ggKbase home page

SCNpilot_cont_500_bf_scaffold_100_202

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Flavobacteriia_40_10

near complete RP 52 / 55 MC: 3 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: comp(223405..225360)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Chitinase n=1 Tax=Formosa sp. AK20 RepID=M7MHK3_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 25.7
  • Coverage: 327.0
  • Bit_score: 87
  • Evalue 5.10e-14
Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Nitrospinae_45_22_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 24.6
  • Coverage: 500.0
  • Bit_score: 106
  • Evalue 1.10e-19

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RLO_Nitrospinae_45_22 → Nitrospinae → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1956
ATGAAAAAATTTATACTTCTTTTTTTATTTTCATTTTTTGGAATATTATACTCTCAAACATGGACATGGGGAATTAAAGCTACTGGAACATCCCAAAACTATAATGCAATTGACTTAAATGTAGATGGTGATGGGAATATGGTTCTTGCAGGATATTATAGATTAAATTTCAGTCTTGGAAATTTTTCTATTTCTTCTATAGATGATTATTATAGGGATATCTATTTAGCAAAAATTAATTCTAATAAAGAGGTTGTTTGGCTTAAGAATATAGAGGCCAATCATAACTATGGTAATGTAATTGCTCTTAAAACTGATGATGATGGAAATATTTTCCTTACTGGTTCTGCAGATAATCACTATGGAATAGTGAAATACGATTCCGATGGAAATAAAGTTTGGTCTAATAATGACACTACAGGTGCTACATCAATAAGCTTTGATCAAGAAGATAATATTTATGTTGCTGGTGGTTCAGGATGGTCTTTTTTCATAGCGAAACTTGACAAAATGGGACAAACAATATGGAAAAAATCGAATTGGTATAACTATTCTGATGCTATTTCAATTTCGGATATTGAAGTTGATCGCTTTGGAAATATATACTTTACAGGATATTTTGCAATTGGAGAATTGAAGTTAGATGATCAAATTACATTGACAAATACATCCTCAAAATATCGTTGGTGTTTATTTGGCAAAATGGATACAAATGGAAATTTTATTTGGGCAAAGAATTTCCAAGGAACTGTAGATGAAGCTCCCAAATTATCATTAACAAGACAAAATGAAATAATTATCACAGGTAGTTATCGTTATAATCTGGAAATAGAAAATGAAACAATCGAGGCAGGTTATTCCAATAAATGGAATGAAAGCTTTCTTTCAAAATTCAATATTAATGGTAATTTAATTTGGTTAAAAAATGGAAGTTTAAGCTCAATTCAAAGAGAAGGTGATAAAATTGTAGATTCAAAAATTGATTTTGATGGAAATATCTATGTAACAGGAGCTTTTTATGGATATAATGATTACTATGGTTATAGTACTTATGTAGAAAAATATAATAAAGACGGCGTTCCTCTTTGGAGATATAATAATAAACAAAGTTATAGTAAGGCTTTAGATATTGATAATTTTGGGAATTTATATCATACAGGGTATAATTATTTCGAAAATTATATCAATCCCAATGCATATTCTACACTTTCAGCAGGAATCGGTCAATTTAACACTAATTCATCTACTTTTAACAAGATTAAAAAACCTGTTGTTAATGGTAATAAATTATTATGTATTAATGAAAATACATTAAACCTTTCAGCGGTTGGAGAAAATATCCAATGGTATTCTGATCCAGAATTAAATAATCTGATAGGTTCTGGTAATTCTTTTAATTTAGATTATATTAATGATACAAAAGTTTATGTAACACAAACAATCAATAACATAGAAAGTTGGGCGAGAGTTGTTTATATAAGGAAATCTGATTTAAATATTAATAACATTGATTTACAGTATAATTCTCCTAGGCTTTCTGTAACTAACAACCCAGAATATTCTTACCAATGGTATTATAATAATATCTTAATTCCAAATGCTAATACATATTTCTTTGATGTTGAAAATGGTAATAATTATTTAAATTATAGTGTTATGATTAGTCAGGAAAACTGTTCTATTAAAGCTAATTCTAGTATTCTAAGTGCTAATGAGGCATTATCAGATATGACGTTTATAATTTATCCAAATCCTTCCTCTGAATATTTTAAAATTATTCATTCTAAAAACTCTACAATTTTGTCTGTTGACATAATAGATTTGTCTGGTAAAGTGGTTAAAAATTTCAGAGAAAATGAAAAATATAATATTGCAAATATTCCTAGCGGGAAATATTTTGCAAGGATTAAATCAAAAAATAATGCTGATAAAATCCTGCCTCTTTTAATAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 652
MKKFILLFLFSFFGILYSQTWTWGIKATGTSQNYNAIDLNVDGDGNMVLAGYYRLNFSLGNFSISSIDDYYRDIYLAKINSNKEVVWLKNIEANHNYGNVIALKTDDDGNIFLTGSADNHYGIVKYDSDGNKVWSNNDTTGATSISFDQEDNIYVAGGSGWSFFIAKLDKMGQTIWKKSNWYNYSDAISISDIEVDRFGNIYFTGYFAIGELKLDDQITLTNTSSKYRWCLFGKMDTNGNFIWAKNFQGTVDEAPKLSLTRQNEIIITGSYRYNLEIENETIEAGYSNKWNESFLSKFNINGNLIWLKNGSLSSIQREGDKIVDSKIDFDGNIYVTGAFYGYNDYYGYSTYVEKYNKDGVPLWRYNNKQSYSKALDIDNFGNLYHTGYNYFENYINPNAYSTLSAGIGQFNTNSSTFNKIKKPVVNGNKLLCINENTLNLSAVGENIQWYSDPELNNLIGSGNSFNLDYINDTKVYVTQTINNIESWARVVYIRKSDLNINNIDLQYNSPRLSVTNNPEYSYQWYYNNILIPNANTYFFDVENGNNYLNYSVMISQENCSIKANSSILSANEALSDMTFIIYPNPSSEYFKIIHSKNSTILSVDIIDLSGKVVKNFRENEKYNIANIPSGKYFARIKSKNNADKILPLLIK*