ggKbase home page

scnpilot_solids2_trim150_scaffold_240_curated_68

Organism: solids_Sphingobacteriales_3

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: 81936..85373

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein id=4030880 bin=GWA2_Bacteroidetes_42_15 species=unknown genus=Bacteroides taxon_order=Bacteroidales taxon_class=Bacteroidia phylum=Bacteroidetes tax=GWA2_Bacteroidetes_42_15 organism_group=Bacteroidetes similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 48.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1099
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 42.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 916
  • Evalue 6.30e-264
Tax=GWE2_Bacteroidetes_42_39_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 48.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1099
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWE2_Bacteroidetes_42_39_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3438
ATGCAATTCATTGCTTTTAACCACCGGTGCCGGGGCATCCGTGGAATTTTATCCAAAACTTTGCGCATCATGCAATTAACCACTGCGCTGCTTTTAGGGATCTGCCTGCAGGCTGCAGCCACCGGGATTGCCCAAACCATTACTTTTTCCGGAAAGGACATTCCCATGGAAAAAGTGTTTACGGTAATCAAACAGCAAACTGGTTATTTTGTAAGTTACAAATCCGGTCAGCTTCGCAAGGCAAAACCAGTTACTATCCAGGGCGATAATATGCCCTTAGAACAGTTTTTAAACGAAGTGTTCCGTAACCAGCAATTGGATTATTCCATCGAGGAAAATACCATCTTCATTAAATGGAAGAAGGAAATCTATCAGATTATTCCCCTGGAATCCGTTTTAGTCACTCCCCATCCTCCTGCCGATATCAGCCTGAGCGGCAGGGTAACCAACGATCAACAGGAACCTTTGGAAGGGGTGAGCGTAGCCGTCAAAGGCACCCAAAACGGTACCACCACTAATGCAGACGGCAGATTCCTGTTATCTGTTCCTTCTGCCAACAATGTGGAGCTGGTTTTTTCATTTGTAGGTTTTGAAACACACACAGTAAAAGTAGGTACTCAGGCAGTATTCAATATTATATTGAAAGCTGTTGTTGCGGGCTTGGATGATGTGGTGGTAGTGGGATATGGAACACAGAAGAAAACATCACTTACAGCAGCCGTCTCCACATTAAAAGGGAACGAACTTATAGCGATACCCACTACCAACCTAAGCAATAATCTTGGGGGCAGGGTTGCTGGTATCATTAGTAAGCAAGGCTCAGGAGAACCTGGCGTTGATGGCTCAAATATTTACATAAGAGGAATTTCCACGATTGGTGCAAACCAGCCTTTGCTAGTAGTTGATGGTGTTCCTCGTAACTTCCAAAACTTAGACCCCAACTCAATTGAATCCTTTACTATACTTAAAGATGCCGCTGCAGTGGCCCCCTATGGGGTAGCTGGAGCCAATGGTGTTATTCTGGTAACAACCAAAGAAGGAAGGAAAGGTGATCCGAAAATAATTTATAATGGCTATGCAGGGTTTCAAAACCCAACGAAAGTACCCGATTTTGTAAACGGGTATCAATACGCGCTATTAAAAAATTTAGCTGCTGAAAATGTGGGACTCCCAAAGCCCTGGTCAGATGAGGCATTACAAAAATTTAAGGATGGTAGCGATCCGGACAGATATCCTCCTTACTATGATCTATGGGGCGACATAATGACTAAGAACGCGCTTTTAACTACTCATAGTTTAGGTGTGTCGGGAGGAACAGATGTGTTCAATTATTATTTTAATCTTGGCTTCCAAAACCAAAAAGGAATGTGGCCTTCAACATATTCAAGAAGATATAACTTCAATTTAGGTATTGACGGAGACATCACCCCTACTACCAATCTTTCAGTCAAAGTAATTGGTATTAATAAGTTCTCAACTTACCCACCGACGGATGTTGATGGATCAATGTCATCATCAACCACCAGGGTGTTTGAACTAATAAAATATGCTCATCCTGATTTCGGGCCCTTAATTTTCAGTAATGGGATGTATGGAGCACCTGCTGCAGCGGCAATATTCAACTCGGGTCACAGAGATATGAATTCAACAAGTGTATTTTCACAAATTAGTTTAAATCAAAAAATACCCTTTATTGAAGGATTAAAACTTACTGGAAGAATTGCTTTTGATCCAACCTTTGGCTCCCATAAGAATTGGTCCATACCCGAACACATGGCAAGCATTGACGTAACTCAGGTACCGTATGTAATTACTGACGGATTTCTGGGCAAGACTAAACCTGCTCTTACTGAGAGCAGAAATGAATCCATTCAACTAACGTATCAGGCTGGGCTTAATTATGAAAATCATTTTGGAAAACATGGAATAAATTTCACATCGGTCTTTGAGGCTATAAAAAGAAAAGCATCTTCTTTAGGAGCTTCGAGGAGAAACTACAGCTTATATATTGATGAAATAAGTATGGGTAGTTCTAGCAACGTAGATATGACAACGGATGGCAGCTCTTCAGAAGCCAGCCAGGTTGGGGTGGTATACAGGCTATCTTATGATTATTCGGATAAATATTTATTAGAGTTTAGTGGACGGTATGATGGGCACTATTATTTTGCGTCAGGGAAACGCTTTGGATTTTTTCCTGCTTTTTCTTTAGGATGGAGATTGTCCGAAGAAAAATTTATAAAAGATAGGTTATTGTGGTTGAATAATCTTAAAGTCAGAGCATCCTATGGTGAGGTTGGAGCATTAGCAGGAGGGCCATTTCAATACCTGAGCACTTATGGGGTGAGTGGGCCAGGTTATGTTATTGGTGGGAGTGGAGTTCAAATAGTCTATGAACGGGCAGAACCCAATCCAAATATAACCTGGGAAAGGGCCAGAAAAACGGATGTTGGAGTAGAGGCTACACTTTGGAATGGATTGTTAAATATTGAAGCAGATTACTTTTATGAAAAGAGGTCCAATATGTTGATTGCCCCAAATGTGGTTACGCCATTAGAATATGGAATTGGTTTAAGTCAGGTAAATAGTGCTATAATGGAAAATAAGGGCTTTGAGTTATTTCTTAGCAGTCAATATAGACTAAATAAAAATGTATCATTCAGCCTGAGTGGTACATTAACCTATGCAAAAAACAAGGTGTTGCAAATATATGAAAGTGCAACTACATATAACAATGCAAACAGAAGAAGAACAGGTCGTCCTCTCGGAACTCAGTTTGGCTATAAAACAATTGGCTATTTTCAGTCCAGCGATTTTGATCAGGGAGGTACTTTAAAAGCTGGTATTCCAACCCAGCCCTGGGGAAAAATATTTCCCGGAGATTTAAGATATCAGGATACTAACGGGGACGGAAAAATAACACCGGAAGATCATGTGCCGATAGGAGACCCAAGTAATCCAGGAATAATTTATGGCTTTTCGCCAAGTATTAGGTATAAAGGCTTTTCCATAGACATTCTGTTCCAGGGTGTAAGAAATACAAGCTACTATTTTGAGGGTTCGGCAATGTGGCCATTTTATAATGGAAGGTCTGCCTATATACAAAATTTTGATTATTGGAAACCAGACAATGCGAACGCCGCATTCCCAAGATTGACTCCGGTTCCTAATGACAACAATGTGCAATTCTCCTCAAAATGGATGTATAATGTTAGCTACCTGAGATTAAAAAGCGTAAAATTTAGCTATGATTTCCCATCAAAGCTTATTAATAGGGTTAAGCTAAACAGGGCGCAGATATATTTGAGTGGAGAAAACATGCTTACGTGGTCCGGATCTTATGTTAGTAATTTTTATGACCCGGAAAGTGTTAGCGGAGGTGGTTATAATTATCCTCAACAAAAAATACTTTCCGTGGGATTACAACTGACTTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1146
MQFIAFNHRCRGIRGILSKTLRIMQLTTALLLGICLQAAATGIAQTITFSGKDIPMEKVFTVIKQQTGYFVSYKSGQLRKAKPVTIQGDNMPLEQFLNEVFRNQQLDYSIEENTIFIKWKKEIYQIIPLESVLVTPHPPADISLSGRVTNDQQEPLEGVSVAVKGTQNGTTTNADGRFLLSVPSANNVELVFSFVGFETHTVKVGTQAVFNIILKAVVAGLDDVVVVGYGTQKKTSLTAAVSTLKGNELIAIPTTNLSNNLGGRVAGIISKQGSGEPGVDGSNIYIRGISTIGANQPLLVVDGVPRNFQNLDPNSIESFTILKDAAAVAPYGVAGANGVILVTTKEGRKGDPKIIYNGYAGFQNPTKVPDFVNGYQYALLKNLAAENVGLPKPWSDEALQKFKDGSDPDRYPPYYDLWGDIMTKNALLTTHSLGVSGGTDVFNYYFNLGFQNQKGMWPSTYSRRYNFNLGIDGDITPTTNLSVKVIGINKFSTYPPTDVDGSMSSSTTRVFELIKYAHPDFGPLIFSNGMYGAPAAAAIFNSGHRDMNSTSVFSQISLNQKIPFIEGLKLTGRIAFDPTFGSHKNWSIPEHMASIDVTQVPYVITDGFLGKTKPALTESRNESIQLTYQAGLNYENHFGKHGINFTSVFEAIKRKASSLGASRRNYSLYIDEISMGSSSNVDMTTDGSSSEASQVGVVYRLSYDYSDKYLLEFSGRYDGHYYFASGKRFGFFPAFSLGWRLSEEKFIKDRLLWLNNLKVRASYGEVGALAGGPFQYLSTYGVSGPGYVIGGSGVQIVYERAEPNPNITWERARKTDVGVEATLWNGLLNIEADYFYEKRSNMLIAPNVVTPLEYGIGLSQVNSAIMENKGFELFLSSQYRLNKNVSFSLSGTLTYAKNKVLQIYESATTYNNANRRRTGRPLGTQFGYKTIGYFQSSDFDQGGTLKAGIPTQPWGKIFPGDLRYQDTNGDGKITPEDHVPIGDPSNPGIIYGFSPSIRYKGFSIDILFQGVRNTSYYFEGSAMWPFYNGRSAYIQNFDYWKPDNANAAFPRLTPVPNDNNVQFSSKWMYNVSYLRLKSVKFSYDFPSKLINRVKLNRAQIYLSGENMLTWSGSYVSNFYDPESVSGGGYNYPQQKILSVGLQLTF*