ggKbase home page

scnpilot_p_inoc_scaffold_605_28

Organism: SCNpilot_P_inoc_Flavobacterium_40_86

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(27973..35781)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Conserved repeat domain protein n=1 Tax=Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101) RepID=A5FE73_FLAJ1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 45.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2010
  • Evalue 0.0
  • rbh
Strain DSM 12611 Contig12, whole genome shotgun sequence {ECO:0000313|EMBL:KIO51914.1}; TaxID=37752 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacteriu similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 46.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2211
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 45.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2010
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Flavobacterium hibernum → Flavobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 7809
ATGAATTGGAATTTTACTCTGAAAAAATGTTTTAAAAGGCTCTACCTGCTTTTTTTAATGTTTTTTCTCTTCGTTCATGTTGATAGCAGCGCACAGGTATCGTATGTGTATGCCAATCAACTTTTGGCTAATAATAGCCATGTAGCTGCCCCCGGTAACGCGGTTTCAGTGAGTACTACCGATTATGCCACGTTGGAATCTTATGGTGGTATTGCTATTAATTTAGGTTCCTATACCGGAAGAATAGAACTGGGTTTCCCGTCTACGGTACCGGCAGGAACAACTTCCTATATCAGAATCCAGACCGATAACACCCTTTTAAACACCTTATTAGGAGGTGGTTTAGGTGGTGCTCTGGCTAATTTGACAGGAACACTGGCCCTGGGAAATCACTACTTTAATGTTAATGTCAAACAAACAGGAAATGCGACCCCGGTATTTTCTGCTTCTTCGATTAATGGTTTTGCCAATGAAAGTGCAAGACTTGTTTATGATGTCAATGGTAATTATTACATTGCAGTAACACCCAATGTGAGCTATAACAGTATTGAAATTGAGGATTTAACGAACACCTTGTTGCTGGGTACAATCAATACCATGAGAGTGTACAGTGCGTTCTATTTTTCAGGCAGTGATGTTTGTAATCCGGCATTTACCACTTCTTTCGACGGTACCGGAGGTACTGTAGATATCTTAGGGGTTGGCGGTGCAGGTGTAGCAGATCCGAAAAATGCCATTGATACGGATAACAACAGCTATTCCATGGTAAGTATGGGAGCGCTGACCGTTGCAGGAACCATAAGTCAGACAATTTATTTTGCAACGCCGTCCAGTACTACAGACCAGTTTCATTTAACCCTGCAGCTGGATGATCCTTCATTATTGAATTTAGGTGTATCAGACGGTATAAAAATAGAAGCGCTGCTCGGGCAAAATGTAGTCTATTCGACCGGATTAGGTGCATTGCTCAACGCAGATGTTTTGGGACTGCTCAGTGCCGGACAGAAAACCAATGTTTCTTTTTCTCCCGGACAGTCGTTCGACAGGGTTAAGGTGACAATCTCCTCACTGGTACAGTTAAACGTGACCAAAACGGTCAAAATATTTAATGTATATCGTTCTCCGGCTAAGCCTGATGTAACTTCTGCGAACCAGAATCTGGCCATTTGCAGCGGTCAGCCGGTATCTTTAACGGCTACTACCGCTTCCACAAATCAATTGCTCTGGTATAACAGTCTTACCAGTACCGCTCCGGTAGCGACTACGGCCTATAACGTACCTTATCTGATTTCTAACGTGTCTGCAACAGCAACCTATTATGTTGCGGCAAGACAAATAGGCTGTACCGCTGTTTCAGAAAGGGTTCCGATTACGATAACCGTTTCGTCCCTTCCGATAGCAACAGATATAACCATCAATGCAAATGTAGCCGCTTCCTGTCTGGGTGTTGCTGTTTTAGCACCCACAACAGCTTTGTCTGGCGGTACATTCAAATATTTTACAAATCAGTTAAAAACACAGGAAATTACAACCGGTTTTGCCGGTCATGCGGGAATTACCTATTTAAAAGACCCTGTTACCGGCGCCTTAACGGTTAGCGGGTTAAACGCAACCAATACACCCAGAAGTTATTTTATAGCAGTGGAACTTGCCGGAGCCTGTGAAAATGCAGCGAATACTTTAGCGGAAGTACAGGTTGGTTTGTCTGTTACAACACTTGATGTTCAGACGACCATTTCCGGCTGCGGATTTGTAAACCTTAGAAATGCCATTGTAAATTTTGATACGACCAGCAATACAACATACTCTTTTTTCGATAGCACGAACACCCCTTTAACGCCGGATCAGGCAGCCAATATAACGGTAGGAGGGACATATTATATTGAAGCTTTAAATGCGAGTAGTACCTGCCCGTCTGAAAGAAAAGCGGTAGTAGTAACGGTAAATCCGTTACCGCAGTTGCAGGTAGTGCCGTTAACCTATACGGTGAATCTTGGCGATTCGGTAACCTTACTGTCAACATCCAATGCAACCGTAACCTGGTTTGACCAAAACGGTGTTGCTTTAGCGGCTAACGTAGCCGGACCGTTTACAACAGCCGGTTATTATACTTTTACGGCTGTGGCCAATAACGGACTGTGTGCGGTTAATATCTCCGTAACGGTTAACGTTATTGATCCTTCCAACTGTCCGCCGTTTATGGATAGGGTGTATGCCAATACACAAAGTTCCGGTTCGATTATTACAGGTGGTGTTATGAATGGCGGTTCGGCAATCGATCAGAACCCGCAGTCATTCTCAACCATTACTACCGGTATCGGACTTTTGGGCATCGGGACCACCTGGCAGAATCTGCAATGGAATACGACTATTCCGGCAGGTACACCGGTTACCATTAAAGTGGGTACGGAATACAGCGGCTTAACGCTGTTGGGAGCCATTACGATTATCGGTACTAAAAAAGACGGTTTGGGCAATCCTGTAGATATCGGAACCCTGCAACCGCTTTCGGCAAGCTTGCTGAACTTATTACCGGGAGAAAACAGTTTTGAATATACTTTTGTACCGTCCAATACTACCGGACCAAAAGCGTATGACGGAATACGAATTGTTATCGGCTCTATATTGAGCGTGGCGCAAAGTGCCCGTATTTATGAGGCCTATTATGCAAAAGTTTCCAATCCGGTGGTTTGTCAGCCGGGCGATGTGGAAGACGTATTTTATGGTAATATCGATTTGGGTATCGGCGCTTTAACGAGTACCGTTGGAGTAACCAATGCCTGGAATGCCGTTGATAACAGTGAAACTACATTTGCTACGATGTCCAGCGGTGTAGGTGTTTTGGCAGCGGCAGAGATGACCGTGAAATTCAGAAGTCCGTCACAGGAAAATGATGTTATCAAAATCAGAATTTCCAAACCGGGAACCTTATTGAATGCAGGGCTTTTATCCGGTTTGAATATTCAGCGTTATATGGGGAATAACCCGGTTGGAGGAGCGTTGGATACCAGCAGTTCCGTACTGTTGGTACAGCTGCTTAACGGCGGAACAGAAGCTGTGATCATTACCAATGCACAGTCGCCGGCATACGACCGCGTTCGTATCAGAATGGGCGGTGTGGCAAGCGTATTGAATAGTTTACAGATACATTCCGTTACAAGAGAAGCAGCTGTTGACGTAGTAGACAGCGGCGGCGACAGAATAATAGAAGTATGTTATGGTGATCTTGTGAGCATTGCTCCTCAGAATTGTACCACATTTAACTGGTATGATGCGGCAACAGGAGGCAATCTGATCACCAGCGGAACGTCCTATACGGTGCCTTTCAGTTTAGCTGTGGGAACGCATGTCTTTTATCTGCAGCCTGTGAGAAGCGGTTGTGAAGTGATGGCCAGAACGGCGATAACACTGATTGTGGGACCTACCTCGCCACAGACTTCGATTACCGGTATTTTAATTAATTCCGGGAATAACACAACATTGTGCGCTCTAGGCGGTGCGGTTACCTTAACAGCACAGTTAAACAGTACTCCGGCGGTAACCAATCCGGTTTATTACTGGTATAGTTTTAACGGAACGGTTCAGACCCTGATTCCGGGACAAACAACCAGTACGCTTTCGTTAACAGGATTAACTCCGGGAACACACACCTATTATGTGGGTGTAAGCTCCGATCAGTTTTGTGAAACGCTGCCGGCAGACAGAATTTCGGTTACGTTCGTAATATTACCGCCGTCAGTAGCTACGGATATTACCGTGAGCGATGTTCAGACCTGTATGAGTAATCCGAATCCGGTTAGCATTCAGCCAACCACGACGTTAACCAATCCGGTTTTTGCCTGGTATTTTACAAATGATATTACGCAACCAATAACCAACGGAACCGTTGGCGGTGTAACCTATGCCATAGCGGCAAACGGTACTCTGACGGTAACCGGTTTAACCACAACAAACAGCCCGTATACCTATTATGTAGCGGTGTCGGGCAATACTACCTGCCCGAATTTACCGGGAACCTTACAGGATGTGGTTGTTAATATGGGCGATGCACCAACGCCAACTACCGATGATACCACTCAGGATTTTTGTAAAGTAGATAATCCGATAGTAGAATCAATCATCGTTAATGAAGCCGGCGTAATCTGGTATAGTGTACCGACAGGCGGAACGTCATTGGCTTCCACAACGCCATTGGTAACCGGAACCTATTACGGAGCCTTGCTGAATGCCGTTTCTGGTTGCGAAAGCTCGGTACGCTTAGCGGTTGCGGTTCAGGTAAACGATGCGCCAACGCCAACAACAAACGATACCACTCAGGATTTCTGTAAAGTAAATAATCCGATTGTGGAATCAATCATCGTCAATGAAGCCGGTGTGATCTGGTATACTGTGCCAACCGGCGGAACGCCATTGGCTTCGACCACGGCATTAGTAACCGGAACCTATTATGGTGTACTGGTAGATGCTGTTTCGGGTTGTGAAAGCTCGGTACGCTTAGCGGTTGCCGTTCAGGTAAACGATGCGCCAACGCCAACAACGAACGATACAACACAGGATTTCTGTAAAGTAAATAATCCGATTGTAGAATCAATCATCGTCAATGAAGCCGGCGTGATCTGGTACAATGTACCAACCGGTGGCACGCCGTTAGCTTCGACCACAGCATTAGTAACCGGTACCTATTATGGTGTATTGGTAGATGCTGCTTCCGGTTGTGAAAGCTCGGTACGTTTAGCGGTTGCCGTACAGGTAAACGATGCACCAACGCCAACAACAAACGATACGACCCAGGATTTTTGTAAAGCAAATAATCCGATAGTGGAATCAATCATTGTAAATGAAGCCGGTGTAATCTGGTACAATGTGCCGACAGGTGGAACGCCATTAGCTTCCACAACGCCATTGGTAACCGGAACCTATTACGGTGTATTAATCGATGCTGTTTCGGGCTGTGAAAGCTCGGTACGCTTGGCGGTTGCCGTTCAGGTAAACGATGCGCCAACACCAACAACGAACGATACGACTCAGGATTTCTGTAAAGTAAATAATCCAACGGTGGCTTCGATCCAGGTAAATGAAACCGGAGTGATCTGGTATACTGTACCAACCGGCGGAACGCCATTGGCTTCCACCACGGCATTGGTAACAGGAACCTATTATGGCGTATTGGTAGATGCAGCTTCCGGCTGTAAAAGCTCGGTACGCTTAGCGGTTACCGTTCAGGTAAACGATGCGCCAACGCCAACAACAAACGATACCACTCAGGATTTCTGTAAAGTAAATAATCCAACGGTGGCTTCGATCCAGGTAAATGAAACCGGAGTGATCTGGTATACTGTACCAACCGGCGGAACGCCATTGGCTTCTACCACTGCATTAGTAACGGGAACCTATTATGGTGTATTGGTAGATGCGGCTTCAGGCTGTGAAAGCTCAGTACGCTTAGCGGTTGCGGTTCAGGTAAACGATGCGCCAACGCCAACTACGAACGATACCACTCAGGATTTCTGTCAGTCGGCAAATCCAACAGTAGCGTCCATTCAGGTGAATGAAACCGGAGTGATCTGGTATACTGCGCCAACAGGAGGTAGTGTTGTAGCTTCGACTACGGCGTTAATCAGCGGAACAACCTATTATGGCGTATTGGTAGATGCCGCTTCGGGTTGTGAAAGTTCCATTCGTCTGGCTGTTACGGTTCAGGTAAATGATGCCCCAACGCCAACAACAAACGATACTACCCAGGATTTCTGTCAGTCGACCAATCCAACGGTAGCGTCCATTCAGGTAAATGAAACCGGTGTGATCTGGTATACTGCACCAACCGGCGGAACACCATTGGCTTCTACCACGGCATTAGTAACGGGAACCTATTATGGAGCATTAGTAGATGCCGCTTCGGGCTGCGAAAGCTTGGTACGTTTAGTCGTTGTGGTTCAGGTAAATGATGCCCCAACGCCAACAACAAACGACACCACTCAGGATTTCTGTAAAGTAAATAATCCAACGGTAGCGTCCATTCAGGTGAATGAAACCGGAGTGATCTGGTATACTGCACCAACAGGAGGCAGTGTAGTGGCTTCGACCACACCATTAGTAACCGGAACCTATTACGGAGCATTAGTAGATGCGGCTTCCGGCTGTGAAAGCTCAGTACGCTTAGCGGTTGCGGTTCAGGTAAGCGATGCCCCAACGCCAACAACAAATGATACAACACAAGATTTTTGTACACAAAGTAATCCAACAATAGCGTCCATCCAGGTAAACGAAACCGGTGTGATCTGGTACAATGTACCAACCGGTGGCACGCCATTAGCTTCGACCACACCGTTAATTAGCGGAATAACCTATTACGGTGTATTGGTGGATGCGGCTTCCGGATGTGAAAGTTCTATTCGTCTGGCGGTAACGGTGACTATTAACAATACCCCAACACCAACAACGAACGACACCACTCAGGATTTCTGTAAAGTAAACAATCCAACAGTAGCGTCCATCCAGGTGAATGAAACCGGAGTGATCTGGTATACTGCTCCAACAGGAGGTACTGTTGTTACGGCTGCTACGGCACTAACCAGTGGTATGACCTATTATGGAGTAATTGTAGATCCGGTAACCGGCTGTGAAAGTGCTGTTCGTCTGGATGTTACGGTTCAGGTTAATGATGCGCCAACACCAACTACTAACGATGCGGTACAGGAATTCTGTCCGACGGCTAATCCTACAGTGGCTTCCATTCAGGTAAACGAAGCCGGAGTGATCTGGTATAACGTTCCTGCAGGCGGAACGCCGTTAGCATCAAATACGCCTATAACGGCTGCCGGAACATACTATGGTGTTTTAGTGGATCCGGTTTCGGGCTGTGAAAGTTCGATTCGTTTAGCCGTTGCGGTTCAGTTCTACAGCGGATCACAGGCAACTTTGAGCGGTGGTTCGGCTACCGTATGTCTTCAGGATCAGGTGACCTACACTACAAACGCCGGTATGACCAACTATGTTTGGACGGTTGGTAACGGCGGACAGGTTGTGAGTGGCGGCGGAACCGCAGATAATACAATCACGGTTGTCTGGTCGCAGGTAGGAGCCAATTCGGTTAATGTTAGCTATAACGATGCAAATGGCTGTACCGTTCTTAGTCTGGCAACCCTGAATCTGAATGTGTCCAACTGTTCGGATATTACCATTACGAAAACGGTAGACAATCCTGCACCATTTATTGACGATAATGTTGTATTTACCATTACGGTAACCAATACAGGACAGGCACAGTTCCAGAATGTTGTGGTTAATGAAGTGATTCCGAGCGGATATTCCTTTGTGAGTATGGTCGTTTCAAACGGAACCTACAATAACAACACCGGAATCTGGACAATCCCGGCTTTAGGACCAAATCAGTCTGCAACATTAGCGATCACTGTAAAAGTTTTATTCTCAGGCGATTATTTAAATACAGTAACGATAGCAAGTTCCGACCCGGTAGATGCCGATGTTAATAATAATACGGCAAGTGCCTCTGTTGAACCGATGTGTTTGGTAGTTTATAACGAGTTTACTCCAAATGAGGATGGCTCTAACGATGTTTTCACCATTAAATGTGCCGAACATTTCCCAAATAACACATTGGAAATCTTTAACAGATATGGAAATCTGGTATACAAAACCAGAGGCTATCAAAACGACTGGAAAGGCGTTTCAAATGTAAACGGAACTTTTGACGGAACTGTTTTACCAACGGGAACTTATTATTATGTTTTTGATACAGGAGATAATTCCGGTACTGTTAAAACCGGATGGGTATATATCATGAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 2603
MNWNFTLKKCFKRLYLLFLMFFLFVHVDSSAQVSYVYANQLLANNSHVAAPGNAVSVSTTDYATLESYGGIAINLGSYTGRIELGFPSTVPAGTTSYIRIQTDNTLLNTLLGGGLGGALANLTGTLALGNHYFNVNVKQTGNATPVFSASSINGFANESARLVYDVNGNYYIAVTPNVSYNSIEIEDLTNTLLLGTINTMRVYSAFYFSGSDVCNPAFTTSFDGTGGTVDILGVGGAGVADPKNAIDTDNNSYSMVSMGALTVAGTISQTIYFATPSSTTDQFHLTLQLDDPSLLNLGVSDGIKIEALLGQNVVYSTGLGALLNADVLGLLSAGQKTNVSFSPGQSFDRVKVTISSLVQLNVTKTVKIFNVYRSPAKPDVTSANQNLAICSGQPVSLTATTASTNQLLWYNSLTSTAPVATTAYNVPYLISNVSATATYYVAARQIGCTAVSERVPITITVSSLPIATDITINANVAASCLGVAVLAPTTALSGGTFKYFTNQLKTQEITTGFAGHAGITYLKDPVTGALTVSGLNATNTPRSYFIAVELAGACENAANTLAEVQVGLSVTTLDVQTTISGCGFVNLRNAIVNFDTTSNTTYSFFDSTNTPLTPDQAANITVGGTYYIEALNASSTCPSERKAVVVTVNPLPQLQVVPLTYTVNLGDSVTLLSTSNATVTWFDQNGVALAANVAGPFTTAGYYTFTAVANNGLCAVNISVTVNVIDPSNCPPFMDRVYANTQSSGSIITGGVMNGGSAIDQNPQSFSTITTGIGLLGIGTTWQNLQWNTTIPAGTPVTIKVGTEYSGLTLLGAITIIGTKKDGLGNPVDIGTLQPLSASLLNLLPGENSFEYTFVPSNTTGPKAYDGIRIVIGSILSVAQSARIYEAYYAKVSNPVVCQPGDVEDVFYGNIDLGIGALTSTVGVTNAWNAVDNSETTFATMSSGVGVLAAAEMTVKFRSPSQENDVIKIRISKPGTLLNAGLLSGLNIQRYMGNNPVGGALDTSSSVLLVQLLNGGTEAVIITNAQSPAYDRVRIRMGGVASVLNSLQIHSVTREAAVDVVDSGGDRIIEVCYGDLVSIAPQNCTTFNWYDAATGGNLITSGTSYTVPFSLAVGTHVFYLQPVRSGCEVMARTAITLIVGPTSPQTSITGILINSGNNTTLCALGGAVTLTAQLNSTPAVTNPVYYWYSFNGTVQTLIPGQTTSTLSLTGLTPGTHTYYVGVSSDQFCETLPADRISVTFVILPPSVATDITVSDVQTCMSNPNPVSIQPTTTLTNPVFAWYFTNDITQPITNGTVGGVTYAIAANGTLTVTGLTTTNSPYTYYVAVSGNTTCPNLPGTLQDVVVNMGDAPTPTTDDTTQDFCKVDNPIVESIIVNEAGVIWYSVPTGGTSLASTTPLVTGTYYGALLNAVSGCESSVRLAVAVQVNDAPTPTTNDTTQDFCKVNNPIVESIIVNEAGVIWYTVPTGGTPLASTTALVTGTYYGVLVDAVSGCESSVRLAVAVQVNDAPTPTTNDTTQDFCKVNNPIVESIIVNEAGVIWYNVPTGGTPLASTTALVTGTYYGVLVDAASGCESSVRLAVAVQVNDAPTPTTNDTTQDFCKANNPIVESIIVNEAGVIWYNVPTGGTPLASTTPLVTGTYYGVLIDAVSGCESSVRLAVAVQVNDAPTPTTNDTTQDFCKVNNPTVASIQVNETGVIWYTVPTGGTPLASTTALVTGTYYGVLVDAASGCKSSVRLAVTVQVNDAPTPTTNDTTQDFCKVNNPTVASIQVNETGVIWYTVPTGGTPLASTTALVTGTYYGVLVDAASGCESSVRLAVAVQVNDAPTPTTNDTTQDFCQSANPTVASIQVNETGVIWYTAPTGGSVVASTTALISGTTYYGVLVDAASGCESSIRLAVTVQVNDAPTPTTNDTTQDFCQSTNPTVASIQVNETGVIWYTAPTGGTPLASTTALVTGTYYGALVDAASGCESLVRLVVVVQVNDAPTPTTNDTTQDFCKVNNPTVASIQVNETGVIWYTAPTGGSVVASTTPLVTGTYYGALVDAASGCESSVRLAVAVQVSDAPTPTTNDTTQDFCTQSNPTIASIQVNETGVIWYNVPTGGTPLASTTPLISGITYYGVLVDAASGCESSIRLAVTVTINNTPTPTTNDTTQDFCKVNNPTVASIQVNETGVIWYTAPTGGTVVTAATALTSGMTYYGVIVDPVTGCESAVRLDVTVQVNDAPTPTTNDAVQEFCPTANPTVASIQVNEAGVIWYNVPAGGTPLASNTPITAAGTYYGVLVDPVSGCESSIRLAVAVQFYSGSQATLSGGSATVCLQDQVTYTTNAGMTNYVWTVGNGGQVVSGGGTADNTITVVWSQVGANSVNVSYNDANGCTVLSLATLNLNVSNCSDITITKTVDNPAPFIDDNVVFTITVTNTGQAQFQNVVVNEVIPSGYSFVSMVVSNGTYNNNTGIWTIPALGPNQSATLAITVKVLFSGDYLNTVTIASSDPVDADVNNNTASASVEPMCLVVYNEFTPNEDGSNDVFTIKCAEHFPNNTLEIFNRYGNLVYKTRGYQNDWKGVSNVNGTFDGTVLPTGTYYYVFDTGDNSGTVKTGWVYIMR*