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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_19_curated_23

Organism: solids_Sphingobacteriales_4

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: comp(27682..31089)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor plug n=1 Tax=Cyclobacterium marinum (strain ATCC 25205 / DSM 745) RepID=G0J1T3_CYCMS similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 59.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1299
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 59.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1299
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug {ECO:0000313|EMBL:AEL23939.1}; Flags: Precursor;; TaxID=880070 species="Bacteria; Bacteroidetes; Cytophagia; Cytophagales; Cyclobacteriaceae; Cyclobacterium.;" source="Cyclobacterium marinum (strain ATCC 25205 / DSM 745) (Flectobacillus; marinus).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 59.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1299
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Cyclobacterium marinum → Cyclobacterium → Cytophagales → Cytophagia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3408
ATGAATTTTAATGCCAATTATCATCGGCGTGTACTTATCAAAAAAACACTGCTGTTTATGAAAATGACAACCCTTCTTCTTTTCTCGGCCTGCCTTGCTGCCAGTGCAGGCGGGTTTGCCCAAAGAGTTACTTTATCGGTAAACAATGAAAAAATCGGGAAAATTTTCAAAGAAATTAAAAAGCAAACAGGTTATGTATTCTTCTATGAAGCGAATGTATTGCAGGAAACAAAACGGGTAAGCGTACATGTAAAAAATGAAACGGTCGGAGAAGTGTTAAAAGAAATTTTGCAAGGAGAACCAATTGATTTTTCTATACTGCAGAAAACAGTATTTATTGTTAAAAAAAAGAATCAGTATGTAACTACAAGTTCTATTACCCCTTTAAGCCAGCTTGAGGAAGATATTCCTCCGGCGCCGGTTAATATTATTACCGGCGCTGTCAAAGATGCACAGGGCAATCCTCTCGCCGGAGTATCAGTAATAGTAAAAGGAACTAACAGAGGAACCAGTACCTCTACCAATGGTAGTTTCAGTATTGATGCTAATGTGGGTGATGTGTTGGAATTTACCATAGTTGGGTATCAGAAAAAGAGTGTGACGGTAGGGCAGAATAATAATCTTTCTGTAGTGATGGAAATTGAAGTATCCGTAGCTAATGAAGTAGTGGTAGTAGGATACGGTACGCAGAAAAAAAGTTCACTTACGGCTTCTGTATCAAGAATAGTAAATGATAATTTAGATCAAGTTCCCGCCGGCAGGACTGAAACAGCGCTTATAGGACGAATAGCTGGTGTTAATATTTCAGCGCTACGCGCCACGCCAGGTACTGCTCCCGTAATCAACGTGAGAGGTTTTGGATCTATCAGTGGCGGCAATAGCCCTTTAATTGTGATTGATGGCTTTCCTGGCGGTAGCTTAGGTCAATTAGATATGAATGATGTAGAATCCATTGAGGTTTTGAAGGATGCTTCTGCAGCAGCTATTTATGGTTCCAGAGGTGCGGGAGGGGTAATCTTGGTTACAACTAAAAGAGGAAAAAGTAGTAAGCCGGTATTAAGCTTAAATTCATATTACGGATCTACACATCCTATGATGTTCAATGATTGGATGACGGGAGAGGAATGGTATAGTTACCTTGTTAAATATCAGAATAGAGAATTTGCCTGGGCTGGTGGAGATGTTTCTCTTCCGATGTTTGGAGATTCACGTCGTCCAGTTCAATTTCAAGTGAATCCACTTATTAAAGAATTACCTCAAACCATTTGGCAAGACGCTGTCACACAAACCGGGGCTATCCAAAATTATAATTTATCTGTCAAAGGCGGTAACCAAAATATTAGATACTACGTTTCGGGAACTTATAGTTCGGAAGATGGATCTGTTCGTACGGCTTCTTACAATACGTATAGTTTTAGAGCAAATTTGGATGTAAAAATTAATAAAATGGTGAGTTTTGGTATGGAGCTTAGCCCTTATTTTGCAAAAAGGAGAGATGCGGGTTCTACCATGAATAATTTGTCAAAGTATCCGCCTTTTGTAAGTTCAAAAAAAGTAGATGGTTATTATCCCAAGGCGACAAATTATATCGCAACAGGTTTTTCTAATCAAGCCAGTCCTTATACGCTTTTATATGGAAAAAAGGATTATACTAACGCTTTTACAAATTTAGCTCGCGCTTTTATTAACGTTTCTTTATTGGACGGATTAAGCTTAAAAACTTCCATCGCCACTAATCTGGATTTTAGTACTAATAATGTTTTTACTGGAGGATACGGGGACCCCGCAGTTGCAACAAGTGGAAGTGTTAGCCAGTCTCAAGGAGTTAATGTAATTAATGAAAATGTTTTAAATTATATTAAAACAATAAAACAAGTACACGATATAAGTGCAATTTTAGGGGCTTCTTACCAGGAAGATAAATCACAAAATTCTTCAATGGCTGCTGTTTCCCGCTCTTTTAATAATGAAATAGTTCAGACATTAAATAATGCTATTATTAATCCTTCCGCCTCTACCCAAACTAAAACGCAGTGGGGATTGATATCTTATTTTGGCCGGGTGAATTACGGGTATAAAGATAAATATTTACTTTCTGCTTCTTTCCGTACTGATGGGAGTTCCCGTTTTGGGGCAGATAATAAATGGGGCAATTTTCCATCCGTATCGGCTGCCTGGCGGGTATCGAAAGAAAAATTCATGCAGAATGTTTCTTCAATAAGCGAATTAAAACTAAGAGGAAGTTATGGTGTTACAGGTAATTTTAATATTGGTGATTTCCAGTATTTAGGTAAAGTAGGAAATATACTTTATTCTCCTAATAATCAAACAATTAAGGGCACTGCTCAAACTTCAATAGAAAATCCAAACTTATCATGGGAAAAGTCAAAAGGCTATGATTTAGGGATTGAGTTAGGCCTATTTGCCAATAGGCTGAATGTTAGTTTTGATTATTACAATAAAATCACAAGCGATATGCTGTATGCTGTAAATGTACCAGCGATTACTGGCTTTACCAGCAATATTGAAAATTTAGGTTCAGTAAAAAACCAGGGAGTAGATGTAGAAATAACTACGAGGAATATGATAAATTCATTTAAATGGAATACCTCTTTTAATTTTTCTACCAATAAAAATACGGTACAAGATATAGGAGGGGTTGACGAAAGGATTTACACAAAAAGTTCGATGAGTTGGATATTGAGGAAAGGGGAACCCATGTTTTCTTTTTATAGCTATAAGATGATTGGAGTATTCCAAAATGCAGACCAAATAACACAGTTGCCTCATTTAGCTGGTACCAAGCCGGGAAACCCTATTGTAAAGGATGTAAATGGTGATGGAAAAATTGATCCGAACAATGATATGGTGATATTAGGAAATTTTCAACCCAAAGTGTTATTAGGTATGTCTAATGATTTGTCGTGGAAAAAGTTTGATATGAGCGTATTTGTTCAGGCTTCTTTGGGAGGCAAGATATTTAATTACGAGCAGCAATATTATGAAGGGAATACCATGGGTGCGATGCGTCGGTCGCTGGCTATAAACCAGTGGTGGTCACAGGATGAGCCAGGCGATGGTAAAACTCCAGCCGCAGCCCTCTCGCAGTTATCCGCTTTTAATGCAAATACCAATTATTATATTGAAGATGCATCGTATTTGAATTTCAGAAATATCAACCTAGGATATAATTTATCAACGCTTGTAAAAACTACAGGTATTAGAAGTTTACGGGTATATACTTCTGTAGCTAATTTGCTGATTATTAAAAATAAAGAGAATCATGCCTATAATCCTGACGGAGCTACAGGAGGGAGCGTTTCAGGAATAAACAGTACACCCGGATACAACGTTGGTACCGAGCCTATTAACAGAACTATTGTATTTGGTGTTAATGTTGGATTTTGA
PROTEIN sequence
Length: 1136
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