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SCNpilot_BF_INOC_scaffold_17_161

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Clostridium_37_18

near complete RP 48 / 55 MC: 5 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 14 / 38 MC: 4
Location: 166403..169459

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Nodulation protein NolG {ECO:0000313|EMBL:KDR95784.1}; TaxID=1121324 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" source="[Clostridium] litorale similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 42.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 833
  • Evalue 3.60e-238
Predicted transporter protein id=2063562 bin=GWB2_Clostridiales_37_7 species=[Clostridium] stercorarium genus=unknown taxon_order=Clostridiales taxon_class=Clostridia phylum=Firmicutes tax=GWB2_Clostridiales_37_7 organism_group=Firmicute organism_desc=Good + similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 42.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 812
  • Evalue 3.60e-232
mdtC; multidrug resistance protein MdtC similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 40.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 797
  • Evalue 5.80e-228

Lists

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Notes

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Taxonomy

[Clostridium] litorale → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3057
ATGCTAGGGAGGCAACCAATGAATAGATTAATAAAAGCTGCCATTACAGAGAGAAAGGTGACCTTTCTTTTGGCAATTATGATCTTTTTTTACGGTATGTATTCCTATTATTTTATTCCTAAGCAAGAGAATCCAGATACTTCAAGTCCAGCAGCACAGATCGTAACCATCTATCCAGGTGCGACTGCTAAAGAGGTCGAAGAACAGGTTACAATAAAAATTGAAGATGAGCTCTCGGCATTAGATGGTATTGAAAACATCGTTTCCTACTCAAATCCAAATGTTTCGGTCGTCATCGTCACACTGAATTATGAAGTTGATTATGATGAGCAATGGGCAAGAATGCGTGTTTTGCTTGATAAAGTAAAGCCTGAGCTACCATCAAATGTATATGATTATCAAGTTGAAACTGAGCTAACTAAGTCAGCAGGTATCATTTTAAGCTTATCTGGTGAGCATTACACCTATGAGCAGCTTGCCGATTATGCAGAAGCTTTTAAGTCTGAGCTGAGTTCGGTTGATGGTGTCTCTCGAGTCTATGTGGAGGGTGCTCCAGATAAGGAGCTAAAAATTAATCTACATTTAAATCAATTAAATCAGCTCCCCTTGTCTATAAAAGATGTTTTTGATTTGATATCTGCACAGACTGTAAATATTCCAGTTGGAGAGTTAGATACTGCCTATGGTGCAATAGGAGTAAAGCATAATATAAAAAATGATCAAAAATCAGCTTATGAGTCAATGATCGTGTATGGCTCTTCCGACTCGGGGAGTATGATTAAGCTAGGTGATATTTCAGATATAGAAATGGGCTATGCGAGTAATCAACACAGCTTTAAGCATGGTGAAGACAACGCAGTGCTAGTGACAGTTTATTTTGATGCCAATCAAAATGTCATTTTAATTGGTGATGAGGTTAGAGCTGTTATAGATAGTAAAAAGAGTCAGTTTCCATCAGATTTAAAAGTGAGTGAAGTATTGTTTCAACCGGAAGAGGTCAGTCGATCCATAGACGGTTTTTTAATTAACCTACTTCAAGGAATTGGCTTTGTTGTCATCGTTGTTTTAATTGGAATGGGCTTTAGAAATGCTTTTGTAGTATCGGTTGCAATTCCACTGTCTGTAACAATGACCGTTATTATGATGAAGCTTATAGGCGTTGACATACAACAGATGTCAATTGCTGCTTTGATCATTGCTTTAGGGATGCTCGTAGACAACTCTATCGTAATAAGTGATGCAATTCAAATAAAGCTGAACGAAGGACTACCAATAACTCAGGCCTGCTACGAAGGGACAGTTGAGCAAGCAATTCCCGTACTAACCTCAACCTTGACAACAGTCGTCGCATTTGCGCCATTAATTATTTTACCAGGTGAAGCTGGCGAATTTGCAAAATCTTTACCTCAGGTAGTCATTATTGCATTAATTGCTTCATATATTGTCGCAATGTTCGTGACACCAGCATTAGCGAGTCTAGTGTTTAAGGCGAATAGAACCTCTCAGTATGAAAAGCATCGATTGAGAAAGATTTTTGAGTCAGGCCTAAGAGGCTCAATGCGTATGCCAAAGTTTTCTTTATTCATTATTTTGATGATTTTGGCTGCCACTGTCTACGGCGCAACCCTATTGCCAATTGAGCTCTTTCCATACACAGATAAGGATTTAATTTACATTGATGTTTTTTCTGAAAAGAAAGGAGATTTGGCGTATACTCAATCTCTATCGGATGAATTATATGCCATATTAGTAAAGGAACCGGGCATTACGGATATTAATGCTTCAATAGGTGGTGGATTCCCTAAATTTTACCTTACAGTAGGGGTAAGACCTGAGTCAGCAGATTATACTCAAACACTGATTACTTTTAATCTGAGCCAAACTGAGGGCTATGACAGTAGAGAAGATTTTGCCTATCATCTACAAACACTTTTAGATGAACAGCTAAAGGGGGGATTTGCAACCGTAAGCTTATTAGAAATCAATCAGCCTGGTCCTTCTTTGGATATTCGTGTCTCAGGAGAGTCTTTAGACGACGTTAGTAAGGTTTCCGACGATATTTATGGCGCTTTGCTCGCACGAGAGGAAACGATTAATGTTCAAACGGATAGCGCAAGCTACAGATATCAATATCAATTGGATGAAGATCTGTCAAAAATGAGTCAATTTGGTTTAAATGCTTATGATGTACAATTACAAACCGCACTGGCTGTAAACGGTATGACGGTTGCAAGTATTCCTTCAGATAAACCAATATCAGTAGTGCTAAAAGGTGATATAAGTACCATTACAGATTTGGAGAATTTTTCGATTAAATCGAGTGCAACTGGCGAAAAAACACTGATGAAGCAGTTTTCAAGTGTTTCACTAAAAAGTGAACTCAATACGATTAAGCGCTATAATCGACAGCCTTCAGTTTCAGTCAGTGCAAATGTGACGCCAGGCTACTCAGTTGGAGAGCTACAAAGCTGGGTTCAGAATTCTTTAATACCTTCAATTGACGTTGAAGGCGTCCAAATTAGCTATGGTGGCGATCAAGAAATCTTTGATAAATACATTTCTGGTTTATTAGGCGCAGCAGCTGTAGCAGTCGTGATTATTTATATTATTCTGCTCATACAATTTAACTCTTTGCAGCAGCCATTAATTATTTTAATGACGGTACCGCTCTCTATTATTGGATCGGTGGTTTCACTCTTGATTTTCAAGCAAAGTGTAACCTTTACAGTTGGATTAGGGGTTGCCAGCTTAATAGGGGTAGTTGTTAATAACGCAATTTTATTGATTGAGTACATCAATAGAGAACGCAAATTAGCACATGACGTCTATAACTCATGTTTAAACTCAGTTGGAAGAAGGTTTAGACCTATTATGCTCAGTACCATTACCACAGTTATTGGCCTGGTTCCTATGGCGCTCTCAGGCAGTTCATTCTTTAGTCCAATGGCAATGGCGTTAATGGGTGGATTAATTGTGTCTACCTTGTTAACGTTAATCGTTATTCCGTTGATTTATTATCAGCTTCATAAACGTGAAGATATAAAAAATGTTGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1019
MLGRQPMNRLIKAAITERKVTFLLAIMIFFYGMYSYYFIPKQENPDTSSPAAQIVTIYPGATAKEVEEQVTIKIEDELSALDGIENIVSYSNPNVSVVIVTLNYEVDYDEQWARMRVLLDKVKPELPSNVYDYQVETELTKSAGIILSLSGEHYTYEQLADYAEAFKSELSSVDGVSRVYVEGAPDKELKINLHLNQLNQLPLSIKDVFDLISAQTVNIPVGELDTAYGAIGVKHNIKNDQKSAYESMIVYGSSDSGSMIKLGDISDIEMGYASNQHSFKHGEDNAVLVTVYFDANQNVILIGDEVRAVIDSKKSQFPSDLKVSEVLFQPEEVSRSIDGFLINLLQGIGFVVIVVLIGMGFRNAFVVSVAIPLSVTMTVIMMKLIGVDIQQMSIAALIIALGMLVDNSIVISDAIQIKLNEGLPITQACYEGTVEQAIPVLTSTLTTVVAFAPLIILPGEAGEFAKSLPQVVIIALIASYIVAMFVTPALASLVFKANRTSQYEKHRLRKIFESGLRGSMRMPKFSLFIILMILAATVYGATLLPIELFPYTDKDLIYIDVFSEKKGDLAYTQSLSDELYAILVKEPGITDINASIGGGFPKFYLTVGVRPESADYTQTLITFNLSQTEGYDSREDFAYHLQTLLDEQLKGGFATVSLLEINQPGPSLDIRVSGESLDDVSKVSDDIYGALLAREETINVQTDSASYRYQYQLDEDLSKMSQFGLNAYDVQLQTALAVNGMTVASIPSDKPISVVLKGDISTITDLENFSIKSSATGEKTLMKQFSSVSLKSELNTIKRYNRQPSVSVSANVTPGYSVGELQSWVQNSLIPSIDVEGVQISYGGDQEIFDKYISGLLGAAAVAVVIIYIILLIQFNSLQQPLIILMTVPLSIIGSVVSLLIFKQSVTFTVGLGVASLIGVVVNNAILLIEYINRERKLAHDVYNSCLNSVGRRFRPIMLSTITTVIGLVPMALSGSSFFSPMAMALMGGLIVSTLLTLIVIPLIYYQLHKREDIKNVE*