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SCNpilot_solid_1_scaffold_1808_6

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_Sphingobacteriales_41_19

near complete RP 53 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: 4003..7449

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor n=1 Tax=Cyclobacterium qasimii M12-11B RepID=S7VGI7_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 55.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1169
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:EPR69325.1}; TaxID=641524 species="Bacteria; Bacteroidetes; Cytophagia; Cytophagales; Cyclobacteriaceae; Cyclobacterium.;" source="Cyclobacterium qasimii M12- similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 55.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1169
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 55.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1168
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Cyclobacterium qasimii → Cyclobacterium → Cytophagales → Cytophagia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3447
ATGCAAATTAAGTCTCTTTACAAGCCCTCCTTTTCTTTGAGGACGGGTGCAGCAGGGATCTTTACCAAAACCTGCCCCGCGGGGTTACACGGGGTGCTGTTGGGTATGAAACTAACGATTGTTTTATTGCTCGCTGCCATGTTGCAGGCAACGGCGAAATCCGATGCGCAAACTGTTACTTATGCTGGCGAATCCGTCAACCTGGAGAAAGTTTTTGTGATTATCAAGAAACAGACGGGTTATGTATTTTTTTACCGGGAGGAAGACATCAGGGGCTTGCCGGCTGTTTCTGTTTATTTCAGGAATACACCTCTTGCAACAGCCCTTCAGGAAACATTAAAAGGGTTTCCGCTGCAGTACAGCATTCAGGGCAAAACCATTTTTATTACCACAACAACAGGCGCCGGTAAAAAGAAAAATGCGATACAGGAGGAAACGGTTTCAGCAGAGCTGTGGGGGGAAATAACAGGCGTGGTGAGAGACAAGGAGGGAACGCCAATGGAGGGTGTGAGCGTAACGGTTAAAAGGACTCAAACGGGTACTACTACCAATGCCGACGGACGCTTCCAGTTATCTGTACCCTCAGCCAATAACATAGAACTTGTTTTTTCTTTTGTGGGATATGGTACACAAACAGTAAAGGTGGGAAGCCGGACTGTTTTAGATATAGTGCTGGAGGAAGCGGTTTCTGATTTGAGCGATGTAGTGGTTATCGGGTATGGAACCCAAAAAAGAAGTTCTGTTACTGCTTCTATTTCCAGGATTGAAAATGACAAATTGGATCAAATCCCTACCGGAAGGTTGGAAAATGCTATCATTGGCCGCATGGCTGGCGTTAACATTACTACACAGCATGACAGGCCGGGGGAGGCTCCTGAAATTAATATAAGAGGATATAATTCTATTAGTGCGGGTAACTCACCTTTAATCGTAATTGATGGGGTTCCCGGAGGAAACCTGGGATCAATAAACATGAATGATATTGAGTCTATTGAAGTATTAAAGGATGCTTCTTCTGCCGCTATTTACGGGTCAAGAGGCGCCGGTGGCGTGCTGCTGGTTACAACAAAAAGAGGGAAAAGCGGCAAGCCGGTTTTGAGTATTAATGCCTATTCCGGATTTTCAAAGGCGATGTTGTATGACGACTGGATCACGGGTAAAGAATGGTATGATCTTTTGGTTAAATACCAAAACAGGGCCTTTGCAACTACAGGGGGCGACGTTTCTATACCTATGATAGGAGATTCCCGGCGCCCCCTGAGTTATCAATTGGATCCGGTTATCTATCAGCTTCCCCAAACCAATTGGGAAAAGGAGGTGACCCGTATAGCGCCCATTCAGAATTATAACGTTACCGTTAGCGGAGGAAGTGAAAATATTAGATATTATGTTTCCGGTACTTACGGTAACGAACAGGGAGTAATAAAGACCGCCGGTTACGAGACTTTTAACTTCCGGGCAAATCTTAATATAAAGGTTAATAAGAGCATTGATATGGGAATAGAGCTGAACCCCCGGTATATCAAACGACGGTTAGCAGGAGGAGGAGCAATGATTAATTTTAACAAGTACCCCTATTTTACCGCTCCGTATAAGGTGAATGGAAAGTATCCCAGAACAATTGACTATGCCTACGGGCATTCGGGGCAGGCAAGTCCGTTTACCTCTATCTATGGTACAAGAAATTTTGTTAACTCTTTATCGAACATTGGGAACGCATTTGTTAATATAAAATTAGTGGAAGGGTTGAGCCTGAGAACATCTGTTGGTACAACTACGGGCTATTCTACCAACAACAATTATACAGATGGAGATGGAGACCCTCAAGTACCTTCTGCAGGATATGTTGATGAGTCGCATGGTATTGATTTGGTTAACGAGAATGTGTTTAGTTTTAAAAAGACGTTCAATGAAAAGCATGATTTCGATGCGCTTTTAGGGGCTTCCTATCAACTTGCTACATCGCAAACTACCAGAATGTCTGCAGTGTCCAATTCTTTCAATAACGATATCGTTCAAACCTTAAATAATGCTATTATTAATCCCTCCTGGTCTACTTCCTCAAAAACCCAGTGGGGATTAATATCCTATTTCGGAAGGCTGAATTATGCGTATGACAATAAATATCTGTTGGTCGCCTCGCTTAGAAGGGATGGCAGCTCACGTTTTGGACAAAACAATAAGTGGGGATACTTTCCTTCGGTGTCAGCAGCCTGGCGTATTTCAAAAGAAAATTTCCTGGTTGATAACAGGTTGATCAATGAATTAAAATTGAGAGCGAGTTATGGGGAAACCGGTAATTTCAATATTGGTAATTTTCAATACCTGGGCATCGTAAGTAATCGTGTTTTTTCACCCGATAACAAGACTGTTAACGGTATTGCCCAAACTTCTATTGCCAATCCTGATTTATCGTGGGAAAAAGTTAAATCCTACGATATAGGAGTTGATCTTGGGTTGTTTAATAACAGGTTGAACTTTAATATAGATTACTATAATAAACGTACACAGGGCATGTTATACCAGGTAAATGTGCCTGCTGTAACAGGGTTTACCAATGCTATTCAAAACATTGGTACGGTTGAAAACAAAGGATTTGAAATAGAAGTTCAGTCAAAAGTAATAGCTGATCGCGACTTTAGATGGAATGCCTCTTTTAATTTCTCTGCCATTAAAAATAAGGTTGTGGGCCTGGGAGGTGTTAACGAAAGGATTATTCCTATATCAATTGGTATGAACTGGTTATTAAGAGTGGGGGAACCTATGTTTTCTTATTATGCTTATAAAATGATTGGCGTATATCAGGATCAGGATGAAATTAACGGAACCCCTCATTTGGCGGGAACTGTTCCGGGGAACCCCATTGTGGAAGACAGAAATCATGATGGTAAAATAAATACAGACGACAGGTATATTGCCGGCAATTACATGCCAAAAGCAACGCTTGGTTTCACCAATCAATTCGCATGGAAAGGATTCGATCTAAGCTTTACTTTACAGGCTTCCTTAGGATCAAAAATCTTCAATGAAGAGTATCTTTTTTATCAGGGTCCCAATTTAGGAACGCTGCGCAGGTCTGTAAATAATCAATGGTGGTCGAAAGATGATCCCGGAGATGGAAAAACACCCGGAATAGCCCTGGCGCAATTATATAGTTATATAACCAATACCGATTACTATATTGAAGATGCGTCTTATTTAAACCTTAGAAACCTGAATCTTGGATATGATATGTCAGGTATAGTTAAGCATACCTTTATAAAAAGCCTGAGGCTGTATCTTTCTGTAAACAATTTGTTTATTATTCAAAGTAAAAACTTTCATGGGTATAATCCTGAAGGGGTAACCAGTGGAGGGATTAACGGGATAAACAGCACGCCTGGTTTTAACCAGGGATCTGAGCCTATGAGCCGCAGAGTAGTATTTGGGATAAATGTGAATCTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1149
MQIKSLYKPSFSLRTGAAGIFTKTCPAGLHGVLLGMKLTIVLLLAAMLQATAKSDAQTVTYAGESVNLEKVFVIIKKQTGYVFFYREEDIRGLPAVSVYFRNTPLATALQETLKGFPLQYSIQGKTIFITTTTGAGKKKNAIQEETVSAELWGEITGVVRDKEGTPMEGVSVTVKRTQTGTTTNADGRFQLSVPSANNIELVFSFVGYGTQTVKVGSRTVLDIVLEEAVSDLSDVVVIGYGTQKRSSVTASISRIENDKLDQIPTGRLENAIIGRMAGVNITTQHDRPGEAPEINIRGYNSISAGNSPLIVIDGVPGGNLGSINMNDIESIEVLKDASSAAIYGSRGAGGVLLVTTKRGKSGKPVLSINAYSGFSKAMLYDDWITGKEWYDLLVKYQNRAFATTGGDVSIPMIGDSRRPLSYQLDPVIYQLPQTNWEKEVTRIAPIQNYNVTVSGGSENIRYYVSGTYGNEQGVIKTAGYETFNFRANLNIKVNKSIDMGIELNPRYIKRRLAGGGAMINFNKYPYFTAPYKVNGKYPRTIDYAYGHSGQASPFTSIYGTRNFVNSLSNIGNAFVNIKLVEGLSLRTSVGTTTGYSTNNNYTDGDGDPQVPSAGYVDESHGIDLVNENVFSFKKTFNEKHDFDALLGASYQLATSQTTRMSAVSNSFNNDIVQTLNNAIINPSWSTSSKTQWGLISYFGRLNYAYDNKYLLVASLRRDGSSRFGQNNKWGYFPSVSAAWRISKENFLVDNRLINELKLRASYGETGNFNIGNFQYLGIVSNRVFSPDNKTVNGIAQTSIANPDLSWEKVKSYDIGVDLGLFNNRLNFNIDYYNKRTQGMLYQVNVPAVTGFTNAIQNIGTVENKGFEIEVQSKVIADRDFRWNASFNFSAIKNKVVGLGGVNERIIPISIGMNWLLRVGEPMFSYYAYKMIGVYQDQDEINGTPHLAGTVPGNPIVEDRNHDGKINTDDRYIAGNYMPKATLGFTNQFAWKGFDLSFTLQASLGSKIFNEEYLFYQGPNLGTLRRSVNNQWWSKDDPGDGKTPGIALAQLYSYITNTDYYIEDASYLNLRNLNLGYDMSGIVKHTFIKSLRLYLSVNNLFIIQSKNFHGYNPEGVTSGGINGINSTPGFNQGSEPMSRRVVFGINVNL*