ggKbase home page

scnpilot_solids1_trim150_scaffold_533_14

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_TRIM150_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 16
Location: comp(30962..32335)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cytochrome b n=1 Tax=Vermamoeba vermiformis RepID=D4PBK8_VERVE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 56.3
  • Coverage: 394.0
  • Bit_score: 482
  • Evalue 5.00e-133
  • rbh
Cytochrome b {ECO:0000256|RuleBase:RU000300}; TaxID=5778 species="Eukaryota; Amoebozoa; Tubulinea; Euamoebida; Tubulinida; Hartmannellidae; Vermamoeba.;" source="Vermamoeba vermiformis (Amoeba) (Hartmannella vermiformis).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 56.3
  • Coverage: 394.0
  • Bit_score: 482
  • Evalue 7.10e-133
cob, OrsajM_p40; apocytochrome b; K00412 ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 55.6
  • Coverage: 360.0
  • Bit_score: 424
  • Evalue 3.90e-116

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Vermamoeba vermiformis → Vermamoeba → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 1374
ATGAATATTTTATTTAATCGTGTACGCCAATTAAGTCAATATAATATAATGCTAAATTTTTTATATGAATTTGCTATATCTTATCCATCTCCGTCAAATTTAACTTATTTTTGAAATTTTGGTTTTTTAGCTTTGATTTTTTTAATTTTTCAAATACTTACAGGACTTTTTTTATCAATGCACTATGTGCCTAATGCTTTATTAGCTTTTAATTCAGTTGAGCATATAATGCGTGATGTATCTTTTGGTGCTTTGTTTCGTTATATGCATGCAAATGGGGCTTCTATGTTTTTTATTGTAGTTTATTTACATATATTAAAAGGTTTGTATTATGGATCATATTTACCACCAAGACAATGAGTTTGATTTTTTGGTGTAATAATTTTATTAATTATGATTTTGACTGCATTTTTTGGTTATATTTTACCTTGAGGTCAAATGAGTTTTTGAGCTGCTACTGTTATAACAAACTTATGTTCATCTATTCCTGTTGTGGGTAAATCAATTGTTTATTGAATATGAGGAGGTTATTCTGTGGATAATCCAACTTTAAATAGGTTTTATACTTTTCATTTTTTATTCCCAATAATTTTATTAGCATTAGTAGGTTTGCATTTAATTTCCTTACACAATGTAGGTTCTAATAATCCTTTAGGTATTTCTATTAAGCAAGATAGTTTTCCTTTTACTGGTTTTTTCTTTGTAAAAGATACTGTTTTTTATATAATTTTTTTTCAAGTAGCTATTATTTTTATATTTTTTTATCCAACAGTTTTAGCACATCCTGATAATTGAGTTATGGCTAATCCTTTAGTAACACCTAAACATATTGTTCCTGAGTGGTATTTTTTAATTTTTTATGCAATTTTAAGAGCAATTCCTGATAAATTATTAGGTACAATAACATTGGTATTTTCTATAGTTTCTTTATTAATTTTGCCTTTTCATCAAAGAAAACATATACGCACTTATCATCGCTTGGGCTGATTAAGTACTTTGTTTTTTTTTGGATTTATAATTACATGTTTGTTGTTGGCTTGAGTAGGTGCTAAACCTGTTGTAACACCTTTTATAGAAATTGCTAGAGTCTGTACTATTTATTATTTTTTATATTTGTTGGTTATTACAAGAGGTTTGTGATTTTTTGAAGCATTAATGAATAAGAATGATTTGTGAGATTTTAATTATTCTTGATCAACATATATATATAAGAATTATAATTCTTTTAACTCTTATACTAAAAATGTATGTGCAAAAATATTTAATTTTATTATAGATTTTTTTATTATTTATTTAGGCTCATATTTTGGTTTATTAAATAATAATGCTTTTAAAAAAATTATAAAATTTTTAAAAGAATATAATAAATTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 458
MNILFNRVRQLSQYNIMLNFLYEFAISYPSPSNLTYF*NFGFLALIFLIFQILTGLFLSMHYVPNALLAFNSVEHIMRDVSFGALFRYMHANGASMFFIVVYLHILKGLYYGSYLPPRQ*V*FFGVIILLIMILTAFFGYILP*GQMSF*AATVITNLCSSIPVVGKSIVY*I*GGYSVDNPTLNRFYTFHFLFPIILLALVGLHLISLHNVGSNNPLGISIKQDSFPFTGFFFVKDTVFYIIFFQVAIIFIFFYPTVLAHPDN*VMANPLVTPKHIVPEWYFLIFYAILRAIPDKLLGTITLVFSIVSLLILPFHQRKHIRTYHRLG*LSTLFFFGFIITCLLLA*VGAKPVVTPFIEIARVCTIYYFLYLLVITRGL*FFEALMNKNDL*DFNYS*STYIYKNYNSFNSYTKNVCAKIFNFIIDFFIIYLGSYFGLLNNNAFKKIIKFLKEYNKF*