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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_533_1

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_TRIM150_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 16
Location: comp(83..10783)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
30S ribosomal protein S2 n=1 Tax=Rickettsia felis (strain ATCC VR-1525 / URRWXCal2) RepID=RS2_RICFE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 27.0
  • Coverage: 226.0
  • Bit_score: 77
  • Evalue 2.20e-10
30S ribosomal protein S2 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00291}; TaxID=244581 species="Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rickettsiales; Caedibacter.;" source="Candidatus Caedibacter acanthamoebae.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 29.3
  • Coverage: 188.0
  • Bit_score: 82
  • Evalue 1.30e-11
rpsB; 30S ribosomal protein S2; K02967 small subunit ribosomal protein S2 similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.0
  • Coverage: 226.0
  • Bit_score: 77
  • Evalue 7.00e-11

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Candidatus Caedibacter acanthamoebae → Caedibacter → Rickettsiales → Alphaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 10701
ATGCAAAATTATAATTGAAAAGGAATTTTAGATATATTATCTTTTAGGCGAAAATTAAATTTTTTTAAAAATAATAAAAGTACTTTTGAAAATTATGATAGGTATTTATTTGAATTAAATTTACCTGAATTTTCTTTATATAAAACTAAGAATAAAAGTCTTTATTTTATACTTAATTCTCAAGTAATCGTTTTTACATTTCATCAAATGTTTAATTATAATTTATTTATAGGATCGTCTATAAGGACATCGTTAAAAACATCTAGATGAATGACAGCAGCTTTCAGATTATCGTTTGTTTTTATAGACTTAGCTACAGCGAATTTTTGTTTAAGATCCGTTATACGTATTGTATTAGTCGCTATTAAAAAACGAAGAAGTATTTTAATTAGTTGTAATAGATCAAGTTCTTATTTTGTTGGTTTAGTTGCATCTTTAGCTAATTGATGTGGTGAGGCTTATTGTGGTGGTCGTTGAGTGGCAGGTACTTTATCAAATTTTAAAGGTATTTTATTTTATTTTCATTTTCATTTGTATCGTTACAAAATGAATGAATTAACTTTAATACAGCAAAAATTAAAAATGGCTTTGAAGGGTTTGGCTTTTTTAAGAAGTAGGCCTCGTATGGTTTTTTTTGGAAATTATTATCATGGTTATCATGGAGCTAAAGAAGCTGCGCGCTTTGAATGTGGTCCTGTTTGTGTTGTTGATTCTGATGTTTTTCCAGATCATGTTATATATCCTATGCCTAGTAATGATGATTCTTTCTCTTCTTTAGAGTTTTATGTTAGGATAATTGCAAAATCTGCTTTATTAGGTAAAATGTATGCTTTAATGCGTTTCTATAAATTGCGTAAGCTGTCAGCTTTTAATCAAATGTTTTTAGAAAAAGATGTTCATTGATGAGATGCAGTTGATCGTTTTTTTAATAAACGTGTTATTACAGCGATTAGTAATAAAATTAATAGAAAAAAGCGTAATTTTTTTTTATTAAAATATTTAACTTTTTTTATTTACTTTAATTTTTTTAATTTAATTTTAGATGCAAGCAAAGGTAAAAAAACAATAAATTTTCGAAAATATTTTGGTTTTTTTACTTTATATTCTATTTATGTTAGATCGTTTGGAGATGAATTTTTGTTGCTTAATAATTATGCACTTAATTACTTTCATATTTATAACATGTTTCAAGAAATAGTTAAAATGTTGATTTCTTTTGATGAAAATTATAAAGATGCTTTAGGTTATAATGCTTATTATTTAGTTATAGGTGCTAGATTTAAGTATTATTTTCATAATAAATTTTTTAAAAATTTTTTTAAATTGACACCATTTATTTATTTTAAATTTTTGTTAAGATGTATGGCTAATTGAAAATTGTTTAAGTATGATTTGCGTTTTAAGAAGGAAAATTTAAACACGAAATATGCTTATTTACATGATAAGCTTTTTAGAGTTAAGCAAGATTCTTTTTTAGTCAGTAAAAAGCCTAAAATTATTTTTTATGAAAATTTATTTGATGTTTATTGTGATTTTGACCAATTAACTTTATTATCTGAGCGTACTTTATTTGATATTGATTTAGAAATTTCAAATTGTTTAGTTTATACTAATTTTGAATTATTTAATAATAATATAAATACTTTTATAAGATATGTGGATGATATGGTATTTCGTATTTATGGTAATTCGTGATATAAAGATATGTATTTATATTTTTTAAATGATTGACAAACATCTAAATTTAATAAAAATATATATATTAATAATAGAAACGCGAATATAAATGACTTTTTTGATAGTAAGTTTATAAAGTATTCAGCTTTTGTAAAATTTTTTAAAAAACGAATATTTGATTTGTATATTTTTTTTTTTAATGAGCCTGAATTTAAACTATTACGTAATCAGATACCCATAAATACTGGTGAGCTTTTAGAATTGCGTAGATTTTATAAAAAATTTTTTGATAATAAAAGTTTGTTGAATTTGTTTGATTATTTTCAAAAATATAATAAATCTTTTGAATCTGAAGTTAATAAAAATAATTTAAACTATTTTTTTGATAAGTTAATTTTTAGTAAGGAACATTTAACTCGCGTATTTAATATGTTAAATTCGAATGAATTGTTTAATAAGGATTTATATAATTATTTTGTTGAATACAATAAAAAATGTTTGCGCTTTTTTGGATATGTATTAAAGCCTAAATTTGTACAAACTTGATTGCAAGATAAACATTCATTAATTTCTCGAAAGTCTTTTAGTATGAATAGATTGGAAGCTAATATTTTAAGGCGTAAAGATTATAAAAAATATTTTAATACTTTTGATTTTTGATACGAATCTGCCTATAAGATGTATAATGAAAATGCTTATGGATATATGTCATATTTCTATACCGATTTTTTTGAAACAATTCCACATTTTTTTGCGAAATATATTAATTTTACAAATGTAAAAAATTCATTTTTTAATTTAATTTTGTCAAAAACTAAGCAAAATCTATTATATACAATAGATAATAAGCTAAAGTTTGTAACTGTATTAAAGAAATATTTAAGAAATATATATTTTTTATTAGTTAATAAAAAATATTTAAAAATAACTAATTTAGATTTTTTGTTAAAAATGTTTATTAAAATAAATATGTATTTGAATATTTTTAAACAAATTCGTTATTTATTTTTTCAAAATTTTTTTTTTGCATATTTTAAATTGCCTTTTCAAAAGGATTTCTTTTTTTTTGAATATTTGATTTTAAACAGCAATAATGAAAATAATAAGTTGTTATTTAATAATGTAACATTTAAATATCTATTTAAGACATCAAATGGAAATACTTTTTTTAATTCAAAATTCCTTGTTAGTTTTATTAATAAGTTTAATAAGTTGAATATGTTTATAAATTCTAATTTATTTTCGCCTTTTGTAAAACAGTTAGATGTATCTAAAATGTCTTTAATAAGATATGTAAAATCTAATATTAATTCAACTAATAGCCGTTTAATCTCTTTAGGTAAATCATATCAACCAGCTTTGTATGTTAATTTGTATTCTCATGTTGCTTTGTTAAAAAATTTAATTTATGAGAGATTGTTTTTTTTAAATAGTAAGTTATTTTTTTTTTTTAAAGCTGGTTTTTTTTTTGTTGATTTACAGACAAAATTTGAAAAAAATTTTAATACTAGTCGAACTTTAAAAAAAGATAATTTAGGTTATTTATTATTAAAGGTTAAATTATATAAGATTTTTATTTTTTTATCATTTTTTAATTTTTTTTCGTCTAAAAGGTTAAAAATTTTTAAAAATAATGAGTTTTTAAATTTAAAAAAAAAAGTACTTACTAAGCATAAATATTTTTTGAAGAATTTTGAATTTCAAACAGAATTAAAATTATTAACTAAAAAACGTTTATTTTGATTAAAAAATTTGTTGAAATATTTTAGTTTATTTGAATTGAAGCTAGGCAATTTAAAATTTTCGCGTGCTTATGTTTATGAGATTTTAAATTGATTAAAAGCTGCACGCATGTCAGAATTAAAATCTAATTCTATAAGATTTCGTGTTTTGGTTCTGAAAAATATTTTTGAGTGTGCTTTTGATGGTTATTTATTTAATGATTTTTTAAAAAAAGCTTTGCTAAATTTTAATTTTTTTCAGAAGAAAGTTTTTTTTGAAAACAAAACTTTATTTTTATGTAAAAAATATGAATTTTTTTTATTTAAAAGATCATCATATTTTCTATTTTTAAATTTATTTAAAGGGGCTTTAAATAAATTTAAAAATAGAAAATATGATCTTGAATCTAAAATTATTAATAAGAATGATAATTTAAAAGTAACATTTCTAAAGAATAAAACAAAGTTATTTTTATTTGATCATGCTACACGTGAAAATAAAAACAAATTTATCTATAAGCGTTTAAATTTTTTAAAGAATTTCTTAATGAAAAGGATAAAATATATTAGGTATTGCTCGGCTAAGGAATTTTTTAAAAAATTTAAAACTTCACGTATTTTTTCAACTCGTGATTTTTCTGGTTTAAAAGCTTTATATAATTTTAATTCTGTGTTGGTAAAATTAAGTAGAATTAAAAATTTTTTTTGTACTAGTATTTTAAATGAAAATTTTATAAAATGTCGTTTGCATAGTTTGAAAACAAATTTAGCTTTTATTCGTAATATTTTTATGAAAACTTTTAAAGTTTTGCAAAATTCTAATTCTTTTAGATTACGTATTTTTTATAAGTATTGATTATTTTATTTTTTTTTGAAATATCGTATAAAAATTTTAACTAAAATTTTACGATTAAATAAATTATCAAATTTTTCTGAGATAGTTAGCAAACTTTTTGAAATTTTAAAATTCGCTTATAAATTTAAAAGTGTTTATATGTTAAAACGTTTGTCGCGTGTTAGAGGAAAGCACATTGCTAAACATAGGTTAGGTATAAAACGCATAAAAATGTTAAGATCTCAGTATGCAAAAAGACGATTGAAGCGTTATTTATATAAAAGATTTTGTGAATTTTTTGGTAAATTTTGTTTAAAGAGTGATAAAACTTATTTAAATAAAACATTAAATAATTTTAAAGTAAGTTTCAATTTTGAAGAAGATACAAAAATAGGTTATAATAGCCTTTTAGTTAATGCTGATTTATTTTTTTTAAGTGGTAAGCTTGAAAATACAAATGTTACCATTGAGTTATTTTTAAATAAAAAAATTGTGGAAGTTAGTAAAAAAGCATTGTTGTTATTTGTAGATGAATGAATTATTTCATTATGATATTTTAGTTTTTATAAGAGTAAAGAGCATATGATTAATTTGTTTTTAGCTAATAATTATGTATATATAGAACATTCTAACTCTTTTAATAAATTTCAGTTTTTTACTAAATATTTAAATGTATTTTTGAGTAAAAAAATTAATGAAAATAAATTTCAGCAGAATATAACTGAATTTAATATATTTTCTAAAAAAAATAAAAAATTATTTAATCA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
PROTEIN sequence
Length: 3567
MQNYN*KGILDILSFRRKLNFFKNNKSTFENYDRYLFELNLPEFSLYKTKNKSLYFILNSQVIVFTFHQMFNYNLFIGSSIRTSLKTSR*MTAAFRLSFVFIDLATANFCLRSVIRIVLVAIKKRRSILISCNRSSSYFVGLVASLAN*CGEAYCGGR*VAGTLSNFKGILFYFHFHLYRYKMNELTLIQQKLKMALKGLAFLRSRPRMVFFGNYYHGYHGAKEAARFECGPVCVVDSDVFPDHVIYPMPSNDDSFSSLEFYVRIIAKSALLGKMYALMRFYKLRKLSAFNQMFLEKDVH**DAVDRFFNKRVITAISNKINRKKRNFFLLKYLTFFIYFNFFNLILDASKGKKTINFRKYFGFFTLYSIYVRSFGDEFLLLNNYALNYFHIYNMFQEIVKMLISFDENYKDALGYNAYYLVIGARFKYYFHNKFFKNFFKLTPFIYFKFLLRCMAN*KLFKYDLRFKKENLNTKYAYLHDKLFRVKQDSFLVSKKPKIIFYENLFDVYCDFDQLTLLSERTLFDIDLEISNCLVYTNFELFNNNINTFIRYVDDMVFRIYGNS*YKDMYLYFLND*QTSKFNKNIYINNRNANINDFFDSKFIKYSAFVKFFKKRIFDLYIFFFNEPEFKLLRNQIPINTGELLELRRFYKKFFDNKSLLNLFDYFQKYNKSFESEVNKNNLNYFFDKLIFSKEHLTRVFNMLNSNELFNKDLYNYFVEYNKKCLRFFGYVLKPKFVQT*LQDKHSLISRKSFSMNRLEANILRRKDYKKYFNTFDF*YESAYKMYNENAYGYMSYFYTDFFETIPHFFAKYINFTNVKNSFFNLILSKTKQNLLYTIDNKLKFVTVLKKYLRNIYFLLVNKKYLKITNLDFLLKMFIKINMYLNIFKQIRYLFFQNFFFAYFKLPFQKDFFFFEYLILNSNNENNKLLFNNVTFKYLFKTSNGNTFFNSKFLVSFINKFNKLNMFINSNLFSPFVKQLDVSKMSLIRYVKSNINSTNSRLISLGKSYQPALYVNLYSHVALLKNLIYERLFFLNSKLFFFFKAGFFFVDLQTKFEKNFNTSRTLKKDNLGYLLLKVKLYKIFIFLSFFNFFSSKRLKIFKNNEFLNLKKKVLTKHKYFLKNFEFQTELKLLTKKRLF*LKNLLKYFSLFELKLGNLKFSRAYVYEILN*LKAARMSELKSNSIRFRVLVLKNIFECAFDGYLFNDFLKKALLNFNFFQKKVFFENKTLFLCKKYEFFLFKRSSYFLFLNLFKGALNKFKNRKYDLESKIINKNDNLKVTFLKNKTKLFLFDHATRENKNKFIYKRLNFLKNFLMKRIKYIRYCSAKEFFKKFKTSRIFSTRDFSGLKALYNFNSVLVKLSRIKNFFCTSILNENFIKCRLHSLKTNLAFIRNIFMKTFKVLQNSNSFRLRIFYKY*LFYFFLKYRIKILTKILRLNKLSNFSEIVSKLFEILKFAYKFKSVYMLKRLSRVRGKHIAKHRLGIKRIKMLRSQYAKRRLKRYLYKRFCEFFGKFCLKSDKTYLNKTLNNFKVSFNFEEDTKIGYNSLLVNADLFFLSGKLENTNVTIELFLNKKIVEVSKKALLLFVDE*IISL*YFSFYKSKEHMINLFLANNYVYIEHSNSFNKFQFFTKYLNVFLSKKINENKFQQNITEFNIFSKKNKKLFNHKFSKAYYNLFFFYKKKINYILALRQQYLRFGYYFKRFEYLLKLKSNYYFSKKTQRTHFSFFKQLFYKLQLLLFKDYSYNLLNKNLFKHKVLNLMFKISPNIKSVLKNDLVLKELDANYKNSTKKYILTKMYKQNFGNFGKFYNQNSFLNKFKRKFG*GFRKRKFFYNVVTKTHLNRKITYFSNNFKFRNFFKKRKFFFLSKQNLFMKKYSLSDNHITEIFLKKN*INIFKCLSKSFFLSNPFSDY*IERYYNTSIVNKGKGFLANN*IFFK*DYSIMDLAIS*ISPSIGLTQTKYKRNKTRSFYLCREKMLQATDLLKRSKKLYFLYANYKHLFINGSKKIKNVDQKFRFLHNILKDSKRISKKLRVFFKAKVFFYLKSDKIFDAFFSKLDMKNRLGFFKTLFDFFSKKHILFFIKKSGFILKNFIF*FFKFYFNTNQFNFVDTNKLYEKFLFRNNLKVEDDKLNLKKKFFFNLYKGNLLNFFRTYNIKKKNKYSLIILQNQKKYMKFFIKKRLGFLLNMNMYRFNIFTKLFSFYSNRSSANNFYGFRQQRTKRI**LFWTKIFFNMLVGNNHQSNSLFLGEQKNLYFSTNNNDVKDKFKLSKKNLFFKYKRCLKRLLKRENFFKVSSKMNALSLKKDNFLKNVKLKKLFINKSRKRKRLQSVSDTFDLKLGLFGKKMANLSDKDIYYNKSIKKLKKMIKSSLFYKYKKNFNSKKNISLSKSKRNAGKIFNNPYIFKNKINKNIRKQLKGHKRAYLKFKRNLFYGKKLKTKLSLKQTEMLKNFDKKRLFLFEKNFKSNKSFGLSDYIYYFNKHLKFNKNYKFLLKIFNVIISDFILLRLKGKVTRILNFYNNFNLGSSKTFKQKNIFENIKFNKSFVFKYLSLHENLNNYVNFGFSNFKMNFFKIKGYFDLVYNNLKNNLKFEVILD*QKFDKFSNGFGFFLKKLKS*KRILMPF*VRDQFYFFKNFKYIFSKIKYFFYFLKRYKFKKRIEAPLNKVLRFLIIKLIKIFKMRDYFF*FY*VLQDVRLFFMNKSLLKVNEHVYNSVFRRRSFLKGYFAKSLKAIRSKLHLKFKQIKNLNSKFSFSHFVTRRSRRLLKRKK*RLKFKRANSLKKFSLKYKNRSRMRLFNALIRRENDYDYRELMNERNFMYYLHDLTHVVGAYVRTYSGDLYGRQYVAQHIFAKYRARYNKWLHRLSLGKRKKPLFPGQIHANFIRVYYKYISRYFFNNNYNFLKEKNHFSKGIRVLSDYFNFNKSISFYKGFYKKN*VARSKVLFLRRKKQAPYFVRWLRLKRNVSFSVHKANFFKYKFNLFKNFRLEGHNKKISLDLLKMRIKYIIYRRGNFR*LFFILKRFSTQLFSYFKINSDYIANDLNKFSKYLLKLKNY*NNSIAFFNFFHTQKRIQIKFRQYKKFKGNLKQIGIFTKNKVNLKKKMGNSFILSQYIKFKYKFFIRRCLMPFFA*CLNVWVYLRKSQFSRKFLGDSMFLSKYINEKHLYLYR*HNILHHINYKVIFNKLVDLINKYNVNIGAQKYALVFKKKGAVGYASRFKRKRKVKSLKVKRTLLKRLCRNVLTYRMEKADLNFRTFFFENLYEN*GLRSLLLSAKLPRVKMKYLYFNKLDYLYAEKCQQIYSKGLLLKKEPLITNNFSLSALFVNKKDPNVVTERNEQLRSIMNLDLDYLKNVYKESNKETLHYKVLRLILIQNLVVLHKNMYKALDIIKLQQPNIFSMHAGKLKFIFNYNTHKRIYSKFLDIKAKVNKSYYNKDITRFYKYNEFFFKYVFNKI*LKKTALYNYFTLIKVNYNVTDHVKISEVN*FTAEYYNFLTVNYNQKSIKFIIARDHFSLINELNYKHKLKKFNIISSSNINNFVEARVLNEENYKLFNKYNVIKKFHNKTLNLTKK*