ggKbase home page

SCNpilot_cont_500_bf_scaffold_682_4

Organism: SCNpilot_cont_500_bf_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 24 / 38 MC: 16
Location: 8846..10624

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5; EC=1.6.5.3;; NADH dehydrogenase subunit 5; TaxID=5755 species="Eukaryota; Amoebozoa; Discosea; Longamoebia; Centramoebida; Acanthamoebidae; Acanthamoeba.;" source="Acanthamoeba castellanii (Amoeba).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 90.7
  • Coverage: 591.0
  • Bit_score: 1084
  • Evalue 0.0
NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 n=1 Tax=Acanthamoeba castellanii RepID=NU5M_ACACA similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 90.7
  • Coverage: 591.0
  • Bit_score: 1084
  • Evalue 0.0
  • rbh
nad5; NADH dehydrogenase subunit 5 similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 53.0
  • Coverage: 585.0
  • Bit_score: 624
  • Evalue 2.60e-176

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Acanthamoeba castellanii → Acanthamoeba → Longamoebia → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 1779
ATGCTGTTGCTTGTTGTATTTGTTTCTTTGTTAGTTCACTTATATTCAATTGATTATATGGATGGGGATCCCCATATAATACGTTTTTTAGGTTATCTTTCTTTATTTACATTTTTTATGCTTATGTTAGTAACGTCAGGTAATTTCGTACAATTATTTCTCGGTTGAGAAGGTGTCGGTCTATCTTCTTACCTTTTGATAAACTTTTGGTATACAAGAGTACAGGCAAATAAGTCAGCTATGAAAGCCATTATAGTGAATAGGTTTGGCGATTTTGGAATTTATTTTTCACTTTTAATAATGTTTTTCTTTTTTAAAAGTTTTGATTTTGGTGTTGTTTTTAATCTGATTCGGTTTCTTGATGCTCAACCGGAGGTATCCTTTTTAGGCTTTAAATTAGGTAGGGTTGATCTTATCGTCATTTTTTTATTTTTAGGGGCAATCGGTAAATCAGCTCAATTGGGACTTCATACTTGATTACCCGATGCTATGGAGGGGCCAACACCTGTTTCAGCGCTTATTCACGCTGCAACTATGGTTACTGCAGGGGTTTTTGTTCTTATAAGATCCTCCCCTATATTAGAGTATAGTGCTTCAGGTTTGTTTTTGGTATCCTTAATAGGGGGTCTGACAGCCTTGTTTGCTGGTACTGTTGGTTTAGTTCAATATGATATAAAAAAGGTTATAGCTTATTCAACCTGTAGCCAATTAGGATATATGTTTTTTGCTTGCGGTATGTCTAATTATTCTGTCGGTTTATTTCATCTTTTTAACCACGGTTTTTTTAAGGCTCTGCTATTCCTCGGTGCAGGATCGGTTATTCATGCACTTTTAGATGAACAAGATATGCGTAAAATGGGTGGTTTAGTAAAATTAATGCCTTTAACATATGTGGCTATTTTAGTTGGTTCTTTGTCTTTGACAGGATTTCCCTTTTTAACTGGTTTTTATTCCAAAGAAGTCGTTTTAGAAATAGCTTTCTCTAAATTTTCAATTAATAGTTTTTTTGTTTACTGGTTAGGTGTATTTGCTGCTTTCATAACTTCTTTTTATTCTATTAGGTTAGTGTATCTTGTTTTTTTTGCAACACCTAATTCATATGTTAGGGCCGTTAGTTCTTCACATGAGTCCCGCTCCTTTATTTTTTATGTATTAAGTTTTTTAGGGTTTTTAAGTATTTTTATAGGTTTTATTTTTAAGGATCTTTTTATTGGATTAGGTACTGATTTTTGGGCAAATTCAATCTTTAATCTTTACATTAATTCTGACATTTTATATGCTGAATTTTTAGATTATTATTTTAAGCTAATCCCGTTAATTTTTAGTTTAGCTGGACTTTCCTTCTCCCTACTTGTTTACTTCGTAATATACGATTATACTTTTTTTATTGTTAAAAAAAGTATTTTTCGTTACGCTTATTTCTTTTTAGCTAAAAAATGGTACTTTGATCTTTTATATAATAATATTTTTGTATTTAACCTATTAAGTGCGTTTTATCTTCTTACATTTAAAATTATTGATAGAGGCTTGATTGAACTCTTTGGACCTTTAAGTCTTGTTAGATTAATTAGTAAATTTTCTGCTATATTTAGCTTGATTCAAACAGGATTCTTGTATAATTATATTTTTATTGTTCTATTAGGTTTAATGTTTTTTATTAAAATAATATTTTCTTTATTTTTTCCGGATTTTACCGCTTTTTTTAATTTTGGTTTATTTGTTTGTTTGCTAAGTTTAGTAATATTTTTATCCCTTGATAGTAAAAGTCAAAATACTTAA
PROTEIN sequence
Length: 593
MLLLVVFVSLLVHLYSIDYMDGDPHIIRFLGYLSLFTFFMLMLVTSGNFVQLFLG*EGVGLSSYLLINFWYTRVQANKSAMKAIIVNRFGDFGIYFSLLIMFFFFKSFDFGVVFNLIRFLDAQPEVSFLGFKLGRVDLIVIFLFLGAIGKSAQLGLHT*LPDAMEGPTPVSALIHAATMVTAGVFVLIRSSPILEYSASGLFLVSLIGGLTALFAGTVGLVQYDIKKVIAYSTCSQLGYMFFACGMSNYSVGLFHLFNHGFFKALLFLGAGSVIHALLDEQDMRKMGGLVKLMPLTYVAILVGSLSLTGFPFLTGFYSKEVVLEIAFSKFSINSFFVYWLGVFAAFITSFYSIRLVYLVFFATPNSYVRAVSSSHESRSFIFYVLSFLGFLSIFIGFIFKDLFIGLGTDFWANSIFNLYINSDILYAEFLDYYFKLIPLIFSLAGLSFSLLVYFVIYDYTFFIVKKSIFRYAYFFLAKKWYFDLLYNNIFVFNLLSAFYLLTFKIIDRGLIELFGPLSLVRLISKFSAIFSLIQTGFLYNYIFIVLLGLMFFIKIIFSLFFPDFTAFFNFGLFVCLLSLVIFLSLDSKSQNT*