ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

SCNpilot_BF_INOC_scaffold_72_142

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Bacteroidetes_37_82

near complete RP 52 / 55 BSCG 49 / 51 ASCG 14 / 38
Location: 170367..175532

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
PKD domain-containing protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_35_15_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 31.5
  • Coverage: 533.0
  • Bit_score: 212
  • Evalue 6.70e-51
Cell wall surface anchor family protein id=1850634 bin=GWE2_Bacteroidetes_42_42 species=Fluviicola taffensis genus=Fluviicola taxon_order=Flavobacteriales taxon_class=Flavobacteriia phylum=Bacteroidetes tax=GWE2_Bacteroidetes_42_42 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=Good + similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 31.8
  • Coverage: 645.0
  • Bit_score: 203
  • Evalue 1.30e-48
psrP1; cell wall surface anchor family protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.5
  • Coverage: 883.0
  • Bit_score: 190
  • Evalue 5.50e-45

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_35_15_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5166
TTGTTTTTAGAAAAATTATACTATATCTTTACCACACCATTTACTCACCGCATGCCCAAGCGGGCTGCTCTAAAAACCTGTGTTATGAAAAACAAATTACAATCTTTAAAAAATGTTAATAATTGGAGGGGGGTAGATCCTACCCGTCAATTTTCATTTCCTCTTGTTTCAACCATTGCTAAATGCTTAATTTTTGGTATCATGGTTTTTTCTACTTTTTTAAACCCAAATGGTTTTGCGCAAACAGCGCCCGATTTAGGTAGTGCCGTCCGGTTTGGTTTGTTGGCTGGTGATTCTATTCGTGCAACCGATACCGTAAAAGTTTTTGGCAATGCCGGAGCATTAAATGCCATCAACAGTAAAGTAATGGCAGATAGTGTTTTTGTATCGGGTACAAAAATCACCGTTGCGCTGTCTGATATAAATACTGCCCAAGCCTTTATGGCAGCACAAAGCGGCACAAGTATCAGCGGCTTGCTGGGCGGGCAAACTTTAAATGCCGGAGTTTATACCATTTCCGGTGATGCTGTGTTAAGCGATACTTTAACCCTGCAAGGCGATACAGGCTCTGTTTTCATTTTCAATATTGGGAGCAACCTGAATATAGACAGCCATGCAGTTATTTATGCTAAAGGAAAAGTAAATGCCAAAAATATTTATTGGAATGTAGCAGGAAATGTAACTATTGGCAGCAATAGTTTTTTTAGTGGTATTGTAATTTCCGGCAGCAACATAAACATAAAAGGAAAGTTTGTTGGAATGTTGGCTTGTTTTGCTACCAATAATATTGATTTTAAAGGAAAGCATAACCCGATGCCGCTCCCGTATTTTAGCTTAGTGAACGGCTGTGTGGTAAAATCACCGGCAAATTTTAATAGCGCAGCAAGGGCAGATTGTGCCGCACCGATTGCAACTTGCGGTGATGCCATAACCAATGGCAATTTAGAAGCCTATTATACAGAACCTCCTTATTATATGTGCAATGAAGAGGTTAATACTACCGGTGGCTTTGCAGCCTGCCAATGGGATGCCCTGCCCTATTTACATGGAACAATAACTCCCGATTATTTCAACACTTGTGTGGAAGGTAGCACAACAACGGGTATTCCTCTTAACGCTTATGGAACACAGATGCCACATTCAGGGAATGGCTATGCGGGTTTGTTTTCCGGGCAAAGCCCTAATTATGTAGAGGAAGGCATATTGCATAATATAGGAGGAATGACAGCCGGAAGAGTTTATGTATTTGAAATGTATGCCAACCTTGCCGAAAGTTCCAAATTGGCATCATCTATGGGTTTTCAAATAAGGGATAGTTCTATGGTAACAACTTTTTCGTATTATCACCCTTCAGCCATAACAGATAAAGCCAATTGGACACCAATAACAACCTGCTACACCGCTACGGGTACGGAAATGATGATATGGGTATCATCTCATGTTGTTGATTACCAGCAAGTGCCTACTGTAAGTGTTCCATCCGGTCCGGGTACCTATCCATATTCATCAACTTGGTTTCCGTTTGCATATTACTATATAGACGATATTTCCCTCCGCCCTTTAGCAGTTGCCGGAGGCAATAAAACCATTTGCGGGTTAAGCACTAATGTGGGTGATGCTGTTTGTGCCATTTCCGGTGCAAGCTATCAATGGACAAAAGTAAGTGGTCCGGGCACGGTAACTTTTGTCAATTCCACTTCTGCCAATACCAATGTAAGTTTTTCACAGTCCGGCACCTATCAGTTAATGCTTAGCGCCACCTTAAACGGCTGCACCGATACCGAAATAATTACGGTTACTGCACAAATTCCGCCCAGTGTAACTATTGTGCCGCCTATTCCCTCAATTTGTTCAGGCAGTTCAGTTACACTTTCTGCTGCCGGAGCTGCTTCTTATCTGTGGTCCACAGGTGCAACAAGTTCATCTATTATTGTTTCTCCCACTGCTGCAACCACATATTCTGTTAAGGGAACAACCAATGGCTGCTCATCAACAGTAAGCGTTACTGTAAATATTAAGGCATTACCAACCGGCTCTATTTCATCAAGTACAAATGTTATTTGTTCGGGAGTTCCATCATCGGTAACATTAACTGCAAGCGGTGGCACAACCTACCAATGGAGTCACGGGCTTGGCACGGGAGCAACAAAAAGTGTAAGCCCTTCTGCCACCACTACTTACACGGTTACAGTTACAAGTGCCAACGGGTGTACGGCAACTGTGGGTAAAACAATTGCTGTTAGCGAAGACCCAATAGCCCTTCTTTTTTCAGACGAAATCAAGGGCGCATGTTTGCATAAGATTACCGCTACCGATTATACAGGCGGCACAGGGACAAGTTATTTGTGGAGCACAGGCAGCACATCAAATCAAATTATTGTAAAACCCAATGCTCAAACCCTCTATTCGGTAACCGTTACCAACGCTGTGGGTTGCACTTCCACCGCATCAGGGCTTTGGAATCGCCCTGAAAGTTGCTGTACCGCAGATAATCCTGCATTAACATTCGATAGCACAATTACTTCCACACAACTGCTTGCACAAGTGAGCAGTATTTTGGGATCTGGCAGCGTATCGGGTACTATGCTCATGTCCGGAGCTAACCAAATTGTTATCAACGGCACACTCAGCCTTAATAGTAATCTCGATTTCTTGGGCTGTACAGAAATAAGATTTGGTGCGAATGGAAATATTAAAACCAATAATTTTAATTTAGGGTGCTACACTTCTACGCTAAAAGGCTGTTCTGACTATATGTGGAAAGGAATAGAAATAAACAATGCGGCAGCACAAGTAACGCTACGCGAATTTTTTGGCGGTAAAACATCGATTTATGATGCAGAGTTTGGAATATTAAATACATCGGGAGGAAAAATACAAACCTTCAATACGGAATTTATCAACGGCTATCGCGGCATTGCCGTGCGTAATGCAATGCCCGCACTTTTTGAGGTATATAACACAGGTTTTTATTCCAACGGTACTTTAAAACTTTCTACTATTTCCAACCCCATTCCTATTATGAATGCAGGTATAGAAATTACCGATATATTCAATACTTCTGCCAACCCAATCACCATAGGCAAAGTATTTTCTACCCGTACCAACTCCAACTACTTCGGTTATGGAAGCGATAACAGTTTGGGTGCGGGTATTGTAATTAAAGATGCCGCGGTGAAAGTGCTTAATTCCGATTTTAGAATTTCCTACACCTATGGTTCCGGATATGTGGGTATCGGTTCCGGTATTCATGCACACAGAACAACCTCCAATACCATGCTCGAAGTGGGAGACGGAACGCCACAAGGCTTAAACAATTTTAAAACAGGCTTGGTGGGCGTTAATCAGGCATTTACCATGAATGTTTCTATCCGTAAAAACTACTTTGAGCGGCTTACCACCGCGTTCTTTGTTTCGTTGTTTAACCATTCTTCCAACATAAGCTTTAACGACAACACGGCTTATTCACCCGGAGTTACGCAGTTTGGTGTATTGATAGGCACAAGCAATAACTCTGTTATAGAAATTCAAAACAACCTGCTTTCTTTCTCAAACGGCAGTGCAGCACAAACCGCTAACTCAACAGGTATAAGCATCAGCAACAGCACCTCTTCTTCTTCTTCGTACCGCATTACTATTGCAAACAATATGCTGCGCCAGGTGGTAAAAGGCATTGCCACCAACAACACCGACCTTCCGCTTATATGGGGCAACGGCATTAACATCCACGCCCGCAACTATTCGTTTTCAAACATAGGCTGGGCAGGTATAGAAAGCACCAGCGATAAGGGAATGAACATTACGCAAAACTATATTGACGTAGAACCTGTGCCTACACCCAATGTTACCTATACCGCCAATAACACCACTACTACAAAAATTATAGGTGTAAACATAAACAGCACCCGCACCAACCCCGCTTATGTGCATTGCGACAGCATACTGAATATGCACTGGGCTTTGGCGGCTACGGGCGCAAACTCCGTGGGCGTGCAGTACAGGCGCAACGCCATGATGATGAACGGAACAAAAGTGGGGCTGGCACTCTACAACCCTACCATTATAGGCAACCAAGGCAGCACCACCGAAACCAACGACAACAAATGGTATGGCACGGTAAACGGAACTACCAATTTCCACTTTGGCTATTTTGCTACGCCCAATGGCAGCCCCATTAGCAGCCAGAAATTCTATTTTAGAAACGGATACGCACTTAACCCCACAAGTTTGGGAGCAGTGAAAAGTGATTTTTGGGGCGTATCCAATACGCCCTTAAGCTATAATTTCACCACGCCCAACAACGGCATTTATTCCTGCTATCCCTTTACCCAAACCCGCAGCGGCAAAATGAGCGAGGAAGATTTGCAGTTTTTGCAGTGGATGGAAACTTTGGTGGGCGATACTTTGGCAACAGATTCGCTGAACCCTTACTTTAACCTGTGGCGCGAGGAGCAGATTATGCTGGCTTTGGAAGAAAACCATTGGCTAAGGGAAGAAAGCAGTATCTTATACGAATATTATTATCAAAATGCAGGCATGGAATCTTTCTTGGCATTGCACAGGCTGCAAAAGCAGGCAGATGCTGCTGCCGACAGTGCAACCGCTTACCGCTTATTAAGTGAAAACGAAAGCATAATACCCACCACAAGACACGAGCAGAATATACAAAAGCTGAATGCCTTAAAACTGCGCCATGCTTTACAACTTTTTACGGGCAATATAGCAGCCTTATACCCCAATGCAACCGATAGTGCGGAGTTGAGGGCACTTGCTGCCGAGTGTTATGTTACGGGCGGACCTTCCATTTTTGCCGCAAGAGCTTATTGGAATGTGGTATATCAAAAAAATGATAACAGCTTCCAGGATTATTGCCTTGAAACTACGGGCTATTACAAAACTGATAGTGTTGCTGGCAAGGGAAACAGCTTAGAATTATTTAAAGTTTTTCCTACTGTTATAGATAAAGGAAACACCCTGAATATTTTATCTTCAGAAATGGGTAAACTCAAACTGTTTGATATTAGCGGTAGGATTATACAGGAAGTTTCTTTTGTAAAAGGAGAAAACAGAATACAACTATTTGAGTTTATATCATCTCAAATAGTATTGTATGATGTTACTATGAGTTCCGGAAAAAAATATAATGGCAAAATTTTTGTAAAATGA
PROTEIN sequence
Length: 1722
LFLEKLYYIFTTPFTHRMPKRAALKTCVMKNKLQSLKNVNNWRGVDPTRQFSFPLVSTIAKCLIFGIMVFSTFLNPNGFAQTAPDLGSAVRFGLLAGDSIRATDTVKVFGNAGALNAINSKVMADSVFVSGTKITVALSDINTAQAFMAAQSGTSISGLLGGQTLNAGVYTISGDAVLSDTLTLQGDTGSVFIFNIGSNLNIDSHAVIYAKGKVNAKNIYWNVAGNVTIGSNSFFSGIVISGSNINIKGKFVGMLACFATNNIDFKGKHNPMPLPYFSLVNGCVVKSPANFNSAARADCAAPIATCGDAITNGNLEAYYTEPPYYMCNEEVNTTGGFAACQWDALPYLHGTITPDYFNTCVEGSTTTGIPLNAYGTQMPHSGNGYAGLFSGQSPNYVEEGILHNIGGMTAGRVYVFEMYANLAESSKLASSMGFQIRDSSMVTTFSYYHPSAITDKANWTPITTCYTATGTEMMIWVSSHVVDYQQVPTVSVPSGPGTYPYSSTWFPFAYYYIDDISLRPLAVAGGNKTICGLSTNVGDAVCAISGASYQWTKVSGPGTVTFVNSTSANTNVSFSQSGTYQLMLSATLNGCTDTEIITVTAQIPPSVTIVPPIPSICSGSSVTLSAAGAASYLWSTGATSSSIIVSPTAATTYSVKGTTNGCSSTVSVTVNIKALPTGSISSSTNVICSGVPSSVTLTASGGTTYQWSHGLGTGATKSVSPSATTTYTVTVTSANGCTATVGKTIAVSEDPIALLFSDEIKGACLHKITATDYTGGTGTSYLWSTGSTSNQIIVKPNAQTLYSVTVTNAVGCTSTASGLWNRPESCCTADNPALTFDSTITSTQLLAQVSSILGSGSVSGTMLMSGANQIVINGTLSLNSNLDFLGCTEIRFGANGNIKTNNFNLGCYTSTLKGCSDYMWKGIEINNAAAQVTLREFFGGKTSIYDAEFGILNTSGGKIQTFNTEFINGYRGIAVRNAMPALFEVYNTGFYSNGTLKLSTISNPIPIMNAGIEITDIFNTSANPITIGKVFSTRTNSNYFGYGSDNSLGAGIVIKDAAVKVLNSDFRISYTYGSGYVGIGSGIHAHRTTSNTMLEVGDGTPQGLNNFKTGLVGVNQAFTMNVSIRKNYFERLTTAFFVSLFNHSSNISFNDNTAYSPGVTQFGVLIGTSNNSVIEIQNNLLSFSNGSAAQTANSTGISISNSTSSSSSYRITIANNMLRQVVKGIATNNTDLPLIWGNGINIHARNYSFSNIGWAGIESTSDKGMNITQNYIDVEPVPTPNVTYTANNTTTTKIIGVNINSTRTNPAYVHCDSILNMHWALAATGANSVGVQYRRNAMMMNGTKVGLALYNPTIIGNQGSTTETNDNKWYGTVNGTTNFHFGYFATPNGSPISSQKFYFRNGYALNPTSLGAVKSDFWGVSNTPLSYNFTTPNNGIYSCYPFTQTRSGKMSEEDLQFLQWMETLVGDTLATDSLNPYFNLWREEQIMLALEENHWLREESSILYEYYYQNAGMESFLALHRLQKQADAAADSATAYRLLSENESIIPTTRHEQNIQKLNALKLRHALQLFTGNIAALYPNATDSAELRALAAECYVTGGPSIFAARAYWNVVYQKNDNSFQDYCLETTGYYKTDSVAGKGNSLELFKVFPTVIDKGNTLNILSSEMGKLKLFDISGRIIQEVSFVKGENRIQLFEFISSQIVLYDVTMSSGKKYNGKIFVK*