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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_533_20

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_TRIM150_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 16
Location: comp(40032..41735)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cytochrome c oxidase subunit 1 {ECO:0000256|RuleBase:RU000369}; EC=1.9.3.1 {ECO:0000256|RuleBase:RU000369};; TaxID=3111 species="Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Trebouxiophyceae; Chlorellales; Chlorellaceae; Prototheca.;" source="Prototheca wickerhamii.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 74.0
  • Coverage: 477.0
  • Bit_score: 763
  • Evalue 2.00e-217
cox1; cytochrome c oxidase subunit 1; K02256 cytochrome c oxidase subunit 1 [EC:1.9.3.1] similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 74.5
  • Coverage: 479.0
  • Bit_score: 751
  • Evalue 1.70e-214
Cytochrome c oxidase subunit 1 n=1 Tax=Prototheca wickerhamii RepID=Q37616_PROWI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 74.0
  • Coverage: 477.0
  • Bit_score: 763
  • Evalue 1.40e-217

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Prototheca wickerhamii → Prototheca → Chlorellales → Trebouxiophyceae → Chlorophyta → Viridiplantae

Sequences

DNA sequence
Length: 1704
ATGTATAATAATTTACAAGCAATAAATATTTTTTTAAATAAAATCTATCGTTGAATTTTTTCAACTAATCATAAAGACATTGGAACTTTGTATTTATGTTTTGCATTATTTGCTGGTGTCGTAGGCACCATTTTTTCTGTAATAATCAGAATGGAATTAGCTTATCCAGGACAAGGTTTGTTAAATAGTGATTTCCAATTATATAATGTTATTATAACAGCACACGCTTTTGTAATGATTTTTTTTATGGTAATGCCTGCACTTATGGGCGGGTTTGGTAACGTTTTATTTCCTATATTAATAGGTGCTCAAGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATATTAGTTTTTGATTATTAATACCATCTTTTTTTTTTTTAATTTTGTCTTCTTTAGTTGAATTTGGAGCAGGTACAGGTTGAACGATATATCCACCATTAAGTGATACTGCTTTTCATTCAGGAGGCTCTGTAGATTTTGCAATATTTAGTTTACATTTAGCAGGTATTTCATCATTATTAGGTTCTATAAACTTTATAACTACAATGTGAAATATGCGTGTCCCTTATATGAGATGACATAATATCCCTTTATTTGTGTGAGCTGTTTTTATTACAGCAATATTATTATTATTATGTTTGCCTGTTCTTGCAGGAGGAATTACAATGCTATTAACTGATCGTAATTTTAACACTTCTTTTTTCGATCCAATAGGAGGAGGTGATCCTATTTTATACCAACATCTATTCTGATTTTTTGGACATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGCTTTTGGTATAGTTAGTCATATGGTTTCAGATTATTCTTACCGCCCTGTTTTTGGTAAAGTAGGTATGATCTATGCTATGATGTCTATAGGTTTTATGGGCTTTATTGTGTGAGCACATCATATGTTTACTGTAGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCGTATTTCACAGCAGCAACTATGATTATTGCTGTACCTACAGGAATAAAAATATTTAGTTGATTAGCTACTATAGGTGCTGGTTTTATTGAATTAAGAGCTCCTATGTTATATGCAATAGGTTTTATTTTTTTATTTACGATTGGCGGTTTAACTGGAATTATTTTGGCAAATGCTGGTTTAGATGTAGCTTTACATGATACTTATTATGTTGTAGCTCATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGCTTATATGCCGGATTTTACCATTGATTCGCTTTTGTATTAGGTAAAGATTATATAGAAAACTTAGCACAAATTCATTTTTGATTAACTTTTTTTGGTGTTAATTTGACTTTTTTCCCTATGCATTTCTTAGGTTTATCTGGTATGCCTAGACGTATTCCAGATTATCCTGATTGTTATTTTACTTTAAACTTTATATGTTCTTTAGGATCATTTTTTTCATTTTTTAGTATTTTATTTTTTTTTGTTATTGTATTTTTTAGTTTAACTAGTTTCTCGTTCAATTTACAATTTTTTTCTATATTTTTTAAAGTTGATTTTTTTAACTATATTAATTTATTAGGAAATACTTTATCAAAACAACAATTATTTTTAAGAAAAAAATTTTATCTTGAAAATATAAATTTTAATACATTAGCTAAATTTAATATATTTCGTTGTTTTTCTTTTTTTAATTTTATATTTAGATTTAAATCTAAAATATTTTCAATATTTTTATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 568
MYNNLQAINIFLNKIYR*IFSTNHKDIGTLYLCFALFAGVVGTIFSVIIRMELAYPGQGLLNSDFQLYNVIITAHAFVMIFFMVMPALMGGFGNVLFPILIGAQDMAFPRLNNISF*LLIPSFFFLILSSLVEFGAGTG*TIYPPLSDTAFHSGGSVDFAIFSLHLAGISSLLGSINFITTM*NMRVPYMR*HNIPLFV*AVFITAILLLLCLPVLAGGITMLLTDRNFNTSFFDPIGGGDPILYQHLF*FFGHPEVYILILPAFGIVSHMVSDYSYRPVFGKVGMIYAMMSIGFMGFIV*AHHMFTVGLDVDTRAYFTAATMIIAVPTGIKIFS*LATIGAGFIELRAPMLYAIGFIFLFTIGGLTGIILANAGLDVALHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFGLYAGFYH*FAFVLGKDYIENLAQIHF*LTFFGVNLTFFPMHFLGLSGMPRRIPDYPDCYFTLNFICSLGSFFSFFSILFFFVIVFFSLTSFSFNLQFFSIFFKVDFFNYINLLGNTLSKQQLFLRKKFYLENINFNTLAKFNIFRCFSFFNFIFRFKSKIFSIFLF*