCCCCTCCCAATCTGTTAATTTAACTATAAATAAATATTTAGCGTTTACTTTATCTTCTGCTAATGATTCATTTAAATATTCTATCAAAGATAATTCAGGTAATACTGTTGCCTGGCTTGGCAATCAAGGAAACATTGTCTTAAAAGGGAGCTGTTTTTCAGGAGGAACATGCAATAATCCAGGAAATAATAGTTTTATTATTGCAAATGCGACAGATAATCATGTTGCCTTCATTAATACAAGCGGAGATTTATGTCTTGAAAAAGGAGATTGTAGTGATCAATCAATAAGTTGCAATCCAATACGAAAAGCATTTATTATTCGGAATTCTTCAGGATACAACATGAGTTACATTGATTATGATGGAGATTTATGTTTAATTGGGAGATTGTATATTAATGCATTATAA
PROTEIN sequence
Length: 1168
MILKNLNSFRITLILVIILFNINLIFSATDSDLSNNNMSIQINIRDTAELKINFIAVDYTSNNISNFISSSKENIDFINSTYPLAKDKFIPIVSSNINFSSNVGGKLNQIEKLILLLRLYSMGRLEGKDYKRIMGIVQEGWFSQRNDTIKGYSLSLLKTGIVEDSFRHGSAHELAHTIGFPLGLCEEYLNSTWQKQDNIPLFSCPNGDSNPDNGNLDGECLIYPYGCPTETFERLVPWLNNTNSTEIIQMRNFMGPSGNEDLRWVSKDSYNYLLNKFSASEDIEQSNMIILVSGLIDKNGTIIFNSFYTLNETSVLNESDPNGNYSVIIKSGASTYYTHKFEPIFRIENIGGEDEDTNVTAFAILLPFNNSVTKIILQNSTTILAEKNVSNNYPNVSFTTDFTNKFFNNTFTVGWNASDIDNDNLTYAILISDDGGLNYTTLALDINQTNLTIENSFLKNGSNYKVKVLATDGVKTSEAISNSSFSIQPDPNIELIFPTNETRLQTNNVTFMYRTFVLNSTITNCSLFINGVRNLTNSTPIVQDEIMNFTKVLVNDNYNWAIRCGDSQGYIGETHTYELNIGNVTTRIIDILSLEEQEFGKNVSINVSLTMPENVSLVTLNITNPNGTVYSYNLTNISSNVWRINNFTDNVNGTYNFTFYVSYNDNISVSGSDIFVMVEEITNLKYCSILDKENTIYYLQKDVQSQATCFNITAHNITLEGMNNVVHYAENSKGHGIYTIGYNNITINNIEIRMNNKTLTDNRGIYFVNSKYNKIANSTLVIKGANNTDVRNHAIELRNTSDSIISNNEVISYNQRGYGIYLQAQIKENSGNNLVEDNVITTYRNLEFGVYVHGVNGGDSTGTNITNNSIRAYGFTSYGIFIEASGPSSTDSNILQEDSIITSGTAHGIRIIDSSHNFIKDSNISASNENDVEILSGTNNTFLNVTYIDEFVSGNFTRKWYLNVKVNATNGSDISQANVSGFNRTYNQQFSELTNSTGEINKKELIEYIINGGNKVYYTNYTINVTKSGFDSPSQSVNLTINKYLAFTLSSANDSFKYSIKDNSGNTVAWLGNQGNIVLKGSCFSGGTCNNPGNNSFIIANATDNHVAFINTSGDLCLEKGDCSDQSISCNPIRKAFIIRNSSGYNMSYIDYDGDLCLIGRLYINAL*